Namn………………………… Klass……………….. Kemiprov Kemi 2 Biokemi med organisk kemi som plattform. Provet består av 14 uppgifter. Hjälpmedel är de bifogade tabellerna. I prover finns angivet om svaren skall lämnas på svarsblanketten eller på rutat papper. På svarsblanketten ser du vilka uppgifter som ger e- c- eller a-poäng. Gör helst uppgifterna för den nivå du vill uppnå och gärna en nivå över för att testa eller en nivå under för att gardera. JEOPARDY!!! 1 (6p)e a) Vad är? Skriv på svarsblanketten! Aminosyror med opolära sidokedjor finns mest i mitten av ett protein, alltså så långt ifrån vattenlösningen som omger proteinet som möjligt. b) Vad är? Skriv på svarsblanketten! Glukos bryts ned till två pyruvatmolekyler. c) Vad är? Skriv på svarsblanketten! pH-värdet då en aminosyras totala laddning är lika med 0. d) Vad är? Skriv på svarsblanketten! Bärarmolekyler för väte. e) Vad är? Skriv på svarsblanketten! Med hjälp av metoden separeras en blandning av proteiner och monosackarider, så att proteiner kommer ut först och monosackariderna sist. f) Vad är? Skriv på svarsblanketten! Processen i vilken introner klipps bort från det primära transkriptet och m-RNA bildas? 2 (1p)e Du vet ju säkert vad som händer då man kokar ett ägg. Vad kallas det som händer med proteinerna under kokningen? Skriv på svarsblanketten! Till uppgift 3-5 ska du bara ringa in det eller de påståenden som är sanna. Gör det på svarsblanketten. 3 (1p/r)e En aminosyra: Skriv på svarsblanketten! a) som ingår i proteiner har den allmänna formeln H H 2N C COOH R b) kan bilda peptider och proteiner genom additionsreaktioner c) har positiv nettoladdning vid högt pH och negativ nettoladdning vid lågt pH d) kan bestämmas kvantitativt och kvalitativt med elektrofores eller jonbyteskromatografi e) anges med tre bokstäver, t.ex. Gly, Ser, Asp. 4 (1p/r)ec I glykolysen: Skriv på svarsblanketten! a) b) c) d) omvandlas alla näringsämnen till pyruvatjoner deltar dihydroxiacetonfosfat som omvandlats från glycerol som kommer från fett används NAD+ som väteacceptor används FAD som väteacceptor 5 (1p/r)ec Transaminering: Skriv på svarsblanketten! a) är cellens viktigaste reaktion för ATP-bildning b) och påföljande deaminering är en reaktionsväg i cellerna för energiutvinning ur aminosyror c) innebär att aminosyror reagerar med ketosyror och blir andra aminosyror d) bidrar till att cellerna kan täcka behovet av aminosyror e) har inget samband med citronsyracykeln 6 (2p)ec Vad kallas processen då t.ex. FADH2 och NADH+H+ ger upphov till ATP och var i cellen sker processen? Skriv på svarsblanketten! 7 (9p)ec Titta på följande molekyler och: a) namnge molekylerna, antingen med det rätta namnet för föreningen eller vilken typ av förening ämnet tillhör. Spelar liksom ingen roll Skriv på svarsblanketten! b) Vilka två av dessa molekyler kan användas till att bygga en nukleotid? Skriv på svarsblanketten! c) Vilken ytterligare kemisk förening krävs för att nukleotiden ska vara komplett? Skriv på svarsblanketten! 8 (2p)c Ange för var och en av de angivna aminosyrorna var i ett globulärt protein du förväntar dig att finna dem, på ”ytan” eller ”inuti”? arg, leu, asp, ser, val respektive thr. Skriv på svarsblanketten! 9 (2p)ca Vid omvandlingen av treonin till isoleucin används fyra olika enzymer enligt nedan. I enzym 1 finns en speciell ficka som är anpassad för isoleucin. Om isoleucin fastnar i fickan så ändras strukturen i det aktiva centrat i enzym 1. Vad innebär det? Skriv på svarsblanketten! 