1 Memorias del Congreso
Memorias del Congreso 1 II Congreso Nacional de Medicina Genómica 2 Memorias del Congreso Programa general Miércoles 25 Jueves 26 Viernes 27 9:00 - 10:00 Conferencia inaugural Análisis de expresión en la investigación genómica en cáncer Dr. Patrick O. Brown 9:00 - 9:50 Cátedra Gonzálo Río Arronte Predisposición genómica a las adicciones Dr. George R. Uhl 9:00 - 9:50 Conferencia Magistral Identificando elementos funcionales en el genoma humano mediante secuenciación comparativa Dr. Eric Green 10:00 - 11:00 Conferencia Magistral Estructura del mapa de haplotipos en el genoma humano Dra. Stacey Gabriel 9:50 - 10:30 Panel de expertos: Propiedad intelectual en medicina genómica 9:50 - 10:30 Lanzamiento de la Revista Genomic Medicine Dr. Davendra Kumar Dr. Gerardo Jiménez Sánchez 11:00 - 11:35 Inauguración Dr. Julio Frenk Secretario de Salud 10:30 - 10:45 Receso 10:30 - 10:45 Receso 10:45 - 11:35 Conferencia Magistral Bases genómicas de las enfermedades cardiovasculares Dr. Stephen Liggett 10:45 - 11:35 Conferencia Magistral Farmacogenómica y terapeútica individualizada Dr. William E. Evans 11:35 – 11:50 Receso 11:35 - 11:50 Receso 11:35 - 11:50 Receso 11:50– 13:20 Simposio 1. Enfermedades multifactoriales I 11:50– 13:20 Trabajos libres Modalidad posters 11:50 – 13:20 Trabajos libres Modalidad presentaciones orales 13:20 – 13:40 Receso 13:20 – 13:40 Receso 13:20 – 13:40 Receso 13:40 – 14:30 Conferencia Magistral Implicaciones raciales y étnicas en la práctica médica Dr. Neil Risch 13:40 – 14:30 Cátedra INMEGEN Biología de sistemas, medicina genómica y el futuro en el cuidado de la salud Dr. Leroy Hood 13:40 – 14:30 Conferencia Magistral Proteómica: Una ventana hacia la función y disfunción en biología Dr. Daniel C. Liebler 14:30 – 16:30 Comida 14:30 – 16:30 Comida 14:30 – 16:30 Comida 16:30 – 18:00 Simposio 2. Enfermedades multifactoriales II 16:30 – 18:00 Simposio 3. Oncología genómica 16:30 – 18:00 Simposio 4. Farmacogenómica y nutrigenómica 18:00 – 18:15 Receso 18:00 – 18:15 Receso 18:00 – 18:15 Receso 18:15 – 19:05 Conferencia Magistral Genómica de la obesidad humana Dr. Philippe Froguel 18:15 – 19:05 Conferencia Magistral Medicina genómica: Tendencias emergentes en ética Dra. Ellen Wright Clayton 18:15 – 19:05 Conferencia Magistral Integrando genética, genómica y biología hacia una medicina mas individualizada Dr. Jeffrey Trent Noche libre Coctel de bienvenida Affimetrix Clausura 3 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Conferencias Magistrales Miércoles 25 9:00 - 10:00 Conferencia inaugural Análisis de expresión en la investigación genómica en cáncer Dr. Patrick O. Brown Stanford University 10:00 - 11:00 Estructura del mapa de haplotipos en el genoma humano Dra. Stacey Gabriel The Broad Institute MIT - Harvard University 13:40 – 14:30 Implicaciones raciales y étnicas en la práctica médica Dr. Neil Risch University of California in San Francisco 18:15 – 19:05 Genómica de la obesidad humana Dr. Philippe Froguel Instituto Pasteur Jueves 26 9:00 - 9:50 Cátedra Gonzálo Río Arronte Predisposición genómica a las adicciones Dr. George R. Uhl National Institute of Drug Addictions National Institutes of Health 10:45 - 11:35 Bases genómicas de las enfermedades cardiovasculares Dr. Stephen Liggett University of Maryland 13:40 – 14:30 Cátedra INMEGEN Biología de sistemas, medicina genómica y el futuro en el cuidado de la salud Dr. Leroy Hood Institute of Systems Biology 18:15 – 19:05 Medicina genómica: Tendencias emergentes en ética Dra. Ellen Wright Clayton Vanderbilt University Viernes 27 4 9:00 - 9:50 Identificando elementos funcionales en el genoma humano mediante secuenciación comparativa Dr. Eric Green National Human Genome Research Institute National Institutes of Health 10:45 - 11:35 Farmacogenómica y terapeútica individualizada Dr. William E. Evans St. Jude Children´s Research Hospital 13:40 – 14:30 Proteómica: Una ventana hacia la función y disfunción en biología Dr. Daniel C. Liebler Vanderbilt University Medical Center 18:15 – 19:05 Integrando genética, genómica y biología hacia una medicina mas individualizada Dr. Jeffrey Trent Translational Genomics Research Institute (TGen) Memorias del Congreso Simposia Miércoles 25 11:50– 13:20 Simposio 1. Enfermedades multifactoriales I Coordinadora: Dra. Clara Gorodezky Instituto Nacional de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos Mapa de haplotipos de los mexicanos Dr. Alfredo Hidalgo Miranda, INMEGEN Predisposición genómica a diabetes mellitus M.C. Ruth Gutiérrez, Institute Pasteur, París Diversidad del genoma humano Dr. Andrés Moreno, Univ. Pompeu Fabra, Barcelona Variaciones genómicas y riesgo cardiovascular Dr. Eros Balam Ortiz, INMEGEN 16:30 – 18:00 Simposio 2. Enfermedades multifactoriales II Coordinador: Dr. David Kershenovich Facultad de Medicina, UNAM Rasgos metabólicos asociados a diabetes mellitus Dra. María Teresa Tusié, INCMyNSZ Genómica del Síndrome Metabólico Dra. Margarita Terán, Pennington Biomed Research Center Degeneración macular asociada a la edad Dra. Irma Silva Zolezzi, INMEGEN Genómica de las enfermedades autoinmunes Dra. Lorena Orozco, INMEGEN Jueves 26 16:30 – 18:00 Simposio 3. Oncología genómica Coordinador: Dr. Alejandro García Carrancá Instituto Nacional de Cancerología Carcinogénesis en piel y de cérvix uterino Dr. Patricio Gariglio, CINVESTAV Genómica funcional y su impacto en quimioterapia Dr. Alejandro Sweet Cordero, Universidad de Stanford Expresión genómica y progresión de cáncer de mama Dr. Mauricio Salcedo Vargas, IMSS Identificación de genes de susceptibiildad para cáncer de próstata Dr. John Carpten, TGen Institute, Phoenix, AZ Viernes 27 16:30 – 18:00 Simposio 4. Farmacogenómica y nutrigenómica Coordinador: Dr. Héctor Bourges Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán Individualidad genética y nutrición Dr. Armando Tovar, INCMyNSZ Nutrigenómica: Implicaciones en Salud Pública Dr. Jim Kaput, Nutrigenomics Variaciones de número de copias y su impacto en la farmacogenómica Dr. Charles Lee, Univ. de Harvard, EUA Farmacogenómica de la hipertensión arterial M.C. Samantha Alvarez Madrazo BHF Glasgow Cardiovascular Research Center 5 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Panel de expertos Jueves 28 9:50– 10:30 Propiedad intelectual en medicina genómica Coordinador: Lic. Carlos Eduardo Represas Patronato Fundador del INMEGEN Participantes: Dr. Jorge Rosenkranz Weiner Grupo Roche Syntex de México S.A. de C.V. Junta de Gobierno, INMEGEN Lic. Jorge Amigo Castañeda Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial Ing. Enrique Taracena Figueroa Instituto Panamericano de Alta Dirección de Empresas (IPADE) 6 Memorias del Congreso Desarrollando innovación científica en medicina genómica. Presentación La medicina genómica avanza a nivel global y México no es la excepción. A dos años de haber celebrado el primer congreso en su género en América Latina y de los primeros en el mundo, este 2006 celebramos el II Congreso Nacional en Medicina Genómica. A tres años apenas de haberse terminado la secuenciación completa del genoma humano y de conocerse en forma sistemática sus variaciones mas frecuentes, hoy contamos con los primeros mapas de haplotipos de diversas poblaciones y comienzan a surgir con mayor vigor las asociaciones entre variaciones genómicas y enfermedades comunes. México por su parte, cuenta hoy con el Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) que coordina el desarrollo de esta disciplina en el país, con una masa crítica de investigadores que desarrollan importantes actividades científicas en este campo. Entre ellas, el desarrollo del primer mapa de haplotipos de la población mestiza mexicana, que servirá como detonante para la identificación de mas genes asociados a enfermedades comunes. Así también, hoy contamos con una creciente comunidad científica que le da forma y vigor a la Sociedad Mexicana de Medicina Genómica (SOMEGEN), fundada en Junio de 2003. Una vez mas, estas dos organizaciones sumamos esfuerzos para llevar a cabo esta reunión científica que contribuye en forma importante al desarrollo de la plataforma nacional en medicina genómica. El programa científico del Congreso incluye temas de gran actualidad como genómica poblacional, análisis de haplotipos, genómica de la obesidad, enfermedades cardiovasculares, cáncer, adicciones, farmacogenómica, proteómica y el estudio de los retos éticos y legales a lo que nos enfrenta esta nueva disciplina. Además, se ha incluido un panel de discusión sobre propiedad intelectual en medicina genómica. Sin duda, la participación de líderes académicos en estas áreas asegurarán su alto nivel académico. Este año además, el Congreso servirá de plataforma para el lanzamiento en América Latina y el Caribe, de la nueva revista científica internacional Genomic Medicine editada por Springer, a la que auguramos un gran éxito. Nuestro reconocimiento al valioso apoyo que el INMEGEN y la SOMEGEN reciben de la Secretaría de Salud, la Universidad Nacional Autónoma de México, el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, la Academia Nacional de Medicina, la Academia Mexicana de Ciencias y la Fundación Mexicana para la Salud, en la planeación y organización de este evento que, sin duda, esta destinado a convertirse en uno de los eventos académicos más importantes de la medicina genómica. Presidentes del Congreso Dr. Gerardo Jiménez Sánchez Director General Instituto Nacional de Medicina Genómica Dr. Francisco Bolivar Zapata Presidente Sociedad Mexicana de Medicina Genómica 7 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Presidentes del Congreso Dr. Gerardo Jiménez Sánchez Dr. Francisco Bolívar Zapata Comité Organizador Dr. Santiago March Mifsut, Coordinador Lic. José Bedolla Castro Mtra. Victoria Castellanos Xolocotzi Ing. Carlos Dávila García Lic. Alejandro López Franco Lic. Mariana Salazar Hernández Lic. Verónica Saucedo Zenteno Act. Cuauhtémoc Valdés Olmedo Dra. Ma. Teresa Velasco Jiménez Ing. Isaac Vera Ramírez Comité Científico Dra. Rocío Ortíz López, Presidente Dr. Miguel Cruz López Dra. Laura del Bosque Plata Dr. Luis Figuera Villanueva Dr. Alfredo Hidalgo Miranda Mtro. César Lara Alvarez Dr. Alejandro Sweet Cordero Dra. Astrid Rasmussen Almaraz Dra. Irma Silva Zolezzi Comité Asesor Dr. Guillermo Soberón, Presidente Dr. Gustavo Chapela Castañares Dr. Emilio García Procel Dr. Juan Pedro Laclette San Román Lic. Antonio López de Silanes Lic. Carlos Eduardo Represas Dr. José Narro Robles Dr. Manuel Ruíz de Chávez Dr. Jaime Sepúlveda Amor Dr. Misael Uribe Esquivel 8 Memorias del Congreso Instituciones participantes Instituciones de Educación Superior Benemérita Universidad Autónoma de Puebla Colegio de Posgraduados Escuela Médico Militar Escuela Nacional de Antropología e Historia Escuela Superior de Medicina, Hospital General de México Instituto Politécnico Nacional (IPN) Centro de Investigación en Ciencia Aplicada y Tecnología Avanzada Centro de Investigaciones y de Estudios Avanzados Ciidir Durango Escuela Nacional de Ciencias Biológicas Escuela Superior de Medicina Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnología Instituto Tecnológico Autónomo de México (ITAM) Instituto Tecnológico de Estudios Superiores Monterrey (ITESM) Escuela de Medicina Universidade Luterana Do Brasil CRDP, Universidad de Montreal Universidad Anáhuac Facultad de Bioética Universidad Autónoma "Benito Juárez" de Oaxaca Universidad Autónoma de Aguascalientes Universidad Autónoma de Chiapas Facultad de Ciencias Químicas Civ, UNACH Universidad Autónoma de Guerrero Maestría en Ciencias Biomédicas Universidad Autónoma de la Ciudad de México Universidad Autónoma de Nuevo León Facultad de Medicina Instituto de Biotecnología Universidad Autónoma de Querétaro Universidad Autónoma de Sinaloa Universidad Autónoma de Tabasco Universidad Autónoma de Tlaxcala Universidad Autónoma de Yucatán CIR, Dr. Hideyo Noguchi Facultad de Química Universidad Autónoma de Zacatecas Universidad Autónoma del Carmen Centro de Tecnologías de la Información, Des-Daci Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo Universidad Autónoma del Estado de México Facultad de Farmacia Facultad de Medicina Universidad Autónoma del Estado de Morelos Facultad de Medicina Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa Unidad Xochimilco Universidad Autónoma de Puebla Universidad Central del Ecuador Centro de Biomedicina Universidad de Antioquia Universidad de Chile Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas Universidad de Guadalajara Universidad de Guanajuato Universidad de las Américas Universidad de Sonora Universidad Iberoamericana Universidad Iberoamericana León Universidad Juárez Autónoma de Tabasco Universidad La Salle Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo Universidad Nacional Autónoma de México Centro de Ciencias Genómicas Facultad de Ciencias Facultad de Ciencias Políticas y Sociales Facultad de Estudios Superiores Cuautitlán Facultad de Estudios Superiores Iztacala Facultad de Medicina Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia Facultad de Química Instituto de Biotecnología Instituto de Física Instituto de Fisiología Celular Instituto de Investigaciones Biomédicas Instituto de Neurobiología, Campus Juriquilla Universidad Pedagógica Nacional Universidad Pompeu Fabra Universidad Simón Bolívar Universidad Tecnológica de la Mixteca Universidad Veracruzana Facultad de Medicina Instituto de Neuroetología University of Toronto Universidad Autónoma de Querétaro Vanderbilt University 9 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Instituciones participantes Sistema Nacional de Salud Secretaría de Salud Secretaría de Salud del Estado de Querétaro Secretaría de Salud de Guerrero Servicios de Salud de Tamaulipas Servicios de Salud de Yucatán Servicios de Salud de Zacatecas Servicios de Salud Pública del D. F. Coordinación General de los Institutos Nacionales de Salud Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición “Salvador Zubirán” Instituto Nacional de Cancerología Instituto Nacional de Cardiología "Dr. Ignacio Chávez" Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía “Manuel Velasco Suárez” Instituto Nacional de Pediatría Instituto Nacional de Perinatología Instituto Nacional de Psiquiatría “Ramón de la Fuente” Instituto Nacional de Rehabilitación Instituto Nacional de Salud Pública Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS) Hospital de Pediatría, CMN Siglo XXI Centro de Investigación Biomédica del Noreste Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO) ISSEMYM, Estado de México Centros de Investigación Centro de Estudios Tecnológicos, Industrial y de Servicios Centro de Investigaciones en Bioética Institute of Medical Genetics Instituto Roche Institut D´Etudes Politiques, Paris Inifap-Cenid-Microbiología 10 Instituto de Salud del Estado de México Hospital General "Lic. Adolfo López Mateos” Instituto de Salud y Seguridad Social de los Trabajadores del Estado (ISSSTE) Centro Médico Nacional “20 de Noviembre” Hospital Regional "1° de Octubre" Centro Médico “Adolfo López Mateos” Hospital Ángeles de Querétaro Hospital Ángeles del Pedregal Hospital Ángeles Lomas, Consultorio 320 Hospital Central Sur de Alta Especialidad, Pemex Hospital Civil “Fray Antonio Alcalde” Hospital de Apoyo Sullana Hospital de Especialidades de la Ciudad de México "Dr. Belisario Domínguez" Hospital de la Mujer Hospital de la Niñez Oaxaqueña Hospital General "Dr. Aurelio Valdivieso" Hospital General de México Hospital Infantil de México Hospital Juárez de México Hospital Lee Moffitt Cancer Center & Research Institute Hospital Médica Sur Hospital Naval Veracruz Hospital Psiquiátrico “Fray Bernardino Álvarez” Organismos Públicos Comisión Nacional de Bioética Desarrollo Integral de la Familia (DIF) Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial Secretaría de Relaciones Exteriores Fundación Altius Fundación Gónzalo Rio Arronte Memorias del Congreso 11 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Patrocinadores 12 Memorias del Congreso Contenido Presentación 7 Conferencias magistrales y simposia Conferencistas magistrales 14 Simposia Enfermedades multifactoriales I 22 Enfermedades multifactoriales II 24 Oncología genómica 25 Farmacogenómica y nutrigenómica 25 Trabajos libres: Presentaciones orales y carteles Presentaciones orales 28 Carteles Investigación básica 36 Investigación clínica 44 Genómica poblacional 60 Farmacogenómica y terapéutica molecular 67 Aspectos éticos, legales, sociales y educativos sobre la medicina genómica 70 Bioinformática 72 Tecnología genómica 75 Ïndice de autores 79 13 Conferencias magistrales II Congreso Nacional de Medicina Genómica Conferencias magistrales Cátedra INMEGEN Biología de sistemas, medicina genómica y el futuro del cuidado de la salud Dr. Leroy Hood Presidente del Instituto para la Biología de Sistemas, Seattle, WA, EUA M.D. de la Facultad de Medicina de la Universidad Johns Hopkins, 1964 Ph.D. en Bioquímica del Instituto Tecnológico de California, 1968 La investigación del Dr. Hood se ha centrado en el estudio de la genómica, la biotecnología, y la inmunología molecular. Inició su carrera profesional en Caltech, donde él y sus colegas participaron en el desarrollo de cuatro instrumentos: el secuenciador y sintetizador del gen del ADN y el sintetizador y secuenciador de proteínas que constituyen las bases tecnológicas de la biología molecular contemporánea. El secuenciador de ADN ha revolucionado la genómica de manera muy particular, permitiendo que exista una secuenciación rápida y automatizada, hecho crucial que durante la década de 1990 contribuyó de manera muy importante al exitoso mapeo del genoma humano. En 1992, el Dr. Hood se trasladó a la Universidad de Washington, donde fundó y asumió la Dirección del Departamento Interdisciplinario de Biotecnología Molecular. En el año 2000, fue cofundador del Instituto para la Biología de Sistemas en Seattle, Washington, siendo pionero en los abordajes de sistemas aplicados a la biología y la medicina. Las contribuciones que el Dr. Hood ha hecho a la biotecnología a lo largo de su vida, le llevaron recientemente a recibir el prestigiado Premio a la Excelencia 2004 en el área de Diagnóstico Molecular, que es otorgado por la Asociación para la Patología Molecular (AMP, por sus siglas en inglés). Asímismo, fue galardonado con el Premio Lemelson 2003 para la Innovación y la Invención, otorgado por MIT, con el Premio Kioto 2002 en Tecnología Avanzada, y con el Premio Lasker de 1987, por sus estudios sobre los mecanismos de la diversidad inmune. Ha publicado más de 500 artículos revisados por pares, ha logrado 14 patentes, y ha sido el coautor de algunos libros de texto en bioquímica, inmunología, biología molecular y genética. El Dr. Hood es miembro de la Academia Nacional de Ciencias, de la Sociedad Filosófica Americana, de la Asociación Americana de Artes y Ciencias y del Instituto de Medicina. El Dr. Hood también ha desempeñado un importante papel en la fundación de un gran número de empresas biotecnológicas, entre las cuales se encuentran Amgen, Applied Biosystems, Systemix, Darwin y Rosetta. Conferencia inaugural Análisis de expresión en la investigación genómica en cáncer Dr. Patrick O. Brown Universidad de Stanford, Stanford, CA, EUA Patrick O. Brown, M.D., Ph.D. El Dr. Brown es también Profesor de Bioquímica en la Facultad de Medicina de la Universidad de Stanford. Obtuvo sus títulos de licenciatura, maestría y doctorado de la Universidad de Chicago. Realizó su tesis de posgrado en colaboración con Nick Cozzarelli, el tema fue el estudio de los mecanismos de las topoisomerasas del ADN. Después de concluir su residencia en pediatría en el Hospital Children's Memorial de Chicago, empezó a estudiar los mecanismos de la integración retroviral dentro de su programa de postdoctorado en la Universidad de California, en San Francisco, en un trabajo conjunto con J. Michael Bishop y Harold Varmus. El Dr. Brown es miembro de la Academia Nacional de Ciencias. Patrick Brown utiliza los microarreglos de ADN - (laminillas de microscopio en las que se imprimen decenas de miles de genes en arreglos diminutos), con el fin de observar los genomas en acción. Él y sus colegas caracterizan sistemáticamente el guión genético que controla la expresión de nuestros genes, tanto en las células sanas que desempeñan sus funciones dentro de un desarrollo y fisiología normales, como en patologías tales como el cáncer. 14 Estructura del mapa de haplotipos en el genoma humano Dra. Stacey Gabriel Instituto Broad del Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT) Universidad de Harvard, Boston, MA, EU Directora de la Plataforma de Análisis Genético del Instituto Broad de la Universidad de Harvard y MIT, en Cambridge, MA. Directora Adjunta de Biología de Alto Rendimiento. Programa de Genética Médica y Poblacional. Centro para la Investigación del Genoma del MIT / Instituto Broad, Cambridge, MA. De Diciembre de 1998 a Enero del 2002 Científica Investigadora / Programa Gerencial de Genotipificación de Polimorfismos de un Solo Nucleótido (SNPs) en Genética Médica y Poblacional, Centro para la Investigación del Genoma del Instituto Whitehead, Cambridge, Egresada del Programa de Maestría del Departamento de Genética de la Universidad Case Western Reserve, en Cleveland, OH. Asesor: Aravinda Chakravarti, Ph.D., Asistente de Investigación del Departamento de Genética humana de la Universidad de Pittsburgh, en Pittsburgh, PA Implicaciones raciales y étnicas en la práctica médica Dr. Neil Risch Universidad de California en San Francisco, San Francisco, CA, EUA El Dr. Risch, genetista estadístico y epidemiólogo genético, participa en una serie de proyectos tanto de naturaleza teórica como aplicada. Sus estudios incluyen proyectos de genética clínica y genomica poblacional. Por ejemplo, uno de ellos consiste en la identificación de genes que subyace a las distonías de torsión. Hasta la fecha, el Dr. Risch y sus colaboradores han identificado varios genes para los subtipos específicos de distonía idiopática; sin embargo, aún no se han mapeado algunas de sus formas variantes. Sus investigaciones actualmente incluyen el mapeo adicional y la clonación posicional de estas formas variantes. El Dr. Risch también ha colaborado en importantes proyectos multicéntricos sobre la susceptibilidad genética a la hipertensión y las complicaciones de la enfermedad cardiovascular. Estos proyectos involucran el análisis de ligamientos, la clonación posicional y los estudios de asociación poblacionales. Recientemente, uno de estos estudios llevó a la identificación de las regiones en los cromosomas 6 y 21 mediante el análisis del desequilibrio en ligamiento de mezclas de sujetos afroamericanos hipertensos. El Dr. Risch planea expandir los estudios de mezclas a otros fenotipos cardiovasculares y metabólicos, tanto en sujetos de estudio afroamericanos, como hispanos. En colaboración con algunos colegas canadienses, el Dr. Risch ha emprendido un proyecto de colaboración sobre la susceptibilidad genética en la esclerosis múltiple. Estos estudios investigan ciertas hipótesis ambientales y genéticas. Dentro del campo de la genética, continúa examinando los proyectos de ligamientos y la clonación posicional de más de 1,000 familias de casos multiples, y emprendiendo nuevos estudios de genes candidatos, así como abordajes de desequilibrio del ligamiento. Uno de sus mayores intereses seguirá siendo el análisis de las contribuciones genéticas a la región del HLA. El Dr. Risch tiene varios estudios genéticos poblacionales en curso que examinan la relación entre la variación genética y las categorizaciones sociales tales como raza y etnicidad y la importancia de estas relaciones en la identificación de los factores genéticos que subyacen a las patologías comunes y complejas, así como formas más raras, Mendelianas. Colabora en proyectos sobre la genética del autismo, la enfermedad de Crohn y los trastornos genéticos en la población judía. 15 Conferencias magistrales Memorias del Congreso Conferencias magistrales II Congreso Nacional de Medicina Genómica Genómica de la obesidad humana Dr. Philippe Froguel Instituto Pasteur, Lille, Francia Philippe Froguel, MD, PhD. Egresado de la Facultad de Medicina de St Antoine en la Universidad Paris 6), y su doctorado en 1991 (Universidad Paris 7). En ese entonces era jefe del laboratorio de diabetes mellitus del Centro de Estudios de Polimorfismos Humanos (CEPH de Paris, cuyo director era el ganador del Premio Nobel, Dr Jean Dausset). Fungió como Secretario General del CEPH y fue miembro del consejo del centro genómico French Genethon. En 1995, asumió el puesto de Director de Genética Humana en el Instituto de Biología CNRS del Instituto Pasteur, en Lille, Francia. En el año 2000, fue nombrado Profesor de Genética Molecular y Diabetes Experimental en el Queen Mary College y fundó el Barts y el London Genome Centre. En el año 2003 empezó a impartir cátedra de Medicina Genómica en el Imperial College. En la actualidad, está a cargo del Departamento de Genética Médica y es Director del Centro del Genoma del Imperial College, ubicado dentro del Hospital Hammersmith donde se realiza secuenciación y genotipificación de DNA de alto rendimiento, microarreglos y proteómica. En el Reino Unido, Philippe Froguel trabaja en un programa sobre "obesidad poligénica" y en la nueva red clínica para la Diabetes del Sistema Nacional de Salud (NHS). Bases genómicas de las enfermedades cardiovasculares Dr. Stephen Liggett Universidad de Maryland, Baltimore, MD, EUA Obtuvo su título de Licenciatura en Física del Instituto Tecnológico de Georgia y su grado de Maestría de la Facultad de Medicina de la Universidad de Miami. Realizó estudios post doctorales en la Universidad de Washington en St. Louis y en el Centro Médico Howard Hughes de la Universidad de Duke. Fue Profesor Adjunto de Medicina y Farmacología en la Universidad de Duke, además de Profesor de la Cátedra Taylor de Medicina y Genética Molecular y Profesor Investigador Universitario Distinguido en la Facultad de Medicina de la Universidad de Cincinnati. En la actualidad, es Profesor de Medicina y Fisiología, además de Director del Programa de Genómica Cardiopulmonar en la Facultad de Medicina de la Universidad de Maryland, en Baltimore. Sus principales áreas de interés son la biología molecular y la genética de los receptores acoplados de la proteína G. 16 Medicina genómica: Tendencias emergentes en ética Dra. Ellen Wright Clayton Universidad de Vanderbilt, Nashville, TN, EUA Profesora de la Cátedra Rosalind E. Franklin de Genética y Políticas de Salud Profesora de Pediatría Profesora de Derecho Co-Directora del Centro para la Ética Biomédica y la Sociedad Ellen Wright Clayton, MD, JD, es Profesora de la Cátedra Rosalind E. Franklin de Genética y Políticas de Salud, además de Profesora de Pediatría, Profesora de Derecho y Sub Directora del Centro para la Ética Biomédica y la Sociedad, en la Universidad de Vanderbilt. Egresada de las Universidades de Duke, Stanford, Yale y Harvard, la Dra. Clayton ha dedicado más de un cuarto de siglo al estudio de las implicaciones de nuestro cada vez mayor conocimiento sobre la genética. Durante todo este tiempo, ha ocupado el puesto de Vicepresidenta del Grupo de Trabajo sobre las Implicaciones Sociales, Legales y Éticas del Proyecto Internacional HapMap, ha sido también miembro del National Advisory Council for Human Genome Research (Consejo Consultor Nacional para la Investigación del Genoma Humano), del Social Issues Committee of the American Society of Human Genetics (Comité para Asuntos Sociales de la Sociedad Americana de Genética Humana) y de dos comités del Instituto de Medicina relacionados con la genética, a la vez que ha fungido como la asesora experta en genética para el Council of International Organizations of Medical Sciences (Consejo de Organizaciones Internacionales de las Ciencias Médicas) encargada de la revisión más reciente de los Lineamientos Éticos Internacionales para la Investigación Biomédica en Seres Humanos (International Ethical Guidelines for Biomedical Research Involving Human Subjects). Sus principales áreas de interés actualmente incluyen la ética en la investigación internacional, con particular énfasis en los biobancos, la genética y las poblaciones vulnerables, así como el impacto psicosocial de las pruebas genéticas moderadamente predictivas y el desarrollo de políticas para el tamizaje neonatal. Predisposición genómica a las adicciones Dr. George R. Uhl Instituto Nacional de Adicciones Institutos Nacionales de Salud, en Baltimore, MD, EUA M.D., Ph.D., de la Facultad de Medicina de la Universidad Johns Hopkins, 1979 / 1978 Institutos Nacionales de Salud NIDA IRP MNRB El Dr. Uhl trabaja en la definición y el estudio de los productos de a) los genes que contienen variantes alélicas humanas que confieren vulnerabilidades de adicción a los seres humanos, b) los genes que están regulados por las sustancias de abuso c) los genes cuyos productos son importantes para la recompensa activada por las sustancias de abuso y d) los genes implicados en aquellos rasgos de la adicción que son similares a la memoria. Ha realizado estudios que han definido los roles del transportador de dopamina y el receptor opioide mu en la recompensa activada por los estimulantes y los opiáceos, estudios que han definido las funciones de las variantes alélicas humanas en varios genes candidatos en la vulnerabilidad a la adicción y en otros fenotipos humanos, así como en estudios que han sido pioneros y han utilizado novedosos abordajes de barrido genómico con base en la asociación, a fin de encontrar variantes genéticas relacionadas con la adicción. Sus intereses en el área de la Investigación: Abuso de las Drogas y el Alcohol, Genética y Genoma Humano, Biología Molecular, Neurociencias y Enfermedades Degenerativas, Farmacología / Fisiología, Psiquiatría / Salud Mental. 17 Conferencias magistrales Memorias del Congreso Conferencias magistrales II Congreso Nacional de Medicina Genómica Novel approaches to identify all functional elements in the human genome Dr. Eric Green NIH Intramural Sequencing Center National Human Genome Research Institute National Institutes of Health Bethesda, MD, USA Dr. Green's research focuses on three major areas: (1) sequencing and comparing targeted stretches of DNA from a wide variety of species en route to unraveling the complexities of genome function, (2) developing innovative research tools and technologies for performing genome analysis, and (3) identifying and characterizing genes associated with human disease. In his multiple roles as Scientific Director of NHGRI, Chief of the Genome Technology Branch, and Director of the NIH Intramural Sequencing Center (NISC) [nisc.nih.gov], he has fundamental interests in mapping, sequencing,and interpreting vertebrate genomes. The major activities in Dr. Green's laboratory, performed in partnership with NISC, center on a novel comparative sequencing program. Specifically, targeted regions of the human genome are selected and then mapped and sequenced in multiple other vertebrates, including a diverse set of primates, numerous other mammals (including marsupials and monotremes), birds, fish, amphibians, and reptiles. The resulting data sets are providing unprecedented abilities to perform evolutionarily diverse sequence comparisons. Farmacogenómica y terapéutica farmacológica individualizada Dr. William E. Evans Hospìtal Pediátrico de Investigación St. Jude, Memphis, TN, EUA El Dr. William E. Evans es Director y Presidente del Consejo del St. Jude Children's Research Hospital (SJCRH), así como Primer Profesor de la Cátedra Tennessee Bank en las Facultades de Medicina y Farmacología de la Universidad de Tennessee. Durante los últimos 30 años, su labor de investigación en el Hospital St. Jude se ha concentrado en la farmacogenómica de los agentes anticáncer en los niños, por lo cual el Instituto Nacional contra el Cáncer le ha otorgado tres Reconocimientos al Mérito NIH (Institutos Nacionales de Salud) consecutivos. Su investigación en el área de la farmacogenómica ha prestado particular interés a una enfermedad, la leucemia linfoblástica aguda infantil. El Dr. Evans es el autor de más de 300 artículos y capítulos de libros, así como el editor de varios libros de texto y publicaciones científicas, y ha sido galardonado con premios nacionales por sus investigaciones. En el año de 2002, pasó a formar parte del Instituto de Medicina de la Academia Nacional de Ciencias. 18 Proteómica: Una ventana hacia la función y disfunción en biología Dr. Daniel C. Liebler Centro Médico de la Universidad de Vanderbilt, en Nashville, TN, EUA Director del Instituto Jim Ayers para la detección y el Diagnóstico del Precáncer, Centro para el Cáncer Vanderbilt-Ingram (2006), Southwest Environmental Health Sciences Center, University of ArizonaDirector, Analytical Core Laboratory, Southwest Environmental Health Sciences Center and Arizona Cancer Center, University of Arizona Assistant Professor, 1993-98 Associate Professor, 1998present, Professor, Department of Pharmacology & Toxicology, College of Pharmacy, University of Arizona, Tucson, AZ. Director de Proteómica del Centro de Investigación de Espectrómetro de Masas (Mass Spectrometry Research Center), Profesor de la Facultad de Medicina en la Universidad de Vanderbilt, Director de los Departamentos de Bioquímica, Farmacología e Informática Biomédica en la Facultad de Medicina de la Universidad de Vanderbilt, Director del Centro de Ciencias de la Salud Ambiental del Suroeste de la Universidad de Arizona, Sub Director de los Departamentos de Bioquímica, Farmacología e Informática Médica de la Facultad de Medicina en la Universidad de Arizona, Profesor Adjunto del Centro de Ciencias de la Salud Ambiental del Suroeste y del Arizona Cancer Center, Analytical Core Laboratory, De 1993 a 1998 Profesor Adjunto, De 1998 a la fecha, Profesor del Departamento de Farmacología y Toxicología en el College of Pharmacy de la Universidad de Arizona, en Tucson, AZ. Integrando genética, genómica y biología hacia una medicina mas individualizada Dr. Jeffrey Trent Instituto de Investigación en Genómica Translacional (TGen), en Phoenix, AZ, EUA El Dr. Jeffrey Trent es Presidente y Director Científico del Instituto de Investigación de Genómica Translacional, o TGen. La misión del TGen es realizar descubrimientos genómicos y traducirlos en avances dentro del campo de la salud humana. Con el fin de alcanzar este objetivo, el TGen está integrando un importante equipo de científicos de laboratorio, expertos en informática, ingenieros biomédicos y asociados clínicos, quienes aprovecharán el conocimiento adquirido a partir del Proyecto del Genoma Humano para crear descubrimientos prácticos que, en última instancia, habrán de ayudar a diagnosticar y tartar un gran número de enfermedades. Este estilo de vinculación entre la ciencia y la medicina ha dado origen a una nueva visión de la investigación mucho más cercana al paciente, que está modificando la manera en que percibimos la enfermedad. Antes de fundar TGen, el Dr. Trent había prestado sus servicios durante diez años en el instituto de investigaciones biomédicas más grande del mundo el Instituto Nacional de Salud en Bethesda, Maryland. Ahí fundó y dirigió la división de laboratorios de la agencia federal encargada de la coordinación y finalización del Proyecto del Genoma Humano. Antes de ocupar su puesto en el NIH, el Dr. Trent impartió cátedra en la Universidad de Michigan y estuvo a cargo del Comprehensive Cancer Center (Centro Integral para el Cáncer) de esta misma universidad. Había tenido puestos similares previamente en el Arizona Cancer Center de Tucson. El Dr. Trent ha dedicado su vida profesional a la lucha contra el cáncer. Su carrera en el campo de la investigación ha dado como resultado una mayor comprensión sobre la base genética del cáncer y ha llevado a mejores diagnósticos y tratamientos, que resultan de mucha mayor eficacia para quienes luchan contra el cáncer de mama, el melanoma y otras formas de esta debilitante enfermedad. Es el autor de más de 300 manuscritos dentro de la literatura científica, ha recibido numerosos premios y reconocimientos, y forma parte de los consejos editoriales de una docena de publicaciones de carácter científico. 19 Conferencias magistrales Memorias del Congreso Conferencias magistrales II Congreso Nacional de Medicina Genómica Biología de sistemas, medicina genómica y el futuro del cuidado de la salud Dr. Leroy Hood The Human Genome Project has catalyzed fundamental changes in the practice of biology and medicine. One of these has been to generate a genetics parts list that includes all human genes (and by inference all human proteins). Analysis of the information from the Human Genome Project has also catalyzed the view that “biology is an informational science.” Together, these advances have promoted the idea of systems biology—the view that biology can only be understood through an analysis of the information processing of biological machines and networks. The corresponding systems view of disease has catalyzed revolutionary changes in how to think about diagnosis, therapy and even prevention. Fueled by dramatic changes in in vitro and in vivo measurement technologies, systems medicine is pushing toward a revolution in health care—one that over the next 5-20 years will lead away from the current reactive medicine (wait until one gets sick before treating) to a medicine that is predictive, preventive, personalized and participatory. Increasingly, the focus will be on wellness rather than disease. P4 medicine will require billions of measurements on each patient and the means of reducing these measurements to coherent hypotheses about the health and disease of individual patients. How the acquisition, storage, mining, integration (of different data types), modeling and eventually distribution of the data and the resulting inferences will occur will be one of the grand challenges of this future in health care. Security and access will be critical considerations. This P4 medicine will catalyze fundamental changes in virtually every aspect of the healthcare system and it will require rethinking the educational requirements for physicians. It will lead to the digitalization of medicine with changes even more profound than the digitalization of information technologies and communications. It will also lead to a turn around in the inexorably increasing healthcare costs—with the possibility of bringing developed world medicine to the developing world. Medicine will truly become an informational discipline—with the enormous potential for individuals to take an active role in helping to guide their future health choices. The digitalization of medicine will transform the computational requirements of health care in ways that we can only begin to imagine. which is the main risk factor for T2D but may also be metabolically “neutral” depending of the genetic background. To unravel the molecular basis of obesity and T2D, Whole Genome Scans based on association studies using high density SNP microarrays now offer a unique opportunity to screen up to 70% of the human genome In collaboration with McGill University and Genome Canada, we have been recently completed in the French population an association WGS in 1,500 diabetic subjects followed by a replication of best results in 5,500 additional samples. Our data show potential breakthroughs in the etiologies of T2D. Especially, we have now strong and replicated indication for the role of genes involved in glucose homeostasis through their pivotal role in the WNT pathway or in insulin exocytosis. These data and their implication for T2D and obesity physiology will be discussed. The identification of potent biomarkers predicting the development of severe forms of obesity, T2D and vascular complications is now an achievable task in the near future. Genomic Medicine based on these discoveries should lead to very important progress for the assessment of the obesity risk for health and to breakthroughs in the treatment of metabolic diseases. Medicina genómica: Tendencias emergentes en ética Dra. Ellen Wright Clayton As genomic medicine is incorporated into clinical care, questions that were merely hypothetical in the past are becoming real. Using examples such as newborn screening, pharmacogenomics, ethnopharmacology, direct to consumer advertising and sales, nutrigenetics, and growing appreciation of the complexity of the interactions among genes, behavior and the environment, this talk will address current perspectives on the following questions. Whose benefit matters in deciding how to make genomic medicine available? What risks are posed by how genomic medicine is actually implemented? Differential access remains a concern, particularly when viewed on a global scale. Numerous actors – patients, clinicians, testers, regulators, payers — have a role in shaping the scope of genomic medicine. What roles should these actors play, and how effective can they be? A final question will be how to use genomic knowledge to understand and intervene in interactions with behavior and the environment. Genómica de la obesidad humana Dr. Philippe Froguel Novel approaches to identify all functional elements in the human genome Dr. Eric Green Twin and family studies have shown that polygenic forms of obesity have a genetic basis (explaining 50-70% of the variance of the BMI), especially in children. Apart from rare monogenic recessive forms of human obesity caused by mutations in leptin and its receptor, prohormone convertase 1 and POMC (alpha and beta MSH), most monogenic early onset obesity are autosomal-dominant due to mutations in the melanocortin 4 receptor, with a prevalence of 2–5%. Several candidate genes have been proposed such as adrenergic receptors but their effect is at best modest. Recently, positional candidate gene studies have revealed variants contributing to both obesity and associated type 2 diabetes (“diabesity”) in the ACDC/AdipoQ gene encoding for the adipokine adiponectin and in ENPP1 encoding for the insulin receptor inhibitor PC-1, which both contribute to childhood and adult obesity but have an inverse effect on associated insulin resistance and risk of diabetes. In this context, variation in the Cannabinoid Receptor 1 have been found to predispose to obesity and to various components of the metabolic syndrome. These studies partially explain the phenotypic heterogeneity of obesity The comparison of genomic sequence generated from different extant vertebrates has emerged as a powerful strategy for identifying functionally important regions of the human genome. As a complement to ongoing efforts to sequence entire genomes, the NISC Comparative Sequencing Program is pursuing multispecies genome explorations by sequencing and analyzing the same orthologous regions in many different vertebrates. To date, we have generated over 1 Gb of comparative sequence data from more than 65 different species. Comparative analyses of these data are revealing important insights about the patterns of sequence conservation among species. In particular, we are developing approaches for utilizing multi-species sequence comparisons to identify highly conserved non-coding sequences, which likely correspond to regulatory and other functionally important elements. In addition, we are examining the relative contributions of different species’ sequences for identifying such highly conserved regions; for example, this has included some interesting comparisons involving eutherian versus non-eutherian mammals. We are also 20 investigating the quality of genomic sequence that is needed for identifying evolutionarily conserved regions in a reliable fashion. The majority of our Program is now dedicated to generating comparative sequence data for the ENCODE project, a large, consortium-based effort that aims to establish a complete catalog of functional elements within a selected 1% (~30 Mb) of the human genome. This project is allowing important integration of experimental and computational data sets in a fashion that is providing new insights about the functional roles of evolutionarily conserved sequence elements, in particular those corresponding to non-coding sequences. Together, our studies should advance the utility of comparative sequence analyses and make important contributions towards unraveling the functional and evolutionary complexities of the human genome. Proteómica: Una ventana hacia la función y disfunción en biología Dr. Daniel C. Liebler Protein thiols are targets for alkylation damage by reactive electrophiles associated with inflammation, degenerative diseases and chemical toxicity. The objective of our studies is to identify protein targets of reactive electrophiles and map the adducts at the level of amino acid sequence. A major challenge in characterizing adducts is the relatively low abundance of adducts in complex proteomes. To circumvent this problem, we have employed biotin-tagged electrophiles as model electrophiles. Analysis of human cytoplasmic, nuclear endoplasmic reticulum (ER) and mitochondrial protein targets of two different thiolreactive electrophiles identified approximately 2,000 cysteine targets, which mapped to over 1,200 proteins. Targeting was selective and reproducible, yet differed markedly between electrophile structures. Selective modification of several protein domain structures and motifs indicates that certain protein families are particularly susceptible to alkylation. Approximately 15% of the total identified targets were consistently modified by both electrophiles and we hypothesize that these thiol targets represent systems that are critically susceptible to damage by diverse electrophiles. Other studies of the oxidant and electrophile sensor protein Keap1 and the signaling regulator protein phosphatase 2A have revealed how differences in site-selective adduction dictate the molecular consequences of damage. Selective protein adduction underlies the induction of stress responses, including the activation of c-Jun-N-terminal kinase (JNK), the induction of stress response genes regulated by the transcription factor Nrf2, the ER stress response and the induction of apoptosis. Studies of these are underway to provide insights into stress adaptation and apoptosis in toxicity and disease. using very high throughput RNAi to systematically knockdown genes, and determine the functional role of each gene in various cellular processes including cell growth, survival, molecular end points, and drug response. The computational ‘fusion’ of multidimensional data sets to integrate structural, functional, and cellular genomic information has proven to be a very powerful strategy for generating