1. No category

15-10-07
“Närbild” av A, B och C (17,000bp)
Distribution of DNA-typer
= Europa
= Mellanöstern
= Östasien
•  Mix av de tre DNA-­‐grupperna (A,B,C) i alla delar av världen •  Liknande frekvenser av dessa tre grupper •  Ingen korrela@on mellan DNA-­‐typ och hundras = Varg
A
→ Mycket homogen genpool i hela världen F
•  Indika@on om varg-­‐inkorsning i Skandinavien, Mellanöstern och Japan: gene@skt @llskoI 2% •  Men klart flest DNA-­‐typer i södra Kina/
Sydostasien B
C
E
D
coyote
“Närbild” av A, B och C (17,000bp)
Distribution av de 10 “A/B/C undergrupperna”
= Europa
= Mellanöstern
= Östasien
= Varg
A
4
5
4
4
F
B
7
5
C
E
7
5
5
10
5
D
coyote
Sydostasien-­‐Mellanöstern-­‐Europa Y-­‐kromosom a
ASY
a3
a5
N=273
SwAsia
a3
a5
N=200
Europe
a3
a5
N=302
o
i
b
c
d
j
e
A
A
a1
a6
f
A
a1
a6
a6
g
a2
a2
n
k
a1
m
HG3
HG9
l
a2
HG6
22
18
HG23 7
9
6
5
10
20
15
16
19
HG1
11
26
17
a4
a4
a4
h
25*
23*
3
23
2*
31
8
14
1
1*
4
13
12
21
24*
27
•  “All” DNA-­‐varia@on i Sydostasien, mindre än 50% i Europa och Mellanöstern 29*
30*
•  “All” DNA-­‐varia@on i Sydostasien, mindre än 50% i Europa 1
15-10-07
Den enkla principen för iden@fiering hundens ursprung. EI exempel: Distribution av de 10 “A/B/C undergrupperna”
4
•  10 vargar (av tusentals i denna popual@on) tämjdes, var och en med varsin DNA-­‐typ. •  Därför, 10 DNA-­‐typer nedärvdes från varg @ll hund. Sålunda, de första hundarna hade totalt 10 DNA-­‐
typer (en per individ…). •  När hundarna spreds från ursprungsområdet över världen förlorades några “på vägen”. Därför är det färre DNA-­‐typer ju större avstånd från startpunkten. 5
4
4
7
5
5
7
5
10
5
Antal ursprungsindivider Hundens ursprung och spridning
ASY
a3
a5
N=273
SwAsia
A
a3
a5
N=200
Europe
A
a1
a6
a4
a5
N=302
A
a1
a6
a2
a2
a3
a1
a6
a2
a4
a4
•  Minst 51 enligt mtDNA-­‐varia@on, minst 13 enligt Y-­‐kromosom –  Troligen åtskilliga hundra, kanske tusen vargar Dingo ASY
a3
a5
N=273
Dingo
a3
Analys av kärn-­‐DNA (hela genomet) a5
N=233
Europe
A
A
a1
a6
a4
a5
A
a1
a6
a2
a2
a3
N=302
a1
a6
a2
a4
a4
•  Ursprung från en enda mtDNA-­‐typ 2
15-10-07
Korsning med varg Södra Kina basal mot varg Varg/hund-­‐split: 33,000 år Global hund-­‐expansion: 15,000 år •  5-­‐15% i hundar •  Jämnt över Eurasien •  Högst i Mellanöstern: 15% Slutsatser
•  Alla typer av DNA visar ungefär samma sak •  Hunden har bred gene@sk bas från sydostasia@sk varg –  Troligen åtskilliga hundra, kanske tusen vargar •  Alla hundar i världen har ungefär samma gene@ska bas •  Litet @llskoI av “varg-­‐gener” runtom Eurasien –  Cirka 10% extra gene@sk varia@on –  >50% @llskoI i Lapphund och Gråhund/Jämthund (?) •  Europeiska popula@onen har cirka 20-­‐50% av den ursprungliga gene@ska varia@onen i Sydostasien •  Dingo har några få % av ursprungsvaria@onen Analys av genförändringar varg-­‐hund
Geografisk korrela@on öst-­‐väst Slutsatser (och spekulationer) om
Hundens ursprung
•  Hunden uppstod i Södra Kina 10,000-­‐16,000 år sedan, från flera hundra vargar •  Möjlig mänsklig kultur (och hur/varför) indikerad: –  Samma @d/plats som ursprunget av jordbruk (ris) – ursprung länkat @ll ”jordbruksrevolu@onen? –  Hundratals domes@cerade vargar: en vik@g kulturell händelse, och många människor inblandade –  Notabelt: hund har “all@d” använts som mat i denna region: –  Anledning @ll domes@cering: konsum@on av köIet? –  KöIätare @ll allätare första steget i “själv-­‐domes@cering” av varg? •  Mer arkeologiska data behövs! •  Samt detaljerade gene@ska studier i Sydostasien Pang et al, Mol.Biol.Evol. Epub sept 1 2009 Analys av genförändringar varg-­‐hund
Selektions-analys identifierar 36 regioner
E Axelsson Nature 000, 1-5 (2013) doi:10.1038/nature11837
3
15-10-07
Selektion för ökad amylas-aktivitet
Analys av genförändringar varg-­‐hund Tydligaste resultat: •  Gener för matsmältning av kolhydrater mycket effek@vare hos hund än varg! •  Många gener kopplade @ll beteende har förändrats E Axelsson Nature 000, 1-5 (2013) doi:10.1038/nature11837
“Ejer första ursprunget”: yIerligare detaljer om hundens @digaste historia •  Dingons ursprung •  Spridning från södra Östasien Ursprung, spridning och varginkorsning ?
