kazalo vsebine - Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo

Univerza v Ljubljani
Medicinska fakulteta
Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo
Katedra za mikrobiologijo in imunologijo
PRAKTIKUM
IZ MIKROBIOLOGIJE
IN IMUNOLOGIJE
ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Ljubljana, 2011
Univerza v Ljubljani
Medicinska fakulteta
Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo
Katedra za mikrobiologijo in imunologijo
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Glavni urednik prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med.
Področni uredniki
Bakteriologija: asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., prof. dr. Manica Mueller
Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med.
Imunologija: prof. dr. Alojz Ihan, dr. med.
Mikologija: doc. dr. Tadeja Matos, dr. med.
Parazitologija: prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr., asist. Miha Skvarč, dr. med.
Virologija: doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med.
Avtorji
prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med.,
doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med., prof. dr. Manica Mueller Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med.,
prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., prof. dr. Alojz Ihan, dr. med.,
doc. dr. Darja Keše, univ. dipl. biol., asist. znan. sod., strok. svet. dr. Saša Simčič, univ. dipl. kem.,
asist. dr. Andreja Nataša Kopitar, univ. dipl. biol., asist. Miha Skvarč, dr. med., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr.,
prof. dr. Tatjana Avšič Županc, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. dr. Mateja Poljšak Prijatelj, univ. dipl. biol.,
viš. strok. sod. Vesna Golob, univ. dipl. biol., Polona Maver, dr. med., Mateja Jelen, univ. dipl. mikr., asist. Monika Jevšnik,
univ. dipl. mikr., dr. Sanja Stopinšek, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. Alenka Andlovic, dr. med., dr. Manca Žolnir Dovč,
univ. dipl. biol., asist. strok. sod. Nataša Švent Kučina, dr. med., asist. Samo Jeverica, dr. med., viš. znan. sod. dr. Branka
Wraber, univ. dipl. biol.
Slike
Veronika Strašek, prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., asist. Mateja Pirš, dr. med., Vladimir Drnovšek
Recenzenti
prof. dr. Marija Gubina, dr. med., prof. dr. Jožica Marin, univ. dipl. biol., prof. dr. Srečko Koren, dr. med.
Lektorica
Katarina Marin Hribar, prof.
Tehnično uredila
Mihaela Oberdank Hrastar
Tehnični sodelavki
Barbara Trtnik, Mrjetka Zupin
Založila
Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo, Katedra za mikrobiologijo in imunologijo
Tisk
Itagraf d. o. o.
Računalniško oblikovanje
Boex DTP d. o. o.
CIP - Kataložni zapis o publikaciji
Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana
579(075.8)(076.5)
616-097(075.8)(076.5)
PRAKTIKUM iz mikrobiologije in imunologije za študente
medicine / [avtorji Vladimir Kotnik ... [et al.] ; glavni urednik
Vladimir Kotnik ; slike Veronika Strašek ... et al.]. - Ljubljana :
Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo,
Katedra za mikrobiologijo in imunologijo, 2011
ISBN 978-961-91159-4-7
1. Kotnik, Vladimir
258504448
Copyright© Katedra za mikrobiologijo in imunologijo 2011
Vse pravica pridržane. Razmnoževanje ali razširjanje delov ali celote te publikacije s katerim koli sredstvom brez pisnega dovoljenja založnika
je prepovedano.
