Kemi 2 Prov Biokemi 2013 Facit

Namn…………………………
Klass………………..
Kemiprov Kemi 2 Biokemi med organisk kemi som plattform.
Provet består av 14 uppgifter.
Hjälpmedel är de bifogade tabellerna.
I prover finns angivet om svaren skall lämnas på svarsblanketten eller
på rutat papper.
På svarsblanketten ser du vilka uppgifter som ger e- c- eller a-poäng.
Gör helst uppgifterna för den nivå du vill uppnå och gärna en nivå
över för att testa eller en nivå under för att gardera.
JEOPARDY!!! 
1 (6p)e
a) Vad är? Skriv på svarsblanketten!
Aminosyror med opolära sidokedjor finns mest i mitten av ett protein, alltså så långt
ifrån vattenlösningen som omger proteinet som möjligt.
b) Vad är? Skriv på svarsblanketten!
Glukos bryts ned till två pyruvatmolekyler.
c) Vad är? Skriv på svarsblanketten!
pH-värdet då en aminosyras totala laddning är lika med 0.
d) Vad är? Skriv på svarsblanketten!
Bärarmolekyler för väte.
e) Vad är? Skriv på svarsblanketten!
Med hjälp av metoden separeras en blandning av proteiner och monosackarider, så
att proteiner kommer ut först och monosackariderna sist.
f) Vad är? Skriv på svarsblanketten!
Processen i vilken introner klipps bort från det primära transkriptet och m-RNA bildas?
2 (1p)e
Du vet ju säkert vad som händer då man kokar ett ägg. Vad kallas det som händer med
proteinerna under kokningen? Skriv på svarsblanketten!
Till uppgift 3-5 ska du bara ringa in det eller de
påståenden som är sanna. Gör det på svarsblanketten.
3 (1p/r)e
En aminosyra: Skriv på svarsblanketten!
a) som ingår i proteiner har den allmänna formeln
H
H 2N C COOH
R
b) kan bilda peptider och proteiner genom additionsreaktioner
c) har positiv nettoladdning vid högt pH och negativ nettoladdning vid lågt pH
d) kan bestämmas kvantitativt och kvalitativt med elektrofores eller
jonbyteskromatografi
e) anges med tre bokstäver, t.ex. Gly, Ser, Asp.
4 (1p/r)ec
I glykolysen: Skriv på svarsblanketten!
a)
b)
c)
d)
omvandlas alla näringsämnen till pyruvatjoner
deltar dihydroxiacetonfosfat som omvandlats från glycerol som kommer från fett
används NAD+ som väteacceptor
används FAD som väteacceptor
5 (1p/r)ec
Transaminering: Skriv på svarsblanketten!
a) är cellens viktigaste reaktion för ATP-bildning
b) och påföljande deaminering är en reaktionsväg i cellerna för energiutvinning ur
aminosyror
c) innebär att aminosyror reagerar med ketosyror och blir andra aminosyror
d) bidrar till att cellerna kan täcka behovet av aminosyror
e) har inget samband med citronsyracykeln
6 (2p)ec
Vad kallas processen då t.ex. FADH2 och NADH+H+ ger upphov till ATP och var i cellen
sker processen? Skriv på svarsblanketten!
7 (9p)ec
Titta på följande molekyler och:
a) namnge molekylerna, antingen med det rätta namnet för föreningen eller vilken
typ av förening ämnet tillhör. Spelar liksom ingen roll  Skriv på svarsblanketten!
b) Vilka två av dessa molekyler kan användas till att bygga en nukleotid?
Skriv på svarsblanketten!
c) Vilken ytterligare kemisk förening krävs för att nukleotiden ska vara komplett?
Skriv på svarsblanketten!
8 (2p)c
Ange för var och en av de angivna aminosyrorna var i ett globulärt protein du
förväntar dig att finna dem, på ”ytan” eller ”inuti”?
arg, leu, asp, ser, val respektive thr. Skriv på svarsblanketten!
9 (2p)ca
Vid omvandlingen av treonin till isoleucin används fyra olika enzymer enligt nedan.
I enzym 1 finns en speciell ficka som är anpassad för isoleucin. Om isoleucin fastnar i
fickan så ändras strukturen i det aktiva centrat i enzym 1.
Vad innebär det? Skriv på svarsblanketten!
10 (10p)c
Följande molekyl är en så kallad oligopeptid.
a)
b)
c)
d)
Hur många aminosyror ingår i oligopeptiden? Skriv på svarsblanketten!
Vilka aminosyror ingår i oligopeptiden? Skriv på svarsblanketten!
Vad kallas bindningarna mellan aminosyrorna? Skriv på svarsblanketten!
Vilken aminosyra är den N-terminala och vilken är den C-terminala? Skriv på
svarsblanketten!
e) Hur många kirala kolatomer innehåller oligopeptiden? Skriv på svarsblanketten!
f) Om du nu bortser ifrån kiraliteten, hur många olika oligopeptider kan du göra om
oligopeptiden har samma antal aminosyror, där varje aminosyra endast
förekommer en gång? Skriv på svarsblanketten!
g) Skriv en möjlig m-RNA-kod för oligopeptiden. Skriv på svarsblanketten!
h) Skriv en tillhörande DNA-kod för den DNA-delen som fungerade som mall för
m-RNA-kopian. Skriv på svarsblanketten!
i) Var i cellen sker translationen och vilken molekyl ser till att det blir translation?
