Mikrobna rezistenca v živilski verigi

Univerza v Ljubljani
Biotehniška fakulteta
Oddelek za živilstvo
Katedra za biotehnologijo, mikrobiologijo in varnost živil
Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Sonja SMOLE MOŽINA
Vsebinski sklopi predstavitve
•
•
•
•
•
Uvod – poskus ilustracije problema
Primeri statističnih podatkov
Primeri raziskovalnih podatkov
Zaključki
Nujni ukrepi
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Vir:
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Vir:
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Glavni poudarki poročila ECDC/EFSA/EMA
• V splošnem poraba protimikrobnih zdravil večja pri živalih;
• V večini analiziranih primerov potrjena pozitivna zveza med
porabo in odpornostjo bakterij;
• Najmočnejša zveza potrjena pri indikatorskih bakterijah
E. coli;
• Pozitivna zveza med porabo in odpornostjo potrjena tudi pri
patogenih bakterijah Salmonella spp. in Campylobacter spp.
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Protimikrobne snovi v živilski verigi
PROTIMIKROBNA ZDRAVILA,
BIOCIDI, ČISTILA, RAZKUŽILA
ČISTILA
KMETIJSKA
PRIDELAVA
SADJE
RAZKUŽILA
FIZIKALNO-KEMIJSKI
POSTOPKI PREDELAVE
(spiranje, mešanje,
segrevanje, pakiranje, itd.)
SREDSTVA ZA ZAGOTAVLJANJE
TRAJNOSTI IN VARNOSTI
ŽIVILSKIH PROIZVODOV
POLJŠČINE
PERUTNINA
PRIREJA ŽIVALI
ZA PROIZVODNJO
ŽIVIL ŽIVALSKEGA
POREKLA
PRAŠIČI
GOVEDO
RIBE
SREDSTVA ZA OHRANJANJE
SUROVIN
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
SNOVI ZA VZDRŽEVANJE
SVEŽINE IN TRAJNOSTI
PROIZVODOV
(npr. konzervansi,
aktivno pakiranje)
BIOLOŠKI POSTOPKI
PREDELAVE
(endogene protimikrobne
snovi: npr. organske kisline,
bakteriocini)
ČISTILA
RAZKUŽILA
DISTRIBUCIJSKO
OSKRBOVALNE VERIGE
trgovska mreža
gostinstvo
ketering
javna prehrana
gospodinjstva
POTROŠNIK
SREDSTVA ZA
OSEBNO HIGIENO
ČISTILA
RAZKUŽILA
Kakšno je dejansko stanje?
• Pri katerih mikroorganizmih se pojavlja odpornost,
kako pogosta je in na katere snovi?
• V katerih živilskih verigah oz. s katerimi izdelki se
prenašajo odporni mikroorganizmi in zakaj?
• S kakšnimi metodami in sistemi se stanje spremlja in
analizira… ali je primerljivo med različnimi obdobji in
področji?
Zelo kompleksno področje…
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
162 strani…
178 strani…
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Št. prijav kampilobakterioze pri ljudeh, 2000-2013
1500
1331
1297
1000
1227
890
1063
1088
944
1075
2004
2005
2006 2007
888
921
999
986
934
1027
2008
2009
2010
2011
2012
2013
500
0
2000
2001
2002
2003
Št. prijav salmoneloze pri ljudeh, 2004-2013
5.000
4.000
3.000
2.000
1.000
0
3.980
3.247
1.519
2003
2004
2005
1.519
2006
1.346
2007
1.033
627
347
403
393
320
2008
2009
2010
2011
2012
2013
Letno poročilo o zoonozah in povzročiteljih zoonoz, UVHVVR, 2014
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Problem mnogokratne odpornosti
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Pa v Sloveniji?
2009
2011
Tip živila
Št.
vzorcev
Št. Campy
poz. vzorcev
Tip živila
Št. vzorcev
Št. Campy
poz. vzorcev
Sveže pišč. meso
187
139 (74.3 %)
Sveže pišč. meso
28
21 (75 %)
Marin. pišč meso
25
12 (48.0 %)
Zel. list. zel.
50
0
Površinske vode
90
19 (21.1 %)
Solate s pišč. M.
50
0
90
80
70
60
% 50
C. Coli
C. Jejuni
40
Campylobacter spp.
30
20
10
0
GEN
STR
CIP
TET
ERY
NAL
CHL
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Frequency
of resistant
strains (%)
100
100
0
Meat samples
C. Jejuni
C. Coli
Campylobacter spp.