KAZALO VSEBINE
KAZALO VSEBINE
SEZNAM KRATIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
UVOD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19
POGLAVJE 1
Pravilno in varno delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Mikrobiološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Pravila o varnem delu v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Varnostni ukrepi pri delu v laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Nezgode v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Higiensko umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Asepsa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Sterilizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Nadzor učinkovitosti sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razkuževanje ali dezinfekcija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
21
23
23
23
24
25
26
26
27
28
POGLAVJE 2
Bakteriologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31
1. VAJA: KOKI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Moraxella catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Neisseria gonorrhoeae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Neisseria meningitidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Staphylococcus aureus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Staphylococcus epidermidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Streptococcus pyogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Streptococcus pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Streptococcus agalactiae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
33
33
39
43
47
52
58
62
68
73
2. VAJA: BACILI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
Bacteroides fragilis in drugi po Gramu negativni anaerobni bacili . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
Bordetella pertussis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Clostridium perfringens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Escherichia coli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97
Haemophilus influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103
Klebsiella pnemoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Listeria monocytogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Pseudomonas aeruginosa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Salmonella Enteritidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125
3. VAJA: DRUGE BAKTERIJE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Borrelia burgdorferi sensu lato . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Campylobacter spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Chlamydia trachomatis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Helicobacter pylori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
130
130
138
143
147
3
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Legionella spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Mycobacterium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Vibrio cholerae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
151
157
162
167
172
POGLAVJE 3
Mikologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
4. VAJA: GLIVE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Aspergillus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Candida spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Cryptococcus neoformans . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dermatofiti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
179
180
187
195
202
POGLAVJE 4
Parazitologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209
5. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Črevesni praživali Giardia intestinalis in Cryptosporidium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Pražival Trichomonas vaginalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Pražival Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Krvna, tkivna pražival Plasmodium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Črevesna glista Enterobius vermicularis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Trakulja Taenia solium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Trakulja Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Uši Pediculus humanus spp., Phthirus pubis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
211
211
216
219
223
226
229
232
237
POGLAVJE 5
Virologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Uvod v virološko diagnostiko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Odvzem in transport vzorcev v virološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Pregled diagnostičnih tehnik v virologiji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Encimsko-imunska metoda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokazovanje virusnih antigenov s hitrimi testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Imunohistokemične metode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Aglutinacija z lateksom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Osamitev virusov v celični kulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Sistemi za osamitev virusa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Primarne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Diploidne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Trajne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Postopek osamitve in identifikacije virusnega izolata . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Elektronska mikroskopija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
241
243
243
244
245
245
246
246
246
246
247
247
247
247
248
248
6.1 VAJA: NEPOSREDNO DOKAZOVANJE VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250
Metoda elektronske mikroskopije: povzročitelji virusnih gastroenteritisov –
rotavirusi, adenovirusi, astrovirusi in kalicivirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250
4
KAZALO VSEBINE
Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) – dokazovanje virusnih okužb dihal –
respiratorni sincicijski virus – RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254
Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV neposredno v kužnini . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257
6.2 VAJA: SEROLOŠKO DOKAZOVANJE VIRUSNIH OKUŽB . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Metode za dokazovanje specifičnih protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Metoda posredne imunofluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Encimsko-imunska metoda (ELISA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Metoda imunoblot (westernblot) ali imunsko pivnanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Nevtralizacijski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Reakcija vezave komplementa (RVK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Inhibicija hemaglutinacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokazovanje okužbe s hantavirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokazovanje okužb z virusom Epstein Barr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test monospot − izvedba in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokazovanje okužbe s HIV-1 s potrditvenim testom westernblot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
258
258
258
259
259
260
260
260
261
263
265
267
6.3 VAJA: MOLEKULARNA DIAGNOSTIKA VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Metode dokazovanja nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokazovanje virusnih nukleinskih kislin brez predhodnega pomnoževanja . . . . . . . . . . . . . .
Osamitev nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Verižna reakcija s polimerazo (PCR) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Posredne hibridizacijske metode − reverzna hibridizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Testiranje občutljivosti na protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določanje genotipa virusa hepatitisa C (HCV) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Kvantitativno določanje virusnega bremena pri okužbi s HIV-1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Genotipsko določanje odpornosti citomegalovirusa (CMV) na zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . .
271
271
271
271
272
273
273
274
278
280
POGLAVJE 6
Imunologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283
7. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Imunski sistem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Celične vrste in podvrste, ki so pomembne za imunski odziv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Fagocitne celice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Limfociti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Kako imunski sistem odstranjuje tuje molekule iz organizma? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Antigeni CD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Protitelesa CD, ki jih uporabljamo za opredelitev limfocitov T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Celice T pomagalke in aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Ugotavljanje limfocitnih populacij z imunofluorescenčno tehniko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Analiza imunskih celic s pretočnim citometrom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Uporaba pretočne citometrije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Analiza protitelesnega odziva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Precipitacijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Mikroprecipitacija v kapilari (semikvantitativna metoda – MPK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Radialna imunodifuzija (RID – kvantitativna tehnika) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Antistreptolizinski test (nevtralizacija hemolize s protitelesi) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Aglutinacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
285
285
285
285
286
286
287
287
287
288
288
289
291
292
292
293
294
296
5
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Encimsko-imunski testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Indirektna tehnika z označenimi protitelesi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Indirektna tehnika z označenim antigenom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Merjenje pokazateljev vnetja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Merjenje aktiviranosti komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Reakcija lize (uničevanja celic) s komplementom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Aktivacija komplementnega sistema po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določevanje koncentracije odlomka C3d/dg z metodo RIEF (raketna imunoelektroforeza) . . . .
