IT-Solutions for Animal Production Sammenligning

IT-Solutions for Animal Production
28. Februar 2017
Seite 1
IT-Solutions for
Animal Production
Sammenligning af avlsfilosofi
for tysk RZG
kontra dansk NTM
Dr. Stefan Rensing
Vereinigte Informationssysteme Tierhaltung w.V. (vit), Verden/Germany
Annual Meeting Danish Holstein 2017, Herning, February 27th
1
Malkekvæg i Tyskland
 12.7 mio. kvæg
 4,267,000 malkekøer

673,000 ammekøer
 4.267.000 malkekøer




in 79,500 besætninger (gns. 53 køer)
88% ydelseskontrol
66% stambog
90% A.I. (4.2 mio. 1st insemineringer)
Brown Swiss
 Racer:
 65% Holstein
 25% Fleckvieh
 5% Brown Swiss
 5% andre (inkl. 1,5% krydsninger)
Page 3
Organisationsstruktur i Tyskland
 Regionale organisationer (DHI, stambog, AI)
 Stambog og A.I. oftest sammenlagt
 Databehandling oftest centraliseret
Page 4
2
International sammenligning af Total Indeks - år 2000
Page 5
International sammenligning af Total Indeks - år 2016
Page 6
3
Tysk Total indeks, RZG (Relativ-Zuchtwert-Gesamt)
RZM
Mælkeproduktionsindeks
F&L, yver
45% mælkeproduktionsegenskaber 15% funkt.
eksteriør.
Indtægt
RZN
levetid
RZR RZS
DøtreSCS
Frugtbarh.
RZKm
DEU:
relativ avlsværdital
udtrykt på 100/12 skala
RZG
40% funktionelle egenskaber
Omkostninger
 Relative vægte i hht. økonomisk vigtighed
 Marginal fordel ved forbedring af 1 genetisk standardafvigelse
 Fastholdelse af alle andre egenskaber (i.e. ceteris paribus conditions)
 Seneste revision: 2008 (døtrefrugtbarhed +10%, produktion -5%, levetid-5%)
28. Februar 2017
Seite 7
Nordisk Total indeks, NTM
29% mælk + kød
Indtægt
28. Februar 2017
14% funkt.
eksteriør
Temp.
Malektid
Øvrige sygd
Klovsund
DøtreFrugtbarh.
Ungdyr over
Yver
sundhed
Holdbarhed
Yver, F&L
Føds. Ind.
Growth
Y-Indeks
mælkeproduktionsindeks
kælvevne.
DFS:
relative avlsværdier
udtrykt på en 100/10 skala
NTM
57% funktionelle egenskaber
Omkostning
Seite 8
4
NTM  RZG
RZKm
NTM
SCS
Temp.
Holdbahreed
RZG
Øvrige
sygd
Other
Diseas.
Klovsund
Claw
health
Malektid
Milking
speed
DøtreFrugtbarh.
Døtrefrugtbarh
Y.Ungdyr
stock. over
Sur.
Yver
sundhed
RZR RZS
Føds. Ind.
Calving
dir.
Yver, F&L
RZN
levetid
F&L, yver
kælvevne.
Calving
mat.
Y-Indeks
mælkeproduktionsindeks
Tilvækst
RZM
mælkeproduktionsindeks
 Flere egenskaber medtaget i NTM med lav vægt