new predictive models of context dependent targeting. In oncology, this research has led to the discovery of context specific vulnerabilities, enabling us to prioritize pharmacologically and clinically relevant drug targets and support more personalized medicine oriented drug discovery. Additionally, we have shown that this approach can lead to the discovery of genes that are casually involved in determing specific response to cancer drugs. These genes are currently being advanced as candidate predictive markers to select patient populations that would respond to specific cancer drugs, and as putative combination targets to enhance response in patients that are not responding. Such information can improve and accelerate the clinical development of emerging cancer therapies. This strategy represents a new paradigm for both drug discovery and drug development, and has the potential to some day impact on how therapeutic decisions are made. Integrando genética, genómica y biología hacia una medicina mas individualizada Dr. Jeffrey Trent Genome wide profiling of gene states (structure, expression, et cetera) has emerged as a means for molecularly defining disease. The next challenge is to match the specific molecular context of disease with the most appropriate therapy. Systems medicine is emerging as a new field of research, which seeks to identify contextual vulnerabilities that arise in disease context. Towards this end, TGen has developed and applied a number of genome wide and genome compatible technologies and strategies to both profile the disease context (structural and functional genomics), as well as profile context selective drug targeting (cellular genomics). Our group has focused primarily on cellular genomics 21 Conferencias magistrales Memorias del Congreso Simposia II Congreso Nacional de Medicina Genómica Simposia Simposio 1. Enfermedades multifactoriales I Coordinadora: Dra. Clara Gorodezky Instituto Nacional de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos Mapa de haplotipos de los mexicanos Dr. Alfredo Hidalgo Miranda, INMEGEN México desarrolla una plataforma de medicina genómica para mejorar el cuidado de la salud de los Mexicanos. Un componente clave en este esfuerzo es la generación del mapa de haplotipos de su población. Esfuerzos similares se llevan a cabo en otras poblaciones del mundo para identificar etiquetas de polimorfismos de un solo nucleótido (“tag SNPs”), lo que disminuirá el número de variantes a analizar, sin perder resolución ni cobertura en estudios de asociación en enfermedades comunes. En la actualidad más del 80% de la población Mexicana se considera Mestiza, una mezcla entre cualquiera de los más de 62 grupos indígenas y los españoles que se inició hace 500 años durante la conquista. Estas características pueden complicar el análisis de los resultados de estudios de asociación dada la presencia de estratificación en las poblaciones analizadas. Tomando en consideración los puntos anteriores, el Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) puso en marcha en junio de 2005 el proyecto “Variabilidad Genómica y Mapa de Haplotipos de la Población Mestiza Mexicana”, con la finalidad de analizar los similitudes y diferencias en el genoma de la población de diversas regiones de nuestro país y comparla con aquella de otras regiones del mundo. Las muestras analizadas son de participantes voluntarios en las “Jornadas para la elaboración del Mapa Genómico de los Mexicanos”, provenientes de seis estados de la República (Guanajuato, Guerrero, Sonora, Veracruz, Yucatán y Zacatecas). Estas Jornadas involucraron un proceso de consentimiento tanto a nivel comunitario, a través de las autoridades políticas, educativas y de salud en cada estado, como a nivel individual, a través de la publicación del consentimiento informado en las Universidades estatales y presentaciones públicas del proyecto días antes de la Jornada de colecta. A la fecha, el banco del INMEGEN contiene ~1,200 muestras de DNA purificadas y codificadas usando códigos de barras que aseguran el anonimato del donante. Un grupo de 300 de estas muestras han sido genotipificadas utilizando microarreglos de alta densidad de Affymetrix, que permiten analizar 116,000 SNPs en cada una de ellas (100K). Asimismo, se tiene mas de un 50% de avance en el análisis de las 600 muestras planteadas incialmente en el proyecto usando microarreglos de 500,000 SNPs (500K). Desde febrero de 2005 a la fecha, la Unidad de Genotipificación y Análisis de Expresión ha procesado más de 1,500 microarreglos, totalizado más de 150 millones de genotipos, con un promedio en el porcentaje de SNPs genotipificados >99.5% para el caso del 100K y >96% para el 500K. Nuestros datos han sido comparados con aquellos generados por el Proyecto Internacional del HapMap usando diferentes herramientas bioinformáticas para analizar patrones de desequilibrio de ligamiento en relación a distancias físicas sobre el genoma, análisis de ancestría, polimorfismos de número de copias y relaciones genéticas entre las poblaciones, entre otras cosas. Los resultados de estos análisis sugieren que el tamaño de los bloques de haplotipos en los Mexicanos parece ser similar al de las poblaciones no africanas analizadas en el 22 HapMap internacional. Sin embargo, la presencia de un menor porcentaje de marcadores con baja frecuencia alélica indica una mayor heterogeneidad genética en el contenido de esos bloques, sugiriendo que la población Mexicana podría presentar “tag SNPs” particulares. Los análisis de ancestría han permitido identificar marcadores que contribuirán a fortalecer la investigación clínica mediante la estratificación genómica de la población, mejorando de forma importante los resultados de los estudios de asociación a enfermedades comunes en población Mestiza mexicana. El análisis de número de copias ha identificado regiones polimórficas donde se alojan genes relevantes para la salud humana. En resumen, este esfuerzo constituye el análisis mas profundo y con mayor cobertura del genoma que se haya realizado a la fecha de la población Mestiza Mexicana y sus resultados iniciales aportan herramientas que serán de utilidad para mejorar el cuidado de la Salud de nuestra población. Predisposición genómica a diabetes mellitus M.C. Ruth Gutiérrez, Institute Pasteur, París Introducción: Recientemente, se ha demostrado que el factor transcripcional KLF11, inducible por TGF-, afecta la regulación transcripcional del gen de la insulina. Variantes genéticas del gen KLF11 están asociadas a la diabetes mellitus tipo 2 (DMT2) en la población francesa, incluyendo la variante Q62R y la del promotor –1659G>C (p-SNP) que se encuentran en LD completo. El objetivo de este trabajo es la replicación del estudio de las variantes de KLF11 asociadas a la DMT2 en la población danesa y la regulación transcripcional de KLF11 afectada por p-SNP. Este SNP se encuentra situado en una secuencia putativa de unión de RBP-Jk o STAT3 ((G>C)TGGGAA). La transición G>C de pSNP predice una pérdida de la unión de los factores de transcripción anteriormente mencionados. RBP-Jk juega un rol muy importante en la vía de senalización de Notch en la diferenciación endócrina de las células -pancreáticas. Por otra parte, STAT3 es necesario para la regulación de la gluconeogénesis en hepatocitos. Materiales y métodos: Para hacer este estudio se genotipificó la variante Q62R en 4,443 individuos con tolerancia normal a la glucosa (TNG), 491 individuos con deterioro de la glucosa en ayuno, 679 individuos con intolerancia a la glucosa, 251 nuevos diabéticos y 118 sujetos con historia de DMT2 (INTER 99 cohorte) y se analizó su asociación con rasgos cuantitativos asociados a la glucosa. Por otra parte, se analizaron las proteínas nucleares capaces de unirse a la secuencia de p-SNP por medio de retardamiento en gel (EMSA). Se clonó el promotor de KLF11 conteniendo la secuencia salvaje o mutante de p-SNP en el vector pGL3-luciferase y se obtuvo la actividad relativa de luciferasa. Resultados: En los sujetos TNG el alelo 62R está asociado significativamente a niveles más altos de insulina en ayuno, niveles elevados del péptido C en ayuno, así como incremento de los índices de resistencia a la insulina HOMA (P= 0.00004, P= 0.006 and P=0.00002, respectivamente). Se demostró que un complejo proteíco se une al alelo salvaje de p-SNP, el cual no se observa en el alelo mutante. Nuestros resultados prueban que STAT3 está presente en este complejo. El análisis de la actividad del promotor de KLF11 muestra una inhibición del alelo salvaje G comparado al alelo mutante C, sugiriendo que p-SNP afecta la expresión de KLF11. Conclusión: KLF11 está asociado a la resistencia a la insulina en la población danesa. El hecho que p-SNP altere la asociación de STAT3 y reprima al promotor de KLF11 sugiere que la regulación de esta proteína juega un rol importante en la sensibilidad de la glucosa en el hígado, lo cual pudiera explicar la asociación de KLF11 a la resistencia a la insulina. Diversidad del genoma humano Dr. Andrés Moreno, Univ. Pompeu Fabra, Barcelona La diversidad genética humana ha sido moldeada por diferentes procesos biológicos e históricos durante la evolución de nuestra especie, dando lugar a una compleja variación fenotípica entre individuos y entre poblaciones, incluyendo diferencias de susceptibilidad a enfermedades multifactoriales. Sabemos que el genoma de dos individuos varía en un pequeño porcentaje que puede explicar estas diferencias, y a su vez, que el genoma humano diverge del de otras especies cercanas al acumular cambios que también nos informan de la composición genética que nos caracteriza como humanos. En este proceso la selección positiva juega un papel fundamental, ya que puede ser responsable de la mayoría de innovaciones funcionales ocurridas en el linaje humano después de su separación de la rama del chimpancé. Con las técnicas de genotipado disponibles actualmente, es posible detectar la huella que la selección positiva deja en los genomas a nivel molecular. Esto ha demostrado ser una buena estrategia para encontrar variaciones funcionales, incluyendo caracteres específicos de especie, variantes asociadas a la resistencia de enfermedades o a diferentes respuestas farmacológicas; por lo cual se ha convertido en un área de especial interés en evolución y recientemente en biomedicina. En el presente estudio utilizamos datos inter e intra específicos para seleccionar genes con evidencias de una evolución acelerada en el linaje humano y genotipar SNPs de dichas regiones en poblaciones humanas representativas de la variación genética mundial (provenientes del Human Genome Diversity Cell Line Panel, HGDP-CEPH). Un total de 365 SNPs de 19 genes han sido genotipados en 1049 individuos de 39 poblaciones diferentes con la tecnología de SNPlex. Además de analizar parámetros de diversidad genética poblacional, hemos aplicado diferentes métodos para detectar señales compatibles con selección positiva: diferenciación poblacional (FST), distribución de frecuencias alélicas menores (MAF), distribución de frecuencias alélicas derivadas (DAF) y homocigosidad haplotípica extendida (EHH). Los resultados muestran una alta conservación en este grupo de genes, en general no hay señales de selección diferencial entre poblaciones. Algunos genes, como el receptor olfativo OR5I1, parecen estar bajo selección positiva en todas las regiones geográficas, probablemente debido a su importancia funcional para la fisiología humana. Variaciones genómicas y riesgo cardiovascular Dr. Eros Balam Ortiz, INMEGEN Introduction. Cardiovascular diseases are the leading cause of death in Mexico and constitute an important finantial burden to its Health Care System. The B1-adrenergic receptor (ADRB1), the B2-adrenergic receptor (ADRB2) and angiotensin-II receptor type 1 (AGTR1), mediate the effects of endogenous catecholamines and angiotensin II, increasing heart rate, contractility, renin release and lipolysis. Recent studies1,2 have shown that SNPs in those genes influence the risk for cardiovascular disease and the therapeutic response to antagonist of B1, B2 and angiotensin II receptors. ADRB1, ADRB2 and AGTR1 genes are located in chromosome 10q23-24, 5q31-32 y 3q21-25, and encode proteins of 477, 668, 359 amino acids, respectively. Here we describe allele frequencies of 8 SNPs in 5 Mexican Mestizo populations, allele distribution and comparison with populations included in the Internacional HapMap Project, as well as calculations of the unphased LD between them. Materials and Methods. We obtained genomic DNA from Mexican Mestizo blood simples. Volunteers were from 6 geographically distant states in Mexico: Zacatecas (ZAC), Sonora (SON), Yucatan (YUC), Veracruz (VER), Guerrero (GRO) and Guanajuato (GTO). We genotyped 8 polymorphisms in three genes: ADRB1 (145A>G and 1165C>G); ADRB2 (46A>G, 79C>G, and 491C>T); AGTR1 (43732C>T, 44221 A>G and 44325A>C), in 184 individuals from each population (n=1,104) using direct allelic discrimination with TaqMan probes on a 7900HT RT-PCR System (AB, USA). We determined alllelic frequencies, Hardy Weinberg equilibrium as well as differences beetwen populations using twosided Fisher Exact Test, P < 0.05 was considered statistically significant. Unphased haplotypes and linkage disequilibrium (LD) measurements (D’ and R2) were determined using the Gabriel´s Method3 and Haploview. Results. Table 1 shows MAFs of 7 SNPS in the ADRB1, ADRB2 and AGTR1 genes in 6 Mexican Mestizo Populations. These variants are in HW equilibrium in the studied populations. Comparative analysis between mestizo populations show differences when were compares between them, these results are show in Table 2a, 2b, 2C. Comparative analysis of genotypic frequencies in these genes between Mestizos and other populations is shown in Table 3. All the SNPs but one show significant differences with Caucasians (CEU), Han Chinese (CHB), Japanese (JPT) and Yorubas from Africa (YRI) from the international HapMap, only 491C>T (ADRB2), showed no differences between these populations. Unphased haplotypes and analysis of linkage disequilibrium (LD) between 145A>G and 1165C>G (1 Kb) in these Mestizo populations was calculated. The degree of LD show significant variations between groups; the ZAC population show complete LD. In contrast, Population from GRO show very low LD. Discussion. The modern Mexican Mestizo population resulted from admixture of Spaniards, several native ethnic groups from Mesoamerica and African groups, in the last 500 years. The geographical distribution of these groups differ significantly within the country. Comparative analysis of these polymorphisms among 6 mestizo populations from distant parts of Mexico showed significant MAF differences in some cases. When we compared this data with that of the International HapMap Project, we found that Mexican Mestizo populations have particular genotypic frequencies in these loci. Moreover, analysis of haplotype distribution show different patterns among Mexican groups. Particulary, the ZAC population show the highest degree of LD and the GRO population the lowest LD. The latter is similar to LD found in the YRI population from Africa in International HapMap Project that showed a site of recombination between those two variants.This is consistent with the fact that GRO is one of the states of Mexico with the highest African ancestral contribution. Our data support differences in these loci between Mexicans Mestizo populations and those populations studied by the HapMap. At these loci, differences too support genetic stratification between mestizo populations that can influence results in genetic association studies. Similar differences in functional SNPs related to cardiovascular disease may arise as we continue to systematically analyze the genomic structure of the Mestizo population of Mexico. Our data support the notion that Mestizo populatins in Latin America conserve SNPs frequencies that differ from those in other populations, including functional polymorphisms associated to cardiovascular disease and drug response. Differences between Mexicans groups support genetic stratification between Mestizo populations that can influence results in genetic association studies. Similar differences in functional SNPs related to other common disease, may arise as we continue to systematically analyze the genomic structure of the Mestizo population of Mexico. 23 Simposia Memorias del Congreso Simposia II Congreso Nacional de Medicina Genómica Simposio 2. Enfermedades multifactoriales II Coordinador: Dr. David Kershenovich Facultad de Medicina, UNAM Rasgos metabólicos asociados a diabetes mellitus Dra. María Teresa Tusié, INCMyNSZ Genómica del Síndrome Metabólico Dra. Margarita Terán, Pennington Biomed Res Ctr The concept of a metabolic syndrome (MetS), a cluster of preclinical metabolic alterations commonly associated with obesity, is the object of much debate. Is the MetS a true disease? Genetic studies have the potential to contribute to some of the key questions including the factual nature of the cluster of pre-clinical features and whether it is associated with human genetic variation. Information for the familial aggregation of individual components of MetS and an overview of the studies that have dealt with candidate genes will be presented. Genome-wide linkage scan data for the principal components of the MetS in the HERITAGE Family Study will be used as an example. In addition, highlights from recent published data will be discussed. Further progress in the understanding of the genetic basis of MetS should occur as soon as a consensus is reached on the true nature of MetS, its components and diagnostic criteria. The debate is largely fueled by two differing schools of thoughts, one promoting an “insulin/ glucocentric”, the other a “cardio/lipocentric” approach to the MetS concept. It could be assumed that obesity, ectopic fat deposition and abnormal adipose tissue metabolism are responsible for alterations in lipid metabolism. In turn, this disarranged metabolism generates the commonly observed pre-clinical shifts in glucose tolerance, lipids and lipoprotein profile, blood pressure, inflammatory markers, endothelial function and prothrombotic state that progress to a clinical condition. The MetS challenge dwells in distinguishing among genes involved in its predisposition, development and or causality and further understanding their physiopathologic role. Degeneración macular asociada a la edad Dra. Irma Silva Zolezzi, INMEGEN La degeneración macular asociada a la edad (DMRE) es la causa más común de pérdida de visión entre personas de más de sesenta años. Esta enfermedad se caracteriza por pérdida progresiva de la visión central, causando disminución de la agudeza visual debido al deterioro de la mácula, parte central de la retina del ojo rica en células fotosensibles. Existen dos formas avanzadas de DMRE: atrofia geográfica (seca) y neovascularización coroidea (húmeda), que pueden ocurrir en uno o ambos ojos. Existe poco conocimiento sobre los mecanismos moleculares involucrados en el desarrollo de DMRE, sin embargo, recientemente diversos estudios permitieron identificar dos genes asociados a la enfermedad, cada uno con una contribución importante pero independiente: El factor H del complemento (CFH) en población blanca no-hispánica y la proteína hipotética LOC387715 (LOC387715) (NCBI Build 35.1) en población blanca. Con la finalidad de evaluar la participación de CFH y LOC387715 en el desarrollo de DMRE en población mestiza mexicana, se genotipificaron cuatro polimorfismos de un solo núcleotido (SNPs) previamente asociados a DMRE en un grupo de pacientes y un grupo de controles poblacionales. Para realizar el estudio de casos y controles de utilizaron muestras de sangre total de 72 pacientes mestizos no relacionados, con alguna de las dos formas de DMRE avanzada de un hospital oftalmológico del Distrito Federal, y 300 controles 24 poblacionales provenientes de 6 regiones del país (Guanajuato, Guerrero, Sonora, Veracruz, Yucatán y Zacatecas). El DNA genómico se extrajo del paquete de células blancas por métodos convencionales (QIAamp DNA Blood Maxi Kit, QIAGEN, Alemania). Posteriormente, se genotipificaron tres SNPs del gen CFH, dos intrónicos (rs1410996, rs380390) y la variante Y402H (rs1061170); y un SNP en LOC387715 (rs10490924) mediante ensayos de discriminación alélica, usando sondas TaqMan® (Applied Biosytems, EUA). Para todos los SNPs se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas, y se evaluó si se encontraban en equilibrio de Hardy-Weinberg en la población control mediante una prueba exacta de Fisher. Las pruebas de asociación se realizaron mediante un análisis de chi-cuadrada. Los resultados obtenidos mostraron una asociación significativa después de corregir por Bonferroni (p<0.0125) de dos SNPs, el rs1061170 (Y402H) de CFH (OR=6.076, C.I. [1.567-23.557], p=0.003); y el rs10490924 de LOC387715 (OR=6.222, C.I. [2.98112.986], p=1.679x10-07) con DMRE avanzada. En el caso de los otros dos SNPs analizados no se encontró asociación significativa con DMRE. Los resultados obtenidos sugieren que CFH y LOC387715 contribuyen al desarrollo de DMRE avanzada en la población mestiza mexicana de manera similar a lo que ocurre en otras poblaciones. Para confirmar estos resultados e identificar loci adicionales asociados a la susceptibilidad a DMRE en la población mestiza mexicana, se está realizando un estudio de asociación de genoma completo con aproximadamente 115,000 SNPs utilizando microarreglos de oligonucleótidos (GeneChip® Human Mapping 100K Set, Affymetrix, EUA). Genómica de las enfermedades autoinmunes Dra. Lorena Orozco, INMEGEN Introducción: Los mecanismos patogénicos responsables de la autoinmunidad aún no están bien dilucidados. Diversos estudios han demostrado que las enfermedades autoinmunes (EAs) son de origen multifactorial, donde la predisposición genética es el principal factor implicado en su etiopatgenia. Se estima que estas entidades afectan el 4-5% de la población, predominando generalmente en el sexo femenino. Recientemente, diversos estudios han identificado varios genes que han mostrado evidencia de asociación alélica con las EAs de inicio en la etapa adulta, sin embargo estos estudios no han sido replicados en todas las poblaciones y en edad pediática se conoce muy poco. La enfermedad reumática más común en la infancia es la artritis reumatoide juvenil (ARJ) y el prototipo de las EAs es el lupus eritematoso sistémico (LES). Objetivo: Identificar los factores genéticos implicados en la susceptibilidad para desarrollar ARJ y LES en pacientes pediátricos mexicanos. Materiales y metodos: Se incluyeron un total de 133 pacientes con ARJ y 250 pacientes con LES, diagnosticados antes de los 16 años de edad, sus padres y 355 controles sanos. Se analizaron polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en genes que participan en las respuestas inmune e inflamatoria tales como: PTPN22, PDCD-1, IRF5, TYK2, FCRL3, TNF-alfa, IL-10, IL-6, MCP1, IKBL, MIF y RANTES y ER-alfa. Los SNP’s fueron caracterizados por el método Taqman y secuenciación. Las frecuencias genotípicas y alélicas así como la frecuencia de haplotipos cuando fue el caso fueron comparadas entre casos y controles mediante diversos programas estadísiticos. Resultados: Se identificaron varios polimorfismos en genes asociados con LES y con ARJ, ninguno de los genes que mostraron asociación fueron compartidos entre LES y ARJ. Se observó una asociación significativa con susceptibilidad para desarrollar LES en edad pediátrica cuando se analizaron los polimorfismos 1858C/T del gen PTPN22 y PD1.3G/A del gen PDCD-1, entre otros. También se identificó un polimorfismo con efecto protector a desarrollar LES. Interesantemente en este trabajo se documenta por primera vez la identificación de un nuevo gen de riesgo para desarrollar LES. Por su parte, los genes MIF, IKBL y FCRL3 mostraron asociación con ARJ. Simposio 3. Oncología genómica Coordinador: Dr. Alejandro García Carrancá Instituto Nacional de Cancerología Carcinogénesis en piel y de cérvix uterino Dr. Patricio Gariglio, CINVESTAV Como sabemos, el cáncer se origina cuando clonas de células mutadas sobreviven y proliferan en forma inapropiada, rompiendo el balance entre la proliferación celular y la apoptosis. En los últimos años, la investigación en cáncer ha hecho avances notables en relación con la biología y la genética de la célula cancerosa. Entre los logros más importantes está el conocimiento detallado de genes, proteínas y procesos que controlan el ciclo celular y el entender que la apoptosis y los genes que la controlan juegan un papel fundamental en el desarrollo de tumores malignos. Para que un tumor maligno se desarrolle, se deben mutar 4-5 genes que controlan el crecimiento celular. Actualmente, se ha llegado a establecer que en el desarrollo de las primeras etapas de una neoplasia intervienen básicamente dos grupos de genes: los oncogenes y los genes supresores de tumores (o antioncogenes). Las proteínas oncogénicas tienen una actividad aumentada si se comparan con las proteínas protooncogénicas (normales). Por otro lado, una característica importante de los antioncogenes es la de inhibir el crecimiento y la proliferación celular. Se ha descubierto que tanto los oncogenes (por ejemplo c-myc, ras, bcl-2) como los antioncogenes más estudiados (rb, p53) participan activamente en apoptosis, lo cual implica que las vías que controlan este proceso juegan un papel importante en cáncer. En cáncer cervical, existe evidencia indicando que la infección persistente por HPV de alto riesgo es necesaria pero no suficiente para el desarrollo de esta neoplasia. Además de la expresión de los oncogenes virales (E6, E7), se necesitan otros cofactores (cancerígenos del tabaco, estrógenos, deficiencia en el consumo de retinoides, etc.) para inducir un cáncer invasor. Con el objetivo de profundizar en las bases moleculares del cáncer cervicouterino y del cáncer de piel, nuestro grupo trabaja en 2 sistemas modelo murinos: A.- En colaboración con el Dr. P. Lambert (Madison, Wisconsin), empleando ratones K14E7, hemos estudiado recientemente la participación de oncogenes y antioncogenes en el desarrollo del cáncer cervical. En particular estudiamos la vía supresora de tumores del TGFbeta. B.- En colaboración con el grupo del Dr., Pierre Chambon (Estrasburgo, Francia), empleando un ratón al que se le puede eliminar en el adulto un gen que codifica para un importante receptor a retinoides (RXRalfa), hemos estudiado los efectos de esta mutación en el desarrollo de cáncer de piel y del cáncer cervical. Se observó que tanto el melanoma como los diversos tipos de cáncer no-melanómico, son inducidos en ausencia del gen RXRalfa. Experimentos preliminares sugieren que la eliminación del gen RXRalfa coopera con los oncogenes E6 y E7 de HPV en el desarrollo de lesiones cervicales. Genómica funcional y su impacto en quimioterapia Dr. Alejandro Sweet Cordero, Univ. de Stanford En los últimos años hemos visto visto un aumento vertiginoso en nuestra capacidad para analizar en forma global los cambios que ocurren a nivel molecular durante la patogénesis de un número muy amplio de enfermedades. Mientras que anteriormente nos veíamos limitados a estudiar solo un gen o una proteína a la vez, la llamada era “ómica” nos está permitiendo cada vez mas comprender como el genoma, el transciptoma y el proteoma se ven afectados en su conjunto por enfermedades como el cáncer. Unos de los ejemplos mas sobresalientes de esta nueva era en la medicina es el uso de los microarreglos de cADN para el análisis de la expresión genética. Por medio de esta tecnología, es posible medir el nivel de expresión de miles de genes a la vez en una muestra determinada Uno del los genes mas frecuentemente mutados en el cancer pulmonar y en otros tipos de cancer (pancreas, colon) es la GTPasa Kras. Utilizando un método para comparar patrones de expresión en un modelo animal y el cáncer pulmonar en humanos, hemos identificado una signatura de expresion que se relaciona con la mutación del oncogen Kras (Sweet-Cordero et al Nature Genetics, 2005). Utilizando este mismo modelo tambien hemos utilizado los patrones de expresión por microarreglos para identificar nuevos genes involucrados en la resistancia a la quimioterapia. Hemos desarollado una metodologia que permite analizar la importancia funcional de estos genes tanto in vitro como in vivo. Utilizando la tecnología del ARN de interferencia, estamos llevando a cabo tamizajes de todos los genes de la signatura de Kras para analizar su función en la oncogenesis. Utilizando esta metodologia hemos identificado varios genes que influyen en la capacidad de Kras de producir un tumor. Expresión genómica en progresión del cáncer cervicouterino Dr. Mauricio Salcedo Vargas, IMSS Identificación de genes de susceptibiildad para cáncer de próstata Dr. John Carpten, TGen, Phoenix Simposio 4. Farmacogenómica y nutrigenómica Coordinador: Dr. Héctor Bourges Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán Individualidad genética y nutrición Dr. Armando Tovar, INCMyNSZ Nutrigenómica: Implicaciones en Salud Pública Dr. Jim Kaput, Nutrigenomics The science of nutrigenomics seeks to provide a molecular understanding for how common dietary chemicals (i.e., nutrition) affect health by altering the expression and/or structure of an individual’s genetic makeup. The conceptual basis for this new branch of genomic research can best be summarized by the following Five Tenets of Nutrigenomics: • Improper diets are risk factors for diseases • Dietary chemicals alter gene expression and/or genome structure • Influence of diet on health depends upon an individual’s genetic makeup • Genes regulated by diet play a role in chronic diseases • “Individualized nutrition” – diets based upon genotype, nutritional requirements and status - prevents and mitigates chronic disease 25 Simposia Memorias del Congreso Simposia II Congreso Nacional de Medicina Genómica Applying the concepts of nutrigenomics to individuals is challenging because of the diversity of genetic makeups and their individual responses to the complexity of food. We have established the Laboratory of Nutrigenomic Medicine to study individuals with type 2 diabetes (T2DM). The complex presentation of impaired glucose tolerance (IGT), hyperglycemia, hyperinsulinemia, insulin resistance, and other abnormalities of this disease and the differences in effectiveness of dietary and drug treatments among individuals indicates an underlying molecular, genetic, and environmental (including diet) heterogeneity of this disease. Specifically, we are analyzing candidate gene variants, clinical phenotypes, diet histories, and genetic ancestry in patients with different severities and complications of type 2 diabetes (T2DM). We anticipate that certain genetic, dietary, and disease state patterns will identify type 2 diabetic subjects likely to develop more severe manifestations of disease. It is anticipated that the development of improved diagnostic capabilities will enable greater accuracy in prescribing early preventative treatment. Power calculations indicate that larger populations will be needed to assess validity of these results. Toward that end, we are participating with others to develop an international Nutrigenomics Societythat will enable collaborations among various research groups throughout the world. Progress of this effort will be presented. Variaciones de número de copias y su impacto en la farmacogenómica Dr. Charles Lee, Univ. de Harvard, EUA Genomic variability can be present in many forms, including single nucleotide polymorphisms (SNPs), variable number of tandem repeats (VNTRs: e.g., mini- and microsatellites), presence/ absence of transposable elements (e.g., Alu elements) and structural alterations (e.g., deletions, duplications, and inversions). Until recently, SNPs were thought to be the predominant form of genomic variation and to account for much normal phenotypic variation. However, recently, our laboratory and others showed that widespread structural variation (including copy number variants – CNVs) existed in the human genome (Iafrate et al. 2004; Sebat et al. 2004; Tuzun et al. 2005). These regions of structural variation appear to be enriched for “environmental sensor” genes that affect the way individuals adapt to the surrounding environment and include genes involved in immunity, inflammation, cell surface antigens, and cell surface adhesion. The Genomic Structural Variation Consortium’s copy number variation project has been to obtain a global profile of copy number variation in the human genome by screening all 270 HapMap individuals (representing four populations) with two independent, genome-wide array platforms: a whole genome tiled BAC array and the Affymetrix 500k SNP array. From these studies, we have identified and characterized over a thousand copy number variable regions. These studies clearly demonstrate the prevalence of CNVs and suggest that these and other structural variants need to be considered and incorporated in future disease-based and pharmacogenomic-based association studies. Farmacogenómica de la hipertensión arterial M.C. Samantha Alvarez Madrazo BHF Glasgow Cardiovascular Research Center La prevalencia mundial de la hipertensión arterial varía del 2535% en la población adulta. A pesar de los avances significativos en el tratamiento de la hipertensión y de haber más de un centenar de antihipertensivos disponibles, menos de un tercio de los pacientes hipertensos son tratados adecuadamente. Las principales razones de los bajos niveles de control son la inadecuada adherencia de los pacientes, las reacciones adversas y la respuesta subóptima a 26 los medicamentos antihipertensivos. Sin embargo, los factores genéticos, la raza y la etnia también juegan un papel importante. La aplicación de estrategias genéticas para estudiar la naturaleza multifactorial y poligénica de la hipertensión han llevado a un mejor entendimiento de la patogénesis de la enfermedad. Por lo que es probable que con el conocimiento de las bases genéticas de la hipertensión y las diferentes vías involucradas en la regulación de la presión arterial sea posible individualizar el tratamiento para cada paciente. Esto esta ejemplificado en el tratamiento de varias formas monogénicas de hipertensión. El Sistema Renina-Angiotensina-Aldosterona (SRAA) tiene un papel importante en la regulación de la presión arterial y por lo tanto ha sido un blanco valioso para la intervención terapéutica. No es sorprendente que la mayoría de las clases de medicamentos (inhibidores de la ECA, inhibidores del receptor de angiotensina II, bloqueadores beta adrenérgicos, bloqueadores de los canales de calcio y diuréticos) estén relacionados con este sistema. Con el fin de determinar la variabilidad en la respuesta del tratamiento con antihipertensivos, varios polimorfismos del SRAA se han estudiado. Sin embargo, los resultados han sido inconsistentes. Por ello nuestros grupos usaron una estrategia de barrido genómico para definir los marcadores genéticos involucrados en la respuesta de la presión arterial. La población del Estudio Británico de Genética de la Hipertensión (BRIGHT) se estratificó en grupos de acuerdo a la respuesta a diferentes clases de antihipertensivos: 89 pares de hermanos con terapia antihipertensiva que inhibe la renina (AB) y 76 pares de hermanos con antihipertensivos que no la inhiben (CD). Se llevo a cabo un análisis de ligamiento no paramétrico en el genoma completo usando 37 marcadores espaciados cada 10cM. Se encontró ligamiento significativo en el grupo AB en el cromosoma 2p (LOD score = 4.84, en 90.68 Kosambi cM) y un ligamiento con tendencia significativa para el grupo CD en el cromosoma 10q (LOD score = 2.83, en 125.96 Kosambi cM). Se identificaron 25 genes en el locus AB susceptible de ligamiento como candidatos potenciales para la hipertensión sensible a la sal y/o asociados con la respuesta a los medicamentos antihipertensivos. Estudios posteriores se están llevando a cabo para validar estos resultados. Además de la estrategia de barrido genómico, también se está empleando en nuestro grupo la estrategia de análisis de genes candidatos para investigar los genes de la 11-beta hidroxilasa y aldosterona sintasa con el fin de obtener un conocimiento más profundo acerca de la patogénesis de la hipertensión y la farmacogenómica. El éxito futuro de los estudios de farmacogenética depende del equilibrio costo-beneficio, la baja tasa de error y eficiencia que ofrezcan. Los beneficios prácticos de la farmacogenómica necesitan verificarse mediante estudios clínicos antes de que ésta realmente se convierta en una herramienta clínica. Memorias del Congreso 27 Presentaciones orales II Congreso Nacional de Medicina Genómica Presentaciones orales Salón A Viernes 27 Horario Trabajo Salón B Viernes 27 Trabajo Polimorfismo genético del CYP3A4*18, CYP2B6*22 y CYP1A2*1F en una población de Yucatán Marco Antonio Sánchez Guerra CINVESTAV-IPN Relación de los polimorfismos -308 de TNF-alfa y -174 de IL-6 con factores de riesgo cardiovascular en pacientes con obesidad y diabetes tipo 2 Isela Parra Rojas Universidad de Guadalajara 12:00 - 12:12 CYP2D6*3, *4 Y *5 Y asociación con enfermedad de Parkinson Marisol López López Universidad Autónoma Metropolitana Participación del gen Inducido por Insulina-2 (INSIG2) en obesidad y metabolismo de lípidos en población mexicana Marisela Villalobos Comparán Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán 12:14 -12:24 La variante R230C de la proteína ABCA1 afecta los niveles plasmáticos de HDLcolesterol y el Índice de masa corporal en mexicanos: Asociación con obesidad y síndrome metabólico Ma. Teresa Villarreal Molina Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán Identificación de un nuevo gene de susceptibilidad para la enfermedad de Crohn por medio de asociación genética directa con un panel de 19,779 SNPs codificantes Francisco Miguel De La Vega Vaca Applied Biosystems 12:26 - 12:36 Caracterización de la expresión de un arn mensajero que codifica para una proteína RHEB-LIKE involucrada en la enfermedad TSC María del Rosario Gonzaga Pérez Instituto Nacional de Psiquiatría “Ramón de la Fuente Muñiz” Distribución geográfica en México de polimorfismos en genes del metabolismo de folatos Irma Silva Zolezzi Instituto Nacional de Medicina Genómica 12:38 - 12:48 Evaluación de la contribución ancestral en poblaciones mestizas mexicanas y sus efectos en la preservación del desequilibrio de ligamiento Jesús Karol Estrada Gil Instituto Nacional de Medicina Genómica Asociación de polimorfismos en genes del metabolismo del folato (MTHFR, CBS, MTRR y GCPII) y riesgo para defectos de cierre de tubo neural en Yucatán, Mexico Lizbeth Josefina González Herrera Universidad Autónoma de Yucatán 12:50 - 13:-00 SACGEN: Software para el Análisis Comparativo de Genomas Ernesto Francisco Bautista Thompson Universidad Autónoma del Carmen Hacia una terapia génica para el alcoholismo: estrategia y avance Amalia Sapag Muñoz de la Peña Universidad de Chile 13:02-13:22 Selección multivariada de biomarcadores en datos de genómica funcional Victor Treviño Alvarado Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey Evaluación in vitro de DNAzimas dirigidas contra ARNm del gen E6 de VPH-16 Pablo Reyes Gutiérrez CINVESTAV-IPN 11:50 - 12:00 28 POLIMORFISMO GENÉTICO DEL CYP3A4*18, CYP2B6*22 Y CYP1A2*1F EN UNA POBLACIÓN DE YUCATÁN. Sánchez Guerra, Marco, Elizondo Azuela, Guillermo, Pérez Herrera, Norma, Reyes Hernández, Octavio y Quintanilla Vega, B. Sección Externa de Toxicología, CINVESTAV, México, D.F., México. El metabolismo de la mayoría de los xenobióticos es dependiente de los citocromos P450 (CYP) y es llevado a cabo en muchos casos por enzimas polimórficas, las cuales pueden causar supresión o incremento en el metabolismo. Dentro de estos xenobióticos están los plaguicidas organofosforados (OF), los cuales sufren una activación metabólica para la formación del oxón, metabolito que ocasiona los efectos neurotóxicos, a través de la inhibición de la acetilcolinesterasa. Se han descrito variaciones genéticas para los CYP involucrados en esta bioactivación de los OF: 3A4, 2B6 y 1A2, que corresponden a las variantes CYP3A4*18, CYP2B6*22 y CYP1A2*1F, respectivamente. Estos polimorfismos están relacionados con un incremento en la actividad enzimática, por lo cual pudieran ser un factor de riesgo para las poblaciones que utilizan estos plaguicidas. En el presente estudio determinamos los polimorfismos CYP3A4*18 por PCR-RFLP y CYP2B6*22 y CYP1A2*1F por PCR-Tiempo real, en una población de trabajadores agrícolas del sexo masculino del municipio de Muna, Yucatán, quienes utilizan OF. Aceptaron participar 101 agricultores de 48 ± 16 años de edad (previa firma del consentimiento). De los 3 polimorfismos estudiados en esta población de fuerte ascendencia maya, solo observamos el polimorfismo CYP1A2*1F, con una frecuencia del 4% para el genotipo C/C (silvestre), del 28% para el genotipo C/A (heterocigoto) y del 68% para el genotipo (A/A) (mutado), frecuencias similares a las reportados en otra población mestiza mexicana. La alta frecuencia observada de la variante genética CYP1A2*1F(A/A) que se asocia con un incremento en la actividad enzimática, sugiere que la población agrícola estudiada puede ser más susceptible a la toxicidad por la exposición a plaguicidas OF. De igual manera, considerando que esta isoforma participa en la activación de pre-carcinógenos, como los hidrocarburos aromáticos policíclicos y dioxinas, esta población puede también tener un factor de riesgo a sufrir efectos tóxicos por la exposición a estos contaminantes que son muy frecuentes en nuestro país. Agradecimientos: CONACYT/SALUD (donativo otorgado a BQV), a las autoridades y voluntarios participantes de Muna, Yuc. CYP2D6*3, *4 Y *5 Y ASOCIACIÓN CON ENFERMEDAD DE PARKINSON López López Marisol,1 Guerrero Camacho Jorge Luis,2 Alonso Vilatela María Elisa.2 1 Departamento de Sistemas Biológicos, UAM-Xochimilco. 2 Departamento de Genética y Biología Molecular, INNNMVS. Antecedentes. La enfermedad de Parkinson (EP) es una entidad compleja resultado de la combinación de factores genéticos y ambientales. Se ha propuesto que la EP puede ser causada por susceptibilidad genética a neurotoxinas ambientales. CYP2D6 es un gen candidato para EP porque regula el metabolismo de drogas y toxinas. El locus CYP2D6 se localiza en el cromosoma 22q13.1, es muy polimórfico y consta de más de 70 alelos diferentes. Entre los más frecuentes están CYP2D6*4, una sustitución G1934A; CYP2D6*3, identificado por una deleción A2637, y CYP2D6*5, que es la deleción del gen. Las variaciones individuales en la expresión de CYP2D6 pueden influir en el riesgo de desarrollar padecimientos ligados a factores ambientales como la EP. Sin embargo, el polimorfismo de CYP2D6 y su relación con el desarrollo de la EP ha mostrado resultados inconsistentes. Objetivo. Determinar si CYP2D6*3, *4 y *5 están asociados con la enfermedad de Parkinson. Pacientes y metodos. Se analizaron pacientes y controles para cada alelo: 212 y 225, CYP2D6*3; 212 y 230, CYP2D6*4; 122 y 93, CYP2D6*5, respectivamente. La genotipificación de CYP2D6*3 y *4 fue realizada por PCR-RFLP, y CYP2D6*5 fue identificado por PCR alelo-específico. El análisis estadístico incluyó las frecuencias genotípícas y alélicas, asociación a riesgo con la prueba c2 y prueba exacta de Fisher; y regresión logística con nivel de confianza del 95 %. Las poblaciones están en equilibrio Hardy-Weinberg. Resultados. La frecuencia alélica de CYP2D6*3 fue 3.05% en pacientes, y 0.90% en controles (OR = 3.61, p = 0.019). Se observó diferencia significativa entre los casos de EP heterocigotos *1/*3 respecto a controles (6.1 vs. 1.8%; OR = 3.61, IC 95% = 1.1 – 15.4, p = 0.019). Se analizó el efecto de CYP2D6*3 en la edad de inicio de EP, dividiendo al grupo de pacientes en £ 40 y > 40 años, y encontramos diferencia significativa con inicio £ 40 años (17.9 vs. 4.4%; OR = 4.75, p = 0.006). No encontramos asociación entre los polimorfismos CYP2D6*4 y *5, y el desarrollo de EP ni con edad de inicio. CONCLUSIÓN. Estos resultados muestran que CYP2D6*3 es factor de riesgo para EP, y sugieren que está asociado con EP de inicio temprano. Para confirmar estos datos es necesario ampliar la muestra para CYP2D6*5. LA VARIANTE R230C DE LA PROTEÍNA ABCA1 AFECTA LOS NIVELES PLASMÁTICOS DE HDL-COLESTEROL Y EL ÍNDICE DE MASA CORPORAL EN MEXICANOS: ASOCIACIÓN CON OBESIDAD Y SÍNDROME METABÓLICO. Villarreal-Molina Ma. Teresa 1,2 , Aguilar-Salinas Carlos 3 , Rodríguez-Cruz Marisela4, Riaño Daniela3, Villalobos-Comparán Marisela1, Guerra-García Teresa1, Coral-Vazquez Ramón4, OrtizLópez Guadalupe 5, Menjívar Marta5, Yescas-Gómez Petra6, Könisberg-Fainstein Mina2, Tusié-Luna Ma. Teresa1, CanizalesQuinteros Samuel1. 