1. No category

Enterovirus D68
Enterovirus D68
Sidsel Krokstad
Spesialbioingeniør
Avdeling for medisinsk mikrobiologi
St.Olavs Hospital
Internundervisning 03.12.2014
8.10.2014
Høstkonferansen 2015
Adressa lørd.29.nov.2014
Høstkonferansen 2015
Høstkonferansen 2015
Enterovirus tilhører fam.Picornaviridae
Species
Coxsackievirus A
Enterovirus A
CAV2-8, 10, 12, 14,
16
Enterovirus B
CAV9
Enterovirus C
CAV1, 11 (15), 13
(18), 17, 19-22, 24
Poliovirus
Coxsackievirus B
Echovirus
Enterovirus
EV71, 76, 89-92
CBV1-6
Poliovirus 1-3
Enterovirus D
E1-7, 9,
11-21, 2427, 29-33
EV69, 73-75, 77-88, 93, 97, 98,
100, 101
EV95, 96, 99, 102
EV68, 70, 94
Høstkonferansen 2015
Andre humanpatogene picornavirus
Humant rhinovirus (HRV A, HRV B og HRV C)
Parechovirus
Hepatovirus (hepatitt A)
Høstkonferansen 2015
Enterovirus og sykdom.
Enterovirus er en stor gruppe med virus med mer enn 100 forskjellige
varianter.
Fleste infeksjoner opptrer sen sommer/høst.
Enterovirus kan gi en rekke sykdommer der sykdommer i
sentralnervesystemet er mest alvorlige.
Poliovirus. WHO laget program for å utrydde polio innen 2018.
Smittemåte er fekal oral og ved hoste (dråpesmitte). Viruset skilles ut i fæces.
Inkubasjonstid ca 1uke.
Høstkonferansen 2015
Enterovirus sykdomsbilder:
Coxackievirus A ble først beskrevet i 1948 og har 23 subtyper
Gir vanligvis infeksjoner i hud, slimhinner eller øye.
Hånd-fot-og-munn-syke er en mild utslettsykdom og gir mindre
utbrudd årlig. Vanligvis forårsaket av coxackievirus A16.
Herpangina (øvre luftveisinf.med karakterisiske forandringer bak i
svelget), vanligst hos små barn
Akutt hemoragisk konjunktivitt kan forårsakes av coxackievirus A24
Coxackievirus B.
Myalgia epidemica (Bamblesyken, Bornholmsyken). Feber og intense
smerter i nedre del av thorax og øvre del av abdomen. Kan også være
forårsaket av coxA og andre enterovirus. Sjelden i Norge i dag.
Mykokarditt og perikarditt komplikasjon i forbindelse med CoxB
infeksjoner
Høstkonferansen 2015
Serøs meningitt/encefalitt (meldepliktig til MSIS)
Systemisk infeksjon hos nydfødte (spesielt premature)
Enterovirus 71 har vært årsaker til epidemier i Malaysia i 1997 og Taiwan
i 1998. Tusener ble syke og mange døde eller fikk følgetilstander. De
fleste var små barn. Hemorragisk lungeødem eller symptomer i
sentralnervesystemet.
Utslett
Øvre og nedre luftveisinfeksjoner (alle enterovirus kan gi luftveisplager)
Høstkonferansen 2015
Enterovirus D-68
Luftveisvirus
Isolert for første gang fra barn med nedre luftveisinfeksjon i California i 1962
Rapportert mindre utbrudd flere steder i verden fra begynnelsen av 2000-tallet
Høsten 2014 utbrudd i USA og Canada med mer enn 1000 tilfeller. 14 dødsfall.
Barn med alvorlig luftveisinfeksjon og noen med neurologiske symptomer og
varierend grad av lammelser
Ingen funn i spinalvæske. Sammenheng mellom EV-D68 og neurologisk
sykdom?
Høstkonferansen 2015
Hvordan var situasjonen i Europa høsten 2014?
ESCV (european society of clinical virology ) ble bedt om å kartlegge
dette.
På ESCV møte i Praha høsten 2014 ble det dannet en arbeidsgruppe
der 51 laboratorier fra 17 land deltok.
Laboratorium i Nederland koordinerte arbeidet
Kartlegge diagnostikk.
Utveksle analyserepertoar
Kjøre spesifikk EV-D68 PCR og sekvensere positive prøver.
Høstkonferansen 2015
Diagnostikk ved AMM.
Prøvemateriale til enteroviruspåvisning: fæces, spinalvæske, luftveisprøver,
vesikkelinnhold og øyeprøver. Forsøker om mulig å dyrke viruset for genotyping
• Enterovirus TaqMan real-time PCR (detekterer ikke EV D68, detekterer noen
rhinovirus)
• Pan-entero-rhinovirus real-time PCR (detekterer EV D68, ikke så god sensitivitet)
• 2 rhinovirus real-time PCR (detekterer ikke EV D68)
• Viruspåvisning i cellekultur (ja, enkelte er dyrket)
• Genotyping av enterovirus
Utfordringer:
Sekvenslikheter mellom enterovirus og rhinovirus.
Spesifikk påvisning av enterovirus og rhinovirus.
Mange typer av både enterovirus og rhinovirus.