Fødselsindeks (6%)
Ungdyrsoverlevelse (5%)
Andre sygdomme (4%)
Klovsundhed (3%)
Malketid (3%)
Tilvækst (2%)
Temperament (1%)
 Flere direkte helbredsegenskaber i NTM; mindre på holdbarhed
 Forhold mellem produktion  funktionelle egenskaber: NTM 1:1.9 (RZG 1:0.9)
 Eksteriør egenskaber meget tilsvarende
28. Februar 2017
Page 9
Realtive vægte  genetisk fremskridt
 Relative vægte reflekterer ikke nødvendigvis den genetiske fremgang for
alle egenskaber
 Fordi egenskaberne ikke er genetisk uafhængige
 Selektion for en egenskab kan medføre positive/negative ændringer i andre
egenskaber (indirekte udvælgelsesrespons)
Genetic correlations
RZN
RZS
RZR
Milk production index (RZM)
-0.10
-0.10
-0.30 ±0.00
Longevity (RZN)
Udder health/SCS (RZS)
RZKm
+0.45 +0.35 +0.20
+0.15 ±0.05
+0.15
Daughter fertility (RZR)
Mælkeprodukt. egenskaber
har negativ korrelation til de
fleste funktionelle egensk.
De fleste funktionelle
egenskaber har positiv
korrelation til hinanden
Daugh. calving ability (RZKm)
28. Februar 2017
Page 10
5
Selektion i praksis
 Hvis landmænd (og avlsorganisationer) ikke udvælger det samme som det
officielle total indeks (TMI)
 Genetisk fremskridt i ko-populationen forbliver teori
Omajo
Braveheart
(O-Man x Major)
(Marshall x Luke)
RZG 139 (#8 Dec. 2010)
RZM 134 RZE 100
RZS 118 RZN 112 RZR 109
Total # offspring: 543
RZG 116 (#>500 Dec. 2010)
RZM 98 RZE 137
RZS 108 RZN 113 RZR 98
Total # offspring: 45,114
28. Februar 2017
Seite 11
Selektion i praksis-DEU
 ᴓ EBV all used semen straws Holstein bulls (2016 until August)
Genomics
new RZG
 Noget skete i 2001/2002 og i 2010/2011 med de anvendte tyre:
2002: negativ genetisk udvikl. for frugtb.,stoppede pludselig, levetid første gang positiv
2011: første gang positiv udvikl. for frugtbarh, dobbelt genetisk fremgang for RZG
Page 12
6
Selektion i praksis-DEU
 ᴓ EBV all used semen straws Holstein bulls (2016 until August)
Progress/year
1998‐2010 2011‐2016
Genomics
new RZG
RZM
RZE
RZS
RZN
RZR
RZG
1,5
1,6
0,4
0,8
‐0,5
1,9
3,3
3,4
1,6
2,7
1,6
5,1
DEU bull from DNK
Fantastic
 Siden 2010 fremgang for alle geneskaber i RZG
 Og mere end fordobling af fremskridt i RZG
 Fremskridt i eksteriør højere end forventet i fht. vægt af RZG
(Famous x Massey)
RZG 160 (#6 Dec. 2016)
RZM 152 RZE 117
RZS 126 RZN 125 RZR 100
Page 13
Total indeks: Teori versus det acceptable
 Total indeks og alle enkelte egenskaber på et relativt neutral grundlag = let at
sammenligne
 men landmænds erfaring er på kg, dage, %, … kr eller €
 Mange egenskaber med lav vægt = korrekt så længe det har økonomisk
påvirkning
 Men landmænd “føler” ofte anderledes (fx tyr med lav malkehastighed i top-10)
 Fordi den økonomiske påvirkning af mange egenskaber ikke er lineær
28. Februar 2017
Seite 14
7
Total indeks : Selektion i genom forskningens tider
 Hvor pålidelige er gEBV for særlige ‘nationale’ egenskaber (lille reference)?
 Landmænd er følsomme overfor store ændringer I avlsværdital
Top‐100 HOL gen.
DNK
SWE
FIN
CAN
DEU
FRA
GBR
ITA
LUX
NLD
USA
Total
28. Februar 2017
Country birth
90
7
3
0
0
0
0
0
0
0
0
100
Top-250 DEU bulls by gRZG
Top-100 Viking bulls by gNTM
 Effektiv pre-selektion af tyre ved genomisk forældregennemsnit
 For særlige nationale egenskaber er dette kun muligt i egen population
  vanskeligere at udvælge i fremmede populationer
Top‐250 HOL gen.
DEU
DFS
NLD
USA
CAN
GBR
LUX
FRA
ITA
Top total
Country birth
171
28
24
16
4
3
2
1
1
250
Dam country
128
32
28
41
14
2
2
2
1
250
DEU bull from DNK
Bonum
(Balisto x Epic)
RZG 158 (#17 Dec. 2016)
RZM 151 RZE 137
RZS 112 RZN 122 RZR 92
Seite 15
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
 NTM og RZG har længe været implementeret med signifikante forskelle
  der burde være bemærkelsesværdige forskelle på hvordan populationen
har udviklet sig
  men hvordan finder man ud af det?
 SNP-udveksling af alle unge tyre blandt EuroGenomics-lande
  uafhængig gEBV fra nationale evalueringer (ikke konverterede)
  udenlandske og nationale tyre er fuldt sammenlignelige
28. Februar 2017
Seite 16
8
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
DFS
scale
DEU
scale
28. Februar 2017
Page 17
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
DFS
scale
DEU
scale
28. Februar 2017
Page 18
9
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
DFS
scale
DEU
scale
28. Februar 2017
Page 19
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
DFS
scale
DEU
scale
28. Februar 2017
Page 20
10
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
DFS
scale
28. Februar 2017
Page 21
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
DFS
scale
DEU
scale
28. Februar 2017
Page 22
11
Selektion på NTM eller RZG: opnåes samme resultat ?
 Proportion of bulls in Top-100 EG6


DFS
scale
t_NTM: theoretical i.e. % all bulls
NTM: real No. in Top-100
28. Februar 2017
Page 23
Sammendrag
 NTM og RZG har signifikant forskellig sammensætning
 Produktion  funktionalitet: NTM=1:2, RZG=1:0.9
 For gruppen af funktionelle egenskaber er mange nationale (≈ 15% af NTM)
 RZG ligner mere Total indeks i andre Holstein-lande
 Forskelle i Total indeks avlsfilosofi har resulteret i genetisk afvigelse i
Holstein (tyre) populationer:
 DFS højere





 DFS lavere




Fertilitet
Kælvning
Yversundhed
(Levetid)
(Fedt)
Kg Mælk
Krop
Yver
(Foder og ben)
 Der fokuseres mere på tyreselektion i nationale populationer i DFS
 Sandsynligvis pga. forskellige egenskaber/mål og selektionen der baserer på
dette
28. Februar 2017
Page 24
12
IT-Solutions for Animal Production
28. Februar 2017
Seite 25
NTM  RZG
RZKm
RZG
NTM
SCS
Temp.
Holdbahreed
Døtrefrugtbarh
Øvrige
sygd
Other
Diseas.
Klovsund
Claw
health
Malektid
Milking
speed
DøtreFrugtbarh.
RZR RZS
Y.Ungdyr
stock. over
Sur.
Yver
sundhed
RZN
levetid
Føds. Ind.
Calving
dir.
Yver, F&L
F&L, yver
kælvevne.
Calving
mat.
Y-Indeks
mælkeproduktionsindeks
Tilvækst
RZM
mælkeproduktionsindeks
 Flere egenskaber medtaget i NTM med lav vægt







Fødselsindeks (6%)
Ungdyrsoverlevelse (5%)
Andre sygdomme (4%)
Klovsundhed (3%)
Malketid (3%)
Tilvækst (2%)
Temperament (1%)
 Flere direkte helbredsegenskaber i NTM; mindre på holdbarhed
 Forhold mellem produktion  funktionelle egenskaber: NTM 1:1.9 (RZG 1:0.9)
 Eksteriør egenskaber meget tilsvarende
28. Februar 2017
Page 26
13