1 Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición “Salvador Zubirán” (INCMNSZ), Instituto de Investigaciones Biomédicas de la UNAM; 2 División de Ciencias Biológicas y de la Salud, UAM-Iztapalapa; 3 Departmento de Endocrinología y Metabolismo, INCMNSZ; 4 Hospital de Pediatría, CMN XXI-IMSS; 5Facultad de Química UNAM; 6Instituto Nacional de Neurología y Neurociencias “Manuel Velazco Suarez”. Aunque el papel de la proteína transportadora ABCA1 en el eflujo de colesterol y la formación de lipoproteínas de alta densidad (HDL) es bien conocido, ABCA1 se expresa en muy diversos tejidos, donde probablemente tenga diferentes funciones. La hipo-alfalipoproteinemia tiene una alta prevalencia en México, por lo que secuenciamos el gen gen ABCA1 en individuos mexicanos con los niveles más bajos y más altos de HDL en la población, buscando posibles variantes funcionales. Se encontró una variante no sinónima (R230C) muy frecuente en individuos con HDL-C bajos, pero no en individuos con HDL-C altos (P=0.00006). Por este motivo buscamos dicha variante en la población general y analizar posibles asociaciones con otros rasgos metabólicos. Se buscó la variante R230C con sondas Taqman, encontrándose en el 20.1% de 429 mestizos mexicanos. R230C mostró asociación estadísticamente significativa no solo con niveles bajos de HDL-C y Apo A-I, sino también con obesidad (OR=2.708; P=0.008) y con síndrome metabólico (OR=1.926; P=0.013), observándose un efecto de dosis alélica para los 2 últimos pero no para los niveles de HDL-C/Apo A-I. R230C se encontró con una frecuencia aún mayor en varios grupos 29 Presentaciones orales Memorias del Congreso Presentaciones orales II Congreso Nacional de Medicina Genómica amerindios, y parece ser exclusiva de poblaciones con componente amerindio. Este es el primer estudio que reporta la asociación de una variante de ABCA1 con obesidad y síndrome metabólico, que a la vez es relevante epidemiológicamente en la población mexicana. CARACTERIZACIÓN DE LA EXPRESIÓN DE UN ARN MENSAJERO QUE CODIFICA PARA UNA PROTEÍNA RHEBLIKE INVOLUCRADA EN LA ENFERMEDAD TSC. Gonzaga Pérez, R, Matus Ortega, ME, Antón Palma, B. Instituto Nacional de Psiquiatría “Ramón de la Fuente Muñiz”, México, DF. En nuestro laboratorio se desarrolló un proyecto de investigación orientado hacia la identificación, aislamiento y caracterización de nuevas proteínas funcionales, basado en tecnologías inmunomoleculares de identificación y clonación de ARN mensajeros, con las que se aisló, identificó y se caracterizó una molécula de ARNm a partir de una biblioteca de expresión de ADNc de cerebro total de ratón. La secuencia primaria de este ARNm de 1541 nt de longitud, cuyo marco de lectura abierto de traducción de 552 nt, codifica para una proteína de 184 aa. La comparación de la secuencia de este ARNm dio como resultado una identidad completa de más del 90% con la secuencia del ARNm de Ras-Homolog Enriched in Brain de Mus musculus. La secuencia del ADNc se reportó por nuestro grupo en la base de datos del GenBank (acceso AY197373). Rheb se define como una nueva y única familia dentro de la superfamilia de proteínas Ras, mostrando secuencias consenso características de esta superfamilia.. Rheb ha tomado importancia ya que participa en la regulación celular, ciclo celular y se ha reportado que participa en el complejo de esclerosis tuberosa (TSC), una enfermedad genética asociada con ataques y retraso mental, así como la aparición de tumores benignos (hamartomas) en diferentes partes del cuerpo. A pesar de su importancia biológica, su distribución y expresión no ha sido establecida completamente, por lo que en nuestro laboratorio, para iniciar la caracterización funcional de Rheb se llevaron a cabo estudios de RT-PCR en áreas neuronales y órganos periféricos de ratón para identificar la expresión de Rheb ante estímulos específicos. Nuestros resultados mostraron que el gen Rheb en condiciones fisiológicas (i.p. SSI) es expresado ampliamente en todas las áreas neuronales examinadas (bulbo olfatorio, cerebelo, corteza, estriado, hipocampo, médula espinal, ojos, tálamo-hipotálamo y tallo cerebral); también fue detectado en tejidos periféricos como corazón, hígado, riñón y glándulas suprarrenales. En el tejido donde no se detectó expresión fue pulmón. En el grupo de animales tratados con PTZ (i.p. 40 mg/kg), la expresión se mantuvo en áreas neuronales, inhibiéndose en hígado y pulmón. En el grupo tratado con cocaína (i.p. 20 mg/kg) se inhibió en ojos, bulbo olfatorio y glándulas suprarrenales. La expresión de Rheb en forma ubicua, en condiciones fisiológicas, sugiere su participación en funciones esenciales del SNC y órganos periféricos. Al modificarse su expresión en hígado (PTZ) y glándulas suprarrenales (cocaína) sugiere su participación en procesos metabólicos. El desarrollo de un ensayo para detectar expresión de Rheb-like dentro dentro de tumores podría ser un instrumento valuable para diagnosticar y determinar el origen de un tratamiento para TSC y el desarrollo de estudios orientados hacia la implementación de terapias para las enfermedades en las que se involucra Rheb. 30 EVALUACIÓN DE LA CONTRIBUCIÓN ANCESTRAL EN POBLACIONES MESTIZAS MEXICANAS Y SUS EFECTOS EN LA PRESERVACIÓN DEL DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO. Jesús Estrada Gil, Alfredo Hidalgo Miranda, Irma Silva Zolezzi y Gerardo Jiménez Sánchez. Instituto Nacional de Medicina Genómica,.Secretaria de Salud, México. Antecedentes. La población mexicana tiene un origen genético único, más del 80% de la población es considerada “mestiza”, resultado de la mezcla de grupos étnicos amerindios con los españoles. Si bien se han hecho estudios que muestran diferencias de mestizaje entre algunos estados de la República Mexicana estos, se han limitado a evaluar solamente algunas regiones genómicas como el HLA, cromosoma Y y DNA mitocondrial. El estudio integral y sistemático del mestizaje a nivel genómico permitirá tener un conocimiento detallado de la heterogeneidad en nuestra población y servirá como marco de referencia para optimizar el diseño de estudios de asociación en medicina genómica. Objetivos. Este estudio está enfocado a estimar la contribución ancestral europea, africana y asiática a la población mestiza mexicana de diferentes regiones del país, utilizando un grupo de 105 polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) distribuidos a lo largo del genoma, que previamente fueron utilizados para evaluar ancestralidad. Además, se procederá a evaluar el efecto de las diferencias de contribución ancestral en la preservación del desequilibrio de ligamiento en poblaciones mestizas mexicanas. Materiales y métodos. Se genotipificaron 104 muestras de los estados de Sonora (n=20), Yucatán (n=17), Guerrero (n=21), Zacatecas (n=19), Veracruz (n=18) y Guanajuato (n=8) utilizando microarreglos de oligonucleótidos que evalúan aproximadamente 115,000 SNPs (GeneChip® Human Mapping 100K Set, Affymetrix, EUA). Como información de las poblaciones ancestrales se utilizaron resultados obtenidos con la misma plataforma tecnológica del proyecto del HapMap Internacional (60 Yorubas de Nigeria, 60 caucásicos de Utah, 45 chinos Han y 44 japoneses de Tokio). A partir de 3,055 SNPs informativos de ancestralidad reportados por Smith et al. y Choundhry et al., se identificaron 105 presentes en el microarreglo 100K, los cuales se utilizaron para calcular la contribución de cada población ancestral a la población mestiza. Para inferir el porcentaje de ancestralidad utilizamos el software Structure bajo el modelo de mestizaje utilizando información a priori. Además, la preservación del desequilibrio de ligamiento (LD) entre la población Europea y la Mexicana se evaluó de dos maneras, primero dividiendo la población mestiza por estado, y después separándola en cuatro grupos generados utilizando datos de ancestralidad europea por individuo (<50%, 50-60%, 60-70% and >70%). Definimos la preservación de LD (PLD) como la proporción de pares de SNPs en LD en una población denominada ‘A’, que se encuentran también en LD en otra población denominada ‘B’. Resultados. La contribución poblacional promedio en las 104 muestras para componente europeo, africano y asiático fue de 58.96%, 10.03%, 31.05% respectivamente. Los estados con mayor y menor contribución europea fueron Sonora (70.63%) y Guerrero (51.98%) respectivamente. Siendo este último el estado con la contribución asiática mas alta (37.17%). La contribución africana se presentó en un rango desde 7.8% en Sonora hasta 11.13% en Veracruz. El estado de Guerrero obtuvo el valor más bajo de PLD con la poblacion caucásica (74%) y Sonora el más alto (77%), lo que correlaciona con los resultados de ancestralidad. El grupo de individuos mestizos con mayor ancestralidad europea (>70%) tuvo el valor mas alto de PLD con la población caucásica, por otro lado, el grupo con menor ancestralidad europea (<50%) tuvo el valor mas bajo de PLD con la población caucásica. Conclusiones. Las diferencias observadas en los niveles de ancestralidad entre estados del norte y de las costas de México sugieren que la población mestiza mexicana es heterogénea. El hallazgo de la existencia de diferencias en la preservación de LD en estos estados, da evidencia de que la estructura genómica de las poblaciones mestizas mexicanas podría favorecer la generación de resultados falsos positivos en estudios de asociación que involucren datos genéticos. Lo anterior subraya la importancia de realizar correcciones por estratificación de ancestralidad basadas en información genómica en este tipo de estudios. SACGEN: SOFTWARE PARA EL ANÁLISIS COMPARATIVO DE GENOMAS. Garza-Domínguez, Ramiro, Bautista-Thompson, Ernesto, Velázquez-Jerónimo Fabiola. Centro de Tecnologías de la Información, DES-DACI, Universidad Autónoma del Carmen, Ciudad del Carmen, Campeche, México. Se presenta una herramienta de software para el análisis comparativo de genomas, la cual integra en un ambiente visual a técnicas de origen estadístico, de inteligencia artificial y de sistemas dinámicos para el análisis de secuencias de nucleótidos. El creciente número de bases de datos sobre genomas requiere del desarrollo de nuevas herramientas y metodologías para la extracción y análisis automatizado de la información almacenada. También se requiere de explorar el uso de técnicas para análisis de datos cuyo origen no necesariamente esta relacionado con las ciencias genómicas, que ayuden al experto humano a identificar, extraer, comparar y clasificar patrones de interés medico o biológico de los genomas bajo estudio. La herramienta que se presenta integra técnicas estadísticas clásicas, por ejemplo, análisis de frecuencias de palabras (frecuencias, porcentaje de frecuencias), ordenación de palabras en base a índice de Breslauer (en el caso de dímeros); con técnicas de inteligencia artificial como K-means, K-means Evolutivo para el agrupamiento de secuencias de nucleótidos, Fuzzy Item Sets para la generación de categorías e identificación de reglas; y técnicas de sistemas dinámicos como los Mapas de Recurrencia para visualizar correlaciones espaciales de datos. El conjunto de técnicas se encuentra integrado en un ambiente visual que facilita el análisis y comparación de secuencias de genomas almacenadas en bases de datos. La combinación de técnicas permite además, generar información sobre diferentes aspectos o facetas de una secuencia de nucleótidos y comparar la información para conjuntos de secuencias. A futuro, se integraran nuevas técnicas de análisis que están en proceso de evaluación, tales como Mapas Auto Organizados Jerárquicos para la generación de clases jerarquizadas y Análisis de Gramáticas para caracterizar la complejidad computacional de las secuencias de genomas. SELECCIÓN MULTIVARIADA DE BIOMARCADORES EN DATOS DE GENÓMICA FUNCIONAL. Treviño, Victor1,3, Raza, Karim2, Young, Stephen2, Salmon, Mike2, Falciani, Francesco1 1 School of Biosciences, 2Division of Immunity and Infection, University of Birmingham, UK. 3Instituto Tecnológico y de Estudios Superiores de Monterrey, Campus Monterrey, México. Actualmente, enfermedades y cáncer se estudian usando ensayos genómicos que generan una enorme cantidad de datos como transcriptómica, proteómica y metabolómica. Una de las aplicaciones directas más importantes de estos ensayos es la selección de biomarcadores entre personas sanas y enfermas. Estos marcadores se utilizan para diseñar modelos estadísticos predictivos que puedan ser usados en diagnóstico clínico, para proponer nuevas drogas como tratamiento y para dirigir subsecuentes esfuerzos de investigación. Existe una gran cantidad de herramientas bioinformáticas para seleccionar tales biomarcadores, las cuales pueden ser divididas en univariadas y multivariadas. La gran mayoría de estas herramientas utiliza estrategias univariadas en las que se considera un solo gen, proteína ó metabolito a la vez, es decir, se prueba estadísticamente una variable independiente de las demás. Sin embargo, la función biológica de cada gen, proteína o metabolito no es independiente sino que ejercen su función en un contexto cooperativo dentro de una compleja red de conexiones bioquímicas. Por estas razones, hemos diseñado estrategias de selección multivariada que consideran combinaciones de variables y sus posibles interacciones que en conjunto modelan mejor la realidad biológica. En este trabajo mostramos que nuestra herramienta bioinformática multivariable puede generar modelos más robustos, más predictivos y con menos cantidad de variables que las que usan estrategias univariadas. Al mismo tiempo, demostramos que nuestra herramienta ha funcionado exitosamente con datos obtenidos de muestras clínicas como transcriptómica de diversos cánceres, proteómica de artritis reumatoide y metabolómica de fluídos oculares. RELACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS -308 DE TNF-ALFA Y -174 DE IL-6 CON FACTORES DE RIESGO CARDIOVASCULAR EN PACIENTES CON OBESIDAD Y DIABETES TIPO 2. Parra-Rojas Isela, Ruíz-Madrigal Bertha, Martínez-López Erika y Panduro Arturo. Servicio de Biología Molecular en Medicina, Hospital Civil de Guadalajara “Fray Antonio Alcalde”. Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara. Polimorfismos en el promotor de los genes de TNF-alfa y de IL6 se han asociado con resistencia a insulina, diabetes tipo 2 y enfermedad cardiovascular. Objetivo. Determinar la asociación de los polimorfismos –308 G/A de TNF-alfa y –174 G/C de IL-6 con factores de riesgo cardiovascular en pacientes con obesidad y con diabetes tipo 2. Metodología. Se incluyeron en el estudio 100 individuos con obesidad (IMC>27 kg/m2) y 100 pacientes con diagnóstico previo de diabetes tipo 2. La glucosa y los lípidos séricos se midieron en el autoanalizador CX5-Delta (Beckman), la insulina mediante el equipo automatizado IMx (Abbott Diagnostics) y la citometría hemática con el CELL-DYN 3700 (Abbott Diagnostics). La resistencia a insulina fue estimada mediante el índice HOMA. La determinación de los polimorfismos se realizó por PCR-RFLPs. Resultados. En los individuos con obesidad, los genotipos GC/CC del polimorfismo de IL-6 se asociaron significativamente con resistencia a insulina (HOMA 3.6 vs. 2.5) y con un aumento en los niveles de glucosa (92.4 vs. 80.0 mg/dL) e insulina (16.0 vs. 13.1 mU/mL). El genotipo GG del polimorfismo de TNF-alfa fue relacionado significativamente con un incremento en las concentraciones de colesterol (167.7 vs. 156.9 mg/dL), VLDL-c (22.4 vs. 18.1 mg/dL) y triglicéridos (117.2 vs. 100 mg/dL) con respecto al genotipo GA. En los pacientes con diabetes tipo 2, los genotipos GA/AA del polimorfismo de TNF-alfa se asociaron significativamente con un incremento en los niveles de glucosa (234.7 vs. 179.5 mg/ dL), HbA1c (12.4 vs. 8.8%), cuenta de leucocitos (7.4 vs. 6.4 31 Presentaciones orales Memorias del Congreso Presentaciones orales II Congreso Nacional de Medicina Genómica 103/mL) y plaquetas (288.1 vs. 260.8 103/mL). El genotipo GG del polimorfismo de IL-6 solamente se relacionó con la concentración de glucosa (210.8 vs. 170 mg/dL). Conclusiones. En individuos con obesidad, los genotipos GC/CC de IL-6 se relacionaron con resistencia a insulina y el genotipo GG de TNFalfa se asoció con un incremento en las concentraciones de lípidos séricos. En los pacientes con diabetes tipo 2, se encontró que el polimorfismo de TNF-alfa tiene un efecto sobre el control glucémico, el estado de inflamación y trombosis, siendo de mayor riesgo cardiovascular para los portadores del alelo A. PARTICIPACIÓN DEL GEN INDUCIDO POR INSULINA-2 (INSIG2) EN OBESIDAD Y METABOLISMO DE LÍPIDOS EN POBLACIÓN MEXICANA. Villalobos-Comparán M, Aguilar-Salinas CA, Tusié-Luna MT, Villarreal-Molina MT, Canizales-Quinteros S. Unidad de Biología Molecular y Medicina Genómica, Instituto Nacional de ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán e IIBm, UNAM. La obesidad en la mayoría de los casos ha sido definida como una patología multifactorial, siendo el componente genético responsable de un 30 a 70% de la variación del índice de masa corporal (IMC). Uno de los hallazgos recientes más prometedores obtenido a través del escrutinio completo del genoma (116,204 SNPs), mostró una variante común del gen INSIG2 (función principal en el metabolismo del colesterol en mamímeros) asociada de manera importante a la obesidad en población caucásica y afro-americana. Con el objetivo de evaluar la participación de este gen en la población mexicana, se realizó un estudio de asociación caso-control que incluyó 88 individuos obesos (IMC ≥ 30Kg/m2) y 159 individuos delgados (IMC < 25Kg/ m2), todos adultos (>20 años) mexicanos en al menos tres generaciones. La genotipificación del SNP rs7566605 se realizó con sondas TaqMan en un PCR tiempo real, y se confirmó a través de secuenciación directa. El análisis estadístico de los datos se llevó a cabo con el programa SPSS (v10). Los resultados obtenidos muestran una frecuencia significativamente menor de los genotipos G/C y C/C para el SNP rs7566605 en obesos vs. delgados (37.5% vs. 52.2%, p=0.026; OR= 0.549, IC95% [0.3230.935]). Resultados similares fueron observados para el alelo C (obesos 19.3% vs. delgados 30.8%, p=0.006). En contraste a lo observado en población caucásica y afro-americana (genotipo CC riesgo aumentado de obesidad), en este estudio se presenta un riesgo disminuido de obesidad para dicho genotipo; lo que podría sugerir que el SNP rs7566605 no es causal de obesidad; sin embargo, podría estar en desequilibrio con alguna(s) variante(s) funcional(es) del gen INSIG2 o cercanas a este locus. De manera interesante, se observó que los individuos delgados portadores de los genotipos GC o CC mostraron niveles significativamente menores de colesterol total, triglicéridos y ApoB que los portadores GG (p=0.009; 0.048; 0.008; respectivamente, ajustado por edad, género e IMC), siendo éste el primer reporte en el que se evidencia la participación del gen INSIG2 en el metabolismo de lípidos en humanos y la variación del IMC en población mexicana. IDENTIFICACIÓN DE UN NUEVO GENE DE SUSCEPTIBILIDAD PARA LA ENFERMEDAD DE CROHN POR MEDIO DE ASOCIACIÓN GENÉTICA DIRECTA CON UN PANEL DE 19,779 SNPS CODIFICANTES. De La Vega, Francisco M.1, Franke, Andre2, Hampe, Jochem2, Rosenstiel, Philip2, Hill, Andreas2, Huse, Klaus4, Albrecht, Mario5, Mayr, Gabriele 5, Briggs, Jason 1, Wenz, Michael 1, Günther, Simone 1, Gilbert, Dennis A. 1, Prescott, Natalie 6, Lengauer, 32 Thomas5, Mathew, Christopher6, Krawczak, Michael3, y Schreiber, Stefan2. 1 Applied Biosystems, Foster City, California, EEUU; 2Institute for Clinical Molecular Biology, 3Institute of Medical Statistics and Informatics, Christian-Albrechts-University Kiel; 4Leibniz Institute for Age Research, Jena; 5Max Planck Institute for Informatics, Saarbrücken, Alemania; 6Department of Medical and Molecular Genetics, King’s College London School of Medicine, Londres, Reino Unido. La ejecución de estudios de asociación genética directa con juegos de SNPs codificantes no sinónimos (cSNPs) puede facilitar el descubrimiento de variantes genéticas de susceptibilidad a enfermedades multifactoriales. Tal es el caso de la enfermad de Crohn (EC), una enfermedad gastrointestinal inflamatoria con componente genético complejo. Para llevar a cabo un estudio a nivel genómico de esta enfermedad, seleccionamos un juego de 19,779 cSNPs de función putativa a partir de una base de datos con mas de 60,000 cSNPs candidatos compilada de fuentes públicas y privadas, filtrados por su probable heterosigosidad en poblaciones de origen Europeo y Africano. Una muestra de 735 pacientes con EC y 368 controles obtenida en Alemania fue genotipificada para dichos SNPs por medio del ensayo de SNPlex™ (Applied Biosystems), identificando 7,832 SNPs informativos. Estos últimos SNPs fueron subsecuentemente tipificados en una muestra independiente de 386 trios, 946 casos, y 1091 controles. El análisis estadístico jerárquico de los resultados identifico un único cSNP asociado significativamente con la enfermedad (p=8.4x10-6 caso-control sencillo, OR=1.70 [95% CI: 1.33-2.16], p=2.9x10 -5 TDT). Esta asociación fue replicada en muestras independientes obtenidas en Inglaterra (661 controles, 515 casos) y Alemania (736 controles, 736 casos). No se lograron obtener cSNPs adicionales que expliquen esta asociación por re-secuenciación completa de la región génica involucrada. El nuevo alelo de susceptibilidad muestra una interacción estadística con otras variantes previamente involucradas con EC en el gene CARD15 (p=0.046, prueba de Breslow-Day). La función hipotética del gene portador de la variante descubierta en este estudio sugiere que los afectados presentan una protección disminuida contra la invasión intracelular de bacterias en células del epitelio gastrointestinal. Nuestros resultados demuestran que la utilización de un juego exhaustivo de cSNPs puede agilizar la identificación directa de variantes genéticas de susceptibilidad para enfermedades multifactoriales. DISTRIBUCIÓN GEOGRÁFICA EN MÉXICO DE POLIMORFISMOS EN GENES DEL METABOLISMO DE FOLATOS. Silva Zolezzi Irma1, Alfaro Luis Alberto1, Contreras Alejandra1, Estrada Jesús1, Goya Rodrigo1 y Jiménez Sánchez Gerardo1. 1 Instituto Nacional de Medicina Genómica, México. La hiperhomocistinemia y la deficiencia de folatos son factores de riesgo para malformaciones congénitas, complicaciones del embarazo, enfermedades cardiovasculares, desórdenes psiquiátricos y cáncer. Diferentes estudios, han encontrado asociaciones entre estas condiciones con polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en genes que codifican para enzimas de la vía de homocisteína dependiente de folatos y para otras proteínas del metabolismo de folatos. Dada la interacción entre el metabolismo de homocisteína y folatos se espera que combinaciones particulares de polimorfismos en genes relacionados a estas vías, modifiquen la susceptibilidad a diversas condiciones clínicas. Con excepción del SNP 677C>T del gen MTHFR, las asociaciones observadas en diferentes poblaciones no han sido replicadas o han presentado resultados controversiales, lo que indica la necesidad de realizar estudios de asociación para analizar la contribución de estas variantes en población mexicana. En este estudio se evaluó la distribución geográfica en México de las frecuencias alélicas y genotípicas de 8 SNPs previamente asociados a diversos fenotipos en 7 genes del metabolismo de folatos: MTHFR, MTR, MTRR, MTHFD1, TCN2, FOLH1 y SLC19A1. Para realizar el estudio se utilizaron muestras de sangre total de ~1100 individuos de población abierta de 6 regiones del país (Guanajuato, Guerrero, Sonora, Veracruz, Yucatán y Zacatecas). El DNA genómico se extrajo del paquete de células blancas por métodos estándar. Posteriormente, se genotipificaron con TaqMan®, dos SNPs funcionales del gen MTHFR 677C>T (A222V, rs1801133), 1298A>C (E429A, rs1801131); y un SNP funcional de cada uno de los siguientes genes: MTR 2756A>G (D919G, rs1805087), MTRR 66A>G (I22M, rs1801394), MTHFD1 1958G>A (R653Q, rs2236225), TCN2 776G>C (R259P, rs1801198), FOLH1 1571C>T (Y75H, rs202676) y SCL19A1 80G>A (5’-UTR, rs1051266). En todos los casos se evaluó el equilibrio de HardyWeinberg y se analizaron diferencias en frecuencias alélicas y genotípicas entre poblaciones utilizando un análisis de C2. Las frecuencias promedio de los 8 alelos y genotipos asociados a fenotipos de los SNPs analizados en la población mexicana, así como el rango observado en los 6 estados son los siguientes: 1) MTHFR 677C>T, T 0.501 (0.428-0.572) y TT 0.246 (0.186-0.332); 2) MTHFR 1298A>C, C 0.143 (0.077-0.256) y CC 0.028 (0.0060.073); 3) MTR 2756A>G, G 0.169 (0.163-0.191) y GG 0.030 (0.006-0.049); 4) MTRR 66A>G, G 0.237 (0.147-0.330) y GG 0.067 (0.038-0.118); 5) MTHFD1 1958G>A, A 0.577 (0.468-0.626) y AA 0.334 (0.207-0.392); 6) TCN2 776C>G, G 0.338 (0.2890.351) y GG 0.115 (0.082-0.157); 7) FOLH1 1561T>C, C 0.263 (0.237-0.302) y CC 0.053 (0.028-0.087); 8) SLC19A1 80A>G, A 0.423 (0.409-0.443) y AA 0.219 (0.159-0.207). En el caso de MTHFR las frecuencias alélicas y genotípicas obtenidas para los SNPs analizados son similares a algunas reportadas previamente en población mexicana, 677C>T, T (0.43-0.58), TT (0.170-0.357), y 1298A>C, C (0.147-0.280), CC (0.023-0.155). En conclusión, encontramos diferencias significativas en las frecuencias alélicas y genotípicas de SNPs en genes del metabolismo de folatos entre algunos estados de la República Mexicana. Lo anterior subraya la importancia de analizar la distribución geográfica de estas frecuencias para optimizar el diseño de estudios de asociación con estos SNPs en población mestiza mexicana. ASOCIACIÓN DE POLIMORFISMOS EN GENES DEL METABOLISMO DEL FOLATO (MTHFR, CBS, MTRR Y GCPII) Y RIESGO PARA DEFECTOS DE CIERRE DE TUBO NEURAL EN YUCATÁN, MEXICO. González-Herrera L, Rodríguez-Estrada L, Contreras-Capetillo S, García-Escalante MG, Pinto-Escalante D. Departamento de Salud Reproductiva y Genética. Centro de Investigaciones Regionales. Universidad Autónoma de Yucatán. Los defectos de cierre de tubo neural (DCTN) representan las malformaciones congénitas de mayor prevalencia en Yucatán (22.31 en 10,000). Polimorfismos en genes del metabolismo y transporte del folato se han asociado como factores de riesgo que aumentan la susceptibilidad a DCTN. Se han incluido como genes candidatos relacionados al folato, el MTHFR, MTRR, CBS y GCPII, ya que sus variantes alélicas muestran un riesgo mayor para DCTN, así como gran variación étnica y poblacional. Dada la naturaleza interconectada de los genes del folato es posible que combinaciones particulares de variantes genéticas interactúen para aumentar la susceptibilidad a los DCTN. En este estudio, se determinó la frecuencia de cinco polimorfismos: C677T-MTHFR, A128C-MTHFR, ins68bp-CBS, A66G-MTRR y C1561T-GCPII, y se evaluó su asociación con el riesgo para DCTN en Yucatán, México. Se llevó a cabo un análisis de asociación, incluyendo 108 recién nacidos con DCTN, 147 madres y padres de ellos como casos, y 120 sujetos control. Se aisló el ADN y se determinaron los cinco polimorfismos mediante PCR-RFLPs. Se compararon las frecuencias genotípicas y alélicas entre casos y controles y se obtuvieron valores de riesgo (OR, IC 95%) usando el paquete estadístico EpiInfo 2000. Las distribuciones genotípicas en el grupo control se ajustaron a las expectativas de Hardy-Weinberg para los cinco polimorfismos (p>0.33). La frecuencia de los polimorfismos C677T-MTHFR e ins68bp-CBS no mostró diferencia significativa entre casos y controles (p>0.05). En tanto que, la frecuencia del polimorfismo A66G-MTRR fue significativamente mayor en controles (48.8%) que en los casos (8.4%) (p<0.0001). La frecuencia de la variante A1298C-MTHFR demostró distribución de acuerdo al genero, así como diferencia significativa en el grupo de madres (p= 0.009). El análisis de los resultados arrojó que el polimorfismo A1298C-MTHFR representa un factor de riesgo asociado con tener descendencia con DCTN únicamente en el grupo de madres, mientras que el polimorfismo A66G-MTRR se asocia con los DCTN como factor de protección en todos los grupos estudiados. Así mismo, los polimorfismos C677T-MTHFR e ins68bp-CBS no se asocian con el riesgo par DCTN en la población de Yucatán. HACIA UNA TERAPIA GÉNICA PARA EL ALCOHOLISMO: ESTRATEGIA Y AVANCE. Sapag Amalia1, Ocaranza Paula1, Karahanian Eduardo2, Lobos Lorena1, Cortínez Gabriel1, Quintanilla María Elena3, Tampier Lutske3, Israel Yedy1,3. 1 Laboratorio de Farmacoterapia Génica, Departamento de Química Farmacológica y Toxicológica, Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, Universidad de Chile, 2 Facultad de Ciencias de la Salud, Universidad Diego Portales, 3 Programa de Farmacología Molecular y Clínica, Facultad de Medicina, Universidad de Chile. Santiago, Chile. La vulnerabilidad al alcoholismo está determinada en un 60 % por factores genéticos. Algunos individuos están muy protegidos de la enfermedad por una mutación en el gen de la deshidrogenasa aldehídica mitocondrial (ALDH2), enzima que degrada el acetaldehído proveniente del etanol y lo oxida a acetato. El acetaldehído circulante es aversivo y causa rechazo al consumo de alcohol. Esta protección se repite en la terapia farmacológica con disulfiram, un medicamento eficaz, pero tóxico e inespecífico, que inactiva la ALDH2 por modificación covalente. Una alternativa promisoria para disminuir la actividad de la ALDH2 es inhibir la expresión del gen de la ALDH2 por degradación o bloqueo del transcrito, estrategia que hemos abordado por tres vías. Un RNA de antisentido que bloquea el mensajero en toda su extensión se administró a ratas a través de un vector adenoviral portador de un gen de antisentido para el mRNA de la ALDH2. Una única inyección (i.v.) del virus en ratas alcohólicas (cepa Wistar, línea UChB) bajó la actividad de la ALDH2 hepática en 80 %, elevó 6 veces el acetaldehído arterial al inyectarles alcohol (i.p.), y redujo el consumo voluntario de alcohol al 50% durante 34 días. Por otro lado, hemos ensayado RNAs pequeños interferentes (siRNAs) y ribozimas en células en cultivo; ambos se unen a segmentos de menos de 20 nt del mRNA de la ALDH2. Un siRNA (dúplex de RNA que dirige la maquinaria celular a degradar el mRNA), disminuyó la actividad de la ALDH2 en 65 % al proporcionarse como tal, mientras que un plasmidio codificante de una horquilla precursora (shRNA) otorgó una disminución del 33 Presentaciones orales Memorias del Congreso Presentaciones orales II Congreso Nacional de Medicina Genómica 52 %. En forma similar, la lipofección con plasmidios portadores de genes de ribozimas de horquilla (RNAs que digieren el sustrato por acción autónoma) redujo la actividad de la ALDH2 en un 42 % aparente (24 % debido al corte del sustrato, 18 % a un efecto de bloqueo) que corresponde a una disminución del ~70 % de la actividad al considerar la vida media de la ALDH2 y la eficiencia de la lipofección. En suma, estos resultados avalan continuar el desarrollo de fármacos genéticos basados en disminuir la expresión del gen de la deshidrogenasa aldehídica mitocondrial para tratar el alcoholismo. EVALUACIÓN IN VITRO DE DNAZIMAS DIRIGIDAS CONTRA ARNM DEL GEN E6 DE VPH-16. Reyes-Gutiérrez, Pablo y Alvarez-Salas, Luis Marat. Laboratorio de Terapia Génica, Departamento de Genética y Biología Molecular, CINVESTAV, México. El Virus de Papiloma Humano tipo 16 (VPH-16), es el agente más común asociado al cáncer cérvico-uterino. Nuestro grupo ha utilizado ácidos nucleicos terapéuticos para impedir la 34 expresión de genes importantes para la supervivencia del VPH16. En el presente trabajo se ha evaluado el reconocimiento y degradación del ARNm del gen E6 de VPH-16 mediado por enzimas de ADN (DNAzimas), las cuales son moléculas de ADN catalíticamente activas que pueden reconocer y cortar ARN complementario. A partir de los prototipos de DNAzima 10-23 y 8-17, se diseñaron y probaron en un sistema in vitro varias DNAzimas dirigidas contra ARNm del gen E6 de VPH-16. La DNAzima 1023-434 fue capaz de reconocer de manera específica el blanco y promover un corte dentro de este. Un análisis bioquímico y genético de la actividad in vitro de 1023-434 permitió establecer las bases requeridas para catálisis, hibridación con el blanco y dependencia de [Mg++]. Las características de 1023434 difieren de la DNAzima 10-23 prototipo indicando que la adaptación a un blanco distinto altera la conformación de la DNAzima con su ARN complementario y afecta su actividad. Estos datos son relevantes para elaborar criterios de diseño y permitirán el desarrollo de DNAzimas como agentes terapéuticos contra el cáncer cervical. Memorias del Congreso 35 Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica Carteles Investigación Básica IB-01 MEDICINA GENÓMICA: ¿EL FUTURO EN LA DETECCIÓN DE ENFERMEDADES? Halabe-Bucay,Alberto 1. Hospital Angeles de las Lomas, México El desarrollo de nuevas tecnologías para la secuenciación de DNA ha dado como resultado la identificación del mapa genético humano y con esto el desarrollo inicial de la Medicina genómica, que tiene como base el conocimiento de las variaciones del genoma humano para implementar recomendaciones individuales dirigidas a retrasar o evitar las enfermedades a las que se tiene predisposición genética; es necesario recordar que aunque esté presente un gen determinado en el genoma de un individuo, por ejemplo el gen para hipertensión arterial, el gen para cáncer de páncreas o el gen para esclerosis múltiple, no necesariamente se tiene que expresar en la vida de un individuo. Los mecanismos de expresión genética son muy variados y aún desconocidos para la ciencia, existen factores que determinan la expresividad de un gen como factores nutricionales, factores metabólicos, factores endocrinológicos, factores inmunológicos, factores neurohumorales, factores membranales y de segundos mensajeros, factores ambientales, factores psicológicos, factores sociales, e incluso, factores culturales. En base a estos preceptos, la Medicina genómica debe considerar que la presencia de un gen en un individuo no lo sentencia a presentar la enfermedad que codifica dicho gen; para demostrar este hecho, convendría realizar secuenciación de DNA y mapeo genético en personas longevas o en cadáveres de pacientes fallecidos por alguna causa, y valorar si presentan los genes para determinadas enfermedades a las que pudieron estar predispuestos y que no se hayan expresado durante su vida. IB-02 VARIACIONES ELECTRÓNICAS Y ESTRUCTURALES DE LA CITOSINA DEBIDO A SU INTERACCIÓN CON AZUFRE. Mollinedo-Rosado, Pamela1, Santamaría-Ortiz, Rubén1. 1 Instituto de Física, Universidad Nacional Autónoma de México, México Distrito Federal. Cuando el azufre se convierte en un contaminante puede afectar importantes procesos biofísicos y bioquímicos. En este trabajo investigamos la interacción de la citosina con azufre. Hemos encontrado dos lugares igualmente probables donde el azufre puede enlazarse a la citosina. Los cambios en la energía, espectro vibracional, momento dipolar, poblaciones y distribuciones de carga, con respecto a la citosina sola, fueron cuantificados. La magnitud de estos cambios depende de la posición donde el azufre se enlaza a la citosina. Los cálculos fueron realizados de acuerdo a la versión Kohn - Sham de la Teoría de Funcionales de la Densidad. Concluimos que es posible que el azufre, enlazado a la citosina, interfiera localmente en la formación de pares de Watson - Crick y en el apilamiento de las bases nucleicas en las hélices de ADN o ARN. 36 IB-03 EFFECT OF AGE ON ACETYLATOR PHENOTYPE IN WISTAR RAT. Lares-Asseff Ismael 1, Pérez Guillé Ma. Gabriela 2, Toledo Alejandra 2 , Camacho Angélica 2 Bradley Francisco 1. 1 IPN-CIIDIR Durango. Laboratorio de Farmacogenómica y Biomedicina Molecular. 2 Laboratorio de Farmacología y Farmacocinética. Torre de Investigación “ Dr. Joaquín Cravioto “. Instituto Nacional de Pediatría-SSA. México City. Acetylation capacity during drug metabolism differs between species, gender and age groups. Objective:The purpose of this work was to determine variations in the acetylating phenotype (AP), in a longitudinal study, as a function of growth and development. Methods: Twenty male Wistar rats were studied. AP was determined on days 21, 48, 114, 180, 457 and 780 with oral doses of 30mg/Kg of sulphadiazine (SDZ) by urine collection. The Schröeder and Vree methods were used to obtain SDZ concentrations both acetylated and not acetylated. Rats were classified as slow or fast acetylators in accordance with previously validated metabolic indicators. Results: Of the 20 rats phenotyped at 21 and 48 days of age, 18 were slow and 2 were fast acetylators. As age and consequent growth progressed, changes in the expression of AP were registered. At 114 days, 16 rats were slow and 4 were fast acetylators; at 180 days, 12 were slow and 8 were fast; at 457 days, 6 were slow and 14 were fast; and at 780 days, the 20 rats were fast acetylators. Slow acetylation predominates at younger ages. Conclusions: The effect of growth and developmental progress on AP is evident and relates to previous reports of changes in AP, determined by age in animal and human models. The relevance of changes determined by growth and development should be considered in rational drug management. Key words: Metabolism, Age, Rat, Acetylator Phenotype. IB-04 DETECCIÓN DEL VIRUS DE EPSTEIN BARR POR REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA Audirac-Chalifour Asride Stephanie1,2, Gutierrez-Rubio Susan Andrea 1, Rosales-Gómez Roberto Carlos1, Mendizabal-Ruiz Adriana Patricia3, Suárez-Rincón Ángel Emilio4, Sánchez-Corona José1, Morán-Moguel María Cristina1 1 Centro de Investigación Biomédica de Occidente, División Medicina Molecular, IMSS; 2 Universidad Autónoma de Guadalajara, 3Doctorado en Genética Humana CUCS-UDG; 4 Hospital General Regional No 45, IMSS. Introducción Se ha descrito la presencia del genoma del virus oncogénico de Epstein-Barr (VEB) en tejido mamario proveniente de pacientes con cáncer de mama invasivo y se ha asociado con la agresividad del tumor. Debido a que el VEB puede ser un cofactor en el desarrollo de cáncer invasivo de mama, es de relevancia hacer este estudio en nuestra población. Objetivos Estandarizar un método de amplificación específica de dos regiones de ADN que corresponden a los genes gp200 y EBNA-2 del VEB para utilizarlo en el estudio de pacientes con cáncer de mama de nuestra población. La primera región (gp 200) sería utilizada para la detección del virus y la segunda (EBNA-2) para la tipificación. Material y métodos. Se utilizó ADN extraído de una muestra de sangre de un paciente con infección por EBV como control positivo de la amplificación y los iniciadores denominados Gp1 y Gp2 para el gen gp200 y E2p1 y E2p2 para el gen EBNA-2. Se estandarizó el método de RCP a partir del descrito en la literatura para la amplificación del gen gp200. Se realizó una curva de Mg+ y se utilizaron 12.5 pmol de cada iniciador por reacción, así como 1.25 U de Taq polimerasa. Los productos amplificados fueron sometidos a una electroforesis en gel de poliacrilamida 29:1 al 8% teñido con nitrato de plata. Para el gen EBNA-2 se estandarizó de la misma manera. Los productos amplificados fueron sometidos a una electroforesis en gel de poliacrilamida 29:1 al 6% con tinción de nitrato de plata. Resultados. Se obtuvieron los mejores resultados con una concentración de 4.5mM de MgCl2, para el gen gp200. Para el gen EBNA-2 el mejor rendimiento se obtuvo con una concentración de MgCL2 3mM. Conclusiones. La implementación de estas metodologías en nuestro laboratorio nos permitirá en un futuro establecer la frecuencia de este virus en la población que presente cáncer de mama y que tipo de VEB es el predominante. IB-05 EL GENOTIPO DE LA APOLIPOPROTEINA “E” EN HUICHOLES, MESTIZOS Y EN ENFERMOS CON ALZHEIMER. Rosales Gómez RC 1,2, Aguilar Aldrete M 3 , Cacavelos R 4 , Sandoval Ramírez L5, Gutierrez Rubio S1,2, Rodríguez Vega M3, Moran Moguel M1. 1 División de Medicina Molecular, Centro de Investigación Biomédica de Occidente. 2Doctorado en Genética Humana, Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara. 3 Departamento de Salud Pública, Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara. 4Euroespes 5Laboratorio de Bioquímica 4, Centro de Investigación Biomédica de Occidente. Introducción: El alelo E4 de la Apolipoproteina E (APOE) ha sido considerado un factor de riesgo para la demencia Alzheimer (DA) especialmente en demencia de inicio tardío. La DA es la tercera causa de muerte en países desarrollados. En México está enfermedad se está convirtiendo en un nuevo problema epidemiológico. El estudio del genotipo de la APOE en nuestra población permite obtener información básica sobre éste problema. Objetivo: se determinó el genotipo de la APOE en pacientes con DA, y dos grupos controles huicholes y mestizos con el fin de comparar las frecuencias con los casos. Material y Método: Se obtuvo el DNA de 40 pacientes con DA, 45 mestizos y 57 Huicholes. Los genotipos fueron identificados por PCR y Hha I digestión en gel de poliacrilamida al 20% teñido con nitrato de plata. Resultados: La frecuencia de alelos fueron: para el grupo de mestizos E2=0.04; E3=0.84 y E4=0.12 para los Huicholes: E2=0.05; E3:0.76 y E4:0.19; Tarahumaras: E2=0, E3=0.79 y E4: 0.21 y de los pacientes E2=0, E3=0.60 y E4=0.40. Conclusión: La distribución de los alelos en pacientes comparado con los grupos control muestran una significante diferencia. La distribución de alelos entre controles fue diferente y estos con grupo de casos, el alelo. El alelo más frecuente en controles fue E3 y en casos fue el alelo E4. Llama la atención que el alelo E2 considerado como protector de demencia fue superior en el grupo control de Huicholes. IB-06 DETECCIÓN DE LA DUPLICACIÓN GÉNICA DE PMP22 MEDIANTE ELECTROFORESIS CAPILAR Y DIAGNÓSTICO INTEGRAL DE CHARCOT-MARIE-TOOTH 1A EN PACIENTES MEXICANOS DEL INSTITUTO NACIONAL DE REHABILITACIÓN. Hernández-Zamora, Edgar1, Arenas-Sordo, María de la Luz1, Escobar-Cedillo, Rosa Elena 2, González-Huerta, Norma Celia1, Leyva-García Norberto1, Maldonado-Rodríguez Rogelio3. 1 Servicio de Genética. 2Servicio de Electrodiagnóstico. INR. 3 Departamento de Bioquímica, ENCB, IPN. Antecedentes: La enfermedad de Charcot-Marie-Tooth (CMT) es el desorden hereditario más común del sistema nervioso periférico humano, con una prevalencia de 1 en 2500. Presenta atrofia muscular peronea y pie cavo. El subtipo más frecuente CMT1A con una trasmisión autosómica dominante está asociado, en la mayoría de los casos con una duplicación en tandem de 1.5 Mb en 17p11.2-p12, que codifica para la proteína PMP22. La severidad de la enfermedad varía entre pacientes, aún dentro de la misma familia. Objetivos: Los objetivos de este trabajo fueron identificar la duplicación del gen PMP22 por medio de la amplificación del exón 2 de PMP22 y electroforesis capilar en pacientes con CMT del INR y realizar un estudio integral que incluyó aspectos clínicos, electrofisiológicos y moleculares. Material y métodos: Se realizó un estudio descriptivo y prospectivo, en el cual se incluyeron a 17 pacientes con diagnóstico clínico y electrofisiológico de CMT del INR. Para el estudio de la duplicación se amplificaron simultáneamente el exón 2 (155 pb) de PMP22 y el exón 51 de distrofina (388 pb), como control interno, en una reacción de PCR múltiple y fueron analizados mediante electroforesis capilar (EC) en un ABI PRISM 310 Genetic Analyzer. Resultados: Mediante EC capilar encontramos que en el control negativo el pico correspondiente al exón 51 fue mayor que el del exón 2 de PMP22, como esperábamos; en contraste, el control positivo para CMT1A y las muestras de pacientes con la duplicación, presentaron un pico mayor que correspondía al exón 2. Detectamos en seis pacientes la duplicación, y fueron corroborados mediante FISH. Conclusiones: Por lo anterior concluimos que nuestros resultados nos permiten asegurar que la electroforesis capilar es un método fácil y confiable para detectar la duplicación del gen PMP22, y que es fundamental realizar un estudio integral que incluya aspectos clínicos, neurofisiológicos y moleculares en pacientes CMT1A para establecer un diagnóstico correcto. IB-07 FENOTIPIFICACIÓN MOLECULAR DEL PROCESO DE REPARACIÓN EPITELIAL EN RATONES TRANSGÉNICOS BK6-E6/E7: P53 Y PRB COMO POSIBLES BLANCOS TERAPÉUTICOS EN REGENERACIÓN DE HERIDAS. Bonilla-Delgado José1*, Valencia-García Concepción2, OcádizDelgado Rodolfo1, Cruz-Colin José Luis1, Gariglio-Vidal Patricio1 y Covarrubias-Robles Luis2. 1 Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional (CINVESTAV-IPN), 1* Programa de Maestría del Departamento de Genética y Biología Molecular, (CINVESTAIPN), 2 Instituto de Biotecnología de la Universidad Nacional Autónoma de México (IBT-UNAM). La piel, dentro de sus múltiples funciones, es ante todo una barrera protectora contra el medio ambiente, y por tal motivo, cualquier ruptura debe ser rápida y eficientemente reparada. Para lograr esto, el sellado de una herida se divide en tres fases: 1) Inflamatoria, 2) De formación de tejido y 3) De remodelación de tejido. No obstante, si alguna de estas tres fases es deficiente o excesiva se generan distintos tipos indeseables de cicatrización que a menudo afectan el estilo de vida de millones personas en todo el mundo. Partiendo de un trabajo previo en ratones transgenicos en el que reportamos el efecto de los oncogenes 37 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica E6 y E7 (Que inactivan a las proteínas p53 y pRB respectivamente) sobre el ciclo del folículo piloso (1), y de los experimentos de Vollmar B. el cual reporta que la inhibición parcial de p53 mediante PFT- puede mejorar considerablemente el sellado de una lesión (2), nuestro grupo se interesó en el efecto que los oncogenes E6 y E7 puedan tener durante el proceso de regeneración de heridas profundas cuando se expresan bajo el control del promotor bovino de la citoqueratina 6b (bK6-E6/E7). Nuestros resultados demuestran que los oncogenes E6 y E7 tienen el efecto no sólo de generar una epitelización acelerada mediante el aumento de células de amplificación transitoria (TAs), sino que además, la expresión de E6 y E7 disminuye tan pronto como la expresión de la citoqueratina 6b se apaga (aproximadamente 2 semanas post-herida). Nuestros resultados sugieren que p53 y pRb podrían ser blancos potenciales para mejorar considerablemente el proceso de sellado de una herida. IB-08 ESTUDIO DE ASOCIACIÓN DE POLIMORFISMOS DE UNA SOLA BASE (SNPS) EN GENES CANDIDATOS CAPN10, IRS-1 Y PPAR-GAMA A DIABETES TIPO 2 EN POBLACIÓN MEXICANA. García-Fajardo Luz Verónica1,2, García Mena Jaime1, WacherRodarte Niels2, de la Vega Francisco3, Kumate, Jesús, CruzLópez Miguel2. 1 Departamento de Genética y Biología Molecular. CINVESTAV. i 2 Unidad de Investigación en Bioquímica. Hospital de Especialidades. Centro Médico Nacional Siglo XXI. IMSS. 3 Applied Biosystems, Foster City California, USA. México es un país en donde la Diabetes Tipo 2 (DT2) se ha incrementado ya que el 7.8% de la población la padece. Tres genes candidato y algunos de sus polimorfismos de un solo nucleótido se han seleccionado para este estudio: El Sustrato Receptor de Insulina 1 (IRS-1) y su SNP (Gly972Arg), que se asocia con una alteración en el transporte de glucosa. La proteasa Calpaína 10 (CAPN-10) en donde se encuentran los SNP 43 (G) y 44 (T) que se han asociado a un aumento en el riesgo de padecer DT2 en población México Americana. El Receptor-gama Activado por Proliferador de Peroxisomas (PPAR-gama), el cual tiene un SNP (Pro12Ala) que se asocia a un aumento en la sensibilidad a insulina y una disminución en el riesgo de DT2 en otras poblaciones, sin embargo en México existen muy pocos estudios de genotipificación en los que se asocie a DT2 con genes candidato. Objetivo. Determinar el genotipo de los genes CAPN10, IRS-1 y PPAR-gama en una muestra de población mexicana de la Ciudad de México y establecer si existe una asociación de estos genotipos y de una combinación de estos SNPs (cSNPs) al fenotipo de DT2. Materiales y Métodos. Se seleccionaron 577 pacientes con DT2 y 708 individuos sanos. Los participantes fueron sometidos a estudios bioquímicos en sangre periférica. Estos incluyen niveles de glucosa y perfil de lípidos, así como mediciones antropométricas. Se clasificaron en dos grupos: Pacientes con DT2 e individuos sanos. Se realizó la extracción de DNA, se verificó su integridad y pureza y se realizó la detección de los genotipos correspondientes a cada gen por medio de PCR en tiempo real utilizando sondas TaqMan. Resultados.