?
–  Till Australien och Oceanien –  Till Amerika –  Till Madagaskar •  Korsning med varg Ursprung, spridning och varginkorsning Ursprung, spridning och varginkorsning 4
15-10-07
Ursprung, spridning och varginkorsning Ursprung, spridning och varginkorsning Ursprung, spridning och varginkorsning Ursprung, spridning och varginkorsning Ursprung, spridning och varginkorsning Ursprung, spridning och varginkorsning 5
15-10-07
Ursprung, spridning och varginkorsning Hundens ursprung och @diga historia: från “ingen aning” @ll många detaljer! •  Ursprung: plats, @d, antal tämjda vargar, relaterad mänsklig kultur (?) •  Gene@sk ”anpassning”: matsmältning och psyke •  Dingons ursprung •  Spridning @ll: –  Polynesien och Australien –  Madagaskar –  Amerika •  OmfaIning av hund/varg-­‐korsning Hundens ursprung och @diga historia: från “ingen aning” @ll många detaljer! •  Ursprung: plats, @d, antal tämjda vargar, relaterad mänsklig kultur (?) •  Gene@sk ”anpassning”: matsmältning och psyke •  Dingons ursprung •  Spridning @ll: Tidig hundhistoria –  Polynesien och Australien –  Madagaskar –  Amerika •  OmfaIning av hund/varg-­‐korsning •  Fram@den? Mycket mer kommer! “Ejer första ursprunget”: yIerligare detaljer om hundens @digaste historia •  Dingons ursprung •  Spridning från södra Östasien –  Till Australien och Oceanien –  Till Amerika –  Till Madagaskar •  Korsning med varg Dingons ursprung, slutsatser
•  Ursprung från tamhund -­‐ från Östasien •  Troligtvis få ursprungsindivider •  Möjligen en enda introduk@on •  Introduk@on ~5,000 år sedan •  Isolering från andra hundar @lls Européerna anlände Savolainen et al, P.N.A.S. 2004 6
15-10-07
Dingo ASY
a3
a5
Dingo
N=273
a3
“Hund-­‐migra@oner” a5
N=233
Europe
a3
A
A
a1
a6
N=302
A
a1
a6
a1
a6
a2
a2
a5
a2
a4
a4
a4
•  Ursprung från en enda mtDNA-­‐typ Distribution av de 10 “A/B/C undergrupperna”
4
5
4
4
5
5
5
7
•  Studeras genom fördelningen av mtDNA-­‐typer i världen. •  Den täta provtagningen över världen ger kunskap om geografiska fördelningen av mtDNA-­‐typer i t.ex. Östasien (10 grupper) och Europa (endast 5 av dessa grupper). Ursprunget av hund i Amerika •  Fråga: Hur stor andel från före Kolumbus? Hur mycket från Europa? •  Fördelning av mtDNA typer: Östasien har alla 10 haplogrupper, Europa endast 5 •  Därför: om Amerikanska hundar har någon av de 5 haplogrupperna som inte finns i Europa, så måste de härstamma från Östasien (introducerade via Berings sund) 7
10
5
Ursprunget av hund i Amerika: resultat Hund @ll Amerika: från Asien i två vågor •  Alla Amerikanska ursprungliga raser (ark@ska raser, Chihuahua, Mexikansk och Peruansk nakenhund) har icke-­‐
Europeiska DNA-­‐typer. •  Max 0-­‐15% Europeisk inkorsning. •  Chihuahua har unik DNA-­‐typ delad endast med arkeologiska Mexikanska hundfynd. •  2 popula@onsgrupper: Ark@ska hundar och Mellan/Syd-­‐ Amerikanskahundar hade helt olika DNA typer; separata ursprung. •  Mexikansk och Peruansk nakenhund delar många DNA typer. •  Inget ursprung från amerikansk varg. 7
15-10-07
