Tillämpad statistik III, överlevnadsanalys

KURSPLAN
Dnr U 2014/757
1(2)
Fastställd av FUN 2015-04-14, gäller från 2015-04-14
Forskarutbildningsnämnden, FUN
Tillämpad statistik III – överlevnadsanalys, METSÖA3
Applied statistics III - Survival analysis
1.5 högskolepoäng
Nivå F
Allmänna uppgifter
Kursen ger en genomgång av grundläggande statistiska metoder inom överlevnadsanalys. Kursen ges på
heltid för doktorander vid Medicinska fakulteten i Lund. Den är i mån av plats, dock max 50% av
deltagarna, även öppen för övriga doktorander, post docs och andra intressenter vid Medicinska
fakulteten, andra fakulteter och vid andra lärosäten. Förkunskaper motsvarande de tillämpade
statistikkurserna på nivå I och II inom forskarutbildningen krävs.
Undervisningsspråk
Engelska
Syfte
Kursen ska ge deltagarna praktiskt användbar kunskap om typsituationer som lämpar sig för
överlevandsanalys samt om passande statistiska metoder för att hantera dessa situationer. Kursen ska också
ge deltagarna förmåga att utföra och tolka empiriska resultat inom medicinsk vetenskap, också utanför det
egna forskningsfältet, som bygger på överlevnadsanalys.
Mål för kursen
Efter godkänd kurs ska deltagaren kunna föreslå, genomföra och tolka statistiska analysresultat inom
relevant typ av överlevnadsanalys.
Kursinnehåll
Kursen inleds med en introduktion till överlevnadsanalys; vad överlevnadsanalys är och i vilka
typsituationer det används. Detta följs av en fördjupning i statistiska metoder för de olika
typsituationerna.
I kursen ingår följande fem teman:
1) Introduktion
• Definition
• Typsituationer
• Studiedesign
2) Deskription av data
• Överlevandskurvan
• Life tables
• Kaplan-Meier skattaren
3) Analys av gruppskillnader
• Kaplan-Meier skattaren och konfidensintervall
• Log-rank test
KURSPLAN
Dnr U 2014/757
2(2)
Fastställd av FUN 2015-04-14, gäller från 2015-04-14
4) Analys av gruppskillnader – fördjupning
• Förväxling av effekter (confounding)
• Stratifierat log-rank test
• Hazarden
• Cox regression
• Anpassning av Cox-modellen
• Log-minus-log-plott
• Schoenfeld residualer
5) Cox-regression – teoretisk fördjupning
• Sampling från risksetet - likheter med nested-case control design
• Likheter mellan hazard rates och incidence rate ratio
Undervisningsform
Kursen omfattar 3 undervisningsdagar plus en halv dag tentamen. Kursdagarna är heldagar med
föreläsningar varvat med datorlaborationer. Genom praktiska övningar får deltagarna dels lära sig
tillämpa de olika metoderna dels skaffa en förståelse för hur situationer och metoder skiljer sig åt
och varför. Deltagarna kan välja mellan att genomföra datorlaborationerna i något av de programpaket
som rekommenderas vid respektive kurstillfälle, t.ex. SPSS, STATA, R, eller SAS. Tillgång till bärbar
dator med den valda programvaran korrekt installerad förutsätts. Eftermiddagen den sista kursdagen
redovisas de praktiska övningarna i form av ett kortare föredrag inför kursledning och övriga
kursdeltagare.
Examination
Individuell praktisk uppgift. Sista kursdagen (halv dag) redovisas de praktiska övningarna i form av ett
kortare föredrag inför kursledning och övriga kursdeltagare och ett skriftligt underlag lämnas in för
bedömning.
För godkänt på kursen krävs, förutom godkänd redovisning av genomförd praktisk uppgift och godkänt
skriftligt underlag för genomförd praktisk uppgift, aktivt deltagande på kursens samtliga moment.
Betyg
Godkänd eller underkänd
Litteratur
Artiklar samt annat undervisningsmaterial som delas ut inför kursstarten samt löpande under kursens
gång.