- El análisis estadístico reveló que existe asociación del SNP44 del gen CAPN10 al fenotipo DT2 (p< 0.05), mientras que el SNP43 del mismo gen, el SNP Pro12Ala de PPAR-gama y el SNP Gly972Arg de IRS-1 no tuvieron asociación a DT2. La cSNPs 2212 también se asoció a este fenotipo y se presentó únicamente en los pacientes con DT2. Conclusiones.- De manera individual no todos los SNPs se encuentran asociados a DT2 pero cuando se encuentran formando una cSNPs como la 2212 esta puede servir como un marcador de predicción para el 38 desarrollo de DT2 en la población mexicana de la Ciudad de México. IB-09 EL CERDO PELÓN MEXICANO: UN POSIBLE MODELO ANIMAL PARA EL ESTUDIO DE LA OBESIDAD HUMANA. Camacho-Rea Maria del Carmen1, Bautista Rodríguez Marcos2, Arechavaleta Velasco Miguel 3, Spurlock Michael4, Gutiérrez Aguilar Carlos 1, Herradora Lozano Marco Antonio 1, Alonso Morales Rogelio1 1 Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia-UNAM, 2 Laboratorio de Análisis Clínicos Jilotepec, 3Centro Nacional de Investigación Disciplinaria en Fisiología Animal, INIFAP., 4 Iowa State University. El cerdo es un modelo importante en biomedicina debido a sus similitudes fisiológicas y anatómicas con el ser humano. El cerdo Pelón Mexicano (CPM) es una variedad local, el cual llega a desarrollar obesidad, característica que lo coloca como un posible modelo para el estudio de la obesidad y sus complicaciones. El objetivo de este estudio fue comparar las concentraciones de metabolitos y hormonas asociados a la obesidad entre CPM (n=12) y cerdos magros Landrace-Yorkshire (CLY) (n=14) desde 1 mes hasta los 9 meses de edad. Se evaluaron concentraciones séricas de glucosa (GLU), colesterol total (CT), triglicéridos (TG), lipoproteínas de alta densidad, (HDL) lipoproteínas de baja densidad (LDL) hormona del crecimiento (HC), leptina (LEP), insulina (INSU), ácidos grasos no esterificados (NEFAS) así como el espesor de la grasa dorsal (EGD). Los resultados mostraron que los CPM tuvieron mayores concentraciones de CT (F=11.61; gl=1,13; P<0.05), TG (F=11.47; gl=1,13; P<0.05), LDL (F=9.38; gl=1,12; P<0.05), INSU (F= 39.78; gl=1,24; P<0.0001), LEP (F= 8.08; gl=1,16; P<0.05) y NEFAS (F=10.19; gl=1,24; P<0.05). Sin embrago, no se encontraron diferencias entre genotipos en las concentraciones de GLU (F=0.05; gl=1,13; P>0.05), HDL (F=2.78; gl=1,13; P>0.05) y HC (F=0.61; gl=1,24; P>0.05). El perfil de lípidos y las concentraciones de leptina detectados en los CPM son semejantes a los reportados en el ser humano y en otros modelos animales de estudio de la obesidad. A pesar del fenotipo obeso de los CPM, estos no presentan alteraciones en las concentraciones de glucosa lo que también ha sido observado en seres humanos obesos. Finalmente, el incremento detectado en las concentraciones de insulina podría tener un papel importante en el desarrollo de la adiposidad del CPM. Estos resultados, junto con los estudios de expresión genética en tejido adiposo que realiza nuestro grupo, constituyen los primeros pasos para determinar las bases genéticas y moleculares que determinan el fenotipo obeso del CPM así como establecer su potencial como modelo de estudio de la obesidad humana. IB-10 POLIMORFISMOS ECORI AND BGLII ASOCIAN CON PROTECCIÓN A METÁSTASIS EN PACIENTES MEXICANAS CON CÁNCER DE MAMA. Gutierrez Rubio S1,2, Mendizábal Ruiz A1, Rosales Gómez R1,2, Suárez Rincón A3, Arévalo Lagunas I3, Vázquez Camacho J4, Flores Martínez S1, Sánchez Corona J1, Morán Moguel MC1. 1 División Medicina Molecular. Centro de Investigación Biomédica de Occidente (CIBO-IMSS). 2Doctorado en Genética Humana, Centro Universitario de Ciencias de la Salud, Universidad de Guadalajara. 3Hospital de Ginecobstetricia, Centro Medico Nacional de Occidente. 4Unidad de Anatomía Patológica, Centro Medico Nacional de Occidente. La reducida expresión del gen NME1 ha sido descrita en células con alto potencial metastásico, observado en cáncer de mama, cáncer gástrico y melanoma maligno. Los polimorfismos bialélicos EcoRI y BglII no han sido estudiados en asociación con metástasis de cáncer de mama. Objetivo: analizar los polimorfismos EcoRI y BglII del gen NME1 en pacientes con cáncer de mama. Materiales y Metodos: Se obtuvo el ADN de 110 bloques de tejido de mama incluidos en parafina (70 casos de cáncer de mama: 23 con metástasis y 18 sin metástasis; y 41 pacientes con enfermedad benigna) y 186 muestras de sangre de individuos de población general. Mediante PCR-RFLP diseñado por nuestro equipo se realizó la tipificación de los polimorfismos. Resultados. Los polimorfismos se encuentran en equilibrio Hardy-Weinberg. El genotipo polimórfico (3) de EcoRI es un factor protector (p<0.05), el genotipo (3) y el alelo (2) polimorficos de BgIII son un significativo factor de riesgo (p<0.05), las combinaciones de los genotipos 1/3 y 2/3 (EcoRI/BglII) son un factor de protección (p<0.001), y el haplotipo 1-2 (EcoRI/BglII) es factor protector (p<0.01). No se consideró la pérdida de heterocigocidad, sin embargo, es de 13% para el gen NME1. Conclusion. El polimorfismo EcoRI parece ser un factor protector y el polimorfismo BglII parece ser un marcador genético de riesgo, ambos para el desarrollo de metástasis. Encontramos una combinación de genotipos (1/3) y un haplotipo (1-2) que confieren protección para metástasis en la población Mexicana estudiada. IB-11 ANÁLISIS GENOTIPICO Y FENOTIPICO DE LA METILMALONIL-COA MUTASA EN PACIENTES CON ACIDEMIA METILMALÓNICA. Méndez ST 1,3, Vela M 1, Belmont L 1, Olivares Z 1, Ibarra I 2 , Velázquez A2 y Flores ME3. 1 Unidad de Genética de la Nutrición, INP; 2Depto de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental; 3Depto. de Biología Molecular y Biotecnología, Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM Introducción. La acidemia metilmalónica (AMM) es un error innato del metabolismo debido a la deficiencia de la metilmalonil-CoA mutasa (MCM), una enzima de la matriz mitocondrial que isomeriza del metilmalonil-CoA a succinil-CoA. Se conocen 2 fenotipos de esta enfermedad: mut- que implica disminución en la actividad de la enzima y el fenotipo mut0 cuando hay carencia de dicha actividad. Este método se realiza actualmente de forma indirecta. En el humano este gen se localiza en el cromosoma 6p12-21.2, consta de 35 Kb conteniendo 13 exones, un transcrito de 2,798 pb y una proteína de 750 aa. A la fecha se han identificado más de 180 mutaciones al rededor del mundo, siendo unas cuantas las prevalentes en determinadas poblaciones, tales como la japonesa (E117X), negros (G717V), caucásicos (N219Y) e hispanos (R108C). Objetivos. Identificar las mutaciones y la frecuencia en pacientes mexicanos diagnosticados con AMM, así como correlacionar el genotipo con el fenotipo de los pacientes mediante la construcción de las mutaciones y la determinación de la actividad enzimática. Métodos. Se obtuvo el DNA genómico de 18 pacientes con AMM y se realizaron las amplificaciones por PCR de todos los exones de la MCM. Por otro lado, se están realizando mutagénesis dirigidas, incluyendo las mutaciones R108C, R616C y V136F. La cuantificación de la actividad enzimática se realizará por HPLC. Resultados. A la fecha se han secuenciado 179 exones de un total de 234 y se localizaron 9 mutaciones; su frecuencia alélica fue para la R108C (20%), R616C (6%), R228X (3%), V227NfsX16 (3%), A631fQfsX17 (3%), N341KfsX20 (3%), R694W (3%), c.385+3insTAAGGGT (3%) y V136F (3%), siendo ésta última una mutación nueva. El gen MUT se obtuvo por RT-PCR a partir de RNA total de una muestra control. Se está utilizando un plásmido para hacer las construcciones y producir por mutagénesis dirigida las mutaciones antes descritas y expresarlas en E coli para cuantificar la actividad enzimática de las proteínas mutantes utilizando la técnica de HPLC. Conclusiones. De 9 mutaciones que se identificaron, 8 ya se encuentran reportadas. Al igual que en el trabajo reportado por Worgan en 2006, en nuestra población encontramos que la mutación R108C es la que se encuentra con mayor incidencia (en el 20% de los alelos). IB-12 ESTUDIO PRELIMINAR EN GENES MODIFICADORES RELACIONADOS CON LA EXPRESIVIDAD VARIABLE EN UN GRUPO DE PACIENTES MEXICANOS CON FIBROSIS QUÌSTICA. Chávez-Saldaña Margarita1, Carnevale-Cantoni Alessandra2, Lezana-Fernández José Luis 3 , Villarroel-Cortés Camilo 1 , Yokoyama-Rebollar Emiy1, García-de Teresa Benilde2 , Orozco Lorena 4. 1. Laboratorio de Biología Molecular INP, 2. Coordinación Nacional de Medicina Genómica ISSSTE, 3. Departamento de Neumología, Hospital Infantil de México, 4. Laboratorio de Genómica de Enfermedades Multifactoriales, INMEGEN. Introducción. La fibrosis quística (FQ) es la enfermedad autosómica recesiva más frecuente en la población caucásica. Las manifestaciones clínicas de la FQ pueden variar desde la esterilidad primaria hasta la afección pulmonar grave, con insuficiencia pancreática y desnutrición que pueden llevar al paciente a la muerte. Los estudios de correlación genotipofenotipo muestran que la función pancreática correlaciona directamente con el genotipo, mientras que las otras manifestaciones varían en pacientes con el mismo genotipo e incluso entre hermanos que comparten el mismo ambiente. Por lo que se postula que existen otros factores genéticos que no son los directamente responsables de la enfermedad, pero que influyen sobre su gravedad. Estudios recientes documentan la existencia de genes modificadores en FQ como TNF-alfa1, MBL, alfa 1-AT, alfa1-ACT, beta-2AD, IL-10, entre otros. Objetivos. 1) Determinar las frecuencias de las variantes alélicas en los genes potencialmente modificadores TNF alfa, IL-10, MBL, beta-2AD, alfa1-AT y alfa1-ACT en un grupo de pacientes mexicanos con FQ. 2) Determinar la asociación de los genes alfa1-AT y alfa1-ACT con la afección pulmonar de los pacientes con FQ. Material y Métodos. DNA genómico de 34 pacientes con genotipo CFTR, TAQMAN Universal PCR Master Mix, Amplitaq polimerasa (Applied Biosystems), Enzimas de restricción AluI, TaqI, DdeI y BstNI (Biolabs). Se realizó el análisis de discriminación alélica en 34 pacientes con FQ mediante el método de TAQMAN en los genes TNF-alfa1, IL10, MBL, beta-2AD, así como mutagénesis dirigida y RFLP´s en los genes alfa1-AT y alfa1-ACT. Se determinó la afección pulmonar mediante la mejor medición de FEV1, tipo de cultivo de secreciones bronquiales al ingreso, edad del primer cultivo por P. aeruginosa, estado actual vivo o muerto. Se realizó el análisis estadístico para determinar la asociación de la afección pulmonar con los genes alfa1-AT y alfa1-ACT. Se consideró significativo un valor de p<0.05. Resultados. En un grupo de 34 pacientes con genotipo CFTR, se analizaron 13 variantes alélicas en los genes modificadores ya mencionados y se determinaron las frecuencias para cada uno de ellos. En la correlación de la afección pulmonar con las variantes alélicas de los genes alfa1-AT y alfa1-ACT se encontró homogeneidad en cuanto a edad y género, y no hubo diferencias significativas para las variables de respuesta (determinación de FEV1, tipo de cultivo de secreciones bronquiales al ingreso, edad del primer cultivo por P.aeruginosa, estado actual vivo o muerto). 39 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica Discusión. Las frecuencias de las variantes alélicas en este estudio son acordes a lo reportado en la literatura, tanto en poblaciones similares a la nuestra como en población caucásica. En un estudio reciente del gen MBL en población general de grupos amerindios de Argentina y Perú, reporta frecuencias alélicas para los alelos B, C y D de 42%, 3% y 0%. De igual forma, en población caucásica con FQ, la frecuencia de los alelos S y Z del gen alfa1-AT se reporta del 8% y 4%. El no haber encontrado relación de las variantes alélicas de alfa1-AT y alfa1ACT con la afección pulmonar, puede deberse a la ausencia de influencia de estos genes o bien al reducido tamaño de muestra de nuestro estudio. Consideramos que es importante identificar los genes que influyen en la afección pulmonar en estos pacientes, lo que probablemente logre predecir la evolución clínica e individualizar el tratamiento. IB-13 APLICACIÓN DE VECTORES ADENOVIRALES PARA LA EXPRESIÓN TRANSITORIA DE GFP EN CULTIVOS PRIMARIOS DE CÉLULAS BIPOLARES DE RETINA. Martínez-Delgado, Gustavo1, Martínez-Dávila, Irma1, Miledi, Ricardo1 y Martínez-Torres Ataúlfo1. Instituto de Neurobiología, Universidad Nacional Autónoma de México–Campus Juriquilla, Querétaro, México. El estudio de las propiedades moleculares de neuroreceptores y canes iónicos de células de retina se ha visto limitado debido a la baja eficiencia que ofrecen las técnicas convencionales de transfección de DNA. Como alternativa para lograr la introducción de genes en células bipolares en cultivo se exploró la capacidad de vectores adenovirales. Los adenovirus además de ofrecer un vehículo potencial para la terapia génica, son también muy eficientes en la transducción de células de linaje neuronal. Por lo que el objetivo de este trabajo fue el expresar la proteína verde fluorescente (GFP), en neuronas bipolares en cultivo utilizando vectores adenovirales (Ad5). Ad5-GFP se propagó en células HEK 293, el sobrenadante de estos cultivos se utilizó para la transducción de células de retina, las cuales se obtuvieron de ratas de 9 días postnatales. Después de 7-10 días in vitro se observó la diferenciación de varios tipos neuronales y gliales. Las células bipolares mostraron su típica morfología, con un soma del cual parten los procesos axonal y dendrítico. 24 h post-infección con Ad5-GFP, se observó por microscopía de fluorescencia que el 70-90 % 90 % de la población celular expresaba GFP (Figuras a y b). Estos resultados presentan un importante paso para el uso de vectores adenovirales marcados con proteínas fluorescentes para el estudio de neuronas bipolares de retina. Eventualmente esta metodología se aplicará en el desciframiento de los mecanismos envueltos en la señalización y tráfico de canales iónicos, de sus posibles implicaciones fisiopatológicas y de como estos estudios posteriormente pudieran llevar a la aplicación directa de vectores adenovirales en terapia génica de la retina. IB-14 EL ALELO CYP2C19*2 ESTA ASOCIADO CON NIVELES ALTOS DE COLESTEROL EN MUJERES Y EN PACIENTES CON DIABETES TIPO 2. Los citocromos P450 (CYP) se encuentran entre los genes con mayor relevancia clínica debido a su papel sobre el metabolismo de fármacos. Uno de los miembros de la familia 2C, el CYP2C19, es quizá el gen más variable entre poblaciones humanas debido a la presencia de tres alelos principales: 1, 2 y 3. Este último solo esta presente en poblaciones orientales, por lo que se esperaría que también estuviera presente en la población 40 mexicana. Entre los sustratos de esta enzima se encuentran el omeprazol, la mefenitoína, el proguanil, algunas benzodiazepinas y el propranolol. Se sabe que la población mexicana en el occidente presenta tres fenotipos: 6% metabolizadores deficientes, 90% metabolizadores extensos y 4% metabolizadores ultra-extensos. Sin embargo no se cuenta con datos de sus genotipos. Dado que la expresión del CYP2C19 depende de glucocorticoides y dada la alta prevalencia de la diabetes tipo 2 en la población mexicana se planteo la posibilidad de que ambos estuvieran relacionados. Con este objeto se analizaron casi 700 sujetos. La mitad pacientes con diabetes tipo 2 y la mitad voluntarios sanos, contando con la firma de su consentimiento informado. Se encontró una frecuencia del alelo CYP2C19*2 de 10% entre los pacientes con diabetes tipo 2 y de 8% en los voluntarios sanos. Ambos grupos se encontraban en equilibrio de Hardy-Weinberg. El alelo CYP2C19*3 no se encontró en ningún sujeto. No se encontró que ninguna de las combinaciones de los genotipos del CYP2C19 estuviera asociada con la diabetes. Se encontró una asociación significativa entre niveles altos de cortisol y los portadores del haplotipo CYP2C19*2 en pacientes con diabetes tipo 2. Así mientras los pacientes hombres tienen un promedio de 200 mg/dL de colesterol en los homocigotos silvestres, los portadores del alelo 2 lo tienen en 216 mg/dL. Las mujeres con diabetes tipo 2 tienen 195 mg/dL si son silvestres y 212 si son portadoras del CYP2C19*2. En cambio no hay diferencias en los hombres sanos con un promedio de 195 mg/ dL y adicionalmente las voluntarias sanas sin portar la mutación tienen 198 mg/dL contra los 212 de las portadoras. En conclusión, este trabajo muestra que la frecuencias de los principales alelos del CYP2C19 son relativamente bajas en comparación con otras poblaciones, de hecho no se encuentra el alelo *3. El CYP2C19 no esta asociado con la diabetes pero si con los niveles de colesterol en ambos géneros de los pacientes con diabetes tipo 2 y en mujeres sanas. IB-15 EFECTO PROTECTOR DEL ALELO 2 DE APOE AL DESARROLLO DE ESQUIZOFRENIA EN UNA MUESTRA DE PARES DE HERMANOS AFECTADOS. Tovilla-Zarate, Carlos Alfonso1, Camarena-Medellín, Beatriz2, Fresan, Ana2, Nicolini Humberto1. 1 Posgrado en Ciencias Genómicas Universidad de la Ciudad de México., 2 Laboratorio de genética del Instituto Nacional de Psiquiatría Ramón de la Fuente, México D. F. La esquizofrenia se caracteriza por la presencia de delirios, alucinaciones, disminución de pensamiento, la efectividad, y deterioro cognitivo. Esta enfermedad es muy común y afecta al 1% de la población mundial, sin embargo, la etiología permanece desconocida. Diversos genes son considerados de riesgo, entre ellos el gen de la ApoE. La literatura sugiere que el alelo epsilon 4 del gen de la ApoE es un factor de riesgo para el desarrollo de la esquizofrenia y que disminuye la edad de inicio de la enfermedad. Nosotros evaluamos la asociación de los alelos de ApoE y esquizofrenia en una muestra de pares de hermanos afectados. En este estudio participaron 60 familias mexicanas con al menos dos pacientes con esquizofrenia. El diagnostico se basó en los criterios diagnósticos del DSM-IV. También se incluyo una muestra control. El ADN genómico se extrajo de sangre periférica mediante el método modificado de Lahirí. Las muestras fueron amplificadas por técnicas de PCR, los productos de PCR fueron digeridos utilizando la enzima Cfo-I. Los fragmentos de digestión fueron resueltos en geles de poliacrilamida al 6%, teñidos con bromuro de etidio. Cuando se analizaron las frecuencias de los diferentes grupos (probando, hermanos afectados, hermanos no afectados, control) no se encontraron Memorias del Congreso 41 Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica diferencias por alelos (2=4.202, gl=6, p=0.6493) ni por genotipos (2=7.827, gl=9, p=0.5517). Sin embargo cuando dividimos la muestra por genero se observo un exceso del genotipo 2/3 en los hombres del grupo de hermanos no afectados (23.8%) respecto a probandos (12.8%) y hermanos no afectados (0%) Lo cual fue estadísticamente significativo por alelos (2=8.41, gl=2, p=0.0149) y por genotipos (2=8.010, gl=2, p=0.0182). En nuestro trabajo no observamos una asociación del alelo 4 de ApoE y la susceptibilidad al desarrollo de esquizofrenia, sin embargo observamos que el alelo 2 podría estar asociado como un alelo de protección al desarrollo de esquizofrenia. IB-16 IDENTIFICACIÓN DE ANTÍGENOS ASOCIADOS A LAS MEMBRANAS DE VESÍCULAS DE HELICOBACTER PYLORI Ayala, Guadalupe1, Mendoza-Hernández Guillermo2, GutiérrezXicotencatl, Lourdes1, Fierros-Zárate, Geny1, Pedroza-Saavedra, Adolfo1, Chihu, Lilia 1, Chagolla, Alicia 3 y González de la Vara Luis G3. 1 Instituto Nacional de Salud Pública, Cuernavaca, México, 2 Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, DF, México. 3CINVESTAV-INP, Irapuato, México. Helicobacter pylori (H. pylori), patógeno humano considerado como el principal agente etiológico de enfermedades como la gastritis, la úlcera péptica y el cáncer gástrico. Algunos de los factores de virulencia son secretados por H. pylori al medio extracelular causando el daño que lleva a la transformación celular promoviendo el desarrollo de las enfermedades gastroduodenales graves. Se ha reportado que H. pylori libera constantemente vesículas de membrana externa (VME) y se ha encontrado que la citotoxina vacuolizante (VacA) –uno de los principales factores de virulencia- está asociada a dichas vesículas. Se ha observado en cortes de biopsias gástricas obtenidas de pacientes infectados con H. pylori que las vesículas pueden unirse y aún entrar a las células epiteliales gástricas. Por lo que se ha propuesto que las vesículas podrían funcionar como un mecanismo alterno para la secreción de factores de virulencia. En este trabajo analizamos la composición de las VME derivadas de aislamientos clínicos de H. pylori, utilizando el fraccionamiento, la secuenciación de Edman y la electroforesis de geles bidimensionales seguida de análisis por espectrometría de masas para la identificación y resolución de proteínas. También investigamos la frecuencia con la que los factores de virulencia presentes en las vesículas fueron reconocidos por los sueros de pacientes infectados por H. pylori. Entre las proteínas asociadas a las membranas de las vesículas que fueron identificadas: la citotoxina vacuolizante VacA, alkil hidroperóxido reductasa (AhpC), flagelin A (FlaA), catalasa, factor de elongación (EF-G), factor de elongación Tu (EF-Tu), ureasa subunidades A y B. La ureasa, VacA y la catalasa fueron los antígenos más reconocidos. Nuestros resultados demostraron que algunos factores de virulencia son secretados por las VME producidas por H. pylori. Estos resultados apoyan la propuesta de que la liberación de vesículas de membrana externa por H. pylori representa un mecanismo para transportar toxinas y antígenos bacterianos a la mucosa gástrica. IB-17 UN HAPLOTIPO DEL FACTOR REGULADOR DEL INTERFERON 5 (IRF5) COMO FACTOR DE RIESGO GENÉTICO EN LA SUSCEPTIBILIDAD A DESARROLLAR LUPUS ERITEMATOSO SISTÉMICO DE INICIO EN LA EDAD PEDIÁTRICA. 42 Velázquez-Cruz R. 1,2, Baca-Ruíz V. 3, Salas-Martínez G. 1,4, Espinosa-Rosales F.5, Morales-Marín M.1, Orozco L.1,4. 1 Instituto Nacional de Medicina Genómica, SS. 2Programa de Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM. 3Hospital de Pediatría Centro Médico Nacional Siglo XXI, IMSS. 4Programa de Posgrado en Ciencias Genómicas, UACM. 5Instituto Nacional de Pediatría, SS. El Lupus Eritematoso Sistémico (LES) es una enfermedad autoinmune compleja que se caracteriza por la activación de la ruta del interferón (IFN) tipo I. Recientemente varios estudios han identificado SNPs en el gen IRF5 (factor regulador de interferón 5) asociados con la susceptibilidad a desarrollar Lupus Eritematoso Sistémico (LES) y artritis reumatoide (AR), en población adulta. El gen IRF5 es un miembro de una familia de factores de transcripción, crítico para la producción de las citocinas pro inflamatorias TNF-alfa, IL-12 e IL-6 siguiente a la señalización del receptor Toll-Like (TLR), también es importante para la transactivación del IFN tipo 1 y genes sensibles-IFN. Dado el papel crucial propuesto para el gen IRF5 en la susceptibilidad del LES, es necesario analizar la participación de este gen en pacientes mexicanos, por lo que el objetivo de este trabajo es determinar si los SNPs rs2004640 G/T y rs2280714 C/T del gen IRF5, se encuentran asociados a la susceptibilidad para desarrollar LES. Para evaluar esta asociación se realizó un estudio de casos y controles en una muestra de 250 pacientes pediátricos mexicanos con LES y 314 controles mexicanos sanos no relacionados, pareados por sexo y origen étnico. La discriminación alélica se llevó al cabo por el método fluorescente de 5’ exonucleasa (Taqman). La asociación de los SNP’s del gen IRF5 fue analizada por la prueba de chi-cuadrada entre casos y controles. La construccion de haplotipos y la prueba de desequilibrio de transmisión (TDT), se realizó con el programa HAPLOVIEW v3.2. El alelo T del SNP rs2004640 mostró una frecuencia significativamente mayor en los pacientes que en los controles, (63% vs 47%; P=2.98 x 10-7; OR=1.86, 95% IC= 1.47-2.37). Así mismo, también el alelo T del SNP rs2280714 mostró una frecuencia más alta en los pacientes que en los controles; 66% vs 56% P=0.00083, OR=1.51, 95% IC=1.19-1.93). Con el propósito de eliminar la posibilidad de estratificación, estos resultados fueron confirmados mediante un estudio de asociación basado en familias (n=133 tríos), usando la prueba de TDT (IRF5 rs2004640, P=0.014 y IRF5 rs2004640, P=0.05). Mediante el análisis de haplotipos se logró documentar que aquel formado por ambos alelos de riesgo (TT) muestra desequilibrio de transmisión en los casos analizados, (Transmitido:No Transmitido, 82:51; P=0.007). Nuestros resultados apoyan la asociación de IRF5 con LES y muestran la identificación de un haplotipo de riesgo que podría jugar un papel importante en el LES de inicio temprano en la población mexicana. IB-18 ASOCIACIÓN DE SNP’S DEL GEN CTLA4 EN PACIENTES PEDIÁTRICOS MEXICANOS CON LUPUS ERITEMATOSO SISTÉMICO. Salas-Martínez G. 1,2, Baca-Ruíz V. 3, Velázquez-Cruz R. 1, Espinosa-Rosales F.4, Jiménez-Morales S.1, Orozco L.1,2. 1. Instituto Nacional de Medicina Genómica, SS. 2. Programa de Posgrado en Ciencias Genómicas, UACM. 3. Hospital de Pediatría Centro Médico Nacional Siglo XXI, IMSS. 4. Instituto Nacional de Pediatría, SS. El lupus eritematoso sistémico (LES) es el prototipo de las enfermedades autoinmunes cuya prevalencia es de 1 en 2,000 individuos, de los cuales del 15-17% se manifiestan durante la infancia. El LES se caracteriza principalmente por la formación de autoanticuerpos, complejos inmunes y pérdida de tolerancia. Existen evidencias de que el gen que codifica para el antígeno 4 de linfocito T citotóxico (CTLA-4) cuya función es inhibir la activación de las células T y el mantenimiento de la tolerancia periférica tiene una participación importante en el desarrollo de esta entidad. A la fecha se han descrito 3 SNP’s que confieren riesgo para desarrollar LES. Con el objetivo de conocer sí SNP’s en el gen CTLA4 se encuentran asociados a LES en pacientes pediátricos mexicanos, se analizaron tres polimorfismos (-318C/T, 49A/G y CT60A/G). Se realizó un estudio de casos y controles en el que se incluyeron 245 pacientes con diagnóstico de LES y 360 controles sanos no relacionados. Los SNP’s se caracterizaron por el método fluorescente de 5’ exonucleasa (Taqman). La comparación de las frecuencias de alelos, genotipos y haplotipos se realizó utilizando los programas EPIINFO y HAPLOVIEW v3.2. mediante la prueba de chicuadrada. La distribución de las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos 318C/T y 49A/G no mostró diferencias significativas entre los pacientes con LES y los controles. Sin embargo el análisis del polimorfismo CT60A/G mostró una frecuencia mayor comparada con los controles (47.35% vs 41.67%, P = 0.05, OR=1.26 95% CI = 0.99-1.59). El haplotipo CGG fue más de dos veces más frecuente en los pacientes femeninos comparado con lo reportado en la literatura (42.14% vs 20.3%, P= 0.03). Nuestros resultados sugieren que el polimorfismo CT60A/G es un factor de riesgo para el desarrollo de lupus eritematosos sistémico en población pediátrica mexicana. Por otra parte, la discrepancia entre la frecuencia de los haplotipos observada en nuestro estudio y lo reportado en la literatura podría ser explicado por la heterogeneidad genética y las diferencias étnicas que existen entre las poblaciones. IB-19 ANÁLISIS DE LA EXPRESIÓN DEL GEN RB-1 A NIVEL DE SU TRANSCRIPCIÓN A MRNA EN TUMORES DE PACIENTES AFECTADOS CON RETINOBLASTOMA. Macías-Vega Miguel 1*, Ocadiz Delgado Rodolfo 2, Pacheco Espinosa Cesar 2, Cruz Colín J. Luis 2, Gariglio Vidal Patricio 2 , Ridaura Sanz Cecilia 3, García Vázquez Francisco 3, Orozco Orozco Lorena 4 1.-Instituto Nacional de Pediatría, Lab. Biología Molecular *, 2.CINCESTAV-IPN, Lab. Genética y Biología Molecular, 3.- Instituto Nacional de Pediatría, Depto. Patología, 4.- Instituto Nacional de Medicina Genómica, Laboratorio de Genómica de Enfermedades Multifactoriales. Introducción En un proceso celular normal la expresión del gen rb-1 es fundamental para controlar la proliferación celular de los retinoblastos, y cualquier mutación que altere la secuencia del gen puede inhibir su expresión y dar lugar a un proceso neoplásico en la retina (1), sin embargo existen reportes en la literatura donde se han detectado mutaciones solamente en el 15-20% de los pacientes con retinoblastoma(2,3,4). En un estudio previo realizado en 48 pacientes del INP se detectaron mutaciones solamente en el 29% de los pacientes estudiados, incluyendo pacientes con antecedentes hereditarios y no hereditarios. Resulta interesante determinar si el gen rb-1 se está expresando en los tumores de aquellos pacientes que resultaron negativos en el rastreo de mutaciones y que pudiesen estar asociadas al desarrollo del tumor tal y como lo indica la literatura. Por lo anterior, el objetivo de este trabajo fue analizar la expresión del gen rb-1 al nivel de su transcripción a mRNA en los tumores de pacientes sin mutaciones asociadas al desarrollo del tumor. Material Se captaron 68 muestras de tumores, todos fueron incluidos en parafina y 66 de ellos se incluyeron en alcohol al 70%. Métodos Para determinar un proceso de transcripción positiva, se sintetizó por transcripción reversa el cDNA correspondiente al mRNA del gen rb-1. De 68 pacientes captados 68 se analizaron por RT-PCR in vitro Fig. a) y de ellas 26 se analizaron por RT-PCR in situ Fig. b). Se consideró cada resultado como positivo si se lograba obtener cDNA por RT-PCR in situ o in vitro, o en ambas pruebas. A cada muestra de RNA extraído se le realizó como prueba de integridad la identificación del RNA ribosomal 16s y 18s. Para evitar falsos positivos los vestigios de DNA se eliminaron mediante la aplicación de DNAsas antes de cada procedimiento. Resultados Encontramos que sólo 32 de 68 pacientes (47%) resultaron con una expresión positiva del gen RB1 lo cual resulta muy interesante si tomamos en cuenta que sólo el 29% de nuestros pacientes tienen una mutación asociada al gen rb-1 y que la incidencia de casos unilaterales no hereditarios que ocurren durante el primer año de edad es mayor a lo reportado en la literatura para otras poblaciones. Conclusiones. Estos resultados junto con los de estudios previos sugieren que en el 30% de nuestros pacientes el tumor se desarrolla sin la intervención de mutaciones en el gen rb-1, lo cual podría explicar el comportamiento del tumor unilateral no hereditario. Una vía alterna para un funcionamiento erróneo del gen rb-1, podría estar asociada a los mecanismos que regulan la transcripción del gen rb-1. Sin embargo, aún e s necesario realizar en las muestras positivas la búsqueda de la proteína pRB110 para poder confirmar la expresión positiva del gen rb-1 y así mismo explicar el comportamiento del retinoblastoma en pacientes que no tienen mutaciones asociadas al desarrollo del tumor. IB-20 LA ACTIVACIÓN HEPÁTICA INAPROPIADA DE PPARA_ SE ASOCIA A DEFECTOS EN EL METABOLISMO ENERGÉTICO DEL RATÓN ABCD3. Silva-Zolezzi Irma1,2, Bradley Sean3, Valle David3,, JiménezSánchez Gerardo2,3. 1 Programa Doctoral en Biomedicina Molecular, CINVESTAV, México. 2Instituto Nacional de Medicina Genómica, México. 3 McKusick-Nathans Institute of Genetic Medicine, Johns Hopkins University, Baltimore, MD, USA. Hasta ahora se han descrito 4 medios transportadores ABC en la membrana peroxisomal humana: ALD, ALDR, PMP70 y P70R, codificados por los genes ABCD1, 2, 3, y 4, respectivamente. Mutaciones en ABCD1 causan Adrenoleucodistrofía ligada al X, no se conoce la función y la asociación a enfermedad de los otros tres genes. Los ratones Abcd3-/- son viables; presentan glucógeno hepático reducido; aciduria dicarboxílica; oxidación deficiente de los ácidos grasos a-ramificados: fitánico y pristánico; y tienen un defecto en la termogénesis adaptativa. Proponemos que PMP70 contribuye al transportador peroxisomal de ácidos grasos a-ramificados, en su ausencia, los ácidos fitánico y pristánico se acumulan, causando la activación inapropiada de PPARa_a y por lo tanto la activación del metabolismo energético. Esta hipótesis se apoya en la sobreexpresión hepática sostenida de blancos de PPARa en ratones Abcd3-/-. Para continuar el análisis de los mecanismos moleculares relacionados a este fenotipo, realizamos un análisis de expresión en hígados Abcd3/- y controles con microarreglos Affymetrix âU74Av2. En este experimento identificamos cambios en la expresión >1.8X en 78 genes que se sabe son regulados por PPARa, incluyendo aquellos que habíamos analizado por Northern blot. En total, encontramos cambios en la expresión de 209 genes, incluyendo 94 incrementados y 115 disminuidos con respecto a los controles. Clasificamos estos genes por proceso biológico de acuerdo a Gene Ontologyä. Del total de genes, 40 (19%) se relacionaron al 43 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica metabolismo de lípidos, incluyendo a genes relacionados al anabolismo y catabolismo de ácidos grasos, formando el grupo más grande, en el cual la mayoría mostraron incrementos en el cambio de expresión; 28 (13%) se relacionaron a la respuesta inmune, la mayoría mostrando decrementos en el cambio de expresión, lo que es consistente con el conocido papel antiinflamatorio de PPARa. Particularmente, llama la atención la reducción en la expresión de lipocalina 2 (Lcn2) y el componente P del amiloide sérico (Apcs), pues previamente se ha reportado incrementada en carcinomas hepatocelulares de ratones sometidos a exposiciones prolongadas a agonistas endógenos y sintéticos de PPARa. Estos resultados apoyan nuestra hipótesis que identifica como causa del severo fenotipo metabólico de los ratones Abcd3-/-, a una activación inapropiada de PPARa_ que da lugar a la activación del metabolismo energético. Este modelo enfatiza las profundas y generalizadas consecuencias que pueden ocurrir a partir de un defecto monogénico. IB-21 COHORTE DE LA FRECUENCIA DE ANTIGENOS LEUCOCITARIOS DEL HUMANO (HLA) EN POBLACION MEXICANA MESTIZA CON DERMATOPOLIOMISITIS Delgado-Ochoa, M. D*; Núñez-Farfán, R*; Vidal-Saucedo, F*; Piña-Olvera,V* López-Morales, E*; Lugo Zamudio G. E.º * Laboratorio de Histocompatibilidad, º Servicio de Reumatología del Hospital Juárez de México, SSa. Introducción: La dermatopoliomisitis (DM) es una enfermedad del tejido conjuntivo que afecta a personas jóvenes, la extensión y la gravedad de las lesiones no guardan correlación con la amplitud y gravedad de la miositis, las principales afectaciones se presentan en piel, dolor muscular y articular, inflamación, telangectasias periunguele, las extremidades presentan contracturas, calcicosis cutánea, vasculopatía sistémica, infiltración celular, daño renal y pulmonar que en ocasiones tiene significancia de malignidad. Los HLA están involucrados en este tipo de padecimientos ya que existen factores genéticos que contribuyen a la etiología. Objetivo: Determinar los alelos de HLA más frecuentes en pacientes mestizos mexicanos con dermatopoliomisitis. que acudieron al Servicio de Reumatología del Hospital Juárez de México. Material y Métodos: Estudio de casos y controles donde se estudiaron a 23 pacientes con diagnóstico de dermatopoliomisitis de acuerdo a los criterios descritos por de Bohann y Peters, comparándolos con el grupo control de 100 personas sanas (pertenecientes al protocolo de donador vivo relacionado de trasplante renal). La determinación de HLA se realizo por la tipificación de los siguientes alelos: Clase I 32 sueros y HLA 22 sueros,. Análisis de datos: la distribución de la frecuencia de antígenos de HLA en los 23 pacientes fue computada y comparada con la frecuencia de 100 sujetos controles, la prueba de X2 fue utilizada para la significancia estadística, se aplico la tabla de contingencia 2x 2 con una P<0.05 y la prueba de Fisher’s exacta, el riesgo relativo (OR) de la DM con un intervalo de confianza del 95%. Discusión: El análisis de la frecuencia de los 100 controles concordaron con los reportes de los Drs. Arellano y Gorodesky, donde los HLA frecuentes en mestizos mexicanos son A2, A28, B5 y B35, en el grupo de pacientes estudiados estadísticamente significativos fueron los alelos B37 y DR8 (17.3 y 8.68) y control (1 y 0) y el riesgo relativo fue de 4.97 y 5.67 respectivamente, comparándolos con estudio realizados en raza africana, japonesa y caucásica donde han obtenido los HLA B8, DQ3 (Tezack 2002), DQ8 (Enas 2004), A24,B7,B52 (Furuya 1998) y 44 DQ1, DQ2,DQ3 (Reed 1999) respectivamente. Conclusión: Se puede sugerir que los alelos B37 y DR8 presentes en la raza mestiza mexicana tienen mayor riesgo relativo de presentar dermatopoliomisitis, así mismo se obtuvo que el alelo B35 pudiera ser un antígeno de protección para no desarrollar la enfermedad. El presente estudio es un primer reporte ya que se deberá realizar estudios por biología molecular para tener mayor conocimiento de la enfermedad en nuestra población. Investigación Clínica IC-01 POLIMORFISMO TTTA DEL GEN DE LA AROMATASA Y SU RELACIÓN CON LA DENSIDAD MINERAL ÓSEA EN UNA MUESTRA DE MUJERES MEXICANAS. Casas A. Leonora*, Gómez O. Rocío*, Magaña A. Jonathan*, Castro H. Clementina+, Rubio L. Julieta+, Diez G. Pilar*, y Valdés F. Margarita*. *Servicio de Genética, Instituto Nacional de Rehabilitación, SS; +Instituto de investigaciones Biomédicas, UNAM. Antecedentes. La osteoporosis (OP) es un padecimiento que se caracteriza por reducción de la densidad mineral ósea (DMO) y deterioro de la micro-arquitectura. La Organización Mundial de la Salud (OMS) considera que la OP es el segundo problema de salud pública mundialmente y calcula que 200 millones de mujeres la padecen. La OP es el segundo problema de salud pública en México. Las etadísticas en México indican que el 27 % de las mujeres mayores de 50 años tienen una masa ósea normal, mientras que el 57% cursan con osteopenia y el 10 % con OP, es decir que 5 millones de mujeres en nuestro país tienen OP. Este es un desorden multifactorial y poligénico y se ha estimado que del 60 al 80% de la varianza en la DMO se debe al componente genético. Existe una cantidad considerable de genes involucrados en el control de la DMO y se han reportado un gran número de polimorfismos asociados con la OP. El gen de la aromatasa (CYP19) es uno de ellos. En él se ha identificado un microsatélite tetranucleótido (TTTA) en el intrón 4. Objetivo. Analizar la distribución de un polimorfismo microsatélite en el gen CYP19 en una muestra de mujeres mexicanas con y sin OP. Material y Métodos. Se estudiaron 62 mujeres mexicanas con OP y 65 sin OP en columna vertebral. El diagnóstico se realizó por absorciometría dual de rayos X (Hologic 2000), según los criterios establecidos por la OMS para definir la presencia o ausencia de OP. De cada mujer se obtuvo DNA de leucocitos de sangre periférica para el análisis molecular, realizado mediante electroforesis capilar. Con el fin de analizar la distribución del polimorfismo en población abierta, se analizaron sólo desde el punto de vista molecular 414 individuos no relacionados entre sí. Resultados. La media de edad fue de 63.77 y 49.12 años para los grupos con y sin OP respectivamente. De acuerdo con lo reportado, el porcentaje de pérdida de DMO aumenta con la edad. Se detectaron 7 alelos en las 3 poblaciones (A-, A, B, D, E, F y G). El alelo más frecuente en los tres grupos es el A- (44.35% en mujeres con OP; 44.62 en mujeres sin OP y 41% en población general). La frecuencia genotípica fue del mismo modo, similar en los tres grupos, siendo el más frecuente el A-,A-, con 23.07%. Las poblaciones se encuentran en equilibrio, de acuerdo a la ley de Hardy-Weinberg. Conclusiones. No se ha detectado asociación de alguno de los alelos o genotipos con la pérdida de DMO, a pesar de que este polimorfismo ha sido relacionado con OP en diversas poblaciones (9 o menos repeticiones TTTA, se asocian con baja densidad mineral ósea en población Italiana y belga). El análisis en población mexicana, es un reflejo de las diferencias genéticas que de forma natural existen entre razas. Las tres poblaciones se encuentran en equilibrio de acuerdo a la ley de HardyWeinberg, sin embargo, tienen una heterocigocidad (Hz) de 0.675 (con OP), 0.6920 (sin OP) y 0.6775 (población general), lo cual indica que este marcador es poco polimórfico y que su distribución dentro de los grupos analizados, no es suficientemente homogénea para utilizarse como marcador genético. Es necesario incrementar la muestra de los grupos con y sin OP, para descartar definitivamente o bien identificar posibles asociaciones. IC-02 DETECCIÓN DE POLIMORFISMOS DEL GEN DE LA PARAOXONASA (PON) POR PCR EN TIEMPO REAL Y SU ASOCIACIÓN CLÍNICA CON PACIENTES HIDALGUENSES DIABÉTICOS TIPO 2 EN EL DESARROLLO DE ATEROSCLEROSIS. 1 Betanzos-Cabrera, Gabriel, 1Téllez-Cedillo Liliana, 2CancinoDíaz, J. Carlos, 3Domínguez-López, Aarón y 4Miliar-García, Angel. 1 Área Académica de Nutrición, Instituto de Ciencias de la Salud, Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Abasolo 600 Pachuca de Soto, Hidalgo 42000 México, 2Depto. de Microbiología Gral. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, IPN. 3Depto. de Gastroenterología, INCMNSZ y 4 Sección de Estudios de Posgrado e Investigación, Escuela Superior de Medicina, IPN. Introducción. La variación genética entre diferentes organismos de la misma especie hace posible entender por qué algunos individuos son más susceptibles a ciertas enfermedades que otros. Resulta necesario entonces, estudiar la variación genética así como metodologías nuevas que sean accesibles, rápidas y confiables. La paraoxonasa (PON) sérica humana (arildialkilfosfatasa; EC 3.1.8.1) es una glicoproteína de 44 kDa localizada sobre la superficie de lipoproteínas de alta densidad (HDL). La PON circula por la sangre unida a las apo AI y apo J de las HDL, y su expresión se inhibe por estímulos proaterogénicos. Además del gene de la PON humana, se identificaron dos genes designados como PON2 y PON3 ligados al gen PON1 en el cromosoma 7q21-q22. Los dos polimorfismos son del tipo SNP y están en los codones 55 (L M) y 192 (Q R), ambos se han asociado con el incremento de riesgo de enfermedades cardiovasculares en pacientes diabéticos tipo 2. Objetivo. Determinar la distribución de polimorfismos de la PON en una población hidalguense y su asociación con la diabetes tipo 2 y en el desarrollo de la aterosclerosis. Material y Métodos. El grupo de estudio se integró por 200 individuos de ambos sexos, que asisten a consulta en Centros de Salud del Estado de Hidalgo, no relacionados genéticamente; 100 diabéticos tipo 2 y 100 no diabéticos. La detección de los polimorfismos se realizó por PCR en tiempo empleando sondas de hibridación. La actividad de la PON se realizó por un método semiautomatizado empleando paraoxón como substrato El perfil lipídico se realizó mediante pruebas enzimático-colorimétricas y mediciones antropométricas fueron realizadas para determinar el índice de masa corporal (IMC), índice de cintura-cadera (ICC) y porcentaje de grasa corporal (% GC). Discusión y Conclusiones. El presente estudio es el primer reporte de las frecuencias de los polimorfismos en una población mexicana y apoyan la hipótesis que los polimorfismos están asociados con la diabetes mellitus tipo 2 y a variables clínicas relacionadas con obesidad como factor de riesgo para aterosclerosis. IC-03 DISPLASIA OSEA TIPO MAJEWSKI: A PROPÓSITO DE UN CASO EN EL HOSPITAL DE LA MUJER. Sierra PF*,Hurtado HL*, Cid RJ*, ValleTJ*, Cácerez SJA*, Camacho QJ**, Calvario HG**. *Departamento de Genética, Hospital de la Mujer SSA, Puebla, pue. **Estudiantes de Medicina Benemérita Universidad Autónoma de Puebla. Las anomalías esqueléticas son únicas dentro de los defectos al nacimiento. Aunque muchas displasias son letales, algunos individuos afectados sobreviven. El síndrome Costilla cortaPolidactilia tipo Majewski es una displásia ósea letal que se caracteriza por acortamiento de las extremidades, tòrax estrecho , costillas horizontales, anomalías cardiacas y renales además de labio y paladar hendido. Caso Clínico. Se trata de paciente recién nacido que fallece al nacimiento. Nace producto vía cesárea con polihidramnios y multiples defectos detectados a las 32 SDG por Ultrasonido. Es producto de la primera gesta de madre de 17 años y padre de 19 años, sanos sin antecedentes de consanguinidad ni endogamia. A la EF presenta talla 30cm, peso 1630kg, cráneo dolicocéfalo, fontanela anterior amplia, hendiduras palpebrales horizontales, puente nasal amplio, labio y paladar hendido bilateral, tórax asimétrico, genitales ambiguos, ano imperforado, extremidades con acortamiento rizo-meso-acromélico, polidactilia y sindactilia bilateral . Conclusión. De acuerdo con las características clínicas y radiológicas se estableció el diagnóstico de síndrome de costilla corta – polidactilia tipo II o Majewski entidad autonómica recesiva con riesgo del 25% , cuyo diagnóstico se puede realizar durante la etapa de la gestación. IC-04 SÍNDROME DE COCKAYNE. INFORME DE UN CASO. REVISIÓN DE LA LITERATURA. Arenas-Sordo María de la Luzπ, Hernández-Zamora Edgar1, 2 3 Montoya-Pérez Luis A. , Aldape-Barrios Beatriz C. 1Servicio de Genética Instituto Nacional de Rehabilitación, 2 Servicio de Cirugía Maxilofacial, Hospital Juárez de México ,3Servicio de Patología Bucal Facultad de Odontología, UNAM. Antecedentes: El Síndrome de Cockayne (CS) es un desorden genético con herencia autosómica recesiva, descrito por Cockayne (1936). Los pacientes presentan detención del crecimiento, talla baja, envejecimiento prematuro, anormalidades neurológicas, fotosensibilidad, retraso en la erupción de los dientes primarios, ausencia congénita de dientes permanentes, macrodoncia parcial, atrofia de los procesos alveolares y caries dental. Puede ser causado por mutación en CKN1 (ERCC8) y el ERCC6, localizados en los cromosomas 5 y 10 respectivamente; originando: CS-A que tienen mutación en ERCC8 y CS-B con mutación en ERCC6, este último provoca sensibilidad a la luz ultravioleta, secundaria a una deficiencia en la reparación de DNA. También se ha asociado el síndrome a mutaciones de los genes XPB, XPD y XPG. Objetivo: Dar a conocer las características del Síndrome de Cockayne a través de un caso. 45 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica Presentación del caso clínico: Paciente de 9 años con talla de 94 cm, peso de 8.6 kg y perímetro cefálico de 42 cm. Hábito caquéctico, problemas posturales con encorvamiento, así como microcefalia, cara ovalada, ojos hundidos, nariz delgada y afilada, falta de grasa en la cara, más notorio en el tercio medio y orejas grandes que le confieren una apariencia de “pajarito”. Marcada fotosensibilidad en toda la piel expuesta al sol. Presenta retraso psicomotor y mental. Intrabucalmente se aprecia higiene deficiente, gingivitis, caries cervical, hipoplasia dental, mala posición dentaria de los incisivos laterales superiores y macrodoncia de los dientes centrales superiores. Radiográficamente ausencia congénita de los dientes: 14, 23, 24, 33, 34, hipoplasia mandibular, atrofia de hueso y raíces cortas. Discusión: La posibilidad de correlación con una mutación presente en el gen CS-B no es posible, aunque asumimos que ésta permitió la existencia de la proteína que codifica este gen, a pesar de no ser normal, ya que la ausencia de la misma provocaría un fenotipo mucho más grave. Conclusiones: La importancia de este caso radica en que es un padecimiento poco frecuente y que entre otras, presenta manifestaciones bucales importantes. No se conoce cómo la proteína anormal del gen CS-B produce las alteraciones estomatológicas, ni muchas otras, por lo que pueden considerarse como futuras líneas de investigación. En los informes de la literatura son pocos los casos que se presentan con CS. IC-05 EL SNP-43 G/G ASOCIADO A DIABETES TIPO 2 NO AFECTA EL MECANISMO DE SPLICING DE LOS EXONES ADYACENTES NI LA ESTABILIDAD DEL PRE-MRNA DEL GEN CAPN10. López Orduña, Eduardo1,2, Kumate Rodríguez, Jesús3, Cruz López Miguel2 y García Mena, Jaime1. 