Skriv på svarsblanketten!
11 (5p)ac
Redogör för ”ett varv” i beta-oxidationen, utgående ifrån oktansyra.
Rita gärna oktansyramolekylen på det här viset. Redogör på rutat papper!
12 (3p)a
Titta på polypeptiden och besvarar efterföljande frågor.
a) Vad betyder de tre svarta markeringarna i polypeptiden? Skriv på svarsblanketten!
b) Hur många nukleotider innehöll m-RNA molekylen minst för att kunna koda för
denna polypeptid? (Tänk efter ordentligt) Skriv på svarsblanketten!
c) Om vi säger att den genomsnittliga molmassan för en aminosyra ligger vid
110 g/mol, vilken blir då den ovan avbildade polypeptidens molmassa? Skriv på
svarsblanketten!
13 (4p)a
Normalt HbA (hemoglobin A) separerades från fyra mutanter med
Agarosgel-elektrofores vid pH 8,6.
I de fyra mutanterna var följande aminosyror utbytta.
Mutant 1 
Mutant 2 
Mutant 3 
Mutant 4 
asn lys (asparagin i position 68 i -subenheten utbytt mot lysin)
gly asp
lys glu
glu lys
Nedanstående separationsmönster kunde iakttas i gelen.
a b
Katod
HbA
c d
Anod
a) Vilka mutanter återfinns i positionerna a, b, c respektive d? Skriv på
svarsblanketten!
b) Motivera svaret! Utan rätt motivering är svaret ingenting värt!
Redogör på rutat papper!
14 (6p)a
Följande molekyler ingår i en reaktionsserie i citronsyracykeln.
Molekylerna ligger inte i rätt ordning!
a) Din uppgift är att sortera molekylerna i rätt ordning 1, 2, 3, 4. Skriv på
svarsblanketten!
b) När du har sorterat molekylerna rätt ska du redogöra för vad som händer då
molekyl 1 blir molekyl 2, då molekyl 2 blir molekyl 3 och
då molekyl 3 blir molekyl 4. Redogör på rutat papper!
Glukos
ATP
ADP
Glukos-6-fosfat
Fruktos-6-fosfat
ATP
ADP
Fruktos-1,6-difosfat
Dihydroxiacetonfosfat
Glyceraldehyd-3-fosfat
NAD+
Pi
NADH + H+
1,3-difosfoglycerat
ADP
3-fosfoglycerat
ATP
2-fosfoglycerat
H2O
Fosfoenolpyruvat
Oxalacetat
ADP
ATP
Pyruvat
NAD+
CO2 NADH + H+
Beta-oxidation
Acetyl-CoA
HS-CoA
Citrat
+
NADH + H
Oxalacetat
NAD+
Isocitrat
Malat
NAD+
CO2 + NADH + H+
H2O
-ketoglutarat
Fumarat
NAD+
FADH2
FAD
CO2 + NADH + H+
Succinat
Succinyl-CoA
ATP
ADP + Pi
Tabell Aminosyror och deras Ip
Förkortning
A
C
D
E
F
G
H
I
K
L
M
N
P
Q
R
S
T
V
W
Y
Ala
Cys
Asp
Glu
Phe
Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln
Arg
Ser
Thr
Val
Trp
Tyr
Fullständigt namn
Ip
Alanin
Cystein
Asparaginsyra
Glutaminsyra
Fenylalanin
Glycin
Histidin
Isoleucin
Lysin
Leucin
Metionin
Asparagin
Prolin
Glutamin
Arginin
Serin
Treonin
Valin
Tryptofan
Tyrosin
6,11
5,05
2,85
3,15
5,49
6,06
7,60
6,05
9,60
6,01
5,74
5,41
6,30
5,65
10,76
5,68
5,60
6,00
5,89
5,64
Tabell Aminosyror strukturformler
NH
O
H3C H COH
C
H2N C
NH2
alanin (ala)
O
H2
C H COH
C
HS
NH2
HC
CH
N
H
H3C
CH3
OH
O
C H
H3C H C COH
NH2
treonin (thr)
Första basen
U
C
A
G
asparaginsyra (asp)
HC
HC
C
H
CH3
H2
O
C H
COH
C
C
CH NH
2
H2N
NH2
O
H2
C H COH
HC
HC
C C
C
C
C C
HO
CH NH2
H
N
H
tryptofan (trp)
H
C
C
H
H2
O
H2
C
C
C H COH
H2 C
C
H2
NH2
lysin (lys)
O
H2
C H COH
HO
C
NH2
serin (ser)
prolin (pro)
H H
C C
COH
NH2
leucin (leu)
O
H2
COH
H
C
C
H2C
C NH
H2
fenylalanin (phe)
Andra basen
U
Phe
Phe
Leu
Leu
Leu
Leu
Leu
Leu