10 (10p)c Följande molekyl är en så kallad oligopeptid. a) b) c) d) Hur många aminosyror ingår i oligopeptiden? Skriv på svarsblanketten! Vilka aminosyror ingår i oligopeptiden? Skriv på svarsblanketten! Vad kallas bindningarna mellan aminosyrorna? Skriv på svarsblanketten! Vilken aminosyra är den N-terminala och vilken är den C-terminala? Skriv på svarsblanketten! e) Hur många kirala kolatomer innehåller oligopeptiden? Skriv på svarsblanketten! f) Om du nu bortser ifrån kiraliteten, hur många olika oligopeptider kan du göra om oligopeptiden har samma antal aminosyror, där varje aminosyra endast förekommer en gång? Skriv på svarsblanketten! g) Skriv en möjlig m-RNA-kod för oligopeptiden. Skriv på svarsblanketten! h) Skriv en tillhörande DNA-kod för den DNA-delen som fungerade som mall för m-RNA-kopian. Skriv på svarsblanketten! i) Var i cellen sker translationen och vilken molekyl ser till att det blir translation? Skriv på svarsblanketten! 11 (5p)ac Redogör för ”ett varv” i beta-oxidationen, utgående ifrån oktansyra. Rita gärna oktansyramolekylen på det här viset. Redogör på rutat papper! 12 (3p)a Titta på polypeptiden och besvarar efterföljande frågor. a) Vad betyder de tre svarta markeringarna i polypeptiden? Skriv på svarsblanketten! b) Hur många nukleotider innehöll m-RNA molekylen minst för att kunna koda för denna polypeptid? (Tänk efter ordentligt) Skriv på svarsblanketten! c) Om vi säger att den genomsnittliga molmassan för en aminosyra ligger vid 110 g/mol, vilken blir då den ovan avbildade polypeptidens molmassa? Skriv på svarsblanketten! 13 (4p)a Normalt HbA (hemoglobin A) separerades från fyra mutanter med Agarosgel-elektrofores vid pH 8,6. I de fyra mutanterna var följande aminosyror utbytta. Mutant 1 Mutant 2 Mutant 3 Mutant 4 asn lys (asparagin i position 68 i -subenheten utbytt mot lysin) gly asp lys glu glu lys Nedanstående separationsmönster kunde iakttas i gelen. a b Katod HbA c d Anod a) Vilka mutanter återfinns i positionerna a, b, c respektive d? Skriv på svarsblanketten! b) Motivera svaret! Utan rätt motivering är svaret ingenting värt! Redogör på rutat papper! 14 (6p)a Följande molekyler ingår i en reaktionsserie i citronsyracykeln. Molekylerna ligger inte i rätt ordning! a) Din uppgift är att sortera molekylerna i rätt ordning 1, 2, 3, 4. Skriv på svarsblanketten! b) När du har sorterat molekylerna rätt ska du redogöra för vad som händer då molekyl 1 blir molekyl 2, då molekyl 2 blir molekyl 3 och då molekyl 3 blir molekyl 4. Redogör på rutat papper! Glukos ATP ADP Glukos-6-fosfat Fruktos-6-fosfat ATP ADP Fruktos-1,6-difosfat Dihydroxiacetonfosfat Glyceraldehyd-3-fosfat NAD+ Pi NADH + H+ 1,3-difosfoglycerat ADP 3-fosfoglycerat ATP 2-fosfoglycerat H2O Fosfoenolpyruvat Oxalacetat ADP ATP Pyruvat NAD+ CO2 NADH + H+ Beta-oxidation Acetyl-CoA HS-CoA Citrat + NADH + H Oxalacetat NAD+ Isocitrat Malat NAD+ CO2 + NADH + H+ H2O -ketoglutarat Fumarat NAD+ FADH2 FAD CO2 + NADH + H+ Succinat Succinyl-CoA ATP ADP + Pi Tabell Aminosyror och deras Ip Förkortning A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Ala Cys Asp Glu Phe Gly His Ile Lys Leu Met Asn Pro Gln Arg Ser Thr Val Trp Tyr Fullständigt namn Ip Alanin Cystein Asparaginsyra Glutaminsyra Fenylalanin Glycin Histidin Isoleucin Lysin Leucin Metionin Asparagin Prolin Glutamin Arginin Serin Treonin Valin Tryptofan Tyrosin 6,11 5,05 2,85 3,15 5,49 6,06 7,60 6,05 9,60 6,01 5,74 5,41 6,30 5,65 10,76 5,68 5,60 6,00 5,89 5,64 Tabell Aminosyror strukturformler NH O H3C H COH C H2N C NH2 alanin (ala) O H2 C H COH C HS