1 Departamento de Genética y Biología Molecular, CINVESTAV, 2 Unidad de Investigación Médica en Bioquímica, Hospital de Especialidades, CMN siglo XXI, IMSS, 3Fundación IMSS. La CAPN10 pertenece a la superfamilia de cisteina-proteasas activadas por calcio, no lisosomales, intracelulares similares a calmodulina. El polimorfismo SNP-43 G/G de calpaina se ha considerado un marcador de asociación y riesgo en población mexico-norteamericana. Análisis in vitro han demostrado que la presencia del genotipo G/G aumenta expresión de CAPN10. In vivo esta variación, G/G, se ha relacionado con niveles disminuidos de RNAm en músculo esquelético y tejido adiposo de sujetos sanos y en pacientes con DT2. Objetivo: estudiar la relación del genotipo G/G del SNP-43 y su probable contribución a la alteración del splicing de CAPN10 y la estabilidad del mRNA de CAPN-10 en las líneas celulares 293T y Jurkat. Materiales y Métodos: en una muestra de 12 individuos residentes en la ciudad de México (6 individuos sanos y 6 individuos con DT2), se genotipificó el SNP-43 empleando la tecnología Taqman. El análisis de splincing se efectuó determinando la presencia y orden de los exones 3 y 4 por RT-PCR en linfocitos de sangre periférica de individuos sanos y DT2. La vida media de CAPN10 se midió en las líneas celulares 293T (SNP-43 G/G) y Jurkat (SNP-43 A/A) empleando RT-PCR en tiempo real. Resultados: Se demostró que el genotipo G/G no altera el splicing de los exones 3 y 4 de CAPN10 en sujetos sanos y DT2 y que la vida media de CAPN10 en ambas líneas celulares es de 8 horas. Conclusiones: la presencia del genotipo G/G de CAPN10 no afecta el orden de los exones 3 y 4 tanto en sujetos sanos como DT2. La estabilidad de los mensajeros de CAPN10 no se ve afectada por el genotipo G/G del SNP-43 al presentar una vida media igual a cuando está presente el genotipo A/A. 46 IC-06 INCONTINENCIA PIGMENTI (IP2): INFORME DE UN CASO FAMILIAR CON VARONES AFECTADOS. REVISIÓN DE LA LITERATURA. 1 Arenas-Sordo María de la Luzπ, Hernández-Zamora Edgar , 2 3 Montoya-Pérez Luis A. , Aldape-Barrios Beatriz C. 1Servicio de Genética Instituto Nacional de Rehabilitación, 2 Servicio de Cirugía Maxilofacial, Hospital Juárez de México ,3Servicio de Patología Bucal Facultad de Odontología, UNAM. Antecedentes: La Incontinencia Pigmenti (IP2) es una genodermatosis descrita por Garrod y definida por Bloch, Sulzberger, Siemens y Bardach en 1920. Es un desorden ectodérmico que afecta piel, dientes, ojos y al sistema nervioso. El nombre de IP2 describe la característica histológica de la incontinencia del pigmento melánico de los melanocitos en la capa basal de la epidermis, y su consecuente presencia en la dermis superficial. El patrón de herencia clásico es dominante ligado al X, letal para el varón, sin embargo se refiere heterogeneidad genética. Objetivo: Dar a conocer las características de la IP2 a través de un caso clínico y la descripción general reportada en la literatura. Recordar que la hipodoncia puede ser un hallazgo sin mayor implicación clínica , pero también puede acompañar a algún síndrome o enfermedad, por lo que el examen minucioso en estos pacientes nos permitirá hacer un diagnóstico adecuado. Presentación del caso clínico: Paciente de 4 años 5 meses. Presentó cabello delgado y escaso, cara ovalada, cejas y pestañas escasas, nariz de puente alto, delgada, protrusión labial, cuatro dientes centrales cónicos y retraso en la erupción de los demás; estrabismo, hipoacusia, defectos del lenguaje y dermatosis en tronco, piernas, pies, glúteos y cara, constituida por presencia de ampollas, lesiones verrucosas y hiperpigmentadas en un patrón lineal. El padre presentó máculas hipopigmentadas en ambas en las zona posterior de ambas piernas. Los exámenes intraorales y radiográficos de ambos mostraron alteraciones diversas. Los cariotipos de ambos fueron normales. Conclusiones: En el presente caso notamos que el padre presenta la IP2 sin tener X supernumerarias y con antecedente de que su madre también padece algo semejante. Puede considerarse que se trata de herencia autosómica dominante o de una mutación diferente del gen NEMO (NF-kappa-B essential modulator), a la descrita clásicamente, que ha sido encontrada en algunos varones afectados. En esta familia por referencia se mencionan otros varones afectados sin embargo, es necesario realizar el estudio molecular de estos pacientes. IC-07 ANÁLISIS DE REPETIDOS CAG EN EL GEN ATAXINA-2 EN PACIENTES CON ATAXIA ESPINOCEREBELAR TIPO 2 Y EN POBLACIÓN MEXICANA. Magaña-Aguirre Jonathan1,3 , Vergara Dolores2, Leyva Oscar1, Sierra-Martínez Mónica2, Gómez-Ortega Rocío3, Váldes-Flores Margarita3, Cisneros Bulmaro1. 1 Departamento de Genética y Biología Molecular, CINVESTAVIPN, México D.F. 2Unidad de Investigación Genética, Hospital Juárez de México, México D.F. 3Departamento de Genética, Instituto Nacional de Rehabilitación, México D.F. Las ataxias cerebelosas autosómicas dominantes (ACAD) son clínica y genéticamente un grupo heterogéneo de trastornos neurodegenerativos que incluyen la distrofia progresiva del cerebelo, los ganglios basales, la corteza cerebral, la medula espinal y los nervios periféricos y se caracteriza por la pérdida generalizada de la coordinación. La sintomatología es indistinguible entre los diferentes tipos de ataxia lo que hace imposible un diagnóstico clínico preciso; por lo tanto, solo es posible identificar cada una de ellas mediante técnicas de biología molecular. Con algunas excepciones, las mutaciones que causan las ataxias son expansiones en el número de tripletes repetidos presentes en cada gen particular. La ataxia tipo II (SCA2) es causada por la expansión del triplete CAG presente en el gen de ataxina 2. En el presente trabajo se analizó mediante las técnicas de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y electroforésis capilar (EC) el número de repetidos CAG del gen de la ataxina 2 en tres familias con sintomatología característica de SCA2. A partir del diagnóstico molecular se confirmó la presencia de la SCA2 en diferentes miembros de dos de las familias analizadas, mientras que en la tercer familia se descartó la presencia de la mutación. En resumen, se identificaron 15 individuos heterocigotos afectados que presentaron un alelo mayor de 36 repetidos (entre 36 y 54 repetidos). Se estableció que un número mayor de repetidos correlaciona con una mayor severidad de la enfermedad. Por otra parte, se analizó una muestra de 300 individuos no relacionados entre si de la población mexicana, las cuales no presentaron ningún síntoma o antecedente de la enfermedad. En esta muestra se identificaron alelos entre 16 y 30 repetidos, de los cuales el alelo más frecuente fue el que presenta 22 repetidos (frecuencia de 91.9%). Las frecuencias alélicas de la población mexicana son muy parecidas a las de otras poblaciones de diferentes grupos étnicos. IC-08 TIPIFICACIÓN DEL GEN DRD4 EN PACIENTES MEXICANOS CON TDAH. Martínez-Levy G., Briones-Velasco M., Gómez-Sánchez A., Reyes E., Díaz-Galvis J., Aguirre-Samudio A., Ricardo J., CruzFuentes C. Instituto Nacional de Psiquiatría “Ramón de la Fuente Muñiz”. Antecedentes: Estudios previos han mostrado asociación entre diferentes polimorfismos y el trastorno por déficit de atención/ hiperactividad (TDAH). Entre las asociaciones más consistentes está la que relaciona al alelo de 7 repetidos localizado en el exón 3 del gen receptor de dopamina D4 (DRD4) con TDAH. Este estudio pretendió replicar esta asociación en una muestra de pacientes mexicanos, población para la cual aún no existen reportes. Metodología: El grupo de pacientes se constituyó por 70 individuos (64 hombres y 6 mujeres de entre 12 y 18 años), que cumplieron con los criterios diagnósticos para TDAH según el DSMIV-R, para establecer el diagnóstico se aplicó la entrevista denominada BPRS-C (Brief psychiatric raiting scale for childrens). El grupo control se formó por 169 individuos (86 hombres y 83 mujeres, entre 19 y 70 años), evaluados con el instrumento de tamizaje para distress psicológico SCL90-R (Symptom check List 90 revised). Se tomó una muestra de sangre a la población estudiada, extrayéndose el ADN mediante la técnica de Laihiri. Se tipifico el polimorfismo tipo VNTR del exón 3 del gen DRD4 por PCR. Se analizó la frecuencia de alelos y genotipos en los grupos de casos y controles empleando la prueba de Chi 2. Resultados: No se observaron diferencias significativas entre los grupos en la frecuencia de alelos (chi 2= 1.35, g.l. 5, p=0.9) y genotipos (chi 2= 9.28, g.l.= 11, p= 0.6) (tabla1). Por lo tanto no se detectó un incremento en la frecuencia del alelo de 7 repetidos en el grupo TDAH. Discusión: Este es el primer estudio que reporta las frecuencias alélicas y genotipos para el polimorfismo del exón 3 del gen DRD4 en pacientes con TDAH de la población del DF. Este resultado aunque negativo debe ser considerado como preliminar, siendo necesario ajustar algunos detalles del diseño (e.g.. incrementar tamaño de muestra, parear con grupo control por edad y sexo). Agradecimientos: Este trabajo se pudo realizar con el apoyo parcial del proyecto de CONACYT SEP-2004-C01-46594 y el trabajo realizado por la clínica de adolescentes y el departamento de psicología de la dirección de servicios clínicos del INP RF, así como todo el personal del laboratorio de genética psiquiátrica del INP RF. IC-09 ESTUDIO MOLECULAR DEL GEN PMP22 EN CHARCOTMARIE-TOOTH TIPO 1A. Leyva-García Norberto1, González-Huerta Norma1, BautistaTirado Ma. Teresa 1, Hernández-Zamora Edgar 1, Kofman-Epstein Susana 2,3, Cuevas-Covarrubias Sergio 2,3. 1 Servicio de genética, Instituto Nacional de Rehabilitación S.S., 2 Departamento de Genética, Hospital General de México. 3UNAM, México D.F. Las neuropatías hereditarias motoras-sensoriales o enfermedad de Charcot-Marie-Tooth (CMT), representan un grupo de enfermedades clínica y genéticamente heterogéneo que afectan los nervios periféricos. Midiendo las velocidades de conducción motora (vcm) se pueden distinguir dos tipos principales: CMT1 y CMT2. CMT1 es una neuropatía desmielinizante caracterizada por disminución de las vcm (<40 m/s), inicia generalmente en la segunda década de la vida y su patrón de herencia es autosómico dominante. El subtipo CMT1A es debido a la duplicación del gen PMP22 en 70-90% de los casos, mientras que 10-30% presentan mutaciones puntuales. El gen PMP22 se ubica en una región de 1.5 megabases en el locus 17p11.2-p12, este sitio codifica para una proteína de 22KDa que se expresa principalmente en el nervio periférico. Se analizaron 12 pacientes no relacionados con diagnóstico electromiográfico, histopatológico y clínico de CMT1. Se procesó la sonda utilizando 100 ng de DNA genómico, amplificando la región que incluía al exón 3 y 4 del gen PMP22 mediante PCR, utilizando DNA polimerasa rTth la cual amplifica segmentos de 5 a 40 Kb con base en el programa XL del termociclador modelo 9700 (PE). Los oligonucléotidos utilizados fueron el F del exón 3 (5’tggccagctctcctaac3’) y el R del exón 4 (5’cctatgtacgctcagag3’) a una concentración de 0.1 mM, en un volumen final de 50 mL. Las condiciones fueron: desnaturalización inicial 94°C por 1 min., seguido de 16 ciclos consistiendo de una desnaturalización a 94°C por 15 seg., alineación a 63°C por 10 min., una segunda etapa de 12 ciclos con desnaturalización a 94°C por 15 seg., alineación a 63°C por 13 min. y un ciclo final de extensión a 72°C por 10 min, Posteriormente se realizó Nick translation para marcar la sonda y se procedió a la Hibridación con métodos estándares. El método de secuenciación de los 4 exones se realizó en un analizador genético AB_310. Se observó duplicación en tres de los pacientes estudiados mediante el análisis de FISH, lo que corresponde al 25%, los tres presentaban una disminución de las vcm por debajo de 20m/ s y manifestaban una afección clínica grave. En los casos que no presentaron duplicación el análisis de secuencia mostró 3 polimorfismos: G45C (Val15Val) en el exón 1, T159C (Cys53Cys) en el exón 2 y G471C (Arg157Arg) en el exón 4 de PMP22 los cuales no han sido reportados previamente. Los pacientes eran del sexo femenino y manifestaban una afección clínica menos grave con vcm de 24 m/s en promedio. Estos hallazgos sugieren 47 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica la necesidad de realizar el examen molecular en los casos con CMT para ofrecer un asesoramiento genético adecuado. IC-10 GENOMA MITOCONDRIAL HUMANO EN POBLACIÓN MEXICANAENCEFALOMIOPATÍA MITOCONDRIAL, ACIDOSIS LÁCTICA Y ACCIDENTES CEREBROVASCULARES (MELAS) CON LA MUTACIÓN A3243G EN EL GEN DEL ARNtLeu(UUR) DEL ADN MITOCONDRIAL EN EL HAPLOGRUPO B2 NATIVOAMERICANO. Delgado-Sáncheza, R., Zárate-Moysenb, A., Monsalvoc, A., Herrerod, MD., Ruiz-Pesinid, E., López-Pérezd, MJ., Montoyad, J., Montiel-Sosaa dJF. a Facultad de Estudios Superiores Cuautitlán, UNAM, México. Departamento de Neurología Pediátrica HGZ 194, Instituto Mexicano del Seguro Social (IMSS), México. c Facultad de Estudios Superiores Iztacala UNAM, México. dDepartamento de Bioquímica y Biología Molecular y Celular, Universidad de Zaragoza – Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud, España. b Introducción. La encefalomiopatía mitocondrial, acidosis láctica y accidentes cerebro vasculares (MELAS) es uno de los síndromes mitocondriales multisistémicos mejor definidos desde el punto de vista clínico. Esta enfermedad se ha asociado preferentemente con la mutación A3243G del ADN mitocondrial. Aunque los estudios descritos hasta ahora no han mostrado una participación relevante de los haplogrupos mitocondriales europeos en variables fenotípicas que poseen la mutación A3243G, no hay trabajos parecidos en haplogrupos nativoamericanos. Caso Clínico. Presentamos un caso de MELAS en una paciente mexicana a quien, además del seguimiento clínico neurológico y las pruebas bioquímicas y citológicas, se le realizó un estudio genético de su ADN mitocondrial, que consistió en el análisis de mutaciones puntuales asociadas a MELAS y posterior secuenciación del genoma completo para determinar el haplogrupo al que pertenecía. Este estudio detectó la presencia de la mutación puntual A3243G en el paciente y familiares relacionados por vía materna (madre y 6 hermanos, todos asintomáticos). El haplogrupo resultó ser el nativoamericano B2 y es portador de dos polimorfismos no sinónimos privados. Discusión. La mutación A3243G se encuentra en distinto porcentaje de heteroplasmia en los diferentes miembros de la familia siendo mayor en el paciente. El genotipo mitocondrial corresponde al haplogrupo nativoamericano B2 y las mutaciones privadas no parecen conferir ninguna modificación fenotípica en el síndrome MELAS. IC-11 DETECCIÓN MOLECULAR DE STAPHYLOCOCCUS AUREUS METICILINO -RESISTENTES (SAMR) Y STAPHYLOCOCCUS COAGULASA NEGATIVOS METICILINO-RESISTENTES (SCONMR) OBTENIDAS DE PACIENTES CON INFECCIONES.NOSOCOMIALES (IN). Cabrera Roberto, Ramírez Maritoña, Morelos Rubén y Meléndez Enrique. Facultad de Medicina, UNAM, México. Introducción: Los staphylococci: (SARM) y (SCoNMR) son las etiologías mas frecuentes de las IN en los países desarrollados y en desarrollo. La secuenciación completa de genomas de SAMR y de SCoNMR permite desarrollar nuevos métodos de diagnóstico 48 molecular con alta especificidad y sensibilidad. Objetivo: Detección de los genes coa (coagulasa) y mecA (resistencia a meticilina “ME”) por PCR dúplex en cepas clínicas de SAMR y de SCoNMR. Análisis in silico. En los genomas de SA MRSA252 y SA N315 resistentes a ME, se búscaron las secuencias de nucleótidos (sq-nt) del gene mecA. Para el gene coa en SA NCTC8325, RF122, MSSA476 y 3 mas en TIGR-CMR por internet. Los genes se alinearon con CLUSTAL W. Las sq-nt seleccionadas se aplicaron al programa PRIMER3 y se obtuvieron los iniciadores de PCR (Tm 50 ºC). Con el programa BLAST del NCBI se compararon con los genomas de SA y S. epidermidis (SE) ATCC12229 y RP62A, siendo iniciadores únicos a coa y mecA. Métodos: Previamente los 119 staphylococci de pacientes con IN se identificaron por “MicroScan” (MS), apoyado con coagulasa (CoT) y fermentación de manitol (MaT). La caracterización de SAMR y SCoN se hizó por: disco de cefoxitina (30 µg) (D-Cf), determinación de MIC´s a oxacilina (MC-Ox) (rango 0.5-4.0 µg/ ml) y aglutinación con latex para la PBP2a (Lt). La PCR duplex se hizó con iniciadores: coa-1(5´-AACTTGAAATAAAACCACAA3´)y coa-2 (5´TACCTGTACCAGCATCTCTA-3´) con amplicon de 240 pb, mecA-1 ( 5´- ATGGCAAAGATATTCAACTA-3´) y mecA2 (5´-GAGTGCTACTACTCTAGCAAAGA-3´) con un amplicon de 458 pb. Resultados: De 119 cepas clínicas con PCR (coa), se confirmó el 82% (98) como SA y el 18 % (21) fue negativo al gen. El 95% (93) de 98 positivas para coa, se identificaron como SA por CoT y MaT. Estas 98 cepas de SA, se evaluaron para resistencia a ME por 3 pruebas fenotípicas. La PCR mecA fue el “estándar de oro” de comparación de la sensibilidad y especificidad (SEN/ESP) de pruebas para detección de SARM en IN. La mejor SEN/ESP la dió D-Cf (97/87), enseguida MC-Ox (92/69) y por último Lt (66/ 90). Conclusión: El análisis genómico y experimental muestra que se pueden detectar de manera confiable y relativamente rápido las cepas de SARM y SCoN de IN y a la vez simultáneamente se puede discriminar SA de los SCoN. IC-12 FACTORES DE RIESGO ASOCIADOS A ALTERACIONES MOLECULARES EN LEUCEMIA AGUDA INFANTIL. Saavedra Herrera MV1, Leyva Vazquez MA1 , Terán Porcayo MA2, Rivera AB2 . 1 Maestría en Ciencias Biomédicas, Laboratorio de Biomedicina Molecular FCQB-UAG, México. 2 Instituto Estatal de Cancerología “Arturo Beltrán Ortega”, Acapulco, Guerrero, México. Resumen: Entre los factores de riesgo asociados a la leucemia aguda (LA) encontramos a la predisposición genética, la exposición a radiaciones, a sustancias químicas , a tratamientos quimioterapéuticos y factores ocupacionales. Las translocaciones cromosómicas son las alteraciones moleculares mejor caracterizadas en la LA, las de mayor significancia pronóstica son la t(9;22) , la t(12;21), la t(8;21) y la Inv (16), sin embargo éstas no se presentan en todos los pacientes por lo que es importante identificar los factores asociados a dichas alteraciones. Objetivo: Realizar la detección de las translocaciones t(9,22), t(8,21), t(12,21) e Inv (16) en pacientes con LA infantil con el propósito de mejorar el diagnóstico, y determinar si existe asociación entre la presencia de translocaciones y los factores de riesgo presentes en la población como son: exposición a agroindustriales, solventes y antecedentes familiares de cáncer. Métodos: De Junio de 2005 a Junio de 2006 se captaron 40 pacientes con diagnóstico de LA en el Instituto Estatal de Cancerología “Arturo Beltrán Ortega”, se realizó RT-PCR para detectar las translocaciones t(9,22), t(8,21), t(12,21) e Inv (16) a Memorias del Congreso 49 Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica partir de sangre periférica y se aplicó una encuesta a los padres para conocer los factores de riesgo presentes en la población. Resultados: Se observó presencia de translocaciones en el 17.5% de los pacientes, la frecuencia fue de 10% en el caso de la t(9,22), 5% para la t(8,21), 2.5% para la t(12,21) y 0% para Inv (16), En cuanto a los factores de riesgo presentes en la población se detectó , el 20% con antecedentes familiares de cáncer, 5% con antecedentes familiares de defectos genéticos, 50% con exposición a agroindustriales, 10% con exposición a solventes y 5% con exposición a radiaciones, al realizar la regresión logística para detectar las asociaciones entre la presencia de translocaciones y los factores de riesgo se detectó que los pacientes con antecedentes familiares de cáncer (RM=8, IC=1.0660), con exposición a agroindustriales (RM=1.6, IC=0.15-17) o con exposición a solventes (RM=4.7, IC=0.55-44), tenían un riesgo mayor de portar alguna de las translocaciones que se buscaron en este trabajo. Conclusión: Se encontró una frecuencia aumentadan el caso de la t(9,22), se detectó un mayor riesgo de portar translocación en los pacientes que presentaban antecedentes familiares de cáncer, exposición a agroindustriales y a solventes. Agradecimientos: al Dr. Guillermo Ruiz Argüelles por su apoyo con las técnicas moleculares. IC-13 POLIMORFISMOS EN LOS GENES ESR1 Y ESR2 Y SU RELACIÓN CON LA DENSIDAD MINERAL ÓSEA EN UN GRUPO DE MUJERES MEXICANAS CON Y SIN OSTEOPOROSIS. Gómez-Ortega M.R., Magaña-Aguirre J.J., Casas-Avila L., Castro-Hernández C., Rubio-Laightbourn J., Díez-García P. y Valdés-Flores M. Instituto Nacional de Rehabilitación, Torre de Investigación, Departamento de Genética. La osteoporosis (OP), es una enfermedad multifactorial discapacitante, caracterizada por la disminución de la densidad mineral ósea (DMO), la desorganización de la integridad esquelética y de la microarquitectura ósea y por el aumento de la susceptibilidad a fracturas. Según cifras de la OMS, la OP es el segundo problema de salud pública a nivel mundial. La OP es un desorden poligénico y diferentes y múltiples estudios en humanos y en diferentes modelos animales han mostrado un grado elevado de susceptibilidad genética con relación a este desorden. Objetivos:Identificar la frecuencia de dos polimorfismos tipo microsatélite (STR) en los genes ESR1 y ESR2 en una muestra de mujeres mexicanas con y sin OP. Metodología: Se estudiaron 70 mujeres pre y postmenopáusicas con OP (63.1 ± 11.06 años) y 70 mujeres pre y post menopáusicas sin OP (48.56 ± 13.58 años). La DMO fue evaluada mediante absorciotometría dual de rayos X (Hologic 2000) y tomando en cuenta los criterios de la OMS. En cada caso, se obtuvieron muestras sanguíneas, se extrajo el DNA y se procedió al análisis molecular de los polimorfismos. Finalmente, se realizó la determinación alélica mediante electroforesis capilar, empleando un analizador genético 310. El análisis de genética poblacional se realizó mediante los programas Genetix, PopGen 32, Structure y Strat. Simultáneamente, se analizaron solamente desde el punto de vista molecular, 500 individuos no relacionados (ambos sexos) con el fin de conocer las frecuencias de distribución alélica en la población abierta. Resultados: En las poblaciones analizadas se encontraron 15 alelos diferentes para el ESR1 y 25 alelos diferentes para ESR2. Las frecuencias de distribución alélica no muestran diferencias significativas entre las poblaciones de casos, controles y la población abierta para ambos loci. Con respecto a los genotipos, se encontraron cerca 90 genotipos 50 diferentes, de los cuales los más frecuentes para el gen ESR1 fueron: EE, FD, FE, GE, HG, ND, NE, OD y PE, todos con frecuencias menores o iguales al 10%. En estos genotipos no se encontraron diferencias significativas entre los casos y los controles, salvo el genotipo ED, el cual presenta una diferencia significativa (P≤0.05), estando presente en los casos, pero no en los controles. Con respecto a ESR2, los genotipos más frecuentes fueron: FE, OD (~14%) y NE, GD y FD (~10%), y los genotipos que presentan diferencias significativas entre casos y controles fueron: HC y HF, los cuales se encuentran presentes en los controles, pero no así en los casos. Con respecto al análisis poblacional, se determinó que la muestra de la población estudiada no se encontraba en equilibrio con relación a la ley de Hardy-Weinberg (Fis:0.00762 en alfa y 0.0436 para beta), lo que sugiere que existe una subestructuración en la población mexicana, la cual presenta por lo menos 3 subgrupos (confirmados por Structure). Finalmente, se buscó una posible asociación entre los genotipos y fenotipos a pesar de esta subestructuración, esta se realizó mediante el programa Strat, el cual nos indicó que no hay ninguna relación aparente entre los genotipos y la OP. Conclusiones: A la fecha, no hemos encontrado ninguna relación entre los diferentes alelos y genotipos y la presencia de OP, sin embargo, los genotipos ED (ESR1) y HC y HF (ESR2) podrían presentar alguna asociación de pérdida y de protección respectivamente. Sin embargo, debido a la subestructuración de nuestra población debemos considerar ampliar el tamaño de muestra y analizar la asociación por subgrupos. De existir una asociación está podría estar enmascarada debido a la propia subestructuración de nuestra población. IC-14 COMBINATION OF GENETIC POLYMORPHISMS AND SMOKER STATUS IN CARDIOVASCULAR RISK . Stoll Mario 1, Esperón Patricia 1,2, Raggio Víctor 1, Lorenzo Mariana1, Artucio María Clara1 1. Área Genética Molecular, Comisión Honoraria para la Salud Cardiovascular, Montevideo, Uruguay. 2. Biología Molecular, Facultad de Química. Montevideo, Uruguay. The goal of the study is to evaluate the clinical aplicability of genomic profiling in guiding preventive interventions in high risk patients. Most genetic association studies in highly complex diseases, like coronary artery disease, do not take into account combination of risk alleles of low additive effect in the determination of risk and genome-environment interactions. As a result many single locus associations have not been replicated giving rise to controversial results. Several gene polymorphisms previously associated with cardiovascular risk were determined and the additive effect of different genotype combinations (genomic profile) and smoker status were tested. The study involved 172 patients of a high cardiovascular risk population, selected by premature disease and familial aggregation of cardiovascular events according to a cualitative risk score. Phenotypic data on cardiovascular risk factors and cardiovascular events were obtained from clinical records and interrogatory. After informed consent, blood samples were obtained, DNA extracted and genotyping performed for Apolipoprotein E (Apo E) E2, E3, E4 and Angiotensin Converting Enzyme (ACE) insertion/deletion polymorphisms. Carriers of ApoE E4 allele have almost twice the frequency of events in all outcomes considered (revascularization, coronay artery disease, acute myocardial infarction and atherosclerosis in any vascular territory), compared with E3 homocygotes. A gene dose and additive effect for higher risk alleles could be observed: for all variables studied ACE D/D genotype combined with ApoE E4+ raised risk significatively. For instance, 18% of patients of genotype ApoE E4+ and ACE D/D underwent revascularization; in contrast no one of ApoE E4- and ACE I/I patients needed myocardial revascularization. Again a gene dose effect for higher risk alleles was observed since 7% of patients of genotype ApoE E4- and ACE D/D or ApoE E4+ and ACE I/I required cardiac revascularization. An interactive raise in risk was observed for individuals who smoke and carry these risk variants, especially ApoE E4: 26% of individuals ApoE E4- who don´t smoke had atherosclerosis in any territory versus 50% of ApoE E4- smokers, 42% of ApoE E4+ non smokers and 83% of ApoE E4+ smokers. ApoE E4 alelle was associated with a higher risk of development of CAD, myocardial infarction and need for revascularization. This association is stronger in patients with other risk genotypes (D/D genotype for ACE) and smokers. The combined information derived from genomic risk profiles and classical risk factors could be used in preventive programs aimed at avoidance of morbimortalilty specially in young adults from high risk families for cardiovascular disease. IC-15 MOLECULAR BASIS OF FAMILIAL HYPERCHOLESTEROLEMIA IN URUGUAY Esperón Patricia1 2, Raggio Víctor1, Stoll Mario1 1. Área Genética Molecular, Comisión Honoraria Para la Salud Cardiovascular, 2. Cátedra de Biología Molecular Facultad de Química. Montevideo, Uruguay. Autosomal-dominant hypercholesterolemia (ADH) has been identified as a major risk factor of morbility and mortality for early atherosclerotic coronary vascular disease (CVD). Since 2001 we began a pilot study of preventive cardiovascular disease in young adults for the first time in Uruguay. All patients included were clinically diagnosed with definite hypercholesterolemia using a uniform protocol and internationally accepted criteria. All study subjects provided written informed consent, and the study protocol was approved by our institution’s ethics review board. DNA samples from clinically diagnosed hypercholesterolemic patients have been analyzed for the presence of LDLR gene mutations and the APOB3500R mutation. All patients who tested negative for the APOB R3500Q mutation, were routinely analyzed for the promoter region, all exons and intronic boundaries of the LDLR gene after SSCP or direct sequencing. Results: we have found 8 different causative genetic variants in the LDLR gene of probands. These variants were confirmed in other family members, both symptomatic and pre-symptomatic. In Uruguay, where there is a very heterogeneous population, it is unlikely that any of described mutations will be present at a high frequency in ADH patients. Nevertheless, two family groups presented the Lebanese mutation C2043A in exon 14 according to their christian-lebanese origin. The distribution of other mutations were: Afrikaner-1 and Padua-1 (exon 4), G1103>A (exon 8), T1352>C (exon 9), ins4 1384 (exon 10), and InsC2058 (exon 14). Besides, we found 2 new mutations. The first is located at the promoter: A-141>C within the SP1 binding site; the second is located at exon 14 as an insertion at C2058. If we consider a frequency of 1:500 for this disease, we can suppose that about 6000 individuals would be carrier of FH in our country, that configure a group of high risk, sub-diagnosed and therefore not appropriately treated. This pilot program has demonstrated the usefullness of ADH patient identification and a National Register will be developed. IC-16 ESTUDIO DE ASOCIACIÓN ENTRE EL GEN DEL RECEPTOR A DOPAMINA D4 (DRD4) Y EL TRASTORNO OBSESIVO COMPULSIVO. Camarena, Beatriz1, Loyzaga, Cristina1, Aguilar, Alejandro1, Weissbecker, Karen2, Nicolini, Humberto3. 1 Instituto Nacional de Psiquiatría Ramón de la Fuente, México, D.F., México; 2Tulane University Health Science Center, Nuevo Orleans, US; 3Universidad Autónoma de la Ciudad de México, México, D.F., México. Evidencia obtenida de datos neuroanatómicos y farmacológicos sugieren que el sistema dopaminérgico se encuentra involucrado en el desarrollo del trastorno obsesivo compulsivo (TOC). Se ha reportado el desarrollo de síntomas obsesivo-compulsivos en pacientes que reciben clozapina. El receptor dopaminérgico D4 (DRD4) tiene una alta afinidad por la clozapina. En el gen del DRD4 se ha reportado un polimorfismo que se caracteriza por ser una región de repetición de 48 pb, expresando 11 diferentes variantes. Nuestro grupo reportó una asociación entre la variante 7R y pacientes TOC con tics. De tal manera, decidimos re-analizar este polimorfismo en pacientes TOC en una muestra de mayor tamaño. Además, se analizó la transmisión de alelos en 86 familias. El análisis entre 210 pacientes TOC y 202 sujetos sanos mostró diferencias estadísticamente significativas (c2=9.33, p=0.0027). El análisis por género mostró una mayor frecuencia de alelos largos en los pacientes TOC hombres que en el grupo control. Sin embargo, no fueron replicados los hallazgos previamente reportados entre el alelo 7R y los pacientes TOC con tics, pero se observó una alta frecuencia del alelo 6R en este grupo. El análisis de las familias no mostró desequilibrio de enlace entre el TOC y el gen DRD4. En conclusión, el gen del DRD4 parece identificar diferencias por género en el TOC y que el subtipo de pacientes TOC que presentan tics presenta una alta frecuencia del la variante de 6 repetidos, lo cual pudiera estar asociado con los reportes que muestran una mayor afinidad del receptor al tratamiento con clozapina en este tipo particular de pacientes. IC-17 NEW APOA1 MUTATION ASSOCIATED TO SEVERE HDLCHOLESTEROL DEFICIENCY AND PREMATURE CORONARY ARTERY DISEASE. Esperón Patricia 1,2, Vital Marcelo 2, Raggio Víctor 1, Alallón Walter3, Stoll Mario1. 1 Área Genética Molecular, Comisión Honoraria Para la Salud Cardiovascular. 2Cátedra de Biología Molecular Facultad de Química. 3Departamento de Laboratorio Clínico. Facultad de Medicina. Montevideo, Uruguay. Our aim consisted in the identification of the genetic variations underlying the very low HDL-C phenotype in high risk families for coronary artery disease. All studied subjects were examined and their informed consent was obtained in the context of a pilot program for high cardiovascular risk families identification and a new risk factors evaluation program of the uruguayan «Comisión Honoraria para la Salud Cardiovascular» (CHSCV). Serum HDL-C, total cholesterol, triglycerides, ApoA-I and ApoB levels were measured using standard commercial procedures assays. PCR amplified DNA was sequenced for the detection of APOA1, ABCA1, and LCAT gene mutations. A medical family pedigree was established from the a 58-yearold female proband with extremely low serum HDL-C (4,3 mg/ 51 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica dL) and advanced CAD with ApoA-1 serum level value of 26 mg/ dL (rv: 104-205) and Apolipoprotein B value of 73 mg/dL (rv: 60117). Triglyceride levels were normal. No retinopathy, cataracts, or tendon xanthomata were present nor other clinical findings suggestive of amyloidosis were found. Other identifiable modifiable risk factors for premature CAD such as cigarette smoking, obesity, sedentarism, or nutritional misconduct were absent. After the genetic analysis we found a novel single point mutation in the APOA-I gene of the woman and her son. This mutation is a G>C transvertion at nucleotide position 2006, exon 4, leading to a substitution of an arginine by a proline at amino acid 153 (R153P), located in an evolutionary conserved residue within the region for LCAT activation. We have identified a novel point mutation in the human APOAI gene, that we propose to be named APOA-IMontevideo This change is associated with a severely diminished serum HDL-C and ApoAI levels and a strong tendency to develop premature CAD without amyloidosis. Both the mother and son presented the mutation in heterozigocity and it cosegregated with the ApoA1 and HDL-C deficiency suggesting a dominant negative patogenic mechanism. IC-18 SECUENCIA TRAP .REPORTE DE UN CASO Y REVISIÓN DE LA LITERATURA. Sierra PF*, Cortés MJ*, Cid RJ*, ValleTJ*, Cácerez SJA*, Camacho QJ**, Calvario HG**. *Departamento de Genética, Hospital de la Mujer SSA, Puebla, pue. **Estudiantes de Medicina Benemérita Universidad Autónoma de Puebla. La acardia Fetal (AcF), conocida como Secuencia de Perfusión Arterial en Reversa (TRAP), es una anomalía congénita asociada a embarazos múltiples, se presenta en el 1% de los gemelos monocigóticos con una frecuencia de 1:35,000 – 48,000 embarazos. Se caracteriza por ausencia de corazón en uno de los gemelos, por lo que el feto normal se encarga de proveer el flujo sanguíneo a acardio para su supervivencia Caso clínico: Se trata de paciente multigesta de 28 años de edad con diagnóstico de embarazo gemelar de 31SDG, con un producto óbito diagnosticado a las 20SDG se resuelve embarazo vía cesárea obteniendo producto de sexo femenino con peso de 1520gr, Apgar 7-8 ,sin defectos congénitos, se obtiene un segundo producto con múltiples defectos con peso de 1800gr.se reporta placenta biamniótica, bicoriónica. Conclusión. Uno de los riesgos que ocurren en los embarazos gemelares es la disrupción de la perfusión vascular normal y el desarrollo de anastomosis arterio-arterial entre los gemelos ocasionando la secuencia TRAP. IC-19 NUEVA MUTACIÓN DE HPRT EN UN LACTANTE CON SÍNDROME DE LESCH-NYHAN. Zamora UA1, Vázquez FR1, Zamora CA1, Morán BV1, O’Neil P2 1. Hospital Infantil de México Federico Gómez (HIMFG), 2. Departamento de Genética, Universidad de Vermont, NE, EUA Introducción. El defecto en la codificación de hipoxantina-guanina fosforribosiltransferasa (HPRT) se localiza en el gene Xq26-q27.2 y se caracteriza por hiperuricemia, retraso mental, cuadriparesia espástica, coreoatetosis, y automutilaciones. Su incidencia es de 1:380000 y se han descrito mas de 200 mutaciones relacionadas. La edad de presentación mas común es entre los 3 y 12 meses de vida. 52 Reporte de Caso. Se trata de masculino de 2 meses de edad sin antecedentes heredofamiliares ni perinatales de importancia, a los 30 días de vida la madre nota aumento de volumen en región dorsal de pie derecho, ingresa al HIMFG a los 2 meses de vida, con aumento de volumen en ambos pies y dedo índice izquierdo; laboratorios con BUN 43 mg/dL, creatinina 2.4mg/dL, ácido úrico 22mg/dL, por lo que se sospecho una deficiencia de la HPRT. Se enviaron muestras del paciente y de la madre al laboratorio de biología celular de la UNAM donde por medio de lizado eritrocitario se encontró una deficiencia grave de dicha enzima, por lo cual las muestras fueron enviadas a la Universidad de Vermont en EUA, donde se realizó el estudio molecular encontrando una deleción de 2 bases en el exon 3 (269-270 del AT) del gen de la HPRT; dicha deleción no ha sido reportada en la literatura, y se corroboró el diagnostico de una deficiencia grave de la HPRT y síndrome de Lesch-Nyhan. Discusión. La deficiencia de HPRT conduce a la sobreproducción de purinas a través debido a la disminución de la reutilización (vía de salvación) de hipoxantina y guanina, provocando por un lado la acumulación de pirofosfato el cual estimula la síntesis de purinas y por otro se disminuyen los niveles de IMP y GMP los cuales actúan como retroinhibidores de la fosforribosil pirofsfato aminotransferasa, con lo cual se favorece también la síntesis de purinas. El aumento en la síntesis de purinas por déficit de HPRT produce hiperuricemia e hiperuricosuria con gota y nefrolitiasis añadidas. La forma principal de presentación es con hipotonía y retraso en el desarrollo psicomotor, sin embargo existe un pequeño grupo de pacientes que se pueden presentar con complicaciones relacionadas a la sobreproducción de ácido úrico, tal es el caso de este paciente que debutó con gota y nefrolitiasis, resultado de la deficiencia enzimática grave en este paciente, a una edad nunca antes reportada en la literatura. IC-20 HISTORIA FAMILIAR DE ENFERMEDADES CRÓNICAS EN MÉXICO: HERRAMIENTA PARA EL ESTABLECIMIENTO DEL RIESGO EN SALUD PÚBLICA. Oliva-Sánchez Pablo Francisco 1, Velasco- Mondragón Héctor 1 , López-Ridaura Ruy 1, Manzano-Patiño Abigail . 1 Instituto Nacional de Salud Pública.. El objetivo de este estudio es evaluar la asociación entre enfermedades crónicas, como la diabetes tipo 2 (DT2), la hipertensión arterial sistémica (HAS) y el síndrome metabólico (SM), con la historia familiar (HF) en sus diferentes componentes (antecedente paterno, materno o ambos), en la población adulta de México. Se realizó un análisis de la Encuesta Nacional de Salud 2000 (ENSA 2000) implementada por el Instituto Nacional de Salud Pública y la Secretaría de Salud, mediante la aplicación de un cuestionario, con una muestra probabilística de adultos de todo el país de 20 y más años de edad de las 32 entidades federativas del país. Se calcularon las RM no ajustadas y ajustadas por medio del análisis de regresión logística para evaluar la asociación entre enfermedades crónicas e historia familiar. El tamaño de muestra de los sujetos con 20 años y más de edad, participantes en la encuesta fue de 42,372. El 7.5% (3,197) de ellos presentó DT2, el 31.6% (14,462) HAS, el 2.5% (712) SM. Al realizar el análisis ajustando, se observó que existe 5.11 (p < 0.0001) veces la posibilidad de padecer DT2 en aquellas personas con antecedente heredo familiar de DT2 en ambos progenitores en comparación con las personas sin antecedente de esta enfermedad. Con respecto a SM se encontró que existe 9.15 (p < 0.0001) veces la posibilidad de padecerlo, en las personas que con antecedente heredo familiar de DT2 en ambos padres en comparación con las personas que sin antecedentes de esta enfermedad. En cuanto al antecedente heredo familiar materno de DT2, mantuvo su significancía estadística al ajustar por otras variables observando una riesgo de 2.36 (p < 0.0001) con respecto a DT2 y 3.53 (p < 0.0001) con respecto a SM. Con base a estos resultados, consideramos que la HF es una herramienta en salud pública, que sirve para detectar grupos de mayor vulnerabilidad tanto genética como ambiental, en el desarrollo de enfermedades crónicas como la DT2. En el periodo en que no se conozca los genes relacionados con una enfermedad y la terapia necesaria para controlar su expresión. La HF representa una herramienta para detectar individuos y/o familias en riesgo, en las cuales se apliqué políticas de salud preventivas mejor dirigidas, en términos del control de las enfermedades. IC-21 FRECUENCIA DE LOS POLIMORFISMOS -108 (C/T) Y 909(G/C) EN EL GEN PARAOXONASA- 1 EN ASOCIACIÓN CON LOS DEFECTOS DE CIERRE DEL TUBO NEURAL EN UNA POBLACIÓN DE YUCATÁN. Alvarado Yaah Julio E, González Herrera Lizbeth, Pinto Escalante Doris. Departamento de Salud Reproductiva y Genética. CIR-UADY, Dr. Hideyo Noguchi. Los defectos de cierre de tubo neural (DCTN) son un grupo de malformaciones congénitas de etiología multifactorial y de mayor prevalencia en Yucatán. El Registro de Malformaciones Congénitas externas del CIR-UADY, sugiere exposición a pesticidas órganofosforados (OF) en familias afectadas, debido a que aproximadamente el 50% de los progenitores de recién nacidos con DCTN tienen ocupación laboral vinculada con el uso de OF. La paraoxonasa-1 (PON1) es una fosforilfosfatasa tisular que participa en la inactivación y metabolismo de los OF, detoxificando al organismo de estos compuestos. Los polimorfismos -108 (C/T) y -909(G/C) del gen PON1, regulan la expresión y concentración de la enzima codificada. Por tal motivo en el presente estudio se analizó la frecuencia de estos polimorfismos en asociación con los DCTN en la población de Yucateca. Se llevó a cabo un estudio de asociación tipo caso-control, incluyendo 161 muestras de ADN de recién nacidos con DCTN y sus progenitores como el grupo de casos y 108 muestras de sujetos sanos como control. Los polimorfismos se determinaron por amplificación mediante PCR-RFLP´s con la endonucleasa BstUI para el polimorfismo -108 (C/T) y PCR-ASO para el polimorfismo -909 (G/C). Se compararon las frecuencias entre casos y controles con una prueba de X2 y se calculó el riesgo relativo (OR, IC 95%). La comparación entre las frecuencias alélicas y genotípicas entre casos y controles no arrojó diferencias significativas, excepto para el grupo de madres con hijos con anencefalia en el alelo -108T (p= 0.045, OR=0.4, IC=0.15-1.08), sugiriendo asociación como factor de protección. Los polimorfismos analizados no se asocian de manera independiente con el riesgo para DCTN, así mismo la interacción entre ambos polimorfismos o haplotipos no parecen aumentar el riesgo para presentar algún DCTN o para tener descendencia afectada en la población estudiada. Excepto para el haplotipo GC/CC que se hallo en los limites de significancia estadística (p=0.06, OR=5 IC=0.73-38.52). La frecuencia alélica de los polimorfismos -909(G/C) y -108(C/T) en la población Yucatán fue de 51.86% y 45.38% respectivamente, con similitud con China, Estados Unidos y Suiza (p>0.05) para -108T y menor para -909C en EE.UU. (p=0.027) y Suiza (p=0.0003). En el presente estudio se concluye que el alelo -108T se asocia como factor de protección materno para anencefalia, mientras que el alelo -909C no representa un factor de riesgo asociado con los DCTN en la población estudiada, así mismo las diferencias de -909C con las poblaciones de EE.UU. y Suiza reflejan variación étnica entre las poblaciones. IC-22 POLIMORFISMOS EN EL CODÓN 72 DE P53 Y EN EL CODÓN 31 DE P21 EN CARCINOMA CERVICAL. Arcos-Román A, 1 Fernández-Tilapa G, 1 Illades-Aguiar B, 1 Enríquez-Rincón F,2 Flores-Alfaro E. 1 Facultad de Ciencias Químico Biológicas, 2Universidad Autónoma de Guerrero, Departamento de Biología Celular, CINVESTAVIPN. El gen supresor de tumor p53 y su efector río abajo p21 juegan papeles importantes en el desarrollo de malignidades humanas. Se ha reportado que las variantes polimórficas de p53 en el codón 72, y en el codón 31 de p21 se asocian con la susceptibilidad para desarrollar cáncer, pero pocos estudios han investigado su efecto sobre el riesgo de carcinoma cervical del cuello uterino. Con el propósito de investigar si los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) de p53Pro/Arg-72 y p21ser/Arg-31, pueden ser factores genéticos de susceptibilidad para desarrollar carcinoma cervical escamoso del cérvix uterino (CaCU), se realizó un estudio de casos y controles que incluyó 241 muestras cervicales de mujeres del estado de Guerrero: 50 con diagnóstico histopatológico de LIEGB, 36 de LIEGA, 53 de CaCU y 102 controles (citología normal). El polimorfismo p53Pro/Arg72 se detectó por PCR-alelo específica y el polimorfismo p21Ser/Arg31 por PCR-RFLPs. Para p53Arg/Arg72 la frecuencia fue de 56% en los casos y de 42% en los controles, la frecuencia alélica fue de 0.70 y 0.60, respectivamente. Para p21Ser/Ser31 la frecuencia genotípica fue de 49% en los controles y del 51% en los casos, la frecuencia alélica, fue de 0.65 en casos y controles. Los resultados sugieren que las mujeres guerrerenses portadoras del genotipo p53Arg/Arg72 tienen más riesgo de desarrollar CaCU, mientras que p21ser/ser31 no se asocia con esta patología. No obstante, el efecto combinado de los genotipos p53Arg-Arg72 / p21SerSer31 potencia el riesgo de CaCU. IC-23 ANÁLISIS DE LOS POLIMORFISMOS A19A DEL GEN LEP, GLN 223ARG Y PRO1019PRO DEL GEN LEPR EN UN GRUPO DE HERMANDADES CON AL MENOS UN INDIVIDUO CON DIABETES MELLITUS TIPO 2. López Cardona M. Guadalupe1, Flores Martínez Silvia E.2, Ortiz Cárdenas Alfredo3, Moran Moguel M. Cristina2, Troyo Sanromán Rogelio1, García Zapien Alejandra2, Lara Rodríguez Roberto3, Cruz Quevedo Edhit2, Sánchez Corona José2. 