Diagnostični primer A: na kromosom X vezana agamaglobulinemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Diagnostični primer B: kronična granulomatozna bolezen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Diagnostični primer C: kronična limfocitna levkemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Diagnostični primer D: aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Opis metod za tehnično izvedbo nalog A, B, C in D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Analiza diferencialne krvne slike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določitev titra protiteles proti tetanusnemu in davičnemu toksinu z MPK . . . . . . . . . . . . . . .
Določanje C-reaktivnega proteina v serumu z aglutinacijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Limfocitne vrste in podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze
s FITC obarvanih E. coli in v testu oksidacije barvila dihidrorodamin 123 . . . . . . . . . . . . . . .
Določanje serumskih protiteles razredov IgM, IgA, IgG s testom ELISA . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razprava A: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razprava B: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razprava C: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razprava D: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
312
314
316
316
317
317
POGLAVJE 7
Laboratorijske tehnike in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Osnovni aparati in drugi pripomočki za delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Mikroskop: svetlobni, s temnim poljem, fluorescenčni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Navodila za mikroskopiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Odvzem in prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Načini odvzema kužnine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Laboratorijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Neposredni razmaz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izdelava razmaza iz hemokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izdelava razmaza sputuma za barvanje po Gramu in vrednotenje mikroskopskega preparata . .
Izdelava neposrednega mikroskopskega preparata iz likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izdelava razmazov in barvanje bakterij iz čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnike barvanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnika barvanja po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnika barvanja z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnika barvanja po Ziehl-Neelsenu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnika barvanja po Giemsi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnika barvanja debele kaplje krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tehnika barvanja spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Bakteriološka gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Vrste gojišč . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
319
321
322
324
325
325
326
326
326
327
327
327
327
328
328
329
329
330
331
331
332
332
6
296
297
297
297
298
298
298
300
301
302
303
304
305
306
306
307
307
307
KAZALO VSEBINE
Osnovna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Obogatena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Bogatitvena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Agar po Drigalskem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Selektivna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Agar XLD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
CNA Columbia agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
MacC (MacConkey agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Specialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Agar BG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Karmali agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Agar CYA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Kromogena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
MRSA kromogeno gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Zasejavanje kužnin na gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Postopek zasejavanja iztrebka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Postopek zasejavanja sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Hemokultura . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Postopek zasejavanja urina s kvantitativno metodo in določitev koncentracije
mikroorganizmov v urinu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Osamitev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Prepoznava (identifikacija) bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izdelava čiste kulture iz mešane kulture bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Postopki za identifikacijo bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Prepoznava bakterij po fizioloških in biokemičnih lastnostih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Biokemična identifikacija po Gramu pozitivnih in negativnih kokov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Navzočnost vezane koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Navzočnost proste koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Deoksiribonukleaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Navzočnost hemolize beta ali alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Bacitracinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Optohinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test razgradnje arabinoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Fermentacija sladkorjev glukoze in maltoze (Hissovi sladkorji) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test CAMP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Biokemična identifikacija po Gramu negativnih bacilov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Biokemična vrsta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test za dokaz razgradnje glukoze, laktoze ali obeh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test za dokaz nastanka indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
332
333
333
334
334
334
335
335
335
335
335
336
336
336
336
336
337
337
337
337
338
338
338
339
339
339
340
340
340
341
341
342
342
343
343
343
343
344
344
344
345
345
345
346
346
348
348
348
7
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Test za dokaz razgradnje glukoze − metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina − Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test za dokaz zmožnosti razgradnje citrata – citrat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Test za dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dokaz gibljivosti bakterij − gojišče po Winkleju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Komercialni testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Odčitavanje API 20 E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Vrednotenje API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Ugotavljanje antigenske zgradbe bakterijskega seva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Serološke metode za dokazovanje bakterijskih okužb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določanje občutljivosti bakterij za antibiotike − antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Difuzijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Minimalna inhibitorna koncentracija, določena z metodo difuzijskega