Sensitivitet ved genotyping av enterovirus som ikke er oppformert i
cellkultur
Høstkonferansen 2015
Enterovirus CPE (cytopatogen effekt)
Høstkonferansen 2015
Enterovirus er RNA-virus 7,3 – 7,4 kb langt
5’UTR brukt for diagnostisk PCR
VP1 brukt for genotyping
Høstkonferansen 2015
Etablerte EV D-68 spesifikk PCR med primere/probe utviklet i
Nederland
Analyserte utvalgte luftveisprøver fra barn mottatt høsten 2014
Etablerte ny PCR for genotyping av enterovirus i VP1 genet og
sekvenserte positive prøver
Resultater og sekvenser ble sendt til Nederland
FHI utviklet en mye mer sensitiv EV-D68 PCR som erstattet
metoden fra Nederland
Høstkonferansen 2015
Publikasjon fra Bragstad et al Folkehelsesinstituttet beskriver primer og
probesekvenser
High frequency of enterovirus D68 in children hospitalised with respiratory
illness in Norway, autumn 2014.
Bragstad K1, Jakobsen K, Rojahn AE, Skram MK, Vainio K, Holberg-Petersen M,
Hungnes O, Dudman SG, Kran AM.
Høstkonferansen 2015
Antall prøver analysert og antall positive EV-D68 rapportert fra Norge:
Oslo FHI: 66 analysert, 9 positive
Oslo Ullevål: 354 analysert, 34 positive
Trondheim: 157 analysert, 6 positive (ingen med alvorlig sykdom)
Totalt ble 17248 prøver analyser, 389 positive.
205 av de positive ble sekvensert
Høstkonferansen 2015
Norge:
2 tilfeller av pasienter med slappe pareser som testet positive på EVD68 i luftveissekret. EV-D68 ikke påvist i fæces, serum eller
spinalvæske.
Også beskrevet en del tilfeller med forverring av astmasymptomer
hos barn innlagt på sykehus i østlandsområdet.
Frankrike:
1 pasient med akutte slappe pareser
Høstkonferansen 2015
Høstkonferansen 2015
European surveillance for enterovirus D68 during the
emerging North-American outbreak in 2014
Journal of Clinical Virology,
october 2015
Høstkonferansen 2015
What happened with EV-D68 in 2014?
In 2014, the United States experienced a nationwide outbreak of EV-D68 associated
with severe respiratory illness. From mid-August 2014 to January 15, 2015, CDC or
state public health laboratories confirmed a total of 1,153 people in 49 states and
the District of Columbia with respiratory illness caused by EV-D68. Almost all of the
confirmed cases were among children, many whom had asthma or a history of
wheezing. Additionally, there were likely millions of mild EV-D68 infections for which
people did not seek medical treatment and/or get tested.
CDC received about 2,600 specimens for enterovirus lab testing during 2014, which
is substantially more than usual. About 36% of those tested positive for EV-D68.
About 33% tested positive for an enterovirus or rhinovirus other than EV-D68.
EV-D68 was detected in specimens from 14 patients who died and had samples
submitted for testing.
CDC mars 2015
Høstkonferansen 2015
Retrospektiv studie publisert i Lancet Infect.Dis.juni 2015:
“A novel outbreak enterovirus D68 strain associated with acute flaccid myelitis
cases in the USA (2012-14): a retrospective cohort study.”
Forsøkt å finne sammenheng mellom EV-D68 og neurologisk sykdom.
Metagenomic next generation sequencing utført på spinalvæske for å utelukke
andre infeksiøse årsaker til neurologisk sykdom.
Ble funnet viremi hos en av pasientene. Noe som kan tyde på at viruset kan
forårsake systemisk infeksjon.
Sekvensering viste at alle EV-D68 var i clade B1 og har 6 aminosyreforskjeller fra
andre clade B som muligens kan være årsak til neurovirulens.
Ukjente immunologiske vertsfaktorer spiller nok en rolle. Søskenpar infisert med
samme genetiske variant av EV-D68. En fikk lettere luftveisinfeksjon mens den
andre utviklet neurologisk sykdom
Høstkonferansen 2015
Oktober 2015
Acute Flaccid Paralysis Associated with Novel Enterovirus C105.
Liana M. Horner, Melinda D. Poulter, J. Nicholas Brenton, and Ronald B.
Turner
Dette tilfellet ble også diagnostisert høsten 2014 I USA.
Nye diagnostiske utfordringer?
6år gammel jente innlagt med slappe pareser. Hun og familien hadde
hatt lettere luftveisinfeksjon.
Luftveisprøve positiv for picornavirus og sekvensering i VP1 viste
enterovirus C105
Nye diagnostiske utfordringer?
Høstkonferansen 2015
Hva jobber vi med nå:
Validerer ny metode for genotyping av enterovirus som er mer sensitiv enn
den vi brukte tidligere. Trenger ikke oppformering i cellkultur.
Jobber med å etablere ny enterovirus real-time PCR som også påviser EVD68 og ikke påviser rhinovirus
I gang med validering av ny PCR for rhinovirus genotyping
Alle prøver som rekvireres til enterovirus påvisning denne høsten blir også
analyserert i spesifikk EV-D68 PCR. Resultater og kliniske data til FHI.
Foreløpig ingen positive.
Høstkonferansen 2015