NH2 HC CH N H H3C CH3 OH O C H H3C H C COH NH2 treonin (thr) Första basen U C A G asparaginsyra (asp) HC HC C H CH3 H2 O C H COH C C CH NH 2 H2N NH2 O H2 C H COH HC HC C C C C C C HO CH NH2 H N H tryptofan (trp) H C C H H2 O H2 C C C H COH H2 C C H2 NH2 lysin (lys) O H2 C H COH HO C NH2 serin (ser) prolin (pro) H H C C COH NH2 leucin (leu) O H2 COH H C C H2C C NH H2 fenylalanin (phe) Andra basen U Phe Phe Leu Leu Leu Leu Leu Leu Ile Ile Ile Met/Start Val Val Val Val H2C glycin (gly) O H2 H3C H C H COH C C O isoleucin (ile) H C O O H2 C H COH C C H2 NH2 glutaminsyra (glu) C H COH C H C H2 NH2 H3C NH2 metionin (met) HO C glutamin (gln) O H2 C H COH C C H2 NH2 NH2 O O H2 H2N C C H COH C C H2 NH2 histidin (his) S asparagin (asn) O O H2 C H COH N C C OH NH2 NH2 arginin (arg) cystein (cys) O H2 H C COH O C C O H2 H C COH O C C H2 O H2 N C C H COH H C C H2 NH2 H2 O C H COH C C CH NH CH3 C H COH H3C H C NH2 2 tyrosin (tyr) valin (val) Tredje basen C Ser Ser Ser Ser Pro Pro Pro Pro Thr Thr Thr Thr Ala Ala Ala Ala A Tyr Tyr Stopp Stopp His His Gln Gln Asn Asn Lys Lys Asp Asp Glu Glu G Cys Cys Stopp Trp Arg Arg Arg Arg Ser Ser Arg Arg Gly Gly Gly Gly U C A G U C A G U C A G U C A G O Svarsblankett Uppg. Namn: __________________________ Klass: ____________ Svar ECApoän poän poän g g g 1a Vad är Hydrofob effekt 1 1b Vad är glykolys 1 1c Vad är isoelektrisk punkt 1 1d Vad är NAD+ och FAD 1 1e Vad är Gelfiltrering 1 1f Vad är Splicing 1 2 Det som händer kallas: Proteinen denatureras 1 3 a b c d 4 a b c d 5 a b c d 6 Processen kallas: Andningskedjan e e ringa in de rätta svaren 1/r 3 ringa in de rätta svaren 1/r 2 ringa in de rätta svaren 1/r 3 1 1 4 3 Processen sker i: i inre cellmembra i mitokondrien 7a Molekyl A Molekyl C Molekyl E Molekyl G alfa ketosyra nukleosid steroid fett Molekyl B alfa aminosyra Molekyl D kvävebas Molekyl F ribos kolhydrat 7b Molekyl D och Molekyl F 7c Fosfat 8 På ytan finns: arg, asp, ser, thr Inuti finns: leu, val 9 Det innebär att: enzym 1 inte fungerar längre som det är tänkt så reaktionen då treonin bildar A avstannar. Isoleucin fungerar som inhibitor/moderator 1 1 2 1 10a 4 1 10b Val-gly-ser-ala 1 10c Peptidbindning 1 10d N-terminal valin 10e 3 1 10f 24 1 10g m-RNA-kod GUU GGU UCU GCU 1 10h DNA-kod 1 10i Var? Cytoplasma Vilken molekyl? Ribosomen stora och lilla delen (t-RNA) C-terminal alanin CAA CCA AGA CGA 1 2 1 Uppg. Svar ECApoän poän poän g g g 11 Redovisas på rutat papper 3 12a Cystein bildar svavelbryggor, disulfidbryggor 1 12b 159+3+3 = 165 minst 1 12c 11053 = 5830 5830-5218 = 5830-936 = 4894 1 13a Mutant 1 i position b Mutant 3 i position d 4 13b Motivering görs på rutat papper 14a Nr 1 är molekyl C Nr 3 är molekyl A 14b Redogör på rutat papper Mutant 2 i position c Mutant 4 i position a ok Nr 2 är molekyl B Nr 4 är molekyl D 1 5 Summa maxpoäng 22 20 Summa erhållna poäng 11 13 Mutant 1 Mutant 2 Mutant 3 Mutant 1 14b asn IP 5,41 lys IP 9,60 gly IP 6,06 asp IP 2,85 lys IP 9,60 glu IP 3,15 glu IP 3,15 lys IP 9,60 2 neg vid pH 8,6 ersätts med pos vid pH 8,6 neg vid pH 8,6 ersätts med neg vid pH 8,6 pos vid pH 8,6 ersätts med pos vid pH 8,6 neg vid pH 8,6 ersätts med pos vid pH 8,6 flyttar mot neg pol. flyttar mot pos pol. flyttar mest mot pos pol. flyttar mest mot neg pol. Ur succinat elimineras två väten med hjälp av FAD och det bildas en alken fumarat. Till fumarat adderas vatten så det bildas en alkohol malat. OH-gruppen i malat oxideras med hjälp av NAD+ som samtidigt tar två väten och det bildas oxalacetat. 16
© Copyright 2024