Pa v Sloveniji?
2013
Preglednica števila odpornih (R) in števila občutljivih (S) izolatov Campylobacter jejuni
iz svežega piščančjega mesa v prodaji l. 2013 na posamezne testirane antibiotike (CRP V4-1110)
GEN
CIP
TET
ERY
NAL
CHL
STR
R
1
20
2
1
17
1
1
S
26
7
25
26
10
26
26
R (%)
3,7
74
7,4
3,7
63
3,7
3,7
S (%)
96,3
26
92,6
96,3
37
96,3
96,3
3,70%3,70%
22,20%
0R
1R
2R
3R
70,40%
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Kaj pa metode ugotavljanja odpornosti?
Iščemo, kar poznamo..
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
CZ
CRO
kokoši
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
SI
CRO
SI
piščanci
HU
Primer uporabe metagenomike za ugotavljanje rezistenčnih genov…
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
analiza 2650 vzorcev hrane
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Je klonsko širjenje rezistence lokalno omejeno?
• Večja raziskava 185 sevov CIP-R C. jejuni:
- iz različnih geografskih regij (60 % iz Slovenije, 23 % Avstrije,
15% Nemčije, ostalo iz Balkanskih držav)
- različni izvori: živali in meso (71%), humani (23%), okoljski (voda,
divje živali (6%))
• MLST, flaA , PFGE genotipizacija
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Molekularna epidemiologija CIP-R C. jejuni
1
Širjenje antibiotske rezistence (CIP-R)
2
3
4
5
6
7
98
1110 S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Širjenje odpornih klonov
ClP-R sevi imajo točkasto mutacijo v
QRDR regiji gena gyrA
Ugotavljanje genetske podobnosti na
osnovi sekvence QRDR in tipa MLST
Kaj lahko storimo?
Jasna Kovač, BF,16.4.2015
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Povzetek o razvoju odpornosti na protimikrobne
snovi v živilski verigi
VODNO
AKVAKULTURA
OKOLJE
MORJE,
JEZERA
KOPALNE
PLAVANJE
VODE
PITNA VODA
REKE in
VODOTOKI
PITNA VODA
ANTIBIOTIKI
ZEMLJA
ODPLAKE
ODPADKI
KMETIJSKI IZPUSTI
in GNOJILA
DIVJE
DIVJINA
ŽIVALI
PREDELAVA
POGINULE
ŽIVALI
ODPADKI
SVINJE
PRAŠIČI
OVCE
HRANA ZA
ŽIVALI
KMETIJSKI PRIDELKI
ZELENJAVA
SADJE
POLJŠČINE
ČLOVEK
GOVEDO
ŽIVALI ZA
PREHRANO
LJUDI PERUTNINA
OVCE
TELETA
KOMERCIALNA
KLAVNICA /
PROIZVODNJA
RASTLIN
ANTIBIOTIKI
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
PREDELAVA
PRIPRAVA
POTROŠNJA
KONZERVANSI,
ČISTILA, RAZKUŽILA
OSTALA
DRUGE
FARMSKE
ŽIVINA ŽIVALI
HIŠNI
DRUGE ŽIVALI
LJUBLJENČKI
GOSPODINJSTVA
NEPOSREDNI
DIREKTNI
KONTAKT
STIKI
BOLNICE,
DOMOVI ZA
OSTARELE,
itd.
JAVNA
PREHRANA,
GOSTINJSTVO,
KETERING
itd.
Zaključki
• Tveganje za razvoj mikrobne odpornosti je veliko:
(po mnenju mnogih zapostavljeno)
– ker se v kmetijstvu porabi največ protimikrobnih snovi;
– ker se uporabljajo v subterapevtskih koncentracijah;
– ker se uporabljajo klinično pomembne ali njim zelo sorodne
skupine učinkovin;
_ ker smo širjenju odpornih sevov izpostavljeni z uživanjem
živilskih proizvodov in s širjenjem v okolje (preko tal, vode,
zraka…)
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi
Nujni ukrepi
• Racionalna uporaba protimikrobnih snovi
(strokovna in odgovorna- razum in etični odnos pred
profitno logiko!
• Javno dostopni rezultati sistemov spremljanja rezistence
in porabe antibiotikov!
• Podpora raziskavam
• Podpora splošnemu izobraževanju
HVALA ZA POZORNOST!
S. Smole Možina: Mikrobna rezistenca v živilski verigi