gradienta – E-test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Odčitavanje E-testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Dilucijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določanje MIK in MBK z dilucijsko metodo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Določitev laktamaz beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Spremni list za mikrobiološke preiskave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izbor preparatov medicinsko pomembnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Izbor preparatov medicinsko pomembnih parazitov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
348
349
349
349
350
350
350
351
352
352
352
353
354
354
355
355
355
356
357
359
360
Slika 1. Postopek pri prelitju mikrobne kulture, kužnine ali krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Slika 2. Postaja za izpiranje oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Slika 3. Postopek izpiranja oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Slika 4. Pravilno umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
Slika 5. N. gonorrhoeae v brisu uretre, barvano z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Slika 6. A: N. gonorrhoeae na krvnem agarju. B: N. gonorrhoeae – fermentacija sladkorjev . . . . . . . . . 44
Slika 7. Potek testa za določitev povzročitelja angine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
Slika 8. Odčitavanje rezultatov testa STREP A. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
Slika 9. A: Mikroskopska slika B. fragilis; B: Kultura B. fragilis z diskom metronidazola . . . . . . . . . . . 78
Slika 10. Mikroskopska slika mešane okužbe − vzorec iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
Slika 11. Bolniku med operacijo aseptično odvzamejo gnoj iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
Slika 12. Tipična mikroskopska slika C. perfringens. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Slika 13. Rast na KA; toplo-hladna hemoliza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Slika 14. Tipična mikroskopska slika C. tetani . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90
Slika 15. Tipična mikroskopska slika C. botulinum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90
Slika 16. Plinska gangrena . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92
Slika 17. Hitri test za dokaz enterotoksina pri C. difficile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
Slika 18. Izvedba urikulta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101
Slika 19. Odčitavanje pozitivnega rezultata urikulta s shemo za oceno števila bakterijskih kolonij . . . . 101
Slika 20. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109
Slika 21. Test API Listeria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
Slika 22. API 20NE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121
Slika 23. Restrikcijski vzorci referenčnih borelijskih vrst . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
Slika 24. Trak z nanesenimi borelijskimi antigeni: pozitivna kontrola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Slika 25. B. burgdorferi sensu lato v mikroskopu s temnim poljem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Slika 26. Elektroforeza pridelka PCR v agaroznem gelu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136
8
KAZALO VSEBINE
Slika 27. Celična kultura z značilnimi klamidijskimi vključki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 28. Priprava vzorca za določitev antigenov bakterije H. pylori v iztrebku . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 29. Prikaz pozitivnega, negativnega in neveljavnega rezultata v testu za dokaz
antigena H. pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 30. Posredna imunofluorescena: Legionella pneumophila – pozitiven rezultat . . . . . . . . . . . . . .
Slika 31. Fotografija značilnih kolonij M. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 32. Diagnostično pomembne strukture posameznih glivnih rodov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 33. Teden dni stare kolonije A. fumigatus, A. flavus, A. niger na SABA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 34. A: Aspergillus spp. – konidiofore, vezikule, fialide, konidiji. B: A. fumigatus,
obarvan z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 35. A: C. albicans, pseudomicelij z značilnimi terminalnimi klamidosporami na
koruznem agarju. B: C. albicans na kromogenem gojišču, obarvana zeleno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 36. C. albicans, kužnina, barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 37. A: M. canis, makrokonidiji, obarvani z modrilom; B: T. mentagrophytes,
spiralne hife, obarvane z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 38. M. canis, teden dni stara kolonija na dermatofitnem gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 39. Shema obravnave vzorca blata, poslanega na ugotavljanje okužbe s črevesnimi paraziti . . .
Slika 40. Inokulacija kužnine v gojišču »InPouch« . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 41. Shema obravnave vzorca seruma, poslanega za ugotovitev okužbe s parazitom
Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 42. Razporeditev vzorcev za izvedbo indirektnega hemaglutinacijskega testa za
kvantitativno določanje protiteles proti Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 43. Test westernblot za dokazovanje protiteles proti ehinokoknim antigenom . . . . . . . . . . . . . .
Slika 44. Primer pozitivnega in negativnega rezultata pri metodi neposredne imunfluorescence . . .
Slika 45. Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 46. Dinamika nastajanja specifičnih protiteles pri okužbi z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 47. Pozitivni in negativni rezultati testa monospot za dokaz okužbe z EBV . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 48. Princip reverzne hibridizacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 49. Shematski prikaz genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 50. Določanje odpornosti CMV za protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 51. Neposredna in posredna imunofluorescenčna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 52. Prikaz rezultatov pretočne citometrije v obliki točkovnih diagramov . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 53. Shematični prikaz mikroprecipitacije v kapilari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 54. Shema nanašanja antigenov v testu RID za določanje koncentracije sestavine C3c
komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 55. Točkast graf za analizo rezultatov C3c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 56. Izvedba antistreptolizinskega testa (AST) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 57. Aglutinacija s kardiolipinom označenih lateksnih delcev v testu RPR
za določanje protiteles pri okužbi z bakterijo Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 58. Encimsko-imunski preskus – direktna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 59. ELISA – določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 60. Izvedba testa za ugotavljanje sestavin, ki so potrebne za aktivacijo komplementnega sistema . . .