1 Instituto de Genética Humana, Departamento de Biología Molecular y Genómica CUCS; Universidad de Guadalajara. 2 División de Medicina Molecular, CIBO, IMSS. 3Endocrinología, Hospital General de Occidente (Zoquipan), Secretaria de Salud. Introduccion: La obesidad frecuentemente cursa con resistencia a la insulina y es factor de riesgo para desarrollar DM tipo 2 (DM2) además contribuyen de forma importante factores genéticos de predisposición para estas dos patologías. Se conocen varios genes candidatos entre ellos LEP y LEPR. Objetivo: Analizar las frecuencias genotípicas y alélicas de los polimorfismos A19G de LEP, Gln223arg y Pro1019pro de LEPR en un grupo constituido por hermandades con al menos un individuo con DM2 (Grupo 53 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica HDM) y compararlas con las frecuencias observadas en la población general de Jalisco (Grupo PGJ), además de analizar si existe diferencias en variables clínicas y bioquímicas relacionadas con DM2 entre individuos con diferente genotipo. Material y metodos: Se estudiaron un total de 50 individuos del grupo HDM y 101 del grupo PGJ. La tipificación se realizo mediante PCR-RFLPs; en el análisis estadístico se utilizó el programa SPSS, se estableció como valor de significancia una p menor de 0.05. Resultados: FRECUENCIAS GENOTÍPICAS: Polimorfismo A19G, grupo HDM 0.18, 0.58 y 0.24; grupo PGJ 0.29, 0.47 y 0.24 (A/A, A/G, GG). Polimorfismo Gln223arg, grupo HDM 0.34, 0.50 y 0.16, grupo PGJ 0.29, 0.51 y 0.20 (Gln/Gln, Gln/arg y arg/arg). Polimorfismo Pro1019pro, HDM 0.48, 0.44 y 0.08; PGJ en los y 0.51, 0.40 y 0.08 (Pro/Pro, Pro/pro y pro/pro). FRECUENCIAS ALÉLICAS: A:047, G:0.53, Gln:0.59, arg:0.41, Pro:0.70, pro:0.30 en los HDM y A:0.52, G:0.48, Gln:0.54, arg:0.45, Pro:0.72, pro:0.28 en PGJ. ANALISIS DE LAS VARIABLES RELACIONADAS CON DM2 Y GENOTIPO. No se encontraron diferencias significativas con respecto al genotipo y media de las variables: glucosa, triglicéridos, colesterol HDL, LDL, hemoglobina glucosilada, microalbominuria, creatinina y niveles de insulina del grupo HDM. Solo los homocigotos Pro/Pro tuvieron una media mayor para triglicéridos (p=0.02). Conclusiones: Los resultados obtenidos sugieren que no existe una probable agregación familiar de algún genotipo o alélo de estos los polimorfismos entre diabéticos y no diabéticos del grupo HDM, ni en comparación con la PGJ, ya que no hubo diferencias significativas en las frecuencias observadas entre estos grupos. Son necesarios otros estudios para conocer la asociación del polimorfismo Pro1019pro con niveles elevados de triglicéridos. IC-24 EPILEPSIA MIOCLÓNICA JUVENIL: NUEVAS MUTACIONES EN EL GEN MIOCLONINA/EFHCI EN FAMILIAS DE HONDURAS, MÉXICO Y JAPÓN. Medina MT1, Toshimitsu S2, Durón R1, Alonso ME3, Bailey J4, Martínez IE3, Bai D5, Inoue Y7, Yoshimura I7, Kaneko S7, Montoya MC1, Ochoa A3, Jara A3, Tanaka M5, Machado SJ5, Yamakawa K2, Delgado-Escueta A.5. 1 Univiversidad Nacional Autónoma de Honduras, Tegucigalpa Honduras, 2RIKEN Brain Science Inst. Saitama, Jap, 3Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía, Mex. 4Selweis Institute of Neurosciences, Neuropsychiatric Institute David Geffen School of Medicine, Los Angeles CA, USA, 5 Epilepsy Center of Excellence, Dept. of Veterans Affairs, Greater Los Angeles Health Care Sciences and David Geffen School of Medicine at UCLA, Los Angeles CA, USA, 6National Epilepsy Center, Shizuoka Medical Inst. of Neurological Disorders, Shizuoka, Jap, 7Dept. of Neuropsychiatric, School of Med, Hirosaki University, Aomori. Jap. La epilepsia mioclónica juvenil (EMJ) es heterogénea. Hay mutaciones en 3 genes que pueden producirla, entre ellos el gen mioclonina-1/EFHCI encontrado por nuestro grupo en familias de México y California. Este gen tiene 11 exones y codifica para una proteína de 640 aminoácidos (isoforma A). Tiene un procesamiento alternativo en el exón 4 produciendo una proteína truncada (isoforma B). En este trabajo buscamos nuevas mutaciones en el gen EFHCI en familias de México, Honduras y Japón. Se estudiaron 29 casos índice con EMJ de México,15 de Honduras y 47 de Japón. A los participantes se les tomó muestra para extracción de DNA previa firma de consentimiento informado. El gen se amplificó por PCR y los productos se secuenciaron. También se buscaron mutaciones en la región promotora 5’UTR del gen en 39 casos índice de Japón y 44 de México y Honduras. En los casos con mutación el estudio se extendió a otros 54 miembros de la familia con EMJ o un EEG anormal. Se detectaron 2 mutaciones nuevas heterocigotas con sentido equivocado en 1 familia mexicana y 1 japonesa, otra sin sentido en el transcrito B en 3 pacientes y 7 individuos asintomáticos pero con alteraciones EEGs en 1 familia de Honduras. Este mismo cambio se vio como mutación de novo en el probando de otra familia hondureña. En 1 familia mexicana se identificó una delección en el transcrito B. En 2 miembros de 1 familia japonesa se encontró en forma heterocigota una delección de 3 pares en la región 5’UTR. Estas mutaciones con excepción de la localizada en región 5’UTR, predicen cambios estructurales o pro de la síntesis de la proteína. Mutaciones en este gen se han descrito en varias poblaciones y son frecuentes en México. IC-25 ASOCIACIÓN DE LA DENSIDAD MINERAL ÓSEA CON EL POLIMORFISMO 174GC EN EL GEN DE IL6 EN MUJERES MEXICANAS. MAGAÑA. Aguirre Jonathan1,2 , Gómez-Ortega Rocío1, Cisneros-Vega Bulmaro2, Casas-Ávila Leonora1, Díez-García Pilar3, ElizondoAzuela Guillermo4, Valdés-Flores Margarita1. 1 Departamento de Genética, Instituto Nacional de Rehabilitación, México D.F. 2Departamento de Genética y Biología Molecular, CINVESTAV-IPN, México D.F. 3Servicio de Ortopedia, Instituto Nacional de Rehabilitación, México D.F. 4Sección externa de Toxicología, CINVESTAV-IPN, México La Osteoporosis (OP) es una enfermedad esquelética multifactorial y poligénica caracterizada por la disminución de la masa ósea y el deterioro microestructural del tejido óseo, con el consiguiente aumento de la fragilidad del hueso y de la susceptibilidad para el desarrollo de fracturas, en la actualidad se considera como uno de los principales problemas de salud pública en México y en el mundo. La Interleucina 6 (IL6) es una citocina importante en la diferenciación osteoclastogénica y por lo tanto en la resorción ósea. IL6 juega un papel importante en el metabolismo óseo y variaciones genéticas en este gen o en zonas adyacentes pueden estar asociadas a variaciones de la densidad mineral ósea (DMO). En el presente estudio analizamos la correlación entre el polimorfismo 174GC SNP presente en el gen de IL6 y la DMO en 70 mujeres con OP y 70 mujeres sin OP. La DMO de columna fue medida a través de estudios densitométricos, usando absorcimetría de rayos X de doble nivel de energía (DEXA). Se estudiaron además 168 individuos mexicanos de la población general. El análisis genotípico se realizó a través de PCR tiempo real. Se encontró que el alelo G esta presente en el 90% de las mujeres con OP, mientras que en el grupo sin OP solo en el 78%, presentando diferencias estadísticamente significativas (p<0.05), la presencia del alelo G presentó un factor de riesgo (OR) de 2.45 veces de padecer OP. El genotipo GG es muy frecuente en el grupo de mujeres con OP (80%) comparado con el grupo sin OP (60%) presentando un factor de riesgo de 2.7 veces de padecer osteoporosis, sin embargo las frecuencias en la población general son muy parecidas a las del grupo con OP, esto podría generar resultados falso positivos, por lo que el análisis poblacional es importante en este tipo de estudios. Por otra parte el alelo C es más frecuente en el grupo sin OP (22%) con relación al grupo con OP (10%) y a la población general (11.6%) (p<0.05), cabe señalar que solo en el grupo sin OP se encontraron homocigotos CC, mientras que en el grupo con OP no se encontró ninguna mujer con éste genotipo, es posible que el alelo C, principalmente en su forma homocigota podría representar un factor protector para OP (OR: 0.41 y 0.0 respectivamente). Estos resultados sugieren que el polimorfismo 174GC SNP del locus de IL6 puede estar asociado con algunos determinantes de DMO, y el alelo C puede ser un factor protector para la OP. Es necesario aumentar el número de sujetos de estudio para detectar en forma precisa la posible asociación. Además es importante señalar que el análisis poblacional es importante para fortalecer la validez de esta investigación. IC-26 CORRELACIÓN GENOTIPO-FENOTIPO EN UN GRUPO DE PACIENTES MEXICANOS CON FIBROSIS QUÍSTICA: RESULTADOS PRELIMINARES. Yokoyama Rebollar, Emiy a, Chávez Saldaña, Margarita a , Villarroel Cortés, Camiloa, Carnevale Cantón, Alessandrab, De Teresa García, Benildeb, Lezana Fernández, José Luisc, Orozco, Lorenad. a Laboratorio de Biología Molecular, INP; bCoordinación Nacional de Medicina Genómica, ISSSTE; cDepartamento de Neumología, AMFQ y HIM; dLaboratorio de Genómica de Enfermedades Multifactoriales, INMEGEN. Introducción. Hasta la fecha se han descrito más de 1500 mutaciones del gen CFTR (regulador de conductancia transmembranal de la fibrosis quística). La delta-F508 es la más común en la población caucásica (70%). Las mutaciones en este gen se clasifican, de acuerdo a su efecto en la proteína, en graves o leves. Se ha visto que existe una alta correlación del genotipo con la afección pancreática, en donde se ha demostrado que las mutaciones leves son dominantes sobre las graves, a diferencia del resto de las manifestaciones en donde no se ha encontrado una clara correlación. Objetivo: Establecer la correlación genotipo CFTR con las manifestaciones clínicas en un grupo de pacientes mexicanos con diagnóstico de fibrosis quística (FQ). Material y Métodos. Se incluyeron 34 pacientes mexicanos con diagnóstico de FQ, genotipo CFTR. A partir del genotipo, se dividió a los pacientes en 3 grupos (1: homocigotos delta-F508; 2: dos mutaciones graves; 3: al menos una mutación leve). Se realizó el análisis estadístico del genotipo con los datos clínicos y se consideró significativa una p<0.05. Resultados. Una vez agrupados los pacientes, se observa que la mutación delta-F508 es la más frecuente, como se había reportado previamente por Orozco et al. Los pacientes de los 3 grupos fueron homogéneos en cuanto a edad y sexo. Se encontraron diferencias significativas con respecto al estado pancreático, nivel de cloruros en sudor y edad al primer cultivo de P. aeruginosa. No hubo diferencias en íleo meconial, fenotipo pulmonar medido por FEV1, así como mortalidad. Discusión. La correlación entre el genotipo CFTR y el estado pancreático es acorde con resultados de estudios previos, siendo evidente en el caso de los pacientes con mutación grave en ambos alelos. Los grupos 1 y 2 presentaron el primer cultivo de P. aeruginosa a menor edad en comparación con el grupo 3, lo cual aunado con la alteración pancreática, puede repercutir en el estado de salud del paciente. De igual forma, los grupos con mutaciones graves, presentaron incremento en los niveles de cloruros en sudor, comparado con el grupo que tiene al menos una mutación leve. El íleo meconial, así como el fenotipo pulmonar medido por FEV1, no se lograron correlacionar con el genotipo CFTR, lo cual puede deberse al tamaño de muestra del estudio o a que existan otros genes modificadores involucrados. IC-27 POLIMORFISMO EN EL GEN DE LA COLÁGENA TIPO 1A1 Y SU RELACIÓN CON LA DENSIDAD MINERAL ÓSEA EN POBLACIÓN MEXICANA. Falcón Ramírez Edith, Casas Avila Leonora, Gómez Ortega Rocío, Magaña Aguirre Jonathan, Diez García Ma. del Pilar, Valdés Flores Margarita. Departamento de Genética, Instituto Nacional de Rehabilitación, SSA. México, D.F. Introducción. La osteoporosis (OP) es una enfermedad caracterizada por una reducción en la masa ósea que lleva al deterioro de la microarquitectura del hueso, aumentando así el riesgo de fracturas. En la patogénesis de la OP los factores genéticos juegan un papel importante y varios polimorfismos en genes involucrados en el control genético de la densidad mineral ósea (DMO) han sido implicados en la regulación de este proceso. Uno de los más estudiados es un polimorfismo en el primer intrón del gen de la colágena COL1A1, en donde la sustitución de un sólo nucleótido G®T afecta un sitio de unión para el factor de transcripción Sp1. Este polimorfismo ha sido asociado con una baja DMO y un incremento del riesgo de fractura. Diversos estudios han informado que mujeres con el polimorfismo en un solo alelo (genotipo sS), presentan un riesgo mayor a presentar fracturas en relación con las mujeres con el genotipo SS. Evidentemente, el riesgo de fracturas es aún mayor en las mujeres homocigotos para el polimorfismo (ss). Es posible que en la práctica clínica la identificación de este polimorfismo genético pudiera emplearse como marcador de predisposición del riesgo de fracturas. El objetivo de este estudio fue analizar el polimorfismo en el gen COL1A1 y determinar su relación con la DMO en una población de mujeres mexicanas con o sin pérdida de la DMO en columna o cadera y en sujetos de población abierta mexicana. Material y métodos. En una población de 180 de mujeres mexicanas, se realizó densitometría en cadera y columna con un equipo HOLOGIC 2000. Por otra parte, a partir una muestra sangre periférica se efectúo la extracción de DNA. Para el análisis molecular los genotipos para el polimorfismo fueron determinados por PCR y mediante la técnica de RFLP que utiliza la enzima Ita I. Los productos de PCR y digestión enzimática se visualizaron por electroforesis en gel de agarosa, teñidos con bromuro de etidio. Resultados. El análisis densitométrico de 180 pacientes, muestra que 53% de la población presenta pérdida de DMO de más del 30% tanto en cadera como en columna. La distribución de los genotipos en los diferentes grupos estudiados mostró que la presencia del alelo “s” en sus formas homo o heterocigoto es más común en las mujeres con OP de cadera y columna, mientras que el alelo “S” predomina en las mujeres sin OP. Por otra parte, el análisis del polimorfismo en los 100 sujetos de población abierta mexicana, mostró que existe diferencia significativa en la distribución de los alelos “s y S”, dicha distribución es similar a la observada en los grupos sin OP, sin embargo, cuando se realizan comparaciones con los grupos con OP, las diferencias son significativas. Los resultados del estudio genotípico en esta población confirman claramente que el polimorfismo es propio de una población con OP y no de una muestra seleccionada al azar. Conclusiones. Se encontró correlación entre la pérdida de la DMO y el alelo “s” en las regiones anatómicas analizadas. El genotipo “ss” esta presente en la población con OP y las mujeres que lo presentan tienen pérdidas óseas severas en cadera ó en columna. Conocer la distribución del polimorfismo en la población abierta fortalece la asociación del alelo “s” y de los genotipos Ss, ss con la presencia de OP. 55 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica IC-28 DISTRIBUCIÓN ÚNICA DE LAS ATAXIA ESPINOCEREBELOSA AUTOSÓMICO DOMINANTES EN POBLACIÓN MEXICANA. Yescas Petra,1Martínez-Ruano Leticia1, Mader Christopher1, Ochoa Adriana1, De Biase Irene2, Gutiérrez Roxana1, Caudle Misti3, Ruano Luis1, Fragoso-Benítez Marcela4, Ashizawa Tetsuo3, Bidichandani Sanjay2,5, Alonso Elisa1, Rasmussen Astrid1,2 1 Depto. de Neurogenética y Biología Molecular y Div. de Neurología, Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía Manuel Velasco Suárez, México, D.F.; 2 Department of Biochemistry and Molecular Biology and 5 Department of Pediatrics, University of Oklahoma Health Sciences Center, Oklahoma City, Oklahoma; 3 Department of Neurology, The University of Texas Medical Branch, Galveston, Texas; 4Centro Médico Nacional 20 de Noviembre, México, D.F. Las ataxias espinocerebelosas autosómico dominantes (ADCA) son clínica y genéticamente un grupo heterogéneo de enfermedades ligadas a 28 diferentes loci. La prevalencia de cada subtipo individual muestra una amplia variación geográfica, siendo la ataxia espinocerebelosa tipo 3 (SCA3) la mas frecuente a nivel mundial, al contribuir con 21.0% de los casos. Dos tipos principales de mutaciones causales se han identificado: 9 de las ADCA se asocian a expansiones de microsatélites repetidos inestables, mientras que SCA4, 5, 13, 14 y 27 se deben a mutaciones de sentido erróneo o deleciones pequeñas. En el presente estudio se analizaron las mutaciones en los genes de SCA1, 2, 3, 6, 7, 8, 10 ,12, 17 y DRPLA en 108 familias con ataxia autosómica dominante (717 individuos) y 123 pacientes con ataxia esporádica. La ataxia mas frecuente fue SCA2, responsable de casi la mitad de los casos dominantes (45.4%), seguida por SCA10 en 13.9%, SCA3 (12%), SCA7 (7.4%) y SCA17 (2.8%). No identificamos mutaciones en los genes causales de SCA1, 6, 8, 12 o DRPLA. Comparado con los reportes de la literatura, esta tasa de detección de mutaciones es alta: solo el 18.5% de los pacientes con ADCA no tuvieron diagnóstico molecular. En los casos esporádicos, identificamos mutaciones en SCA2 en 6 pacientes (4.9%), y mutaciones en SCA3 y SCA17 en un paciente cada una (0.8%). Concluimos que la distribución de mutaciones de las ataxias espinocerebelosas autosómico dominantes en mestizos mexicanos es única. Su conocimiento nos ha permitido la implementación de una eficiente estrategia diagnóstica. IC-29 IDENTIFICACIÓN DE POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEÓTIDO EN EL GEN NFE2L2: UN REGULADOR CLAVE EN LA RESPUESTA CELULAR CONTRA RADICALES LIBRES. Córdova Emilio1 y Orozco Lorena1. 1 Instituto Nacional de Medicina Genómica, México. La generación de las especies reactivas de oxígeno (ROS) es un proceso normal y necesario durante el metabolismo celular. Sin embargo, un incremento en los niveles intracelulares de las ROS puede causar un estrés oxidativo, generando daños en DNA, proteínas y lípidos. La vía de señalización Nrf2-Keap1 es uno de los principales mecanismos de defensa contra el estrés oxidativo. En condiciones normales, el factor de transcripción Nrf2 (codificado por el gen NFE2L2) es retenido y degradado en el citoplasma a través de su interacción con Keap1. Sin embargo, en respuesta a un aumento en los niveles de las ROS, Keap1 libera a Nrf2, el cual se transloca al núcleo donde promueve la 56 expresión de diversas enzimas antioxidantes. Se ha demostrado en modelos animales que la ruta Keap1-Nrf2 juega un papel esencial en la protección contra diversas enfermedades asociadas al estrés oxidativo, como el lupus eritematoso sistémico, asma y cáncer entre otras. Hasta el momento existen pocos estudios acerca de la presencia de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) en el gen NFE2L2 y su asociación con diversos padecimientos. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo es determinar la existencia de nuevos SNPs en el gen NFE2L2 y conocer su frecuencia alélica en una muestra de individuos mexicanos sanos. Se incluyeron en el estudio 100 individuos sanos no relacionados, captados del banco de sangre del Instituto Nacional de Pediatría. La detección de nuevos polimorfismos se realizó mediante secuenciación directa de los productos amplificados obtenidos por PCR tanto de la región promotora como de la codificante de grupos formados por 10 individuos. La discriminación alélica para determinar la frecuencia de los SNPs se realizó a través del método fluorescente de la 5' exonucleasa (TaqMan). Se identificaron 2 SNPs en la región promotora (686G>A y -650C>A), los cuales se han reportado previamente sólo en población japonesa. En la región codificante no se encontró ningún SNP. En nuestra población, ambos polimorfismos están presentes en una alta frecuencia (-686G>A = 43% y 650C>A = 27%), muy semejante a la reportada previamente. En conclusión se cuenta con la caracterización completa de los SNPs del gen NFE2L2, lo cual constituye una herramienta valiosa para evaluar la posible asociación de genes involucrados en la respuesta al estrés oxidativo con cáncer, padecimientos autoinmunes y el asma, entre otros. IC-30 ANÁLISIS DE POLIMORFIMOS EN GENES INVOLUCRADOS EN LA RESPUESTA INFLAMATORIA EN PACIENTES PEDIÁTRICOS MEXICANOS CON ASMA. Jiménez-Morales S 1,2, , Cuevas F 3 , Martínez-Aguilar N 4 , Velázquez R1, Ramírez-Bello J1, Salas-Martínez MG1, Saldaña Y1, Escamilla G5, OrozcoL1. 1 Lab. de Genómica de Enfermedades Multifactoriales, INMEGEN, SS; 2Programa de Doctorado en Biología Experimental, UAM-I; 3 Depto. de Neumología y Cirugía del Tórax, Instituto Nacional de Pediatría SS.; 4Servicio de Alergia, Hospital Regional 1° de Octubre, ISSSTE; 5Banco de Sangre, Instituto Nacional de Pediatría, SS. El asma es una de las enfermedades inflamatorias crónicas más comunes en los países industrializados. Esta entidad se caracterizada por una respuesta inmune que aunque es predominantemente de tipo TH2, la participación de moléculas de respuesta TH1 y de moléculas coestimuladoras involucradas en la interacción de las células presentadoras de antígenos con las células T juegan un papel fundamental. A la fecha, se han reportado en poblaciones caucásicas, afro-americanas y asiáticas que polimorfismos de un sólo nucleótido (SNPs) en genes que codifican para estas proteínas confieren riesgo para desarrollar asma, atopia u otras entidades inflamatorias. Para conocer el papel de los polimorfismos en los genes IL4, FCER1B, RANTES, IL12, CTLA4 y PDCD1 en la susceptibilidad a padecer asma en la población infantil mexicana, se realizó un estudio de casos y controles en el que se analizaron 12 polimorfismos distribuidos en estos genes. En el estudio se incluyeron 100 pacientes pediátricos con diagnóstico clínico de asma y 259 controles sin antecedentes de asma y atopia. El estudio de genotipificación se realizó mediante la técnica de la 5´exonucleasa (TaqMan). En la construcción de haplotipos se utilizó el software HAPLOVIEW y en el análisis estadístico los programas EPIINFO y FINETTI. Memorias del Congreso 57 Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica Los resultados mostraron que la distribución de los polimorfismos analizados se encontraba en equilibrio de Hardy-Weinberg. Las frecuencias alélicas y genotípicas no mostraron diferencias estadísticamente significativas entre los casos y los controles ni en la distribución de los haplotipos generados. Los resultados obtenidos sugieren que estos polimorfismos no confieren riesgo para desarrollar asma o atopia en la población mexicana, sin embargo con base a los datos obtenidos en otras poblaciones no se descarta la posibilidad de que otros SNPs en estos genes contribuyan como factores genéticos de riesgo para asma. IC-31 ANÁLISIS DE LA EXPRESIÓN DE PROTEÍNAS ASOCIADAS A DISTROFIAS MUSCULARES EN PACIENTES MEXICANOS CON DIAGNÓSTICO CLÍNICO DE ESTAS ENFERMEDADES E IDENTIFICACIÓN DE UNA NUEVA MUTACIÓN EN EL GEN DE DISFERLINA Escalante-Bautista D6, Gómez-Díaz B6, Roque-Ramírez B6, Badillo-Vázquez S6, Sánchez-Pineda A6, Fernandez-Valverde F1, Ruano-Calderón LA1, Meza-Espinoza PA6, Hernandez-Varela KA6, Garcia-Ramirez R3, Ramírez-Navarrete E3, Piña-Mora E2, Rivera-Gámes E2, Escobar-Cedillo RE3, Miranda Duarte A5, Salamanca-Gómez F6, Rosas-Vargas H3, Coral-Vázquez RM3. 1 Instituto Nacional de Neurocirugía; 2Servicio de Cirugía de Alta Especialidad Hosp. de Pediatría; 3Servicio de Neurocirugía Hosp. de Pediatría; 4Servicio de Electrodiagnóstico Instituto Nacional de Rehabilitación, 5Servicio de Genética Instituto Nacional de Rehabiloitación, 6Investigación Médica en Genética Humana, Hospital de Pediatría, Centro Médico Nacional Siglo XXI – IMSS. La comprensión genética de las distrofias musculares ha avanzado considerablemente en las dos décadas pasadas. Al presente se conocen alrededor de 30 genes que producen distrofia muscular y para cada uno de ellos son varias las mutaciones que se han descrito. Esta variabilidad genética también está acompañada por una alta diversidad fenotípica. Asimismo, es frecuente que las características clínicas de diferentes distrofias musculares se asemejen, lo que dificulta su diagnóstico. Por otra parte, se ha observado que la presencia de una mutación en una misma familia se puede asociar a distintos fenotipos, en los que se puede afectar tanto el músculo esquelético así como la función cardiaca. Además se sabe que la alteración en un gen no solo puede modificar la expresión de la proteína que codifica, sino también la de otras proteínas asociadas, debido a alteraciones en la interacción proteínaproteína. La explicación para la variabilidad del fenotipo en las distrofias musculares actualmente se está explorando. Pero para ello primero es necesario conocer el patrón de expresión de las proteínas asociadas a distrofias musculares, para identificar la deficiencia primaria en el paciente y posteriormente realizar la búsqueda de la mutación. Nosotros analizamos, mediante inmunofluorescencia indirecta con anticuerpos para distrofina, disferlina, alfa, beta, gama y deltasarcoglicanos, emerina, laminina alfa 2, teletonina, lamina A y lamina C, 182 biopsias de músculo esquelético de pacientes que presentan un cuadro clínico heterogéneo de distrofia muscular. La deficiencia de distrofina 67/182 fue la más frecuente, secundada por la deficiencia de disferlina 17/182. Mediante Western blot cuantificamos esta última proteína y en el análisis por secuenciación del gen DYSF de 3 pacientes, encontramos una nueva mutación en el exón 39, que cambia la producción de un aminoácido (Gly 1418 Asp) en la proteína. Además analizamos por Western blot la expresión de calpaina 3 en muestras de 24 pacientes que mostraron por inmunofluorescencia una expresión normal para el resto de las proteínas examinadas en este estudio, en dos pacientes calpaina tres esta ausente y en cinco más esta 58 deficiente, por lo que reubica como la tercera en deficiencia mas frecuente, a diferencia con lo reportado en Brasil y Europa, donde se ubica en segundo lugar, solo después de la deficiencia por distrofina. En cuarto lugar encontramos la deficiencia de laminina alfa 2 en tres muestras y por último una muestra presento ausencia por imunofluorescencia y por Western blot para caveolina 3 además de una deficiencia secundaria de disferlina. IC-32 EL XMRV ES ALTAMENTE PREVALENTE EN TEJIDO DE CÁNCER DE PRÓSTATA Y NO CORRELACIONA CON EL POLIMORFISMO 462 DEL GEN RNASEL. Martinez-Fierro M,1 Leach RJ,2 Pais-Johnson T,2 Troyer D, 2 Beuten J, 2 Thompson IM, 2 Ortiz-Lopez R, 1 Silva-Platas C, 1 Gomez-Guerra LS,1 Garza-Guajardo R,1 Martinez-Rodriguez HG,1 Martinez-Villarreal RT,1 Rojas-Martinez A.1 1. Grupo de Monterrey para Investigación en Cáncer de Próstata, Facultad de Medicina, UANL, Monterrey, México y 2. Programa de Biomarcadores de Riesgo para Cáncer de Próstata (SABOR), University of Texas Health Science Center at San Antonio. Resumen. El virus xenotrópico relacionado al virus de la leucemia murina (XMRV), un gamma-retrovirus humano descubierto recientemente, ha sido asociado con cáncer de próstata, particularmente en sujetos homocigotos para el alelo 462Q del gen RNASEL (involucrado en la respuesta natural antiviral inducida por interferón) 1. Material y Métodos. En un estudio piloto, una colección de 27 tejidos tumorales de próstata del proyecto SABOR fueron tamizados para XMRV por RT-PCR anidada y genotipificados para el codon 462 del gen RNASEL (ensayo TaqMan). Conclusiones: Este estudio confirma la presencia del XMRV en tejido tumoral prostático, pero con una prevalencia mayor (37.0%) que la reportada previamente (10.4%) y también sugiere que no hay correlación entre la infección con XMRV y el genotipo 462Q/ Q en el gen RNASEL. IC-33 ANÁLISIS DE POLIMORFISMOS EN EL FACTOR H DEL COMPLEMENTO (CFH) Y EN EL GEN LOC387715 EN POBLACIÓN MESTIZA MEXICANA CON DEGENERACIÓN MACULAR RELACIONADA A LA EDAD. Silva Zolezzi Irma 1, Contreras Alejandra Virginia 1, Hidalgo Miranda Alfredo1, Inchaústegui Aldana Alejandro1, Cano Hidalgo René Alfredo1, Zenteno Ruiz Juan Carlos2, Ayala Ramírez Raúl2, Pérez Cano Héctor2, March Misfut Santiago1, Graue Enrique2,3 y Jiménez Sánchez Gerardo1. 1 Instituto Nacional de Medicina Genómica, Secretaria de Salud, México; 2Fundación de Asistencia Conde de Valenciana IAP, , México DF; 3División de Investigación y Estudios de Posgrado, Facultad de Medicina, UNAM. La degeneración macular asociada a la edad (DMRE) es la causa más común de pérdida de visión entre personas de más de sesenta años. Esta enfermedad se caracteriza por pérdida progresiva de la visión central, causando disminución de la agudeza visual debido al deterioro de la mácula, parte central de la retina del ojo rica en células fotosensibles. Existen dos formas avanzadas de DMRE: atrofia geográfica (seca) y neovascularización coroidea (húmeda), que pueden ocurrir en uno o ambos ojos. Existe poco conocimiento sobre los mecanismos moleculares involucrados en el desarrollo de DMRE, sin embargo, recientemente diversos estudios permitieron identificar dos genes asociados a la enfermedad, cada uno con una contribución importante pero independiente: El factor H del complemento (CFH) en población blanca no-hispánica y la proteína hipotética LOC387715 (LOC387715) (NCBI Build 35.1) en población blanca. Con la finalidad de evaluar la participación de CFH y LOC387715 en el desarrollo de DMRE en población mestiza mexicana, se genotipificaron cuatro polimorfismos de un solo núcleotido (SNPs) previamente asociados a DMRE en un grupo de pacientes y un grupo de controles poblacionales. Para realizar el estudio de casos y controles de utilizaron muestras de sangre total de 72 pacientes mestizos no relacionados, con alguna de las dos formas de DMRE avanzada de un hospital oftalmológico del Distrito Federal, y 300 controles poblacionales provenientes de 6 regiones del país (Guanajuato, Guerrero, Sonora, Veracruz, Yucatán y Zacatecas). El DNA genómico se extrajo del paquete de células blancas por métodos convencionales (QIAamp DNA Blood Maxi Kit, QIAGEN, Alemania). Posteriormente, se genotipificaron tres SNPs del gen CFH, dos intrónicos (rs1410996, rs380390) y la variante Y402H (rs1061170); y un SNP en LOC387715 (rs10490924) mediante ensayos de discriminación alélica, usando sondas TaqMan® (Applied Biosytems, EUA). Para todos los SNPs se calcularon las frecuencias alélicas y genotípicas, y se evaluó si se encontraban en equilibrio de Hardy-Weinberg en la población control mediante una prueba exacta de Fisher. Las pruebas de asociación se realizaron mediante un análisis de chi-cuadrada. Los resultados obtenidos mostraron una asociación significativa después de corregir por Bonferroni (p<0.0125) de dos SNPs, el rs1061170 (Y402H) de CFH (OR=6.076, C.I. [1.567-23.557], p=0.003); y el rs10490924 de LOC387715 (OR=6.222, C.I. [2.98112.986], p=1.679x10-07) con DMRE avanzada. En el caso de los otros dos SNPs analizados no se encontró asociación significativa con DMRE. Los resultados obtenidos sugieren que CFH y LOC387715 contribuyen al desarrollo de DMRE avanzada en la población mestiza mexicana de manera similar a lo que ocurre en otras poblaciones. Para confirmar estos resultados e identificar loci adicionales asociados a la susceptibilidad a DMRE en la población mestiza mexicana, se está realizando un estudio de asociación de genoma completo con aproximadamente 115,000 SNPs utilizando microarreglos de oligonucleótidos (GeneChip® Human Mapping 100K Set, Affymetrix, EUA). IC-34 ESTUDIO DE HIBRIDACION GENOMICA COMPARATIVA EN PACIENTES CON LEUCEMIA LINFOCITICA AGUDA Macias García, B1; Lugo Trampe, A1; Méndez Ramírez, N2; De la Rosa Alvarado, R3; Jaime Pérez, J2; Gómez Almaguer, D2; Salazar Riojas, R2; Rojas Martínez, A1; Martínez de Villareal, L3; Villareal Quiroga, P 4; Decanini Arcaute, H4; Ortiz López, R1 Departamentos de 1Bioquímica, 2Hematología, y 3Genética de la Facultad de Medicina de la UANL, 4Hospital Santa Engracia, Monterrey, Nuevo León Introduccion: Las alteraciones en el número de copias de DNA es una de las maneras por las que la expresión y función de un gen es modificada(Wessendorf 2003) al grado que pueden llevar a la célula a desarrollar diversos tipos de cáncer, incluyendo los hematológicos. La técnica de Hibridación Genómica Comparativa en microarreglos (aCGH) nos permite ver un mapa del número de copias relativas de las secuencias del DNA entre genomas en función de su localización cromosómica(Kallioniemi 1992, Pinkel 2005) . El objetivo de este estudio es conocer mediante aCGH las regiones cromosomicas que se encuentran amplificadas o deletadas en muestras de pacientes con Leucemia Linfocítica Aguda. Materiales y metodos: Se utilizó DNA de muestras de sangre periférica y a concentraciones iguales de muestra problema y control se marcó con el kit Microarray Random Priming (Vysis) para hibridar sobre GenoSensor Array 300 (Vysis) que contiene 274 clonas de BACs de autosomas humanos y 14 clonas de cromosomas X y Y. Los microarreglos se escanearon y analizaron utilizando el GenoSensor Reader (Vysis). Resultados: Se examinaron 10 muestras de pacientes con LLA. Los resultados arrojados por el aCGH muestran una amplificación de regiones cromosomicas principalmente de las regiones 6q16 y de los genes ERG1 y CCND2. Las regiones que se encontraron con pérdida de material genético corresponden a la región 5q33 y a los genes MYCN, REL, TIF1, MTAP, ATM, RB1. Conclusiones: Los resultados encontrados muestran ganancia o pérdida de regiones cromosomicas en genes asociados a cáncer. Resulta interesante que en las regiones 5q33 y 6q16 se encontraron alteradas en 6 de los 10 pacientes. Estas regiones contienen genes de proteínas recientemente asociadas a procesos neoplásicos, pero que aun no han sido totalmente caracterizadas. La validación de estos resultados se esta realizando por FISH, IC-35 POLIMORFISMOS -455G/A Y -148C/T Y NIVELES DE FIBRINOGENEMIA COMO BIOMARCADORES DE ENFERMEDAD CORONARIA CARDIOVASCULAR. Canseco-Avila Luis M1,2, Jerjes-Sanchez, Carlos3, GuzmánRamírez Denisse2, Asssad-Kottner Christian3, Rojas-Martínez Augusto,1Ortiz-López Rocío2 1 Unidad de Diagnostico Inmunológico Molecular, Facultad de Ciencias Químicas C IV, Universidad Autónoma de Chiapas, 2 Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de Nuevo León, 3Departamento de Emergencia, Hospital de Enfermedades Cardiovasculares y del Tórax, IMSS. Monterrey, N.L., Mexico. Resumen: La hiperfibrinogenemia se ha identificado como un evento directamente asociado a los síndromes coronarios agudos (SCA). Algunos polimorfismos en los genes que codifican para fibrinógeno se han correlacionado con los niveles plasmáticos de este factor de la coagulación y varios estudios han analizado las probabilidades de que estos polimorfismos estén asociados a los resultados clínicos de los eventos patológicos agudos. En el presente estudio se seleccionaron dos grupos de pacientes con SCA y enfermedad coronaria estable (ECE) y un grupo de sujetos control (n=50/grupo), se reclutaron en el Servicio de Urgencias del Hospital de Especialidades de Tórax del Instituto Mexicano del Seguro Social en Monterrey, México, y se les dio seguimiento durante seis meses. Los grupos se aparearon por edad, sexo, índice de masa corporal y sedentarismo. Se compararon los niveles de fibrinógeno plasmático y los polimorfismos -455G/A, -148C/T, +1689T/G y Bcl I del gen beta_del fibrinógeno en los tres grupos. La comparación de las medias de los niveles plasmáticos de fibrinógeno demostró niveles significativamente superiores a 414 mg/dl en los sujetos con enfermedad coronaria (ECE y SCA). Valores de fibrinógeno plasmático superiores a 450 mg/dl se asociaron a muerte en el seguimiento del grupo SCA (p=0.04). Las cargas alelicas del 455A y -148T se asociaron con niveles de fibrinógeno plasmático superiores a 450 mg/dl (p<0.0001 y p=0.0014, respectivamente) y con enfermedad coronaria en general (p=0.0013 y p<0.0001, respectivamente). Un análisis del seguimiento de los eventos adversos post-SCA mostró que la carga genética del alelo -148T en cualquiera de los genotipos que lo portan se asoció a eventos adversos post-SCA en general (RR=1.6, IC 95% rango 1.0-11.2, 59 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica p=0.04). En conclusión la determinación en conjunto de los polimorfismos (-455G/A y -148C/T) y los niveles elevados del Fg (>450 mg/dl) podrían ayudar a la estratificación de riesgo y severidad de la enfermedad para un mejor tratamiento en los pacientes. IC-36 ESTUDIO FAMILIAR DE ANTIGENOS LEUCOCITARIOS DEL HUMANO (HLA) CLASE I Y II CON ESCLEROSIS MÚLTIPLE López-Morales, E*; Núñez-Farfán, R*; Vidal-Saucedo, F*; PiñaOlvera, V*; Aguilar-Ángeles, Dº, Delgado-Ochoa, M.D*. º División de Medicina Interna y *Laboratorio de Histocompatibilidad del Hospital Juárez de México, SSa. Introducción: La esclerosis múltiple (EM), es una enfermedad progresiva y generalizada que involucra procesos de desmielinización activados de forma multifactorial, como son las infecciones por retrovirus, puerperio, anticuerpos anti-tiroideos, por interrelación y mimetismo molecular entre epitopes compartidos con mielina, anticuerpos anti-topoisomerasa, elevados niveles de prostanglantina E2, regulada por la ciclooxigenasa 2; además de una predisposición hereditaria y factores ambientales. Debido a que es de gran ayuda al diagnóstico el estudio y determinación de las moléculas de HLA en estas alteraciones y a que es utilizado como marcador de predisposición para el desarrollo de la EM y de otras patologías como la artritis reumatoide, espondilitis anquilosante y diabetes. La manifestación de la EM oscila entre los 20 y los 40 años, siendo raro el inicio antes de los 10 o después de los 50 años, además se observa que el sexo femenino es más comúnmente afectado. Existe una fuerte asociación entre la esclerosis múltiple y marcadores HLA específicos, se reporta en poblaciones de Norteamérica y norte de Europa. Los haplotipos HLA DR52, DR15, DQ6, Dw2 (equivalente a DRB1*1501, DRB5*0101, DQA1*0102, DQB1*0602), son comunes en la EM, en donde los haplotipos Dw2, B35 está presentan en Europa, Estados Unidos y en diferentes grupos étnicos, como los nativos norte americanos y mestizos en donde se observa un incremento en la frecuencia de B8, DR4, D3, A9, A19, B39 y B35. En los Japoneses son más frecuentes los: HLA-DR3, DQ2, B35, B7, RB1, DRB3, DRB4, Dw2. Debemos recalcar la fuerte relación de Dw2, B35 y B7 en mecanismos de respuesta autoinmune, por lo que el estudio de los distintos haplotipos en la EM, en nuestra población es de suma importancia. El 55% de los pacientes afectados por la EM presenta DR2, DR4, lo que contrasta con el 18% entre la población general. Objetivo: Estudiar los alelos de HLA Clase I y II presentes en una familia mestiza con esclerosis múltiple. Material y Métodos: Se estudiaron a 11 integrantes de una familia: padre, madre y 9 hijos (7 mujeres y 2 hombres) con diagnóstico de EM, por medio de la técnica de tipificación de HLA Clase I utilizando 32 sueros y HLA Clase II con 22 sueros. Discusión: Los haplotipos obtenidos, nos muestran que los nueve hijos presentan el alelo B27, ocho presentan el B35 y cuatro el DR4, todos relacionados con la predisposición a la enfermedad. En la familia de estudio existe una fuerte relación entre la presencia del los alelos B27, B35 y DR4, en el desarrollo agudo de la EM, y en este caso se evidencia dominancia en la transferencia de alelos. Conclusión: En nuestra población (mestizo-americano) se observa una frecuencia baja de EM, sin embargo el estudio de la misma demuestra que los alelos que con mayor frecuencia se presentan en este padecimiento son A2, A28, B5, B35, B40; Es por esto que se abre un campo mayor para el estudio de esta y 60 otras patologías. Se espera en un futuro inmediato, el ampliar este estudio por medio de biología molecular. Genómica Poblacional GP-01 ESTUDIO DE LAS MUTACIONES C677T EN EL GEN DE LA MTHFR, G20210A EN EL GEN DE LA PROTROMBINA, G1691A DEL FACTOR V LEIDEN Y DE LA INSERCIÓN/ DELECIÓN 4AB EN EL GEN DE LA SON EN UN GRUPO DE PACIENTES CON DISECCIÓN CERVICAL ARTERIAL. Jara Prado A 1., Alonso Vilatela ME 1., Martínez Ruano L 1., Guerrero Camacho JL., Arauz Góngora A2. 1 Departamento de Genética y Biología Molecular, 2Clínica de Terapia Vascular, Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía MVS. Antecedentes: La disección cervical arterial (DCA) es una causa poco frecuente de isquemia cerebral que suele afectar a pacientes adultos jóvenes. En los últimos años se ha sugerido que algunas mutaciones son un factor de riesgo para el desarrollo de enfermedades vasculares. La presencia de la mutación C677T en el gen de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR), en sujetos homocigotos induce hiperhomocisteinemia y ha sido relacionada con eventos isquémicos. La mutación G20210A reportada como causante de enfermedad isquémica en el gen de la protrombina, provoca que sujetos portadores de esta mutación presenten niveles elevados de protrombina. En más del 90% de los casos la Resistencia Proteína C activada es a causa de una mutación en el gen del FV. La heterocigocidad para la mutación en este gen esta asociado con un incremento en el riesgo de desarrollar trombosis. Genes que regulan el sistema endotelial, como los de la sintasa del óxido nítrico (SON), han sido asociados con alteraciones en la actividad del promotor encontrándose una relación con el desarrollo de infarto lacunar sintomático. La inserción/deleción de 27 pb en el intrón 4 es uno de ellos. Objetivo: Investigar si la asociación entre la presencia de las mutaciones C677T en el gen MTHFR, G20210A del gen de la protrombina, G1691A del factor V Leiden y de la inserción/ deleción 4ab en el intrón 4 de la SON en un grupo de pacientes con Disección Cervical Arterial. Material y métodos: Se estudiaron 48 pacientes con DCA, 27 hombres y 21 mujeres con un promedio de edad de 38 años (rango 17-60, D.E.+/-10.73 años) y se aparearon con controles por sexo y edad en una proporción 2 a 1 con un promedio de edad de 37.8 años (rango 18-56, D.E. 10.17 años). Se les tomó muestras de sangre periférica para extracción de DNA, la identificación de los polimorfismos se realizó mediante PCR y RFLP´s a excepción del polimorfismo 4ab, los productos fueron resueltos en geles de agarosa para su genotipificación. Resultados: Se determinaron las frecuencias de los diferentes genotipos y los odds ratio como medida del riesgo relativo, junto con su intervalo de confianza para el 95%. La frecuencia de homocigotos para la mutación C677T de la MTHFR en pacientes, los homocigotos para la mutación fue de 16.7% contra 11.7% en los controles (OR=1.55, IC95%=0..5-4.59), para la mutación G20210A de la protrombina se encontró una frecuencia de heterocigotos del 8.3% para los pacientes y del 2.1% para los controles (OR=4.27, IC 95%= 0.48.37), para G1691A del factor V Leiden se encontró una frecuencia de heterocigotos del 2.1% para los pacientes y 3.3% para los controles (OR=0.65, IC95%=0.01-8.31) y para la inserción/deleción 4ab, la frecuencia de heterocigotos fue de 22.2% para los pacientes y 22.5% para los controles (OR=1.23, IC95%=0.45-3.23), también se compararon las frecuencias por género entre pacientes y controles y se encontró que para la mutación C677T de la MTHFR la frecuencia de homocigotos para la mutación fue de 18.5% para los pacientes y de 3.7% para los controles (OR=5.91, IC95%= 0.86-64.88) con una p=0.03. Conclusiones: No se encontró asociación con ninguno de los polimorfismos y el desarrollo de la enfermedad. Consideramos que es necesario ampliar la muestra para confirmar esta conclusión. GP-02 CREACIÓN DE UN BANCO DE ADN PARA EL ESTUDIO DE FACTORES GENÉTICOS ASOCIADOS A TRASTORNOS MENTALES EN ADOLESCENTES. Mendoza- de la Rosa, Graciela1, Gómez, Sánchez Ariadna1,Cruz Fuentes Carlos1,Benjet Corina2. Departamento de Genética Psiquiátrica; Subdirección de Investigaciones Clínicas 1 y Dirección de Investigaciones Epidemiológicas y Psicosociales INPRF2. Los trastornos mentales son considerados como un grave problema de salud pública. La adolescencia es particularmente importante porque en esta se gestan muchos de los problemas de las etapas subsecuentes. La creación de un banco de información genética de adolescentes, primero de su tipo en nuestro país, nos permitirá evaluar el papel de los genes en los trastornos psiquiátricos durante esta etapa del desarrollo humano. Esta iniciativa se inscribe dentro de un plan mundial de investigación sobre epidemiología genética de trastornos mentales en adolescentes impulsado por la Organización Mundial de la Salud. Los resultados obtenidos permitirán comparar los factores relevantes comunes o específicos entre países o culturas. El protocolo para el estudio fue revisado y aprobado por el comité científico y de ética del Instituto Nacional de Psiquiatría. Se recolectaron muestras de adolescentes de edades de 12 a 17 años, estas fueron representativas de la población que radican en el D.F y área metropolitana. Para la colecta se utilizo un enjuague bucal (Scope®), el cual se congeló hasta su procesamiento. Posteriormente se realizo la extracción del ADN usando el kit de aislamiento PureGene®. (Gentra). La concentración y calidad total de ADN fueron determinadas mediante espectrofotometria. Se aisló el material genético de 2522 muestras. El rendimiento promedio fue de 87 microgramos ADN/muestra, y la absorbancia 260/280 nm = 1.6 ± 0.2. La integridad de las muestras se analizó por electroforesis en agarosa 0.8%. Finalmente, algunas de las muestras mediante la amplificación de 3 polimorfismos de genes candidatos estudiados en trastornos psiquiátricos como son APOE, DRD4 y SLC6A4. La calidad y cantidad de ADN obtenida con esta técnica es similar al que se obtiene en metodologías que utilizan sangre periférica. La metodología utilizada es recomendable para estudios que impliquen la obtención de muestras de gran escala. GP-03 ELEMENTOS CLAVE SOBRE LA DIVERSIDAD GENÉTICA DE POBLACIONES INDÍGENAS MEXICANAS. Sandoval-Mendoza, Karla1, Buentello-Malo, Leonora2 PeñalozaEspinosa, Rosenda3 y Comas, David1. 1 Unitat de Biologia Evolutiva, DCEXS, Universitat Pompeu Fabra, Barcelona, España. 