Lieferumfang: 100 bp-DNA-Fluoro-Leiter, 50 µg in 500 µl [100 ng/µl] Masse (ng) / µg Marker 100 bp-DNA-Fluoro-Leiter (ready-to-use) 100 100 100 100 100 150 Die Fragmente dieses Markers sind vorgefärbt mit dem Fluoreszenzfarbstoff EvaGreen®. Die Herstellung erfolgte durch PCRAmplifikation auf Basis von Lambdaphagen-Template-DNA. Nach Amplifikation wurde die DNA gereinigt, spektroskopisch vermessen und in den angegebenen Mengen in den Marker eingesetzt. 1 Fragmentgrößen (in bp) 1000 900 800 700 600 500 400 300 200 100 1 DNA-Massen (ng/µl Markerlösung) 10 10 10 10 10 15 10 10 10 10 Vor dem Hintergrund der Sequenziergenauigkeit können wir bei der Angabe der Fragmentgrößen eine Fehlerrate von <1 % garantieren. 100 100 100 100 Abbildung: 5 µl 100 bp-DNA-Fluoro-Leiter auf 2,4 % Agarose Anwendung: Unsere DNA-Fluoro-Leitern sind mit dem DNAFluoreszenzfarbstoff EvaGreen® vorgefärbt. Sie können direkt auf ungefärbte Agarosegele aufgetragen werden. Der Farbstoff EvaGreen® hat nur eine geringe Membrangängigkeit und ist daher weder mutagen noch toxisch. Er kann durch UV-Licht und Blaulicht angeregt werden und ersetzt gängige Farbstoffe wie Ethidiumbromid oder SYBR® Green. Die 100 bp-DNA-Fluoro-Leiter ist eine ideale Ergänzung zu dem mit EvaGreen® vorgefärbten Gelladepuffer Roti®-Load DNAstain 2 (Best.-Nr. 5784). ® EvaGreen : Biotium ® SYBR : Molecular Probes Der Marker ist gelöst in einfach konzentriertem Gelladepuffer (Tris-HCl, pH 7,5, 10 mM; EDTA 10 mM; Glycerin 10 %; EvaGreen®; Orange G, Xylencyanol) und kann direkt eingesetzt werden. Die Konzentration beträgt 1 µg DNA / 10 µl Markerlösung. Probenauftrag: Die übliche Beladung für MINI- oder MIDIGele beträgt 5 µl (500 ng) pro Spur. Detektion: Wir empfehlen Ethidiumbromid-Breitbandfilter oder SYBR® Green-Filter. Anregungsmaximum (DNA-gebunden): ca. 320 nm (UV), 470-500 nm (Blaulicht) Emissionsmaximum (DNA-gebunden): 525 nm Lagerung: Die optimale Lagerungstemperatur liegt bei -20 °C. Wiederholtes (>10-mal) Auftauen und Einfrieren schadet dem Marker und ist zu vermeiden. Gegebenenfalls den Marker in Portionen aliquotieren. Aktuell verwendete Marker-Aliquots können kurzzeitig (einige Wochen) bei +4 °C gelagert werden. Vor Licht geschützt lagern! Hinweise: Die 100 bp-DNA-Fluoro-Leiter ist sehr gut kombinierbar mit der 20 bp- oder der 50 bpDNA-Fluoro-Leiter (Best.-Nr. 8262 oder 8263). Man erhält eine vielfältig einsetzbare Leiter für den kleinen Fragmentbereich. 100 bp-DNA-Fluoro-Leiter 8264.1 500 µl Mass (ng) / µg Marker 100 100 100 100 100 100 bp DNA Fluoro Ladder 150 (ready-to-use) 100 100 The fragments of this marker are prestained with the fluorescent dye EvaGreen®. The marker was generated by PCR amplification based on Lambda phage as template DNA. Following PCR, the DNA was purified, spectroscopically measured and used for marker mixture in the amounts given below. Fragment sizes1 (in bp) 1000 900 800 700 600 500 400 300 200 100 DNA mass (ng/µl marker solution) 10 10 10 10 10 15 10 10 10 10 1 Taking the sequencing accuracy as a basis, we can guarantee an error rate of <1 % when indicating fragment sizes. Delivery includes: 20 bp DNA Fluoro Ladder, 50 µg in 500 µl [100 ng/µl] 100 100 Figure: 5 µl of 100 bp DNA Fluoro Ladder on 2.4 % agarose Application: Our DNA Fluoro Ladders are prestained with the fluorescent dye EvaGreen®. They are optimised for direct loading on unstained agarose gels. Due to the low membrane permeability of the dye, the marker is non mutagenic and non-toxic. It can be excited by UV- and blue light making it a superior replacement for the widely used dyes ethidium bromide or SYBR® Green. The 100 bp DNA Fluoro Ladder is an ideal addition to the with EvaGreen® prestained gel loading buffer Roti®-Load DNAstain 2 (Art. No. 5784). The marker is solubilised in 1x concentrated sample buffer (Tris HCl, pH 7.5, 10 mM; EDTA 10 mM; glycerol 10 %; EvaGreen®; orange G, xylene cyanole) and may be applied directly to the gel. The concentration is 1 µg DNA / 10 µl marker solution. ® EvaGreen : Biotium ® SYBR : Molecular Probes Sample application: The standard loading of MINI or MIDI gels is 5 µl (500 ng) per lane. Detection: We recommend use of broadband ethidium bromide or SYBR® Green foto filters. Excitation maximum (bound to DNA): ca. 320 nm (UV), 470-500 nm (blue light) Emission maximum (bound to DNA): 525 nm Storage: Optimal storage temperature is -20 °C. Repeated (>10 times) thawing and freezing will damage the marker and should be avoided. If necessary aliquote the marker in portions. Short term storage (few weeks) may be done at +4 °C. Store in the dark! Please note: The 100 bp DNA Fluoro Ladder is highly compatible with the 20 bp or 50 bp DNA Fluoro Ladder (Art. No. 8282 or 8263). They result in a versatile range of DNA marker bands for analysis of small DNA fragments. 100 bp DNA Fluoro Ladder 8264.1 500 µl Carl Roth GmbH + Co. KG Schoemperlenstraße 3-5 76185 Karlsruhe Postfach 100121 76231 Karlsruhe Telefon: +49 (0) 721/5606-0 Telefax: +49 (0) 721/5606-149 E-Mail: [email protected] Internet: www.carlroth.de e.d. 12/2014
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