Slika 61. Shema za izvedbo testa za ugotavljanje dejavnosti komplementnega sistema
po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 62. Slika gela s precipitati C3d/dg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 63. Preiskovanec A: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 64. Preiskovanec B: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 65. Preiskovanec C: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 66. Preiskovanec D: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
144
149
150
152
163
179
180
180
187
188
202
203
212
217
220
234
235
257
257
265
265
273
276
282
288
290
293
293
294
295
296
297
298
299
300
301
309
309
310
311
9
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Slika 67. Preiskovanec A: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 68. Preiskovanec B: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 69. Preiskovanec C: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 70. Preiskovanec D: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 71. Shema pipetiranja na mikrotitrsko ploščo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 72. Avtoklav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 73. Varnostna komora . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 74. Laboratorijski hladilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 75. Bakteriološki inkubator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 76. Suhi sterilizator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 77. Laboratorijska centrifuga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 78. Bunsenov gorilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 79. Bakteriološke zanke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 80. Posoda za varno odlaganje kužnih odpadkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 81. Deli svetlobnega mikroskopa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 82. Kaj zmanjšuje učinkovitost razločevanja opazovanih predmetov v svetlobnem mikroskopu? . .
Slika 83. Mikroskopiranje z imerzijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 84. Bris žrela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 85. Odvzem brisa uretre pri moškem in brisa cerviksa pri ženski . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 86. Odvzem srednjega curka urina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 87. Priprava mikroskopskega razmaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 88. Barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 89. Oblika in razporeditev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 90. Razporeditev bičkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 91. Priprava razmaza krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 92. Barvanje spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 93. Navadni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 94. Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 95. Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 96. Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 97. Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 98. Različna diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 99. Agar BG (Bordet Gengou) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 100. Kromogeno gojišče za gojenje MRSA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 101. Zasejavanje kužnine na gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 102. Redčenje vzorca na gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 103. Priprava ustrezne razredčine urina za kvantitativno urinokulturo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 104. Zasejavanje in štetje kolonij pri kvantitativni urinokulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 105. Priprava čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 106. Značilne oblike bakterijskih kolonij od zgoraj in v prerezu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 107. Po Gramu pozitivne in po Gramu negativne bakterije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 108. Značilna rast v bujonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 109. Anaerobni lonec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 110. Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 111. Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
10
312
313
313
314
315
321
321
321
322
322
322
322
322
322
323
324
324
325
325
326
327
328
329
329
330
331
333
333
334
334
335
336
337
337
338
338
339
339
340
340
341
341
341
342
343
KAZALO VSEBINE
Slika 112. Dokaz koagulaze na predmetniku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 113. Dokaz koagulaze v epruveti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 114. Hemoliza beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 115. Hemoliza alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 116. Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 117. Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 118. Hissovi sladkorji za dokaz bakterijske vrste Neisseria/Moraxella . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 119. CAMP fenomen, ki je značilen za skupino B beta hemolitičnih streptokokov
(S. agalactiae) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 120. Fermentativna (enterobakterije) in oksidativna (nefermentativni po Gramu
negativni bacili) razgradnja glukoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 121. Značilne reakcije na dvojnem sladkorju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 122. Gojišče za dokazovanje razgradnje triptofana do indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 123. Metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 124. Reakcija Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 125. Gojišče za dokaz citrata kot edinega vira ogljika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 126. Dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 127. Gojišče za ugotavljanje gibljivosti bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 128. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 129. Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 130. Izdelava difuzijskega antibiograma z avtomatskim polagalcem diskov . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 131. Določanje MIK z E-testom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 132. Določanje minimalne inhibitorne in minimalne baktericidne koncentracije antibiotika . . .