2Laboratorio de Genética, Instituto de Investigaciones Antropológicas, UNAM, Mexico D.F. 3Unidad de Investigación Médica en Genética Humana, CMN Siglo XXI, IMSS, México D.F. A pesar de la creciente utilización de técnicas moleculares empleadas para la reconstrucción de la historia de la humanidad, aún existen limitaciones, como la falta de un muestreo poblacional sistemático y la disponibilidad de poblaciones de diferentes regiones geográficas, las cuales pueden ser específicamente informativas con respecto al proceso de evolución y dispersión humana. Norteamérica es una de estas regiones, que debido a sus características étnicas y lingüísticas puede contribuir con gran información al esclarecimiento del proceso de colonización del nuevo continente, el cual sigue siendo muy controvertido. El presente trabajo se enfoca en el estudio de la dinámica del poblamiento de América por medio del análisis molecular de poblaciones indígenas actuales de México. Estas han sido analizadas conjuntamente con datos publicados de poblaciones nativas del Norte, Centro y Sudamérica. Para el presente estudio se obtuvieron muestras sanguíneas de seis poblaciones indígenas: Tarahumara, Purépecha, Otomi, Mixteca, Nahua y Triqui, cada una de estas pertenece a alguna de las seis familias lingüísticas descritas en México. Se analizó la región hipervariable I y algunos marcadores bialélicos dentro de la región codificante del ADN mitocondrial. Se determinó la composición haplotípica de 293 individuos, encontrando cuatro haplogrupos (A, B; C y D) pertenecientes a poblaciones Amerindias. No se encontró el haplogrupo X, también descrito en Amerindios, ni tampoco haplotipos no Amerindios. Los índices de diversidad de secuencias, distancias genéticas y composición haplotípica revelan que estos grupos Mexicanos son muy homogéneos. Se analizarán marcadores genéticos en el cromosoma Y para comparar ambos linajes. Los datos que se generen se enfocarán sobre la reconstrucción de la colonización de América, el pasado biológico y las relaciones filogenéticas de las poblaciones indígenas actuales. De esta manera se podrán dirigir futuros muestreos para la realización de mapas genómicos de la población indígena mexicana, que será de vital importancia para corregir la subestructura de poblaciones mezcladas en posibles estudios de asociación a enfermedades. GP-04 ASOCIACIÓN DEL POLIMORFISMO +62G/A EN LA REGIÓN 3’UTR DEL GEN DE LA RESISTINA CON OBESIDAD Y DIABETES. Fierro-Torres A 1 , Martinez-Sandoval E 2, López-Silva S 2 , González-Jasso E3, Bernabe A1, Espinoza-Rojo M1. 1 Unidad Académica Facultad de Ciencias Químico-Biológicas, Universidad Autónoma de Guerrero. 2Unidad Académica de Medicina Universidad Autonoma de Guerrero. 3CICATA. La resistina es una proteína liberada por adipocitos caracterizada por la relación directa de la misma con la resistencia a insulina, en el gen (rstn) que la codifica se han encontrado varios SNPs, algunos localizados en regiones no codificantes que pueden influir en la acción de la insulina en interacción con obesidad, en el año 2001 Cao y Hegele reportaron dos SNPs uno en la posición +39C>T y otro en la posición +62G/A en la región 3’UTR del exón 4, éste último se estudió en una población china asociándose el genotipo GG a hipertensión y diabetes sugiriendo que este SNP podría influenciar la diferenciación y maduración de adipocitos contribuyendo a la patogénesis de resistencia a insulina y DMT2 . En este estudio nuestro objetivo fue detectar el SNP +62G/A localizado en la región 3’UTR en trabajadores de la Universidad Autónoma de Guerrero zona Acapulco y relacionarlo con la presencia de diabetes y obesidad. El SNP 61 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica +62G/A se identificó por PCR y RFLPs en 204 individuos agrupados en pacientes con DMT2 e individuos normales. RESULTADOS: La variante AA se encontró en menor proporción (22.4%), que la variante GG (77.6%). La frecuencia alélica +62A, fue mayor en los pacientes con DMT2 (0.664) en comparación con los controles (0.401). El riesgo bivariado crudo mostró asociación significativa con obesidad abdominal (RM=3,IC95% 1.1 a 5.8 p=0.01) y con glucosa arriba de 126 mg/dl (RM=4,IC95% 1.8 a 7.0 p=0.000), sin embargo al realizar análisis estratificado la variante AA ya no mantuvo su asociación con la presencia de obesidad abdominal pero si con un riesgo cuatro veces mayor de presentar DMT2 (RM=4, IC95% 2.0 a 8.2 p=<0.000). La presencia de DMT2 y el genotipo AA fueron asociados con dislipidemias: hipertrigliceridemia (RM=8,IC95% 0.95 a 9.6 p=0.002) e hipercolesterolemia en (RM=3,IC95% 1.3 a 7.5 p=0.005). Por análisis de regresión logística hubo asociación del genotipo AA con glucosa alterada en DMT2 (RM=726.5,IC95% 87.5 a 6029.8 P=<0.000), encontrando cinco veces mas probabilidad de presentar DMT2 en presencia de dicho genotipo (RM=5, IC95%1.6-18.2 P=0.007). Los resultados del presente trabajo, determinan que el genotipo homocigoto AA del polimorfismo +62 G/A en la región 3´UTR del gen rstn se asocia con la presencia de DMT2 y alteración en la glucosa. GP-05 VARIANTES COMUNES EN LOS GENES QUE CODIFICAN PARA LOS CANALES DE K+ SENSIBLES A ATP (SUR1 (ABCC8) Y KIR6.2 (KCNJ11)) Y SU RELACIÓN CON DIABETES TIPO 2 (DT2) EN POBLACIÓN ADULTA DE LA CIUDAD DE MÉXICO. Sánchez-Contreras Ma. Elena1; Alonso-García Ana Lucía 1; Sánchez-Barrera Reyna Gabriela1; Hernández Saavedra Daniel1; Cruz-López Miguel1. 1 Unidad de Investigación Médica en Bioquímica, Centro Medico Nacional Siglo XXI. La DT2 es un desorden multifactorial caracterizado por defectos en el control de la glucosa y secreción y acción de la insulina. Se ha reportado asociación de DT2 con polimorfismos en los genes SUR1, KIR6.2; que codifican para proteínas del canal de potasio sensible a ATP (de las células beta-pancreáticas), sensor metabólico crítico en hiperglucemia. Nuestro objetivo fue evaluar si polimorfismos en los genes SUR 1 y KIR 6.2 se asocian con DT2. Se estudiaron 666 individuos sanos y 485 con DT2 con edades de 35-65 años. Los polimorfismos analizados fueron: A-1273G(A/ G), A1369S(G/T), G-1561A(A/G) en SUR1 y E23K(E/K) en KIR6.2. La discriminación alélica se realizó con sondas TaqMan en el equipo 7900HT (AplBios). Y el análisis por estadística descriptiva de todos los parámetros y la distribución de frecuencias genotípicas fue validada utilizando X2. Las poblaciones estudiadas se encuentran en equilibrio de HardyWeinberg. Las frecuencias genotípicas de la población con DT2 para estos polimorfismos no fue significativamente diferente de la encontrada en sujetos sanos. Los polimorfismos evaluados no muestran asociación con DT2. No se encontró asociación entre los polimorfismos estudiados, particularmente en la asociación alélica reportada en otras poblaciones para A1369S / KIR 6.2. GP-06 GENOTIPO PON1 192 Y SU ASOCIACIÓN CON EL PERFIL DE LÍPIDOS EN UNA POBLACIÓN YUCATECA. Pérez Herrera, Norma1, May Pech, Carlos1,2, Polanco Minaya, Hilda1,2, Castro Mañé, Jorge2, Gamboa Llanes, Roque2, Alvarado 62 Mejía, Jorge3, González Navarrete, Leticia3, Hernández Ochoa, Isabel1, Rojas García, Elizabeth1,4, Quintanilla Vega, Betzabet1. 1 Sección Externa de Toxicología, CINVESTAV, México, D.F., 2 Facultad de Química y 3Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de Yucatán, Mérida, Yuc., 4 Dirección de Fortalecimiento de la Investigación, Universidad Autónoma de Nayarit, Tepic, Nay. México se encuentra en un proceso de transición epidemiológica, en el cual los padecimientos crónico-degenerativos han desplazado a las enfermedades infecciosas. En Yucatán, las enfermedades cardio- y cerebro-vasculares se encuentran entre las 3 principales causas de mortalidad. Se han reportado factores genéticos de susceptibilidad para estas enfermedades, entre ellos el polimorfismo 192 de la enzima paraoxonasa (PON1), a la cual se le atribuye un papel antioxidante, porque se asocia a las lipoproteínas de alta densidad (HDL), previniendo la oxidación de lípidos. Estudios epidemiológicos muestran que la alta frecuencia del alelo PON1192R se asocia con el riesgo de presentar enfermedades vasculares. Nuestro objetivo fue conocer el genotipo PON1 192 en una población mestiza Yucateca y determinar su asociación con el perfil de lípidos. Se realizó un estudio transversal en Muna, Yucatán (febrero-septiembre de 2005) y se incluyeron 90 individuos sin relación consanguínea (previa firma de consentimiento). Se aplicó un cuestionario para evaluar: características generales, hábitos, dieta e historia clínica y la muestra de sangre se tomó en ayunas. Se determinó el polimorfismo PON1192 por PCR en tiempo real y el perfil de lípidos por métodos colorimétricos. La frecuencia del polimorfismo PON1192 en esta población mestiza (de fuerte ascendencia maya) es similar a otras poblaciones mestizas de México. El colesterolHDL y el índice de Rouffy se encontraron por debajo de los valores normales. El análisis multivariado, ajustado por confusores (peso/ talla, dieta, etc), mostró que los niveles de colesterol-HDL estuvieron asociados con el genotipo: los sujetos con el genotipo QQ presentaron niveles más altos que los sujetos con el genotipo RR (p=0.039). Este estudio sugiere que el genotipo PON1192RR se asocia con bajos niveles de colesterol-HDL y puede ser un factor de riesgo de enfermedad aterosclerótica. Proyecto financiado por CONACYT-SALUD; donativo otorgado a BQV. Se agradece a las Autoridades de Muna y a los voluntarios participantes. GP-07 HEREDABILIDAD Y CORRELACIONES GENÉTICAS DE FENOTIPOS RELACIONADOS A ENFERMEDADES METABÓLICAS EN MÉXICO: REPORTE PRELIMINAR DEL ESTUDIO EN FAMILIAS GEMM. Raul A. Bastarrachea1, Jack W. Kent Jr.1, Guadalupe Rozada2, Felipe Vadillo2, Jean W. Maccluer1 Y Anthony G. Comuzzie1 1 Department of Genetics, Southwest Foundation for Biomedical Research, San Antonio, Texas, USA. 2 Instituto Nacional de Perinatología, México, D.F., México. La enfermedad cardiovascular aterosclerosa (ECA) es una de las mayores causas de mortalidad en México, y el síndrome metabólico, un conjunto de factores de riesgo de ECA, va en aumento. Hasta ahora, ha habido pocos estudios de epidemiología genética del síndrome metabólico en México. Como un primer paso antes de implementar el estudio multicéntrico en familias GEMM (Genética de Enfermedades Metabólicas), se reclutaron 375 individuos de 21 familias extensas en 9 instituciones médicas de México. La selección de las familias se hizo a conveniencia sin considerar ninguna enfermedad. Se recolectaron datos antropométricos (estatura, peso y perímetro abdominal), hemodinámicos (presión arterial y ritmo cardíaco), y se midieron las concentraciones en sangre en ayuno de glucosa, colesterol y triglicéridos. Los análisis de genética cuantitativa basada en los componentes de la varianza se realizaron en el programa SOLAR. Todos los fenotipos excepto la presión arterial diastólica fueron significativamente heredables. Algunos fenotipos presentaron un efecto de región aleatorio significativo, posiblemente debido a diferencias sistemáticas del ambiente por el nivel de la población o la frecuencia alélica (p.ej estatura), o diferencias en la técnica de medición (p. ej. Presión arterial). Consistente con la definición del síndrome metabólico, muchos fenotipos presentaron correlaciones ambientales significativas; se encontraron también correlaciones genéticas significativas entre las mediciones de adiposidad, glucosa en ayuno y triglicéridos en ayuno. Estos datos preliminares representan las primeras estimaciones de heredabilidad para estos fenotipos en México. Los resultados indican que este diseño ofrece un poder excelente para el descubrimiento de genes relacionados a enfermedades metabólicas. GP-08 EFECTO DE LA DEFICIENCIA DIETÉTICA MATERNA DE VITAMINA B12 Y LOS POLIMORFISMOS DE LA METILENTETRAHIDROFOLATO REDUCTASA SOBRE EL NEURODESARROLLO INFANTIL. Del Río Garcia, Constanza1,2, Torres Sánchez Luisa1,2, Chen Jia3, Schnaas Lourdes4, Hernández Chávez Carmen4,Osorio Erika4,Cebrián Mariano5,Galván Portillo Marcia1,2, López Carrillo Lizbeth1 1 Instituto Nacional de Salud Pública,Morelos,Mexico. 2Selikoff Fellowship International Training Program in Environmental and Occupational Health. 3Community Medicine Department, Mount Sinai Medical Center, New York. 4 Instituto Nacional de Perinatología, Departamento de Neurobiología, México DF.5Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional, México DF. Objetivo: Evaluar la relación entre la ingesta dietética materna de vitaminas del grupo B y folato durante el primer trimestre del embarazo y el neurodesarrollo infantil de acuerdo con los polimorfismos maternos de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR 677C>T y MTHFR 1298A>C). Material y metodos: Como parte de un estudio de cohorte perinatal realizado en cuatro municipios del estado de Morelos, se evaluaron a 253 niños productos de embarazos simples, sin complicaciones al momento del parto, cuyas madres fueron seguidas antes y durante el embarazo. La ingesta dietética de vitaminas B2, B6, B12 y folato durante el primer trimestre del embarazo se estimó mediante un cuestionario semi-cuantitativo de frecuencia de consumo de alimentos. A través de técnicas de PCR-RFLP se determinaron los polimorfismos maternos de la MTHFR (677C>T y 1298A>C). El desarrollo mental (DM) y psicomotor (DPM) de los niños al 1, 3, 6 y 12 meses de edad, se evaluó mediante la aplicación de la prueba de Bayley (BSID-II). El efecto de la ingesta dietética materna de vitaminas B2, B6, B12 y folato durante el primer trimestre del embarazo y los polimorfismos maternos de la MTHFR sobre el neurodesarrollo infantil se estimó mediante un análisis multivariado con modelos generalizados de efectos mixtos. Resultados: Las frecuencias alélicas 677T y 1298C fueron del 59 y 10%, respectivamente. La deficiencia en el consumo de vitamina B12 durante el primer trimestre se asoció de manera no significativa con una disminución en DPM y una reducción estadísticamente significativa de 1.4 puntos sobre el DM independientemente del genotipo MTHFR materno. La ingesta dietética <400 mg/d de folato durante el primer trimestre del embarazo, se asoció de manera no significativa con el DPM y DM sólo entre los niños cuyas madres fueron portadoras del genotipo MTHFR 677TT. Conclusiones: Nuestros resultados sugieren que la deficiencia materna de vitamina B12 durante el embarazo tiene un impacto negativo sobre el desarrollo mental independientemente del genotipo de la MTHFR materno. Por el contrario, el efecto negativo del consumo materno deficiente de folato sobre el neurodesarrollo infantil podría estar mediado por el genotipo MTHFR materno. Por lo tanto, se justifica que durante el embarazo la suplementación vitamínica debe incluir vitamina B12 además del folato. GP-09 RIESGO DE ABORTO ESPONTÁNEO Y POLIMORFISMOS MATERNOS DE LA METILENTETRAHIDROFOLATO REDUCTASA EN MUJERES MEXICANAS. Rodríguez-Guillén Maria del Rosario 1,2 Torres-Sánchez Luisa 1,2 Chen Jia3, Blanco-Muñoz J1, Galván-Portillo M 1,2, Silva-Zolezzi I4, López-Carrillo L1. 1 Instituto Nacional de Salud Pública,Morelos,Mexico. 2Selikoff Fellowship International Training Program in Environmental and Occupational Health. 3Community Medicine Department, Mount Sinai Medical Center, New York, 4Instituto Nacional de Medicina Genómica, México DF. Con el objetivo de evaluar el riesgo de aborto espontáneo en mujeres mexicanas portadoras del polimorfismo de la metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR) (677 C>T y 1298 A>C); se llevó a cabo un estudio de casos y controles anidado en una cohorte perinatal de mujeres residentes en cuatro municipios del estado de Morelos, México. Veintiocho casos de aborto espontáneo (edad gestacional ≤ 20 semanas) fueron comparados con 106 mujeres aún embarazadas para el momento de aparición del caso. Al inicio de la cohorte, se aplicó un cuestionario estructurado, con el que, se obtuvo información acerca de las características sociodemográficas y dietéticas, el consumo paterno de alcohol y el hábito tabáquico materno y paterno. La determinación de los polimorfismos maternos de la MTHFR (677 C>T y 1298 A>C) se realizó mediante técnicas de PCR-RFLP y la concentración sérica de homocisteina se evaluó mediante cromatografía de líquidos (HPLC). El riesgo de aborto espontáneo según tipo de polimorfismo bajo estudios se estimó a través de modelos de regresión logística. Resultados: En comparación con los controles, los casos presentaron una mayor frecuencia genotípica MTHFR 677TT (35.7% vs. 25.4%), aunque esta diferencia no fue estadísticamente significativa. El genotipo MTHFR 1298CC se presentó sólo en uno de los casos. Entre los controles ambos genotipos se encontraron en equilibrio de Hardy-Weinberg. Bajo un modelo de herencia recesivo, las mujeres portadoras del genotipo 677TT tuvieron un incremento significativo en el riesgo ajustado de aborto espontáneo (OR=5.0; IC 95% :1.2; 20.9) comparado con las portadoras del genotipo 677CC/CT. Así mismo, una asociación positiva y marginalmente significativa con el aborto espontáneo (OR=5.5 95%CI: 0.9; 11.5) se observó cuando comparamos a las portadoras del genotipo 1298AA vs. 1298AC/CC. Conclusión: Nuestros resultados concuerdan con reportes previos, en los que se sugiere la importancia de los polimorfismos (MTHFR 677 C>T y 1298 A>C) como potenciales determinantes del aborto espontáneo. 63 Carteles Memorias del Congreso II Congreso Nacional de Medicina Genómica GP-10 DISTRIBUCIÓN GEOGRÁFICA DE LOS POLIMORFISMOS ASOCIADOS A DIABETES MELLITUS TIPO 2 EN POBLACIÓN MEXICANA. L. del Bosque-Plataπ, A. Inchausteguiπ, K. Carrillo-Sanchezπ, G. Jimenez-Sanchezπ πInstituto Nacional de Medicina Genómica La diabetes mellitus tipo 2 (DT2) afecta aproximadamente al 5% de la población general; en Mexico la prevalencia es de ~10.8%. Se han reportado varios genes con variantes asociadas al incremento de riesgo a la DT2; sin embargo, solo pocas de esas asociaciones han sido replicadas. Más del 80% de la población mexicana es mestiza, resultado de la mezcla entre los españoles con cualquiera de los 62 grupos étnicos que vivian en MesoAmérica. Para explorar la hipótesis de la existencia de diferencias entre las frecuencias alélicas de las variantes asociadas a DT2 en diferentes regiones geográficas de México, analizamos variantes en 9 genes previamente asociados a la enfermedad (p<0.01): receptor de la sulfonilurea (ABCC8), canal rectificador de potasio (KCNJ11), receptor de glucagón (GCGR), receptores activados por el proliferador de peroxisomas gama (PPARG), factor nuclear de hepatocitos 4 alfa (HNF4A), miembro 1 de la familia clase 2 de acarreadores de solutos (SLC2A1), calpaína 10 (CAPN10), glucocinasa (GCK) y el factor de transcripción 7 similar al 2 (TCF7L2). Incluimos 1104 individuos de 6 estados de México (50% mujeres y 50% hombres): Guanajuato, Guerrero, Sonora, Veracruz, Zacatecas y Yucatán. Los resultados iniciales incluyen las frecuenicas alélicas menores (FAM) promedio, así como los rangos entre las frecuencias más bajas y más altas por estados: 1) PPARG (rs1801282) G=0.12 (0.06-0.17); 2) CAPN10 (rs297576) G=0.09 (0.07-0.13); 3) KCNJ11 (rs5219) T=0.39 (0.360.44); 4) HNF4A (rs2144908) A=0.49 (0.43-0.58); and, 5) TCF7L2 (rs185384) A=0.19 (0.15-0.26). Comparamos el promedio de FAMs de las poblaciones mexicanas mestizas con las reportadas por el HapMap. Interesantemente, el SNP común funcional del gene KCNJ11 analizado muestra FAMs mayores en todos los estados de Mexico (Zacatecas 0.45, Sonora 0.39, Veracruz 0.39, Guanajuato 0.38, Guerrero 0.37, y Yucatán 0.37), que las reportadas para caucásicos de Utah (0.34), africanos de Yoruba (0.08), chinos Han (0.24) y japoneses de Tokio (0.30). En algunos de las otras variantes estudiadas existen estados con FAMs mayores a las reportadas en las poblaciones del HapMap. Los resultados iniciales soportan la hipótesis de que la población mestiza mexicana tiene diferencias entre regiones geográficas y en con otras poblaciones del mundo (HapMap); esta información contribuirá a estratificar las poblaciones en los estudios de asociación y incrementará nuestro conocimiento de la predisposición genética a la DT2. GP-11 POLIMORFISMOS -148C/T Y -455G/A EN EL PROMOTOR DEL GEN QUE CODIFICA PARA LA CADENA BETA DEL FIBRINÓGENO EN PACIENTES CON DIABETES TIPO 2 Y OBESIDAD. Torres-Rojas, Carolina 1; Flores-Alfaro, Eugenia1; VelascoMondragón, Eduardo 2; Parra-Rojas, Isela 1; Espinoza-Rojo, Mónica1. 1 Unidad Académica Facultad de Ciencias Químico Biológicas. Universidad Autónoma de Guerrero. 2 Instituto Nacional de Salud Pública. Cuernavaca, Mor., México. Uno de los avances más importantes hasta el momento ha sido la identificación de los principales factores de riesgo aterogénicos para las enfermedades cardiovasculares (ECV), como la 64 hipertensión arterial, las dislipidemias, el tabaquismo, la obesidad, la DM-2 y el incremento en los niveles del fibrinógeno. En la síntesis del fibrinógeno el gen de la cadena beta ejerce función reguladora, de modo que varios polimorfismos de este gen han sido identificados y están asociados con elevados niveles plasmáticos de fibrinógeno y con la ECV. Los polimorfismos que se han asociado con el aumento de la proteína del fibrinógeno son el -148C/T y -455G/A. Dada la relación existente entre la presencia de Diabetes y las enfermedades cardiovasculares, y la estrecha relación de esta última con el incremento de los niveles del fibrinógeno, es importante evaluar la asociación de los polimorfismos -148C/T y -455G/A con la presencia de DM-2 y obesidad en personas de Chilpancingo, Gro. Para ésto se realizó un estudio transversal en donde se analizaron 335 muestras de DNA por PCR y RFLPs para detectar los polimorfismos, 117 muestras de pacientes aparentemente sanos, 50 DM-2 con obesidad, 88 DM-2 sin obesidad y 60 obesos. En donde el OR crudo y ajustado obtenido evidenció asociación del genotipo CT del polimorfismo -148C/T, con la presencia de obesidad y DM-2 con obesidad, en donde el grupo de pacientes obesos tuvo un OR ajustado de 3.3 (IC 95% 1.7-6.2). El grupo de DM-2 con obesidad el OR obtenido mostró que este grupo de pacientes tiene mayor probabilidad de presentar el genotipo CT en comparación con el grupo de obesos, con un OR ajustado de 7.8 (IC 95% 2.9-21.2). Con respecto al genotipo de riesgo AA del polimorfismo -455G/A, esté se asoció con la presencia de obesidad, encontrando un OR ajustado de 4.0 (IC95% 0.7-21.7), aunque está asociación no fue estadísticamente significativa. El genotipo GA se asoció significativamente con la presencia de DM-2 con obesidad (OR ajustado, 2.4; IC95% 1.1-5.1). Por lo que se sugiere que los polimorfismos analizados en este estudio, se asociaron con la presencia de obesidad y no con DM-2, y que esta asociación se potencia más en los pacientes que presentan DM-2 con obesidad. GP-12 MESTIZAJE EN LA CIUDAD DE MÉXICO: IMPORTANCIA DE LA MEZCLA GÉNICA EN LA IDENTIFICACIÓN DE FACTORES GENÉTICOS DE RIESGO ASOCIADOS A DIABETES TIPO 2. Valladares Adan, PhD1, Cameron Emily A, BSc2, MartinezMarignac Veronica L, PhD2, Chan Andrea, BSc2, Perera Arjuna, BSc2, Globus-Goldberg Rachel, BSc2, Wacher Niels, MD, M.Sc3, Kumate Jesus, MD, PhD4, McKeigue Paul M, PhD5, O’Donnell David, PhD5, Shriver Mark D, PhD6, Parra Esteban J, PhD2, Cruz Miguel, PhD 1 . 1 Unidad de Investigación Médica en Bioquímica, Hospital de Especialidades, Centro Médico “Siglo XXI”, IMSS, México; 2 Department of Anthropology, University of Toronto, Mississauga, Ontario, Canada, L5L 1C6; 3Unidad de Investigación Médica en Epidemiología Clínica, Hospital de Especialidades, Centro Médico “Siglo XXI”, IMSS, Mexico; 4Fundación IMSS, México; 5Conway Institute, University College Dublin, Dublin, Ireland and 6 Department of Anthropology, Penn State University, USA. Se identificó el porcentaje del componente genético en un grupo de 286 individuos con diabetes tipo 2 (DT2) y 275 individuos sanos no relacionados, sin antecedentes familiares de DT2, ambos grupos viven en la Cd de México. La proporción de la mezcla génica fue evaluada con 69 marcadores autosómicos informativos ancestrales (AIMs). También se estimó la contribución materna mediante polimorfismos del mtDNA y la contribución paterna mediante los polimorfismos del cromosoma Y. La contribución génica de la población nativa americana, europea y africana fue de 65%, 30% y 5 %, respectivamente. La Memorias del Congreso 65 Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica contribución nativa americana vía materna fue estimada en 90% y la paterna en 40 %. El número de generaciones ancestrales se estimó en 6.7 (95%, IC 5.7-8.0), por lo tanto, se requieren 1,400 AIMs para mapear todo el genoma. También se requerirá un tamaño de muestra de 2000 casos aproximadamente para detectar aquellos locus que contribuyan con un riesgo de al menos 1.5 veces. Este enfonque, probablemente, nos permita identificar variaciones en los genes de riesgo a enfermedades para la población mexicana y europea. GP-13 ANÁLISIS DE SNP´S EN GENES CANDIDATOS QUE CONFIEREN SUSCEPTIBILIDAD A DESARROLLAR ARTRITIS REUMATOIDE JUVENIL EN PACIENTES PEDIÁTRICOS MEXICANOS. Ramírez-Bello J.1,2, Baca-Ruíz V. 3, Velázquez-Cruz R.1, MoralesMarín M. 1, Espinosa-Rosales F. 4, Zarco, O 4, García-Díaz E.1, Orozco L1,2 1. Instituto Nacional de Medicina Genómica, SS. 2. Programa de Maestría en Ciencias Genómicas, UACM. 3. Hospital de Pediatría Centro Médico Nacional-Siglo XXI, IMSS, 4. Instituto Nacional de Pediatría, SS. La Artritis Reumatoide Juvenil (ARJ) es la artropatía autoinmune crónica más común en niños, se caracteriza por inflamación articular persistente, dolor, rigidez, e incapacidad para realizar movimientos. La prevalencia de esta enfermedad multifactorial es de aproximadamente 1 de cada 1000 niños. Entre los factores genéticos que confieren susceptibilidad se han encontrado polimorfismos de un solo nucleótido (SNP´s) en los genes IL1 alfa, CCL5, TAP2, TSNP, MCP1, IKBL. Estas variantes alélicas se encuentran asociadas a la enfermedad sólo en ciertas poblaciones, por lo que el objetivo de este trabajo es determinar si SNP´s localizados en estos genes se encuentran asociados a la susceptibilidad para desarrollar ARJ. Para evaluar esta asociación se incluyeron 132 pacientes pediátricos mexicanos con diagnóstico de ARJ con una edad de inicio menor a 16 años y como controles 250 individuos sanos sin antecedentes de AR o cualquier otra enfermedad autoinmune. Todos los casos incluidos fueron diagnosticados siguiendo los criterios del Colegio Americano de Reumatología. Tanto los casos como los controles fueron individuos no relacionados y fueron parearos por sexo y origen étnico. Para realizar la genotipificación de los SNP´s se utilizó el método fluorescente de 5’ exonucleasa (Taqman). La asociación de los SNP´s con ARJ se determinó comparando las frecuencias genotípicas y alélicas entre los casos y controles por medio de chi-cuadrada y la prueba exacta de Fisher. Nuestros resultados muestran que la frecuencia de los SNP´s en los genes IL1 alfa -889G/A, CCL5 –28C/G, TAP2 Ala565Thr, TPSN Thr265Arg, MCP1 –2518G/A fueron similares entre casos y controles. Sin embargo, la frecuencia de los SNP´s – 403G/A de CCL5 y – 62T/A de IKBL mostraron diferencias estadísticamente significativas entre pacientes y controles (SNP –403G/A: p=0.02, OR: 2.4, IC: 1.12-5.10; SNP –62T/A: p=0.015, OR: 2.19, IC: 1.15 – 4.17). Los resultados obtenidos en este estudio sugieren que los SNPs – 403 G/A de CCL5 y –62 T/A de IKBL participan en la susceptibilidad para desarrollar ARJ en pacientes pediátricos mexicanos. GP-14 ANÁLISIS COMPARATIVO DE LA VARIACIÓN DE LOS POLIMORFISMOS EN EL NÚMERO DE COPIA ENTRE POBLACIONES MESTIZA MEXICANA Y EUROPEA. Uribe-Figueroa Laura, Hidalgo-Miranda Alfredo, Silva-Zolezzi Irma, Estrada-Gil, Jesús, Arrieta Maylen, Contreras Alejandra, Jiménez-Sánchez Gerardo. Instituto Nacional de Medicina Genómica. México. Las variaciones en el número de copia (VNC) se han identificado recientemente como una forma de diversidad genómica entre individuos. Inicialmente, las VNC fueron relacionadas con susceptibilidad a enfermedades como el cáncer, pero recientemente se ha demostrado que también pueden caracterizar diferencias genéticas importantes entre grupos poblacionales. El objetivo del presente trabajo fue analizar las variantes en el número de copia de 300 muestras de ADN de voluntarios mestizos de 6 estados de la República Mexicana utilizando microarreglos de Genotipificación 100K de Affymetrix . Los resultados se analilzaron con el software DChip y se compararon con datos de 60 muestras de la población caucásica (CEU) del proyecto Internacional del Mapa de Haplotipos analizadas con la misma plataforma tecnológica. Para el análisis comparativo entre poblaciones, se calculó el cambio en el número de copias de la población mexicana y luego se comparó con los datos de las 60 muestras europeas que, para fines del análisis, se consideraron como control normal diploide. Los resultados muestran que en los individuos de los distintos estados de la Repúbica Mexicana no se observan diferencias en VNC entre los seis estados analizados. Sin embargo, al compararlos con los datos de las 60 muestras europeas, se observaron en más del 20% de los casos, regiones con menos de una copia (deleciones) y regiones con más de 5 copias (amplificaciones) en un 15% del total analizado. El análisis comparativo in silico con las muestras europeas mostró una importante variabilidad en VNC, siendo estas tanto deleciones como amplificaciones, en más del 50% de la población mexicana. Los resultados muestran que la población Mestiza Mexicana analizada es, homogénea en las VNC, y tiene diferencias claras al compararse con las muestras de origen caucásico. La caracterización de las diferencias en VNC entre distintos grupos poblacionales es importante para entender la influencia de estas variantes estructurales en la enfermedad humana. La validación de las VNC encontradas en la población mexicana al compararla con la europea son el siguiente paso para determinar el poder de discriminación de estas variantes para el estudio a nivel genómico de nuestra variabilidad. El conocer las VNC inherentes a una población específica resulta de gran valor para establecer un patrón de comparación que permita identificar aquellas VNC de relevancia médica. GP-15 ALTERACIONES EN DNMT1 Y 3B Y METILACIÓN DE PROMOTORES DE LOS GENES MGMT, FHIT, HMSH2, HMLH1 DURANTE LA CARCINOGÉNESIS CERVICAL Daniel Hernández Sotelo, Berenice Illades Aguiar, Marco Antonio Leyva Vázquez, Yaneth Castro Coronel, Julio Ortiz Ortiz, Aurora Castillo Laguna, Diana Canela Campos y Yaliccia Jahel González Barrientos. Unidad Académica Facultad de Ciencias Químico Biológicas, Lab de Biomedicina Molecular. Introducción: La metilación de promotores de genes supresores de tumor y reparadores de DNA es un evento común en cáncer 66 cervical. Existen evidencias que señalan que la metilación en promotores ocasiona disminución o silenciamiento en la expresión de genes. La metilación es catalizada por DNA-metiltransferasas, las cuales se dividen en dos, de mantenimiento (DNMT1) y de novo (DNMT3B). En distintos tipos de cáncer se han encontrado alteraciones en el nivel de expresión de DNMTs. Recientemente se reportó el polimorfismo C46359T en el promotor de la DNMT3B, del cual el genotipo CT confiere un promotor más fuerte, además pacientes con este genotipo tienen mayor riesgo de desarrollo de cáncer de mama. Por lo que las DNMTs, en especial la 3B, tienen un papel clave en la metilación anormal y en consecuencia en el desarrollo de cáncer. Objetivo: Investigar el papel de la DNMT1 y 3B en la metilación de genes reparadores de DNA y supresores de tumor durante la carcinogénesis cervical. Métodos: Se realizó un estudio transversal analítico. Se recolectaron 140 muestras en el Instituto Estatal de Cancerología “Dr. Arturo Beltrán Ortega” de Acapulco Guerrero, 40 de citología cervical normal, 39 de lesión escamosas intraepitelial de grado bajo (LEIGB), 20 de lesión intraepitelal escamosa de alto grado (LEIGA) y 41 de cáncer cervical. Se detectó, mediante PCR-SM, la metilación de los promotores de los genes MGMT, FHIT, hMSH2 y hMLH1. Mediante RT-PCR semicuantitativa se determinó el nivel de expresión de MGMT, FHIT, DNMT3B y DNMT1 y mediante PCR y RFLPs se genotipificó el polimorfismo C46359T de DNMT3B. Por PCR (MY09/MY11)-RFL¨s se detectó y genotipificó al VPH. Las asociaciones entre variables se establecieron mediante la prueba exacta de Fisher’s o X2. Las diferencias en el nivel de expresión de los genes MGMT, FHIT, DNMT3B y DNMT1 se establecieron con la prueba de Mann Whitney. P < 0.05 se consideró estadísticamente significativa. Resultados: En citología normal se detectó metilación en los genes MGMT 17.5%, FHIT 37.5% y hMLH1 77.5%. En LEIGB, MGMT 38.5%, FHIT 46.1%, hMSH2 14.3% y hMLH1 90.5%. En LEIGA, hMSH2 25% y hMLH1 55%. En cáncer cervical, MGMT 36.6%, FHIT 53.6%, hMSH2 5% y hMLH1 95%. El nivel de expresión de los genes MGMT y FHIT fue significativamente mas bajo en cáncer cervical que en citología normal (P=0.01 y P=0.009, respectivamente). La expresión de DNMT1 y 3B fue más alta en cáncer cervical y LEIGA que en LIEGB y citología normal. El genotipo CT de la DNMT3B fue el más frecuente en cáncer cervical, LEIGA, LEIGB y citología normal (88.8%, 82.1%, 69.9% y 86%). Los heterocigóticos CT mostraron un incremento de casi 5 veces el riesgo de cáncer cervical, comprados con los homocigóticos CC (OR=4.9, IC 95%, 0.45-247.2). Conclusión: Existen alteraciones en la expresión de las DNMTs en cáncer cervical y lesiones precancerosas. La expresión de la DNMT3B es alta en cáncer cervical y el genotipo heterozigótico CT del polimorfismo C46359T de la DNMT3B, es el más común en la población estudiada, lo que indica que todas las alteraciones en las DNMTs podrían ser las responsables de la metilación anormal en los genes MGMT, FHIT, hMLH1 y hMSH2 durante el desarrollo del cáncer cervical. GP-16 MESTIZAJE Y BLOQUES GENÉTICOS DEL HLA: IMPLICACIONES EN EPIDEMIOLOGÍA MOLECULAR. Barquera, Rodrigo1,2, Torres-García, Diana1, Montoya-Gama, Karla1, Hernández-Díaz, Raquel2, García-Salas, Claudia3, AcuñaAlonzo, Víctor1,2 y Granados, Julio4. 1 Laboratorio de Genética Molecular, ENAH, México, 2Laboratorio de Fisiología, Bioquímica y Genética, ENAH, México, 3 Departamento de Farmacia, Facultad de Química, UNAM, México, 4Departamento de Reumatología e Inmunología, INCMNSZ, México La definición de mestizo mexicano es muy general y poco informativa desde el punto de vista genético. La relación genesambiente va estrechamente ligada al contexto del mestizaje en la medida en que este último introduce nuevas variantes alélicas en una población. La única manera confiable de estudiar bloques genéticos en marcadores autosómicos sujetos a recombinación es la tipificación de tríadas padre-madre-hijo para armar haplotipos, teniendo un reflejo fiel de la asociación en vez de una estimación estadística. De esta manera se puede calcular adecuadamente el valor delta para medir el Desequilibrio de Ligamiento (LD) entre dos alelos de loci cercanos. Los genes del Antígeno Leucocitario Humano (HLA, por sus siglas en inglés) codifican para proteínas presentadores de antígenos, siendo fundamental su estudio y entendimiento como parte de muchas enfermedades, tanto infecciosas como autoinmunes. Este sistema genético es el más polimórfico en el ser humano y aunque sus alelos se encuentran distribuidos globalmente existen contrastes entre algunas frecuencias alélicas y haplotípicas que permiten utilizarlo para estudios poblacionales. Mediante el estudio de las frecuencias de los alelos y los bloques genéticos del HLA se estudió la composición genética y se estimó el componente ancestral amerindio, europeo y africano que poseen 3 poblaciones mestizas de México: la Ciudad de México, Puebla y Sinaloa, siendo el primer reporte para esta última. En los mestizos, se encontraron alelos y haplotipos previamente reportados en las poblaciones ancestrales. Las asociaciones más fuertes en los tres casos son aquellas previamente reportadas en poblaciones europeas, seguidas por asociaciones amerindias. La diferencia en la contribución ancestral observada entre los distintos grupos mestizos justifica la necesidad de contar con grupos control bien caracterizados para elaborar estudios de asociación que controlen la variación etnogenética de acuerdo a la procedencia de la muestra. Farmacogenómica y Terapéutica Molecular FTM-01 EL PULQUE; ALIMENTO FUNCIONAL DE ETNIAS MESOAMERICANAS. Lemus-Fuentes, Enrique Instituto de Agroindustrias, Universidad Tecnológica de la Mixteca, Huajuapan de León, Oax. Una mezcla de información, obtenida tanto de técnicas de análisis sofisticadas actuales así como de registros arqueológicos y documentos de la colonia, permiten sugerir al pulque que contiene prebióticos y probióticos entre otros nutrientes, como alimento funcional. Escalante et al, 2004, usando la técnica 16S rDNA, reportan una importante cuantificación de microorganismos en el pulque, es de destacar que los microorganismos encontrados se consideran probióticos. El alto contenido de fructoligosacárido en el aguamiel, permite señalar su función como prebiótico. El uso del pulque en Mesoamérica ha quedado registrado en vasijas que se datan entre el año 600 al 800 dC. Sus aplicaciones tanto ceremoniales como medicinales también se han mencionado por Sahagún [4] y en documentos de la colonia como el códice Florentino o el códice Badiano. En vista de la actualidad de los probióticos y prebióticos como altamente efectivos en la supresión de tumores cancerígenos [1, 2, 3, 5], flatulencias, etc., cobra especial relevancia los antecedentes del consumo prehispánico del pulque. Así, el pulque debe considerarse como un vehiculo de administración de probióticos y prebióticos. Los consumidores 67 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica ya no esperan que los alimentos solo los nutran con proteínas, calorías y vitaminas, sino que además les ayuden a mejorar el funcionamiento del organismo. El pulque ha sido consumido por las etnias que poblaban originalmente Mesoamérica, con esto, se puede inferir de que el consumo del pulque en dosis moderadas tiene un riesgo bajo en estas poblaciones. FTM-02 USEFULNESS OF CYP2C9 GENOTYPING AND INDIVIDUAL VARIABILITY IN RESPONSE TO WARFARIN. Raggio Víctor 1, Esperón Patricia 1,2, Tabú Irene 3, Lorenzo Mariana1, Cuesta Alejandro3, Rodríguez Adriana3, Ortiz Virginia3, Kuster Fernando3, Lluberas Ricardo3, Stoll Mario1 1 Área de Genética Molecular, Comisión Honoraria para la Salud Cardiovascular. 2Cátedra de Biología, Fac. Química Montevideo. 3 Depto. Cardiología del Hospital de Clínicas, Facultad de Medicina. Montevideo, Uruguay Warfarin is a widely used oral anticoagulant whose dosification requires serological monitoring with INR (International Normalized Ratio) because narrow therapeutic index and potencially severe adverse effects. Polymorphic variants in various genes modulate individual response to this drug, especially CYP2C9. We studied the influence of these genetic variants on interindividual variability in response to warfarin and the risk of adverse reactions in an uruguayan population. Methods:The study involved 55 patients undergoing chronic oral anticoagulant treatment. Data on maintenance dose, pharmacokinetic response, and adverse reactions were obtained. CYP2C9 *1, *2 and *3 genotype was analyzed using commercial kits (ATGen Sistemas Moleculares–Celsius, Uruguay). Results:Carriers of CYP2C9 *3 allele requiered the lesser manteinance doses, followed by *2 allele carriers and then *1 homocygotes (4.4±1.0 vs 5.4±2.3 vs 7.0±3.6 mg/d, p=0.049). No CYP2C9*3 allele carrier received a maintenance dose of 8 mg/d or higher vs 13% of *2 carriers and 39% of *1 homocygotes (p=0.015). CYP2C9 *3 allele carriers had an increased risk of bleeding and overanticoagulation (67% vs 57%), and required almost twice dose adjustments to achieve a proper anticoagulation, compared with *1 homocygotes. The group of CYP2C9 *2 allele carriers did not have an increased risk of bleeding. The two episodes of mayor bleeding ocurred in patients carrying CYP2C9 variant alleles. Conclusions: this study is the first carried out on this subjet in a uruguayan population and confirms an increased sensibility to warfarin in carriers of CYP2C9 *2 and *3 alleles, as widely described in previous reports. We propose, as a clinical application of pharmacogenetics in a preventive program, that genotypic data should be considered when establishing the best individual dose in patients: 1-at high risk of bleeding, 2- who suffered an adverse effect, or, 3-young people who would potentially face a long term anticoagulant therapy. FTM-03 ENZIMAS DE ARN COMO HERRAMIENTAS DE SUPRESIÓN GÉNICA CONTRA EL VPH-16. Aquino-Jarquin Guillermo y Alvarez-Salas Luis Marat. Laboratorio de Terapia Génica. Departamento de Genética y Biología Molecular. CINVESTAV-IPN. Una estrategia atractiva para conseguir un bloqueo específico de la expresión génica, es mediante el empleo de ácidos nucleicos antisentido. Las ribozimas son moléculas de ARN dotadas de actividad catalítica, identificadas como las primeras moléculas 68 de naturaleza no proteica capaz al mismo tiempo de almacenar información genética y de manifestar una actividad enzimática. La demostración de que el ARN puede ser cortado por ribozimas que actúan en cis (intramolecularmente) y en trans (intermolecularmente), ha permitido el diseño de un nuevo concepto de sistemas de expresión de múltiples ribozimas. Nosotros utilizamos ARNs catalíticos como modelo para el desarrollo de ARNs terapéuticos contra el cáncer cervical. Previamente desarrollamos dos ribozimas hairpin (HP), R419 y R434, que inducen la supresión específica del ARNm del Virus del Papiloma Humano tipo 16 (VPH-16). Esto produjo la inhibición de la proliferación tanto de células inmortalizadas con VPH-16 como de células tumorales. Ahora, hemos desarrollado dos sistemas de expresión de múltiples ribozimas basados en el corte en cis y en trans de ribozimas HP, que permite la actividad independiente de varias ribozimas terapéuticas provenientes de un solo transcrito dentro de un ambiente intracelular. Debido a su diseño original, uno de ellos potencia la supresión del ARNm de E6/7 del VPH-16 y previene el escape de mutantes al incrementar la cantidad y tipo de ribozimas desplegadas.. FTM-04 PRODUCCIÓN DE RATONES KNOCK-IN QUE EXPRESAN PROTEÍNAS DE FUSIÓN WAP-GNRH. Macías-Riveros, Dolly1; Vázquez-Chagoyán, Juan Carlos1; Alonso-Morales Rogelio2 y Cajero-Juárez Marcos3. 1 Centro de Investigación y Estudios Avanzados en Salud. Universidad Autónoma del Estado de México. 2Laboratorio de Genética y Biología Molecular de la FMVZ de la UNAM y 3Centro de Estudios Multidisciplinarios en Biotecnología de la Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. Un organismo genéticamente modificado (OGM) es aquel que lleva en su genoma fragmentos de ADN exógeno, ya sean deleciones o inserciones con pérdida o ganancia de función y transmite esos cambios a sus descendientes por vía germinal. La generación animales con genes recombinantes dirigidos para que se expresen en determinados tejidos mediante promotores específicos, constituye una valiosa herramienta para el estudio de la función génica, de la fisiología del desarrollo y del origen de algunas enfermedades, así como el posible diseño de tratamientos y la producción de proteínas de valor farmacológico. El proceso postraduccional de una proteína es definido por el organismo que la produce aprovechando la maquinaria enzimática natural celular para obtener un péptido específico. Así, se planteó como objetivo producir proteínas recombinantes en leche a través de mutagénesis dirigida. Se han generado transgenes de inserción aleatoria y específica, pero no se ha producido la proteína recombinante de fusión WAP-GnRH. Se eligió la GnRH, neurohormona gonadotrópica péptidica de 10 aminoácidos, importante en la reproducción, porque actúa sobre los receptores específicos hipofisiarios de las hormonas luteotropas y folículo estimulantes (LH y FSH) y genera los pulsos determinantes de la función reproductiva. El fragmento resultante de la fusión de mWAP del inglés Whey acidic protein, proteína ácida sérica de la leche más GnRH, se purificó y se transfectó en células madre de ratón (ES). Blastocistos obtenidos de ratonas donadoras se microinyectarán con las ES transfectadas y purificadas; estos embriones híbridos se transfieren a hembras receptoras. El estudio se ha dividido en tres fases que obedecen a la metodología de la de producción de animales knock in. Fase I: Diseño y construcción del vector. Fase 2: Cultivo, transfección y purificación de células ES. Fase 3: Producción de ratones que generen proteína recombinante de fusión,. FTM-05 EL INHIBIDOR DE DESACETILASA DE HISTONAS ÁCIDO VALPRÓICO INDUCE LA TRANSCRIPCION DEL RECEPTOR ADENOVIRUS-COXACKIEVIRUS (CAR) IN VITRO E IN VIVO. Avalos, Berenice1, Rangel, Edgar1, Segura, Blanca1, Benítez, Jorge1, Velázquez, Dora1, Barrón, Eva1,3, Pérez, Delia3, Aguilar, José Luís2, Martínez-Said, Héctor4, Cabrera, Gustavo1 . 