Ile
Ile
Ile
Met/Start
Val
Val
Val
Val
H2C
glycin (gly)
O
H2
H3C H C H COH
C
C
O
isoleucin (ile)
H
C
O
O
H2
C H COH
C
C
H2
NH2
glutaminsyra (glu)
C H COH
C H C
H2
NH2
H3C
NH2
metionin (met)
HO C
glutamin (gln)
O
H2
C H COH
C
C
H2
NH2
NH2
O
O
H2
H2N C
C H COH
C
C
H2
NH2
histidin (his)
S
asparagin (asn)
O
O
H2
C
H
COH
N
C
C
OH
NH2 NH2
arginin (arg)
cystein (cys)
O
H2
H
C
COH
O
C
C
O
H2
H
C
COH
O
C
C
H2
O
H2
N C
C
H
COH
H
C
C
H2
NH2
H2
O
C H
COH
C
C
CH NH
CH3
C H COH
H3C H C
NH2
2
tyrosin (tyr)
valin (val)
Tredje basen
C
Ser
Ser
Ser
Ser
Pro
Pro
Pro
Pro
Thr
Thr
Thr
Thr
Ala
Ala
Ala
Ala
A
Tyr
Tyr
Stopp
Stopp
His
His
Gln
Gln
Asn
Asn
Lys
Lys
Asp
Asp
Glu
Glu
G
Cys
Cys
Stopp
Trp
Arg
Arg
Arg
Arg
Ser
Ser
Arg
Arg
Gly
Gly
Gly
Gly
U
C
A
G
U
C
A
G
U
C
A
G
U
C
A
G
O
Svarsblankett
Uppg.
Namn: __________________________ Klass: ____________
Svar
ECApoän poän poän
g
g
g
1a
Vad är Hydrofob effekt
1
1b
Vad är glykolys
1
1c
Vad är isoelektrisk punkt
1
1d
Vad är NAD+ och FAD
1
1e
Vad är Gelfiltrering
1
1f
Vad är Splicing
1
2
Det som händer kallas: Proteinen denatureras
1
3
a
b
c
d
4
a
b
c
d
5
a
b
c
d
6
Processen kallas: Andningskedjan
e
e
ringa in de rätta svaren
1/r
3
ringa in de rätta svaren
1/r
2
ringa in de rätta svaren
1/r
3
1
1
4
3
Processen sker i: i inre cellmembra i mitokondrien
7a
Molekyl A
Molekyl C
Molekyl E
Molekyl G
alfa ketosyra
nukleosid
steroid
fett
Molekyl B alfa aminosyra
Molekyl D kvävebas
Molekyl F ribos kolhydrat
7b
Molekyl D
och Molekyl F
7c
Fosfat
8
På ytan finns: arg, asp, ser, thr
Inuti finns: leu, val
9
Det innebär att: enzym 1 inte fungerar längre som det är tänkt så
reaktionen då treonin bildar A avstannar.
Isoleucin fungerar som inhibitor/moderator
1
1
2
1
10a
4
1
10b
Val-gly-ser-ala
1
10c
Peptidbindning
1
10d
N-terminal valin
10e
3
1
10f
24
1
10g
m-RNA-kod GUU GGU UCU GCU
1
10h
DNA-kod
1
10i
Var? Cytoplasma
Vilken molekyl? Ribosomen stora och lilla delen (t-RNA)
C-terminal alanin
CAA CCA AGA CGA
1
2
1
Uppg.
Svar
ECApoän poän poän
g
g
g
11
Redovisas på rutat papper
3
12a
Cystein bildar svavelbryggor, disulfidbryggor
1
12b
159+3+3 = 165 minst
1
12c
11053 = 5830 5830-5218 = 5830-936 = 4894
1
13a
Mutant 1 i position b
Mutant 3 i position d
4
13b
Motivering görs på rutat papper
14a
Nr 1 är molekyl C
Nr 3 är molekyl A
14b
Redogör på rutat papper
Mutant 2 i position c
Mutant 4 i position a
ok
Nr 2 är molekyl B
Nr 4 är molekyl D
1
5
Summa maxpoäng
22
20
Summa erhållna poäng
11
13
Mutant 1
Mutant 2
Mutant 3
Mutant 1
14b
asn IP 5,41
lys IP 9,60
gly IP 6,06
asp IP 2,85
lys IP 9,60
glu IP 3,15
glu IP 3,15
lys IP 9,60
2
neg vid pH 8,6 ersätts med
pos vid pH 8,6
neg vid pH 8,6 ersätts med
neg vid pH 8,6
pos vid pH 8,6 ersätts med
pos vid pH 8,6
neg vid pH 8,6 ersätts med
pos vid pH 8,6
flyttar mot neg pol.
flyttar mot pos pol.
flyttar mest mot pos pol.
flyttar mest mot neg pol.
Ur succinat elimineras två väten med hjälp av FAD och det bildas en alken fumarat.
Till fumarat adderas vatten så det bildas en alkohol malat.
OH-gruppen i malat oxideras med hjälp av NAD+ som samtidigt tar två väten och det
bildas oxalacetat.
16