Slika 133. Inaktivacija penicilina z laktamazo beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Slika 134. Obrazec spremnega lista . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
343
343
344
344
345
345
345
346
347
348
348
348
349
349
349
350
351
354
354
355
355
356
357
Razpredelnica 1. Pregled sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27
Razpredelnica 2. Priporočeni temperatura, čas delovanja in tlak pri sterilizaciji s toploto . . . . . . . . . . 27
Razpredelnica 3. Nekatera razkužila in njihovo delovanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Razpredelnica 4. Barvilne in biokemične značilnosti Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
Razpredelnica 5. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Razpredelnica 6. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Razpredelnica 7. Barvilne in biokemične značilnosti M. catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39
Razpredelnica 8. Diagnostična razpredelnica za ugotavljanje biokemičnih značilnosti M. catarrhalis . . 41
Razpredelnica 9. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. aureus . . . . . . . 55
Razpredelnica 10. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
Razpredelnica 11. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. pyogenes . . . . 67
Razpredelnica 12. Razpredelnica za oceno ustreznosti odvzetega sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Razpredelnica 13. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije
S. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Razpredelnica 14. Ugotavljanje občutljivosti za penicilin in cepotaksin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
Razpredelnica 15. Razpredelnica za določitev MIK pri neznani anaerobni bakteriji . . . . . . . . . . . . . . . 82
Razpredelnica 16. Kultivacijske in biokemične značilnosti klostridijev . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
Razpredelnica 17. Razpredelnica za vpis podatkov za interpretacijo urinokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . 99
Razpredelnica 18. Antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb, povzročenih z enterobakterijami . . 100
Razpredelnica 19. Ocena kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105
Razpredelnica 20. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s H. influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
Razpredelnica 21. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s K. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Razpredelnica 22. Ugotavljanje navzočnosti laktamaze beta razširjenega spektra (ESBL) . . . . . . . . . 112
11
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
Razpredelnica 23. Biokemični testi značilni za razlikovanje listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 24. Kultivacija likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 25. Razpredelnica za identifikacijo listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 26. Razpredelnica za ugotavljanje kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 27. Razpredelnica z antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb
z nefermentativnimi bakterijami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 28. Kauffmann-Whiteova razpredelnica antigenske zgradbe
bakterij iz taksonomske vrste Salmonella enterica subsp. enterica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 29. Biokemična identifikacija kampilobaktrov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 30. Razpredelnica za vnos rezultatov testiranja Campylobacter spp. na
odpornost za antibiotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 31. Koncentracije in količine reagentov, potrebnih za izvedbo testa
PCR za dokaz Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 32. Značilnosti netreponemskih in treponemskih testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 33. Razpredelnica za ugotavljanje občutljivosti za antimikotik . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 34. Značilnosti različnih vrst kvasovk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 35. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 36. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 37. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 38. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike flukonazol,
vorikonazol, amfotericin in caspofungin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 39. Razdelitev dermatofitov glede na naravno nahajališče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 40. Najpogostejši povzročitelji gastroenteritisov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 41. Danes znani tipi hantavirusov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 42. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 1) . . .
Razpredelnica 43. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 2) . . .
Razpredelnica 44. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 3) . . .
Razpredelnica 45. Virusne beljakovine, nanesene na nitrocelulozno membrano testa
westernblot, za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 46. Interpretacija testa westernblot za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 47. Poročilo rezultatov potrditvenega testa westernblot za dokaz okužbe
