Skattejakten på genene våre
– med statistikk som verktøy!
Kristoffer Hellton,
Stipendiat ved Universitet i Oslo
Statistikk?
Data!
Statistikk
Matematikk
Verden
Usikkerhet
Tilfeldighet
Sannsynlighet
Men driver jeg på med?
Jeg prøver å finne
informasjon i genene
våre
Så kommer legene og mikrobiologene med
mange spørsmål:
• Kan vi finne de genene som øker risikoen
for kreft?
• Kan vi bruke genene skille mellom ulike
krefttyper og dermed gi bedre
behandling?
• Kan vi bruke genuttrykket til å forutsi
hvordan kreften vil oppføre seg?
Dess høyere opp, dess sterkere sammenheng
mellom genet og sykdommen.
Å skille mellom to typer
leukemi er essensielt for
behandling! Men dette kan
være vanskelig i praksis. Kan
dere hjelpe oss ved å finne
genene som skiller disse to
krefttypene?
Golub et. al 1999
Data: Måling av aktivitet i 7000
gener fra 72 pasientprøver i to
grupper, type I og type II.
Prøve
1
Prøve
2
Prøve
3
Gen 1
1,2
11,4
18,4
Gen 2
6,0
5,5
Gen 3
17,2
14,9
For et gen og 35 prøver
ser det slik ut:
Gen
Prøve
1
Prøve
2
Prøve
3
Gen 1
--
+
++
3,4
Gen 2
-
-
-
2,0
Gen 3
++
+
--
Type I
Gen
Type II
Etter å ha statistisk
«sortert» alle gene
kommer vi fram til en
gen-profil for den
første type og en for
den andre type. Dette
kan vi bruke til sjekke
hvilken type en ny
prøve kan ha, hvis
legen er usikker.
Derfor kan vi være helt
sikre på å gi riktig
behandling, slik at vi kan
redde liv!
Statistikk handler om å
forstå tall og usikkerhet
fra virkeligheten
gjennom matematikk.
For å finne viktig
informasjon i genene
våre brukes statistikk
til å avgjøre hva som er
ekte sammenhenger
og hva som er tilfeldig.
Utrolig viktig i alt
fra værmeldingen
til fisketelling.
Dermed kan vi svare på
mange ulike spørsmål
knyttet til genetikk,
sykdom og kreft.