1 Laboratorio de Vectorología y Terapia Génica y Departamentos de 2Oncología, 3Patología y 4Cirugía, Instituto Nacional de Cancerología, México DF, México. Introducción- El éxito de las estrategias de transgénesis para el tratamiento del cáncer depende de la transducción eficiente de las células tumorales. La presencia del receptor adenovirus coxackie (CAR) en las células que constituyen la masa tumoral es un requisito indispensable para lograr una eficiente infección adenoviral. Se ha documentado que en diferentes líneas celulares de cáncer existe una baja o nula expresión del receptor CAR asociada con el grado de des-diferenciación celular con la consecuente repercusión en perfiles sub-óptimos de transducción adenoviral. Se ha propuesto que dicho obstáculo podría ser resuelto mediante la inducción transcripcional farmacológica utilizando inhibidores de desacetilasas de histonas (HDACi) ya que reportes recientes indican que la transcripción del gen CAR es regulado por mecanismos epigenéticos, principalmente la acetilación de histonas. El ácido valpróico ha sido utilizado para el tratamiento de desordenes bipolares y epilepsia y posee la característica de ser un inhibidor de HDACs. Objetivo- En el presente trabajo estudiamos el efecto del ácido valpróico sobre la actividad de HDACs, acetilación de histonas H3 y H4, niveles del mRNA de CAR y transducción adenoviral en células de cáncer de mama (MCF-7), de cervix (HeLa) y de de vejiga (T24), y en muestras de pacientes con cáncer cervico uterino tratadas con valproato de magnesio. Resultados- Se documentó la hiperacetilación de histonas H3 y H4 como resultado de la acción inhibitoria de la enzima desacetilasa de histonas del valproato de magnesio. Se observó la inducción transcripcional del gen CAR mediante RT-PCR semi cuantitativo; así como un incremento en el perfil de transducción adenoviral en las líneas celulares estudiadas. Finalmente se documentó la inducción del receptor CAR en muestras de cáncer cérvico uterino de pacientes tratadas con valproato de magnesio. Conclusiones- El valproato de magnesio es un inhibidor eficiente de HDACs el cual genera hiperacetilación de las histonas H3 y H4 y libera la represión transcripcional del gen CAR mediada por HDACs en células HeLa, MCF-7 y T24. Así mismo, se incremento la transducción génica mediada por adenovirus recombinantes. Se observó hiperacetilación de las histonas H3 y H4 en muestras de tejido tumoral de cáncer cervico-uterino de pacientes tratadas con valproato de magnesio. Estos resultados respaldan la propuesta de adicionar iHDACs a los esquemas de transgénesis terapéutica del cáncer en estudios clínicos con el objeto de mejorar los perfiles de transducción adenoviral tumoral. FTM-06 INHIBIDORES DE DESACETILASAS DE HISTONAS SUPRIMEN LA EXPRESIÓN DEL TRANSGEN REGULADO POR UN PROMOTOR GLIAL ESPECÍFICO EN CÉLULAS C6. Benítez, Jorge Alejandro1, Avalos, Berenice1, Rangel, Edgar1, Segura, Blanca1, Velázquez, Dora1, Barrón, Eva1,3, Pérez, Delia3, Aguilar, José Luís 2, Martínez-Said, Héctor 4, Segovia Jose 5 Cabrera, Gustavo1 1 Laboratorio de Vectorología y Terapia Génica y Departamentos de 2Oncología, 3Patología y 4Cirugía, Instituto Nacional de Cancerología y 5 Departamento de Fisiología, Biofísica y Neurociencias, Centro de Investigación y de Estudios Avanzados, México DF, México. Introduccion- Para lograr un efecto anti-neoplásico específico sin dañar el tejido no neoplásico mediante transgénesis terapéutica, se han empleado promotores tumor o tejido específicos. No obstante, los niveles de expresión de los genes terapéuticos regulados por promotores específicos no son óptimos, debido en parte, a cambios epigenéticos sobre el genoma del vector de transferencia viral en la célula transfectada. Una forma de regular estos cambios epigenéticos e incrementar la expresión del transgen terapéutico, es empleando inhibidores de des-acetilasas de histonas (iHDACs), como el valproato de magnesio (VPA) y la tricostatina A (TSA). Objetivo- Optimizar el perfil de expresión de genes reporteros a partir de un promotor viral ubicuo (CMV) y de un promotor glialespecífico (gfa2), mediante el uso de adenovirus recombinantes como vectores de transferencia génica, en una línea celular derivada de astrocitoma murino (C6) utilizando dos iHDACs: VAL y TSA. Resultados- Inicialmente, demostramos un incremento dosisdependiente en la actividad de expresión del gen reportero luciferasa, en células C6 transducidas con Ad-CMV-Luc tratadas con VAL y TSA. Este incremento se correlacionó con un aumento en el estado de acetilación de la histona 4 (H4). Posteriormente, estudiamos el efecto de los dos iHDACs sobre la expresión de b-Gal regulada por un promotor glial-específico (gfa2). Sorprendentemente, el tratamiento con VPA y TSA en células C6 transducidas con Ad-gfa2-LacZ suprimió la expresión del gen reportero a pesar de haber documentado un aumento en la acetilación de la histona 4 (H4). Adicionalmente se observó un cambio morfológico indicativo de un proceso de diferenciación en las células C6 tratadas con dichos fármacos acompañado de una disminución en los niveles endógenos de GFAP y GDNF. Dicho efecto de diferenciación podría ser el mecanismo responsable del silenciamiento del promotor glial específico. CONCLUSIONES- Los cambios en los niveles de expresión del transgen están asociados directamente al promotor tejido específico empleado y a los cambios en la cromatina de la célula hospedera generados farmacológicamente. Estos son, por tanto, aspectos importantes a considerar dentro de la terapia génica específica y en el uso de inhibidores de desacetilasas de histonas. FTM-07 IDENTIFICACIÓN DE SEÑALES DE SELECCIÓN NATURAL RECIENTE EN LOS GENES DE LAS ENZIMAS METABOLIZANTES DE FÁRMACOS. De La Vega, Francisco M.1, Hyland, Fiona1, Lazaruk Katherine1, Haque, Kashif2, Welch, Robert A. 2, y Yeager, Meredith2. 1Applied Biosystems, Foster City, California; 2Core Genotyping Facility, Division of Cancer Epidemiology and Genetics, SAIC Frederick, National Cancer Institute, Gaithersburg, Maryland, EEUU. Las enzimas metabolizantes de fármacos (EMF) participan en la biotransformación de varios substratos endógenos y exógenos, incluyendo los fármacos terapéuticos. Se ha reportado que diversos polimorfismos funcionales en estos genes, y cuya frecuencia varia entre poblaciones, afectan la respuesta terapéutica y toxica a los fármacos, así como la susceptibilidad a ciertos tipos de cáncer. Por lo tanto, la identificación y genotipificación de los mismos es importante para la farmacogenética y la medicina personalizada. Ya que la composición de xenobióticos en el medio ambiente varía con la dieta y el estilo de vida humanos, los genes de EMF podrían ser blancos importantes de la selección natural adaptativa que haya 69 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica operado durante la reciente expansión de las poblaciones humanas. Estudios previos han identificado patrones de variación sugerentes de huellas de selección natural en miembros de la familia de citocromos CYP3A y otros genes de EMF. Aunque recientemente se han efectuado varios análisis a nivel genómico con los datos del HapMap en búsqueda de señales de selección natural, estos no representan adecuadamente los genes de EMF, debido a que es muy difícil obtener ensayos de genotipificación funcionales para polimorfismos en esta familia de genes altamente similares. Con objeto de hacer una búsqueda mas exhaustiva de huellas de selección natural en genes de EMF, genotipificamos las muestras de poblaciones del proyecto HapMap (africana, europea, y asiática) con un grupo de ensayos TaqMan® ampliamente validados para 2,394 SNPs codificantes no-sinónimos que cubren 217 genes de EMF (TaqMan® Drug Metabolism Genotyping Assays). El análisis de los datos se realizo tanto independientemente como en combinación con los datos del HapMap, estudiando la distribución de indicadores de diferenciación poblacional (Fst, Pexcess, y d), y la identificación de homocigosidad extensiva de haplotipos hipotéticamente seleccionados. Nuestros resultados identifican un numero de genes de EMF que al parecer sufrieron historias selectivas muy diferentes en las poblaciones estudiadas, incluyendo NAT2, ALDH2, ADH1B, y miembros de la familia de transportadores ABC y citocromos P-450, algunos de los cuales son consistentes con reportes previos. La combinación de nuestros resultados con los del HapMap, permite por primera vez obtener un perfil mas completo de las señales de selecciona natural reciente en los genes de EMF, importantes mediadores de la adaptación e interacción de las poblaciones humanas con su medio ambiente. caucásica, africana y asiática. El proyecto del mapa genómico de los mexicanos a cargo del INMEGEN pretende conocer la variabilidad genómica y el mapa de haplotipos en la población de nuestro país y, contribuir al estudio histórico y antropológico de México. La hipótesis es que los mexicanos, mestizos en su mayoría, tienen diferencias genéticas particulares. El conocimiento de tales diferencias genéticas permitirá diseñar nuevas medidas de prevención, de diagnóstico y tratamientos. Se han tomado muestras en 6 estados de la república. El proyecto comenzó después de la aprobación de las comisiones de investigación, ética y bioseguridad del INMEGEN, con financiamiento del propio Instituto. Se han considerado los siguientes aspectos éticos y legales: información a los pacientes, firma del consentimiento informado, comunicación a la comunidad los resultados y, aspectos de propiedad intelectual. Además, las muestras son anónimas y no se incluyeron muestras de población vulnerable. En Guanajuato, el proyecto lo aprobaron autoridades de salud y universitarias. Sin embargo, faltó la revisión y aprobación del proyecto por un comité de bioética local. Consideramos que el seguimiento de los resultados por un comité estatal de bioética será determinante para analizar el beneficio del proyecto para los participantes, así como lo relativo a la confidencialidad de los datos obtenidos. ELSI-02 ETICA Y PATENTABILIDAD DE INVENCIONES BIOTECNOLÓGICAS DIRIGIDAS A LA MEDICINA GENÓMICA. García-Calderón Norma; Barrón Pastor Propiedad Industrial y Desarrollo Tecnológico. Aspectos Éticos, Legales, Sociales y Educativos sobre la Medicina Genómica ELSI-01 ASPECTOS BIOÉTICOS DEL ESTUDIO DEL MAPA GENÓMICO DE LOS MEXICANOS EN EL ESTADO DE GUANAJUATO. Anaya-Velázquez, Fernando 1,2 y Navarrete-Cruz, Victoria2. 1 Instituto de Investigación en Biología Experimental, Fac. de Química y 2Centro de Investigaciones en Bioética, Instituto de Investigaciones Médicas, Universidad de Guanajuato. La necesidad de realizar la investigación científica en seres humanos con bases éticas se ha plasmado en varias declaraciones de la UNESCO. En la más reciente, se reconoce la importancia de la libertad de investigación científica y el beneficio del desarrollo científico y tecnológico, destacando que los consiguientes adelantos se realicen en el marco de principios éticos universales. Actualmente, la medicina genómica se enfrenta a nuevos retos éticos, legales y sociales, los cuales requieren ser abordados. Se han reportado variaciones en la secuencia del genoma humano, como los cambios de un solo nucleótido (SNPs). Los grupos de SNPs, son representativos de cada región del genoma humano. Los haplotipos son bloques de variaciones que se heredan conjuntamente y tienen alrededor de 50 SNPs cada uno. El proyecto HapMap pretende conocer el catálogo de bloques de haplotipos en el genoma humano y analizar las variaciones encontradas en diferentes grupos humanos. Se han observado variaciones en las poblaciones 70 Daniel. Las nuevas tecnologías derivadas de las ciencias biológicas, particularmente aquellas relacionadas con la biotecnología y la Medicina genómica, representan un reto desde el punto de vista ético para las Oficinas de Patentes alrededor del mundo. En este sentido, México no es la excepción, y es necesario establecer un marco de trabajo ético para la determinar la patentabilidad de tecnologías emergentes. La Ley de Propiedad Industrial permite la patentabilidad de una amplia gama de invenciones en el campo de la genética y la biología molecular, con respecto a productos y procesos, siempre y cuando se cumpla con los requisitos mundiales de novedad, actividad inventiva y aplicación industrial, así como la suficiencia de la descripción y reproducibilidad (habilitación y soporte). No obstante lo anterior, aún cuando una solicitud de patente satisfaga los requisitos de Ley, es necesario evaluar el aspecto ético de cada invención. En este sentido, la Ley de la Propiedad Industrial marca en su Artículo 4 algunas condiciones relacionadas con la ética y patentabilidad de invenciones que deben ser analizadas cuidadosamente al momento de presentar una solicitud de patente. Asimismo, existen excepciones a la patentabilidad en los Artículos 16 y 19 que deben ser consideradas. En este trabajo se provee un análisis de estos artículos para establecer el marco de patentabilidad vigente a la luz de la Ley de la Propiedad Industrial y cómo se están estandarizando los criterios de patentabilidad en el área biotecnológica. ELSI-03 EDUCACIÓN EN MEDICINA GENÓMICA EN MÉXICO. Santiago March, Alejandro López, José Bedolla, Carlos Dávila, Victoria Castellanos, María Teresa Velasco, Alfredo Hidalgo Miranda, Irma Silva-Zolezzi, Gerardo Jiménez-Sánchez. Instituto Nacional de Medicina Genómica, México. El Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) tiene como misión contribuir al cuidado de la salud de los mexicanos desarrollando investigación científica de excelencia y formando recursos humanos de alto nivel, que conduzcan a la aplicación médica del conocimiento genómico a través de una cultura innovadora, tecnología de vanguardia y alianzas estratégicas, con apego a principios éticos universales. El INMEGEN concentra sus actividades educativas en dos vertientes: 1) Formación de recursos humanos especializados en medicina genómica; y 2) Divulgación sobre medicina genómica, sus aplicaciones y sus retos éticos, legales y sociales. La primera incluye los tres primeros cursos de posgrado en medicina genómica: “Introducción a la medicina genómica”, “Aplicaciones genómicas en pediatría” y “Aplicaciones genómicas en medicina interna”, así como el curso: “Accesando la secuencia del genoma humano”, producto de la colaboración con el Wellcome Trust Sanger Institute y Cold Spring Harbor Laboratories. Adicionalmente, se han establecido sinergias con la Asociación Mexicana de Facultades y Escuelas de Medicina (AMFEM) con el propósito de incluir a la medicina genómica en el programa de competencias profesionales del médico general. El INMEGEN iniciará su programa de Doctorado en medicina genómica a partir de 2007. Los programas de divulgación en medicina genómica del INMEGEN cuentan con diversos instrumentos educativos entre los que destacan: la transmisión, en inglés y español, de cursos y conferencias en tiempo real por internet. Esto ha permitido transmitir 8 conferencias a 6,500 personas en diferentes partes de América y Europa. Por otra parte, el portal de internet del INMEGEN (www.inmegen.gob.mx) recibió más de 1.9 millones de consultas durante el último año, y ha proporcionado más de 1.3 millones de documentos a usuarios en más de 38 países, dentro de los cuales 48% corresponden al sector privado. Este instrumento educativo, incluye el primer portal de bionformática en español, que ofrece servicios de cómputo avanzado a más de 110 usuarios en el México y el extranjero, a través de líneas seguras que ofrecen acceso en español a diversas bases de datos como BlastP, BlastN, NCBI, ENSEMBL y Med Geneid. En 2006 el INMEGEN produjo el cómic titulado: “El genoma humano” dentro de la serie “La medicina genómica”, el cual inició su distribución en todas las instituciones de educación básica del país. Por otra parte, el INMEGEN, en conjunto con otras instituciones académicas, ofrece talleres sobre Innovación en Ciencias de la Vida y sobre Aplicaciones Matemáticas del Estudio del Genoma Humano. El fortalecimiento de los programas educativos es una herramienta fundamental para el desarrollo pleno de una plataforma nacional en medicina genómica en México. ELSI-04 ENSAYO: LOS BENEFICIOS DE LA EPIDEMIOLOGÍA GENÉTICA EN LA ERA POST -GENÓMICA. Oliva-Sánchez Pablo Francisco 1, Pruefer Franz, Lara-Álvarez César2, López-Ridaura Ruy1. 1 Instituto Nacional de Salud Pública, Dirección de Enfermedades Crónicas, Cuernavaca México. 2 Instituto Nacional de Medicina Genómica, México. El Proyecto Genoma Humano (PGH), las ciencias genómicas y la salud pública en su meta de alcanzar un mejor control, prevención y diagnóstico de las enfermedades, se congregan en nuevas disciplinas como la epidemiología genética. Las herramientas de la medicina genómica junto con los métodos epidemiológicos, han conseguido éxitos importantes en la salud pública como la detección temprana de algunas enfermedades y un mejor entendimiento de los mecanismos patogénicos y etiológicos de carácter genético y sus determinadas interacciones geno – ambientales. Este panorama nos indica, que el “conocimiento altruista” generado por las ciencias genómicas, otorga grandes beneficios. Sin embargo, el conocimiento del genoma humano aplicado a estudios poblacionales produce interrogantes en torno a las implicaciones éticas, sociales, económicas y políticas dentro de su utilización. En este ensayo se realizó una análisis ético de los límites de la epidemiología genética y su aplicación en programas salud pública, con base en la experiencia de los países en donde se han desarrollado las ciencias genómicas; que han dado como resultado nuevas legislaciones y políticas públicas, en torno a la investigación genética en humanos y sus problemas éticos y sociales generados. Además, se analizó los aspectos generales, de cómo este “conocimiento altruista” puede cambiar su dirección a un conocimiento no benéfico, afectando a los individuos y las poblaciones. Se definió el papel que juega la bioética deontológica (el deber ser) del conocimiento del genoma humano y su aplicación en epidemiología en donde la causa final presente un verdadero beneficio (teleología). Y finalmente dentro de todo este contexto se situó las leyes en investigación en humanos de México, como preámbulo de una actualización dentro de esta nueva “Era post – genómica”. El “deber ser” de un conocimiento no debe ir en contra de los derechos humanos de los individuos y de las diferentes comunidades humanas. ELSI-05 ACTITUDES Y REACCIONES DE LOS DERECHOHABIENTES DEL ISSSTE ANTE LAS PRUEBAS GENÉTICAS DE RIESGO PARA CÁNCER DE MAMA Y PRÓSTATA. Carnevale Alessandra1, Urraca Nora1, Romero-Hidalgo Sandra1, Lisker Rubén2, Villa Antonio2. 1 Coordinación Nacional de Medicina Genómica, ISSSTE, México. 2 Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición “Salvador Zubirán”, México. El rápido descubrimiento de genes y polimorfismos genéticos relacionados con diferentes tipos de cáncer, está produciendo en otros países cambios en la práctica clínica al contar con marcadores moleculares que ayudan a identificar personas en riesgo. En México, la introducción de estas pruebas genómicas debe ir acompañada del conocimiento sobre sus implicaciones éticas, legales y sociales. Objetivo: Investigar las creencias, reacciones y actitudes, de los derechohabientes del ISSSTE, ante las pruebas genómicas de cáncer de mama y próstata. Métodos: Se aplicaron cuestionarios a una muestra de 800 derechohabientes mayores de 30 años en hospitales regionales del ISSSTE en el D.F. El análisis estadístico incluye la prueba de diferencias por medio de chi-cuadrada y análisis multivariado mediante regresión logística. Resultados: Los hallazgos preliminares muestran que alrededor del 80% de los encuestados considera que una prueba genética puede salvar sus vidas y que ésta proporciona información valiosa sobre el riesgo que tienen sus familiares de padecer cáncer. Por otra parte, el 65% de los derechohabientes manifiesta temor de que el gobierno o el hospital pueda utilizar los resultados sin su 71 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica autorización o de forma indebida. Este temor es significativamente mayor entre aquellos con menor escolaridad. Más del 70% de las personas estaría dispuesta a modificar su estilo de vida, independientemente del resultado de la prueba. Suponiendo un resultado positivo, el 95% no dudaría en seguir las indicaciones del médico. De manera general, las mujeres manifiestan mayor preocupación por el cáncer de mama que los hombres por el cáncer de próstata. Conclusiones: Estos resultados sugieren que es necesario preparar a los profesionales de la salud para aprovechar la disposición y el conocimiento actual de las personas acerca de los posibles beneficios de las pruebas genómicas, y para reducir su temor ante la posibilidad de discriminación genética o uso indebido de la información. A la vez, es indispensable que los médicos se capaciten sobre este tema ante la responsabilidad que implica contar con la confianza casi absoluta de sus pacientes. ELSI-06 RIESGOS Y OPORTUNIDADES EN TORNO A LA PROPIEDAD INTELECTUAL DEL MATERIAL GENÉTICO EN AMÉRICA LATINA. Rendón Cárdenas Alma Eunice. Institut d´Etudes Politiques, Paris Al momento de crearse el sistema de propiedad intelectual, no se tenía pensado patentar elementos vivos, la protección fue planeada para cosas inanimadas. Es por ello que la inclusión del material vivo en la esfera de lo patentable no ha sido fácil y genera importantes dilemas. La posibilidad de patentar material vivo ha suscitado innumerables debates y polémica entre aquellos que opinan que no se debería patentar material vivo, por pertenecer a la esfera viviente y aquellos que dicen que los objetos y material patentable son creados por el hombre de manera inventiva e innovadora y por ello se deben otorgar los derechos de propiedad industrial para incitar el desarrollo tecnológico en la materia En el caso de América Latina la evolución de la propiedad intelectual esta intrínsecamente relacionada con los tratados y normas impulsadas por los países desarrollados, especialmente Estados Unidos, que ha estado a la vanguardia de la situación. Sin embargo vemos que existen riesgos y oportunidades significativas que los países latinoamericanos debemos identificar para evitar abusos y desarrollar nuestras capacidades en torno al tema. Algunos de los rasgos más comunes que intervienen en las trabas de los sistemas de propiedad intelectual en América Latina y por los cuales se explica que la mayoría de las patentes en nuestros países pertenezcan a extranjeros son la existencia de diversos inhibidores de la difusión biotecnológica, como son los débiles sistemas de difusión existentes, los problemas de regulación, la falta de tomadores de riesgo, escaso interés estratégico de corporaciones, y la baja capacidad de absorción de programas nacionales, entre otros. La protección de la propiedad intelectual debe actuar como motor de la innovación y no como impedimento para el desarrollo nacional. Por ello, el reto actual para América Latina, es manejar el sistema de propiedad intelectual para fomentar el desarrollo de capacidades nacionales, así como para el flujo de capital y de tecnología. Para conseguir esto, se necesita de políticas públicas que incluyan a la propiedad intelectual en una estrategia nacional que busque la competitividad de nuestra biotecnología y la protección de nuestros recursos genéticos. ELSI-07 BASES JURÍDICAS EN LA PROTECCIÓN DE DATOS GENÉTICOS. Hidalgo-Valadéz, Carlos 1,3; Rodríguez-Corona J. Antonio 2; Navarrete-Cruz Victoria3. 1 Facultad de Medicina, 2Facultad de Derecho y Administración Pública, 3Centro de Investigaciones en Bioética, Universidad de Guanajuato. La protección jurídica de los datos genéticos ha adquirido en el ámbito internacional y en nuestro país significativa importancia a raíz del conocimiento que sobre el genoma humano se posee, en la consideración de que, en efecto, no existe concepto que refleje con mayor certeza y solidez el principio de intimidad que acompaña a la condición humana. En esta idea, podemos afirmar que –no obstante el surgimiento denominado derecho genómico-, en nuestro país, el genoma humano se encuentra protegido desde nuestra Ley Fundamental; es decir, su artículo 1, tercer párrafo establece la prohibición a realizar actos discriminatorios que atenten –entre los valores-, contra la dignidad humana, razón por la cual, en una correcta interpretación de este precepto constitucional, podemos arribar a la conclusión de que el respeto al genoma humano y la información que éste comprende, es una perfecta expresión de respeto de dignidad humana. En la legislación secundaria, si bien es cierto que no existe una normatividad expresa que contemple la protección del genoma humano –a pesar de la existencia de algunas propuestas legislativas para fortalecer en este sentido la Ley General de Salud-, debemos destacar que, en el ámbito federal, existe la Ley Federal de Acceso a la Información Pública Gubernamental, la cual posee una apartado normativo vinculado a la protección de datos personales, que en la última instancia y de modo implícito, tutelaría lo relativo a la información genética que todo individuo posee. En Guanajuato, recientemente se publicó la Ley de Protección de Datos Personales para el Estado y los Municipios de Guanajuato, la cual, entre otras notables características, posee la de explicar –coincidiendo con ello con la norma federal-, el concepto de datos personales como “La información concerniente a una persona física identificada o identificable, relativa a su origen racial o étnico o que esté referida…a su intimidad, entre otras”. En consecuencia, la legislación en materia de datos personales puede jurídicamente defender y proteger lo relativo al genoma humano puesto que se trata de información intima, merece y exige privacidad y, eventualmente, la imposición de una sanción a quienes realicen actos tendientes a vulnerar los bienes jurídicos tutelados que se han descrito. Bioinformática BIO-01 VISUALIZACIÓN Y ANÁLISIS DE INFORMACIÓN GENÓMICA CON MAPAS DE RECURRENCIA. Bautista-Thompson, Ernesto, Velázquez-Jerónimo Fabiola, Garza-Domínguez Ramiro. Centro de Tecnologías de la Información, DES-DACI, Universidad Autónoma del Carmen, Ciudad del Carmen, Campeche, México. Se presenta la aplicación y evaluación de la técnica de Análisis Cuantitativo con Mapas de Recurrencia como una herramienta 72 Memorias del Congreso 73 Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica para la visualización y análisis de información genómica. El análisis con mapas de recurrencia es una técnica que permite localizar patrones ocultos recurrentes, no estacionarios y cambios estructurales en series de datos. Los mapas de recurrencia equivalen a una matriz de correlación espacial de los datos que al ser visualizada multiplica la información disponible para identificar patrones tales como: periodicidad, determinismo y aleatoriedad; de esta forma es posible visualizar relaciones espaciales entre diferentes segmentos de una cadena de datos, en nuestro caso cadenas de bases del DNA humano. Adicionalmente, la técnica genera una serie de parámetros cuantitativos tales como Entropía Espacio Temporal, Determinismo, Recurrencia y Entropía de Información (Shannon); que permiten caracterizar desde el punto de vista de la dinámica no lineal al sistema representado por el conjunto de datos bajo estudio. BIO-02 ANÁLISIS DE GENES EN ESPACIO FASE. Rivera, Ana Leonor, Ramírez, Leslie & Castaño, Víctor M. Centro de Física Aplicada y Tecnología Avanzada, Universidad Nacional Autónoma de México, Juriquilla, Querétaro, México. Se realiza el análisis de secuencias genómicas en espacio fase con el fin de localizar genes en secuencias del genoma humano. Para ello se elaboró un programa de software que a partir de la secuencia en formato fasta obtiene la secuencia numérica como función de la posición y la transformada de Wigner de dichos datos. La transformada de Wigner mide la autocorrelación en la secuencia y nos permite localizar genes específicos dentro de una secuencia dada. Este programa también nos permitirá comparar secuencias. La diferencia con los métodos tradicionalmente implementados (por ejemplo en Ensembl) es que el tratamiento es totalmente numérico y se basa en un ajuste matemático del comportamiento de la secuencia. BIO-03 ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE LA REGULACIÓN TRANSCRIPCIONAL DURANTE LA RESPUESTA INMUNE DE ANOPHELES SP. Hernández Romano Jesús, Martínez Barnetche Jesús, Salgado Osorio Heladia, Lamadrid Figueroa Héctor, Solano González Maritza, Carlos Rivera Francisco Javier, Rodríguez López Mario Henry. CISEI, Instituto Nacional de Salud Pública. La disponibilidad de los genomas de Anopheles gambie, Drosophila melanogaster y otros organismos, aunado a la disponibilidad datos de expresión temporal frente a distintos retos inmunológicos obtenidos por microarreglos, permiten analizar la regulación de la respuesta inmune en insectos vectores de enfermedades humanas y detectar mecanismos de regulación transcripcional potencialmente conservados entre distintas especies. Utilizando herramientas bioinformáticas se analizaron las secuencias 5’ de genes de An. gambiae y D. melanogaster sobre-expresados frente a diferentes retos inmunes, buscando motivos de ADN estadísticamente sobre-representados y motivos conservados en cuanto a secuencia y posición al sitio de inicio de la transcripción, además se evaluó el potencial nucleosomal de estas secuencias. En ambos insectos se identificaron grupos de genes con perfiles transcripcionales similares (genes coexpresados) que presentaban motivos de ADN similares a los elementos de respuesta reconocidos por factores de transcripción 74 de la familia NFkB (motivos kB-like), además de otros dos motivos denominados por los autores como CATGA2 y M7 cuya secuencia no ha sido reportada, estos tres motivos se localizan en zonas conservadas de las secuencias 5’ de múltiples genes coexpresados. Adicionalmente, las regiones 5’ de genes sobreexpresados pertenecientes a la clase funcional de inmunidad (GO:0006952) mostraron una sobre-representación de motivos ricos en A y T asociados siempre a un elevado potencial nucleosomal. Estos resultados sugieren que los motivos kB-like, CATGA2 y M7 podrían estar regulando programas de defensa conservados entre An. gambiae y D. melanogaster, y la expresión de los genes involucrados podría estar estrechamente asociada con modificaciones en la estructura de la cromatina. Se validarán experimentalmente estos hallazgos, y extenderá el análisis a genes reprimidos durante la respuesta inmune, y a otras especies, como el humano. BIO-04 DESARROLLO E IMPLEMENTACIÓN DE UN ANÁLISIS BAYESIANO DE LIGAMIENTO GENÉTICO. Romero-Hidalgo, Sandra 1 , Gutiérrez-Peña, Eduardo 2 , Rodrigues, Eliane 3, Tusié-Luna, María Teresa 1. 1Instituto de Investigaciones Biomédicas, UNAM, México. 2 Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y Sistemas, UNAM, México. 3Instituto de Matemáticas, UNAM, México. Introducción. La herramienta estadística más eficaz para identificar genes con una contribución mayor en el desarrollo de una enfermedad ha sido el método de lod score. La primera versión de este método la propuso Morton (1955) y fue diseñada para familias nucleares. Este autor estableció un valor de lod score de 3 como evidencia a favor de ligamiento y de -2 como exclusión de ligamiento. A pesar de que este método ha sufrido modificaciones, obtener un valor de lod score mayor o igual a 3, independientemente de la estructura y el tamaño de las familias, sigue siendo una garantía para publicar el hallazgo. Por otra parte, en el método de lod score el parámetro de interés es la fracción de recombinación, que contiene la información relativa a la distancia que hay entre el locus de la enfermedad y el marcador genético. Sin embargo, hay otros elementos involucrados como son la penetrancia y las frecuencias alélicas, cuyos valores en general se desconocen en la población de estudio. Utilizando un enfoque Bayesiano, en conjunto con los métodos de Monte Carlo vía cadenas de Markov, es posible estimar estos parámetros durante el análisis. Adicionalmente, a través de un enfoque Bayesiano se obtiene la probabilidad de ligamiento asociada a la(s) familia(s) bajo estudio. Objetivo. Desarrollar e implementar en un programa un análisis Bayesiano de ligamiento genético de dos puntos para un marcador multialélico utilizando métodos de Monte Carlo vía cadenas de Markov. Resultados. Con el programa generado se probaron tres ejemplos: el primero con evidencia contundente de ligamiento (lod score = 7.02), el segundo con evidencia sugestiva de ligamiento (lod score = 2.5), y el tercero con evidencia de ausencia de ligamiento (lod score = -6.57). En los tres casos se utilizó una probabilidad inicial de ligamiento de 4.5%, obteniendo una probabilidad final de ligamiento de 100%, 49.1% y 3.6%, respectivamente. De acuerdo a estos resultados en el primer caso se tiene absoluta certeza de ligamiento entre la enfermedad y el marcador estudiado; en el segundo caso, se tiene evidencia de la presencia de ligamiento, ya que observamos un incremento considerable de la probabilidad, sin embargo, existe también un porcentaje considerable de incertidumbre; y en último ejemplo, se tiene suficiente evidencia para considerar que no hay ligamiento. Conclusiones. En los casos de evidencia contundente de ligamiento o exclusión de ligamiento ambos análisis son concluyentes. Sin embargo, en el segundo ejemplo, la conclusión a la que se llega en uno u otro análisis es distinta. Es decir, por el método de lod score, un valor de 2.5 es muy cercano al valor crítico de 3 que representa suficiente evidencia en favor de ligamiento, mientras que una probabilidad de ligamiento del 50% no proporciona la misma confianza que en el caso anterior. Lo hace evidente la utilidad del análisis Bayesiano como herramienta para considerar o no ligamiento a un determinado locus. Tecnología Genómica TG-01 DESARROLLO DE UN SISTEMA DE MICROARREGLOS DE cDNA PARA LA TIPIFICACION DEL VIRUS DEL DENGUE. Diaz-Badillo A., Altuzar-Aguilar V. M., Herrera-Pérez J. L., Sánchez-García G., Gariglio-Vidal P., Luna-Arias J. P., RodríguezFragoso P., Mendoza-Álvarez J. G., Sánchez-Sinencio F., Muñoz M. L. CINVESTAV-IPN, CICATA-IPN. El dengue es una enfermedad causada por cualquiera de cuatro virus estrechamente relacionados (DEN-1, DEN-2, DEN-3 ó DEN4). Los virus son transmitidos a los humanos por la picadura de un mosquito infectado. El Dengue y sus formas potencialmente fatales—el dengue hemorrágico y el síndrome de choque del dengue—se han intensificado alcanzando niveles alarmantes en esa última década. A medida que se deterioraron las campañas de erradicación del mosquito Aedes aegypti durante las décadas de 1970 y 1980, el mosquito proliferó y se propagó por casi todos los rincones de la Región. La mayoría de los países se han reinfestado y han sufrido brotes explosivos. El ascenso alarmante del dengue hizo necesario contar con acciones para su prevención y control, en especial porque los manuales de procedimientos y guías publicados con anterioridad están incompletos o descentralizados, al igual que los planes de acción puestos en práctica. A la fecha no hay medicamento o vacuna específicos para tratar la infección del dengue. Como con el Dengue Clásico, no hay medicamento específico para el DH (Dengue Hemorrágico). Sin embargo, este puede tratarse efectivamente con terapia de reemplazo de líquidos si se hace un diagnóstico clínico temprano. Esta serie de complicaciones hacen necesario el apoyo clínico con técnicas moleculares a fin de proporcionar un diagnóstico acertado en el menor tiempo posible, entre ellas han destacado el PCR y el RT-PCR, el uso de sondas marcadas, y mas recientemente la aplicación de microarreglos de cDNA. Los biochips o microarreglos, matrices ordenadas de DNA, RNA o proteínas son un herramienta reciente que empieza a permitir analizar los genes presentes en una célula (genoma) y su expresión, tanto en el nivel de RNA (transcriptoma) como de proteínas (proteoma). La tecnología de los microarreglos (microarrays) de DNA permite realizar análisis genéticos sobre miles de genes simultáneamente. El análisis de estos experimentos supone un reto desde el punto de vista estadístico, ya que los métodos clásicos de análisis deben adaptarse a la enorme multiplicidad de hipótesis que se prueban. Además, la gran variabilidad observada en los experimentos y su elevado costo exigen un diseño cuidadoso. En este momento, el uso intensivo de estas tecnologías «masivas» está sujeto a serias limitaciones técnicas y supone un costo muy elevado. El objetivo de este proyecto es el desarrollo y la aplicación de nuevas tecnologías de diagnóstico molecular para enfermedades virales, principalmente el Dengue, contemplando la micro-manipulación de líquidos y la optimización de “grafos”, al proceso de deposición del menor volumen posible de muestra del mayor número posible de “muestras de pacientes” diferentes, en la menor superficie posible, compatibles con la resolución de los instrumentos ópticos disponibles. Se diseñarán experimentos que determinen la densidad máxima, reproducibilidad, robustez y velocidad de fabricación de los DNA chips para Dengue. TG-02 ALTERACIONES CROMOSOMICAS EN DIFERENTES ESTADIOS DE LA CARCINOGENESIS MEDULAR TIROIDEA. González-Yebra B1, Guerrero-Martínez FJ1, Martínez I2, Vázquez G2, Alatorre B2, Vázquez K2, Piña P2, Hermsen M3, SalcedoVargas M2. 1 Facultad de Medicina, Universidad de Guanajuato, 2Laboratorio de Oncología Genómica, Unidad Investigación Médica en Enfermedades Oncológicas, Centro Médico Nacional Siglo XXIIMSS, 3Department of Pathology, Free University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands. El carcinoma medular tiroideo (CMT) se origina en las células parafoliculares de la glándula tiroides, la fase precursora al desarrollo de la neoplasia es una hiperplasia que posteriormente evoluciona a tumor, las metástasis comúnmente se presentan en ganglios linfáticos, pulmón, hígado y sistema óseo. La carcinogénesis medular tiroidea es un proceso de múltiples pasos, en el que puede ocurrir pérdida y/o ganancia de regiones cromosómicas. Las mutaciones puntuales en el oncogén ret son la causa necesaria para el desarrollo del CMT, sin embargo no están bien descritas otras alteraciones moleculares y/o cromosómicas implicadas en la progresión de este tumor primario a metástasis; por lo que en este trabajo nos propusimos investigar a nivel cromosómico cuales son las alteraciones implicadas en el desarrollo y progresión del tumor medular tiroideo. Se estudió el ADN proveniente de leucocitos de sangre periférica, tejido tiroideo normal (TN), tumor primario (CMT) y metástasis MET de un mismo paciente con CMT esporádico. El ADN se extrajo mediante el protocolo establecido (digestión con proteinasa K, purificación fenol-cloroformo y precipitación con isopropanol). Se buscaron las mutaciones en el oncogén ret tanto en el ADN de leucocitos como en el tejido tumoral y MET, mediante PCR y secuenciación de los exones 10, 11 y 16. Para determinar las alteraciones cromosómicas presentes se realizó la hibridación genómica comparativa (HGC) en todas las muestras de ADN. El protocolo detallado se encuentra en la página de internet http:// amba.charite.de/cgh. La mutación del oncogén ret encontrada en el ADN de los tejidos CMT y MET fue M918T. No se encontraron alteraciones cromosómicas en el ADN de leucocitos ni en el tejido tiroideo normal. En el tumor primario se encontró tanto pérdida de las regiones cromosómicas 6p y 16p, y ganancia de 18p; mientras que en la metástasis se encontraron varias alteraciones cromosómicas: pérdida de 1p, 1q, 6p, 6q, 8p, 8q, 9q, 10p, 10q, 11q, 12q, 15q, 16p, 16q, 17p, 17q, 19p, 19q, 20p, 20q, 22q y ganancia de las regiones 2q, 4q, 8q, 12q, y 13q, entre otras. Estos resultados confirman que la carcinogénesis medular tiroidea es un proceso donde intervienen varias alteraciones moleculares y cromosómicas. De tal forma que el oncogén ret promueve el desarrollo de la neoplasia, sin embargo para que el tumor adquiera un fenotipo más agresivo y haya progresión, las células van adquiriendo nuevas alteraciones 75 Carteles Memorias del Congreso Carteles II Congreso Nacional de Medicina Genómica cromosómicas, estas pueden ser tanto ganancia como pérdida de regiones cromosómicas que contienen genes involucrados en la invasión y metástasis. TG-03 ALTERACIONES CROMOSOMICAS EN TEJIDOS DE CARCINOMA PAPILAR TIROIDEO INVASOR. González-Yebra B1, Guerrero-Martínez FJ1, Martínez I2, Vázquez G2, Alatorre B2, Vazquez K2, Piña P2, Hermsen M3, Salcedo-Vargas M 2. 1 Facultad de Medicina, Universidad de Guanajuato, 2Laboratorio de Oncología Genómica, Unidad Investigación Médica en Enfermedades Oncológicas, Centro Médico Nacional Siglo XXIIMSS, 3Department of Pathology, Free University Medical Center, Amsterdam, The Netherlands. El carcinoma papilar de tiroides (CPT) es el más común de los carcinomas de la glándula tiroides y se origina en las células foliculares. Más de la mitad de los casos muestran invasión ganglionar. Algunos genes se han visto involucrados en la carcinogénesis del CPT, como es el caso de los proto-oncogenes ret y trk. Se ha demostrado que los rearreglos intracromosómicos del gen ret con otros genes son la causa para el desarrollo de los CPT. Por otro lado, también se han encontrado algunas alteraciones cromosómicas en algunos CPT sin antecedentes de radiación, por ejemplo ganancias de fragmentos cromosómicos en 1q, 5q, cromosoma 7, 17 y 21q; pérdidas en 16q y puntos de ruptura en las regiones 1q y 10q. Sin embargo, no se han reportado las alteraciones moleculares ni cromosómicas asociadas a la invasividad de los CPT, por lo que se realizó este trabajo con la finalidad de conocerlas. Se analizaron los ADNs provenientes de ocho CPTs invasores con historia negativa a radiaciones (positivos para la inversión intracromosómica RET/PTC3), mediante la técnica de hibridación genómica comparativa. El protocolo detallado de esta técnica, se encuentra en la página de Internet http://amba.charite.de/ cgh. Se observaron varias alteraciones cromosómicas: ganancias en las regiones 2q, 3q, 4q, 5q, 6q, 7q, 8q, 12q, 13q y pérdida de regiones cromosómicas en 1p, 9q, 10q, 16, 17, 19, 20q, 21q, 22q, entre otras. Los datos obtenidos muestran alteraciones cromosómicas consistentes tales como la ganancia en el cromosoma 4q1.1-2.6 y la pérdida en los cromosomas 1p2-ter, 19, 20q y 22q, siendo la de más incidencia la pérdida del cromosoma 19 completo en el 100% de los casos. Los resultados sugieren la probable presencia en el cromosoma 19 de algunos genes asociados a invasión y/o metástasis en el carcinoma papilar tiroideo. TG-04 GANANCIA DE LOS GENES EGFR Y RBP1 EN UN SUBGRUPO DE TUMORES DE LARINGE. Peralta-Rodríguez R1, Juárez S1, Martínez-Sanabria I1, Villegas V1, Arreola H1, VázquezG1, Piña P1, Fragoso V1, Alatorre B1, 76 Vázquez K1, Gallegos F2, Mantilla A3, Hernández DM4, Ortiz R5, Gonzalez-Yebra B6, Baudis M7, Salcedo-Vargas M1. 1 Laboratorio de Oncogenómica, Unidad Investigación Médica en Enfermedades Oncológicas, 2Servicio de Cabeza y Cuello, 3 Depto.Patología, 4U.Epidemiología, Centro Médico Nacional Siglo XXI-IMSS, 5Depto.Biología Molecular, Hospital Santa Engracia de Nuevo León, 6Fac. Medicina, U. Guanajuato, México. 7 Medizinische Klinik und Poliklinik V der Universität Heidelberg, Germany. La etiología genética del cáncer (Ca) de laringe es compleja. Aunque se ha encontrado al virus de papiloma humano (VPH) en este tipo de neoplasia, no se ha determinado si juega un papel importante dentro de la etiología multifactorial de esta enfermedad. Tampoco han sido identificados los genes que participan en el desarrollo de los tumores de laringe. Los objetivos de este trabajo fueron: 1) determinar la frecuencia del VPH en tumores de laringe y 2) encontrar los genes alterados mediante Hibridación Genómica Comparativa sobre microarreglos genómicos (HGCm). Se extrajo el ADN de 19 tumores primarios de Ca de células escamosas de laringe, se sometió a PCR con dos juegos de oligonucleótidos universales (GPs y MYs) para detectar el gen L1 del VPH. El genotipo presente se determinó mediante secuenciación automatizada de los productos amplificados y alineamiento de las secuencias con una base de datos. Se realizó HGCm para detectar los posibles genes alterados, para lo cual, los ADNs se marcaron e hibridaron sobre microarreglos que contienen 287 clonas por triplicado correspondientes a genes asociados al proceso de carcinogénesis. Brevemente, el DNA tumoral se marcó con Cy3 y el DNA normal con Cy5, seguido de digestión con DNAsa y purificación. La mezcla de hibridación se hizo con cantidades equimolares del DNA normal y tumoral, la mezcla se hibridó y se colocó sobre cada microarreglo, finalmente se tiñeron con DAPI. Los datos se analizaron para encontrar las regiones ganadas y perdidas, considerándose un radio >1.25 (log2=0.32) como ganancia y <0.75 (log2=-0.41) como pérdida. Se utilizó el convertidor ISCN2matrix (http://www.progenetix.de). El 41% de los tumores fueron positivos para HPV, estando presente en todos los casos el VPH-16, mientras que el 59% fue negativo para el VPH. Las principales alteraciones encontradas fueron la ganancia de RBP-1 (retinol binding protein 1) en el 53% y de EGFR (epidermal growth factor receptor) en el 47% de las muestras. No se encontró asociación entre el HPV y los genes alterados. Concluimos que 1) la infección por el VPH-16 puede tener un rol etiológico importante en un subgrupo de tumores de laringe; 2) la ganancia de RBP1 y EGFR sugiere que estos genes participan de manera importante en el desarrollo y/o progresión de un subgrupo de tumores de células escamosas de laringe que comparten determinadas características clínicas. Memorias del Congreso 77 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Ïndice de autores G A Aguirre Jonathan 54 García Calderón Norma 70 Alvarado Yaah Julio E 53 García Fajardo Luz Verónica 38 Anaya-Velázquez, Fernando 70 Garza Domínguez, Ramiro. 31 Aquino-Jarquin Guillermo 68 Gómez Ortega M.R. 50 Arcos-Román A 53 Gonzaga Pérez, R 30 González-Herrera L 33 Arenas-Sordo María de la Luz 45, 46 Audirac-Chalifour Asride Stephanie 36 González-Yebra B 75 Avalos, Berenice 69 González-Yebra B 76 Ayala, Guadalupe 42 Gutierrez Rubio 38 H B Barquera, Rodrigo 67 Halabe-Bucay,Alberto 36 Bautista-Thompson, Ernesto 72 Hernández Romano Jesús 74 Benítez, Jorge Alejandro 69 Hernández-Zamora, Edgar 37 Betanzos-Cabrera, Gabriel 45 Hidalgo-Valadéz, Carlos 72 Bonilla-Delgado José 37 J C Jara Prado A 60 Cabrera Roberto, Ramírez Maritoña 48 Jesús Estrada Gil 30 Camacho Rea Maria del Carmen 38 Jiménez-Morales S 56 Camarena, Beatriz 51 L Canseco Avila Luis M 59 L del Bosque Plata 64 Carnevale Alexandra 71 Lares Asseff Ismael 36 Casas A. Leonora 44 Lemus Fuentes, Enrique 67 Chávez Saldaña Margarita 39 Leyva García Norberto 47 Córdova Emilio 56 López Cardona M. Guadalupe 53 López López Marisol 29 López Orduña, Eduardo 46 López Morales, E 60 D Daniel Hernández Sotelo De La Vega, Francisco M. 66 32, 69 Del Río Garcia, Constanza 63 M Delgado-Ochoa, M 44 Macias García, B 59 Delgado-Sáncheza, R. 48 Macías Riveros, Dolly 68 Macías Vega Miguel 43 Diaz Badillo A. E 75 Magaña Aguirre Jonathan 46 Escalante-Bautista 58 March M Santiago 71 Martínez Delgado, Gustavo 40 Esperón Patricia F 51 Martinez Fierro M 58 Falcón Ramírez Edith 55 Martínez Levy G., 47 Fierro Torres A 61 Medina MT 54 78 Memorias del Congreso Méndez ST 39 Mendoza de la Rosa 61 Mollinedo Rosado, Pamela 36 O Oliva Sánchez Pablo Francisco 52, 71 P Villalobos Comparán M. 32 Villarreal Molina Ma. 29 Y Yescas Petra 56 Yokoyama Rebollar, Emiya 55 Y Parra Rojas Isela 31 Peralta Rodríguez R 76 Pérez Herrera, Norma 62 Zamora UA 52 R Raggio Víctor 68 Ramírez-Bello J.1 66 Raul A. Bastarrachea 62 Rendón Cárdenas Alma Eunice 72 Reyes Gutiérrez, Pablo 34 Rivera, Ana Leonor, Ramírez 74 Rodríguez-Guillén Maria del Rosario 63 Romero Hidalgo, Sandra 74 Rosales Gómez RC 37 S Saavedra Herrera MV1 48 Salas Martínez G. 42 Sánchez Contreras Ma. Elena 62 Sánchez Guerra, Marco 29 Sandoval Mendoza, Karla 61 Sapag Amalia 33 Sierra PF 45 Sierra PF 52 Silva Zolezzi Irma Stoll Mario 32, 43, 58 50 T TorresRojas, Carolina 64 Tovilla Zarate Carlos Alfonso 40 Trevino, Victor 31 U Uribe Figueroa Laura 66 V Valladares Adan, 64 Velázquez Cruz R. 42 79 II Congreso Nacional de Medicina Genómica Memorias del II Congreso Nacional de Medicina Genómica Instituto Nacional de Medicina Genómica Tiraje 2000 ejemplares Octubre 2006 Diseño: Departamento de Diseño y Difusión Lic. Alejandro López Franco Lic. José Bedolla Castro Lic. Lucia Orozco Islas Impresión: MAN Medios 80
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