s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 48. Poročilo rezultatov genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 49. Najpomembnejše molekule (antigeni), ki jih odkrivamo za
opredeljevanje limfocitnih populacij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 50. Normalne vrednosti limfocitnih populacij pri zdravih odraslih ljudeh . . . . . . . . .
Razpredelnica 51. Spremembe aktivnosti in koncentracije posameznih sestavin
komplementnega sistema pri nekaterih boleznih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 52. Predvidene normalne vrednosti za test ugotavljanja fagocitne
in oksidativne zmožnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 53. Povečava, potrebna za opazovanje različnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 54. Shema za identifikacijo po Gramu pozitivnih in po Gramu negativnih kokov . . . . .
Razpredelnica 55. Shema za identifikacijo po Gramu negativnih bacilov – enterobakterij . . . . . . . . .
Razpredelnica 56. Različne enterobakterije razgrajujejo različne substrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 57. Interpretacija rezultatov testa API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 58. Antibiotiki, ki jih lahko testiramo pri po gramu pozitivnih
in negativnih bakterijah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Razpredelnica 59. Nekatere bakterije in bolezni, ki jih le-te povzročajo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
12
115
117
117
122
123
128
139
141
165
168
184
189
191
192
199
200
202
250
261
266
266
267
268
269
270
277
288
290
301
312
324
342
346
347
352
353
358
S E Z N A M K R AT I C
Seznam kratic
AHFITC (anti human FITC) – s FITC obarvana protitelesa proti človeškim imunoglobulinom
aids (acquired immune deficiency syndrome) – sindrom pridobljene imunske pomanjkljivosti
AP (Alternative Pathway) – alternativna pot aktivacije komplementnega sistema
API (Analytical Profile Index Systems) – komercialni testi za dokazovanje bakterijskih povzročiteljev bolezni
API 20E – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij
API NH – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij
ARS – akutni retrovirusni sindrom
AST – antistreptolizinski test
ATCC (American Type Culture Collection) – zbirka trajnih celičnih linij
BAL – bronhoalveolarna lavaža
BCYE (Buffered Charcoal Yeast Extract) – obogateno in selektivno gojišče za legionele
bDNA (branched-chain) – razvejana DNA
BG (Bordet Gengou) – agar za gojenje bakterije Bordetella pertussis
BSA (Bovine Serum Albumin) – goveji serumski albumin
CagA – citotoksični protein – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori
CAMP (Christie Atkins Munch-Peterson) – test za identifikacijo beta hemolitičnih steptokokov skupine B
CAPD (Continous Ambulatory Peritoneal Dialysis) – peritonealna dializa
CCD (Charge Coupled Device) – fotoelektrična kamera
CD (Cluster of Differentiation) – monoklonska protitelesa proti antigenom na limfocitih, tudi antigeni
na limfocitih
CDC (Center for Disease Control) – center za nalezljive bolezni – najbolj znani iz Atlante v ZDA
CDV – cidofovir
NK – naravne celice ubijalke
CFW – fluorescenčno barvilo (kalkofluor belo, angl. CalcouFluor White, CFW)
CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) – agar za izvedbo kvantitativne urinokulture
CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) – zbirka mednarodnih mikrobioloških standardov
CMV – citomegalovirus
CNA (Columbia agar) – selektivno gojišče, ki omogoča rast po Gramu pozitivnih bakterij
CPU – citopatogeni učinek
CRP – C-reaktivni protein
CT – računalniška tomografija
CTXФ – lizogeni bakteriofag
CVK – centralni venski kateter
CYA (Charcoal Yeast Agar) – agar, ki omogoča rast legionelam
ČA – čokoladni agar
13
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
DIF – direktni (neposredni) imunofluorescenčni test
DKS – diferencialna krvna slika
DNK – deoksiribonukleinska kislina
dNTP – deoksiribonukleotid
DOB – virus Dobrava
DRIG – agar po Drigalskem
EAEC – enteroagregativna E. coli
EBV – virus Epstein Barr
ECACC (European Collection (Agency) of Cell Cultures) – zbirka trajnih celičnih linij –
podobno kot v ZDA ATCC
EDTA (Ethylene Diamine Tetraacetic Acid) – antikoagulans – helator kalcijevih in magnezijevih ionov
EGTA (Ethylene Glycol Tetraacetic Acid) – helator kalcijevih in magnezijevih ionov, vendar z mnogo
večjo afiniteto do kalcijevih ionov kot EDTA
EHEC – enterohemoragična E. coli
EIA ali ELISA (Enzyme Immuno Assay ali Enzyme Linked Immunosorbent Assay) –
encimsko imunski test
EIEC – enteroinvazivna E. coli
EIT – encimsko-imunski test
EM – elektronska mikroskopija
env – gen, ki kodira ovojnično virusno beljakovino
EPEC – enteropatogena E. coli
ESBL (Extended Spectrum Beta Lactamases) – enterobakterije z razširjenim spektrom laktamaz beta
ETEC – enterotoksigena E. coli
FALS (Forward Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri svetlobo v smeri izvora
FITC – FluoresceinIzoTioCianat
FOS – foskarnet
FSC (Forward SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC na kateri so prikazani dogodki, ki jih
zazna detektor FALS
FTA – ABS (Fluorescent Treponemal Antibody – ABSorption) – imunofluorescenčni test za
dokazovanje protiteles proti bakteriji Treponema pallidum