Hundarnas väg @ll Polynesien och Australien Hundarnas väg @ll Polynesien och Australien •  Polynesien beboI 3,000 år sedan •  Språk och arkeologi indikerar ursprung från Södra Kina via Taiwan 4,000 år sedan •  Historiska frågeställningar: •  Polynesien beboI 3,000 år sedan •  Språk och arkeologi indikerar ursprung från Södra Kina via Taiwan 4,000 år sedan •  Historiska frågeställningar: –  Snabb spridning av folk och hela kulturpaketet via Taiwan? –  Eller, långsam spridning och uppblandning av folk och kultur? –  Snabb spridning av folk och hela kulturpaketet via Taiwan? –  Eller, långsam spridning och uppblandning av folk och kultur? •  Dingo: arkeologiska bevis 3,500 år sedan •  Dingo: arkeologiska bevis 3,500 år sedan •  Vår fråga: kom hundarna via Taiwan med människorna, eller blev de ”upplockade” på vägen? •  Kom dingon samma väg? Hundarnas väg @ll Polynesien och Australien Hundarnas väg @ll Polynesien och Australien A3 6% A65 3% A29 5% eller
A3 35% A65 65% A29 0% A29 100% A3 35% A65 65% A29 0% A29 100% Hundarnas väg @ll Polynesien och Australien Peopling of Madagascar •  First populated 2,000 ya by “Polynesians” •  Human mtDNA shows 50% Asian and 50% African types, thus later influx from Africa A3 6% A65 3% A29 5% A3 0% A65 0% A29 0% A3 35% A65 65% A29 0% A3 8% A65 34% A29 19% A29 100% 8
15-10-07
Peopling of Madagascar Dog routes to Madagascar •  First populated 2,000 ya by “Polynesians” •  Human mtDNA shows 50% Asian and 50% African types, thus later influx from Africa •  Our ques@on, dogs brought to Madagascar by the “Polynesians”? How much mix with African dogs? ?
Dog routes to Madagascar ?
?
Dog routes to Madagascar ?
Afr 100% Asia 0% Afr 100% Asia 0% Dog routes to Madagascar Dog routes to Madagascar Afr 100% Asia 0% Afr 100% Asia 0% 9
15-10-07
Hund-­‐varg korsningar •  Endast tre indika@oner (av mtDNA) av hund-­‐varg korsning, i Skandinavien, Mellanöstern och Japan. •  Indikerat av de regionala träd-­‐grupperna D (d1, d2) och F Grupp D och F
= Europa
= Mellan Östern
= Östasien
= Varg
A
A, B och C överallt, hos
98-100% av hundarna
D, E, F regionalt, totalt
2% av alla hundar
F
B
C
E
D
coyote
Tid
Hund-­‐varg korsningar •  Endast tre indika@oner (av mtDNA) av hund-­‐varg korsning, i Skandinavien, Mellanöstern och Japan. •  Indikerat av de regionala träd-­‐grupperna D (d1, d2) och F •  Den skandinaviska inkorsningen (d1): –  Endast i nordskandinaviska hundar (Lapphund och Grå-­‐/
Jämthund) –  Cirka 50% har d1 (resten har A, B och C) •  Indikerar stor betydelse (selek@v fördel) för hundarna! Hund-­‐varg korsningar •  Endast tre indika@oner (av mtDNA) av hund-­‐varg korsning, i Skandinavien, Mellanöstern och Japan. •  Indikerat av de regionala träd-­‐grupperna D (d1, d2) och F •  Inkorsning i Mellanöstern indikerad också av genom-­‐
analys. •  Japan: Grupp F hiIad endast bland japanska hundar, samt arkeologiska japanska vargar –  Ursprung 500-­‐2,000 år sedan (alltså inkorsning, inte separat domes@cering av varg) Ursprung, spridning och varginkorsning Hundar på södra Kinas landsbygd
10