gag – strukturna virusna beljakovina
GAS-PAK – sistem za gojenje anaerobnih bakterij
GCV – ganciklovir
HAART (Highly Active Antiretroviral Therapy) – način medikamentoznega zdravljenja okužbe s HIV
HBV – virus hepatitisa B
HCV – virus hepatitisa C
HIV – virus pridobljene imunske pomanjkljivosti
HLA (Human Leukocyte Antigens) – antigeni poglavitnega sistema tkivne skladnosti pri človeku
14
S E Z N A M K R AT I C
HLAR (High-Level Aminoglycoside Resistance) – povečana odpornost proti aminoglikozidom
HMRS – hemoragična mrzlica z renalnim sindromom
HPS – hantavirusni pljučni sindrom
HPV – humani papiloma virus
I – (Indeterminate) – nedoločljivo
IFT – imunofluorescenčni test
IgA – imunoglobulin razreda A
IgG – imunoglobulin razreda G
IgM – imunoglobulin razreda M
IHA – indirektni (posredni) hemaglutinacijski test
IIF – indirektni (posredni) imunofluorescenčni test
KA – krvni agar
KIA (Kligler Iron Agar) – agar za gojenje enteričnih, po Gramu negativnih bakterij
KLL – kronična limfocitna levkemija
KNS – za koagulazo negativni stafilokoki
KOPB – kronična obstruktivna pljučna bolezen
KRA – koruzni agar
LCR (Ligase Chain Reaction) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo z ligazo
LGV – LimfoGranuloma Venerum – spolno prenosljiva bolezen
LIA (Line Immuno Assay) – molekularni test za dokaz protiteles proti rekombinantnim antigenom
npr. T. pallidum
LOS – LipoOligoSaharid
M (Membrane protein) – membranski protein, pomemben za razlikovanje streptokokov
MAC (Membrane Attack Complex) – tudi terminalni kompleks ali C5b-9 – končna faza ubijanja celic
s komplementom
MacC (MacConkey agar) – selektivno in diferencialno gojišče, ki omogoča rast po Gramu
negativnim bakterijam, zavira pa rast po Gramu pozitivnih bakterij
MBK – minimalna baktericidna koncentracija
MGB (Minor Groove Binder) – hibridizacijska sonda za označevanje na novo nastale DNK
v reakciji PCR
MH – gojišče Mueller – Hinton
MIK – minimalna inhibitorna koncentracija
MKP – modificirno Kelly – Pettenkoferjevo gojišče za gojenje borelij
MOMP (Major Outer Membrane Protein) – poglavitna beljakovina zunanje ovojnice pri C. trachomatis
MPK – mikroprecipitacije v kapilari
MR – metil rdeče
MRSA (Methicillin-Resistant S. aureus) – proti meticilinu odporen S. aureus
NAD – nikotinamid adenin dinukleotid
15
PRAK TIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE
NASBA (Nucleic Acid Sequence Based Amplification) – metoda, primerna za odkrivanje okužbe
s HIV – alternativa PCR
NCAM (Neural Cell Adhesion Molecule) izoforma adhezijske molekule živčnih celic na naravnih
celicah ubijalkah
NS – (Non Susceptible) – ni občutljiv
ORSAB – MRSA kromogeno gojišče
PAF – protein akutne faze vnetja
PBS – fosfatni pufer
PCR – verižna reakcija s polimerazo
PE (PhycoErythrin) – rdeče fluorescirajoče barvilo
PFGE (Pulsed-Field Gel Electrophoresis) – metoda elektroforeze v utripajočem električnem polju
pol – gen, ki kodira virusni encim
PTLD – posttransplantacijska limfoproliferativna bolezen
PUU – virus Puumala
PYR (L-pirolidonil-beta-naftilamid) – test za dokaz enterokokov
RALS (Right Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri lomljeno svetlobo
RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) – polimorfizem restrikcijskega odseka
RIA (Radio Immuno Assay) – radioimunski preskus
RID – radialna imunodifuzija
RIEF – raketna imunoelektroforeza
RNK – ribonukleinska kislina
ROS (Reactive Oxidative Species) – reaktivne kisikove zvrsti, pomembne za oksidativni način
ubijanja mikrobov v fagocitih
RPR (Rapid Plasma Reagin) – test za odkrivanje antikardiolipinskih protiteles pri sifilisu
RSV– respiratorni sincicijski virus
RT-PCR – pomnoževanje nukleinskih kislin z verižno reakcijo s polimerazo v realnem času
RVK – reakcija vezave komplementa
S – (Susceptible) –občutljiv
S-DD – (Susceptible – Dose Dependent) – občutljiv, odvisen od doze
SCID (Severe Combined Immune Deficiency) – težka kombinirana imunska pomanjkljivost
SDA (Strand Displacement Assay) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo
SEO – virus Seoul
SLE – sistemski lupus eritematosus
SN – virus Sin Nombre
SSC (Side SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC, na kateri so prikazani dogodki, ki jih zazna
detektor RALS
STREP A – hitri test za dokaz antigena S. pyogenes
TCBS – gojišče (Tiosulfat, Citrat, žolčne soli (Bile), Saharoza)
16
S E Z N A M K R AT I C
TCR – T-celični receptorji
TEM – transmisijska elektronska mikroskopija
tio – tioglikolatni bujon
TMA – metoda pomnoževanja nukleinskih kislin – pomnoževanje s transkripcijo
TMB – tetrametil benzidin
TPHA – test pasivne hemaglutinacije za določitev protiteles proti bakteriji Treponema pallidum
UZ – ultrazvok
VacA – vakuolizirajoči toksin – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori – povzroča nastanek
vakuol v epitelijskih celicah želodca
VDRL (Veneral Disease Research Laboratories) – kardiolipinski test za dokaz sifilisa, ekvivalenten
testu RPR (Rapid Plasma Reagin)
VP (Voges-Proskauer) – test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina
VRE (Vancomycin-Resistant Enterococcus) – enterokok, odporen za vankomicin
VTM – virusni transportni medij
WB – test westernblot
XLD (Xylose, Lysin, Deoxycholate agar) – gojišče, ki omogoča rast salmonel, zavira rast po Gramu
pozitivnih bakterij
17