1. No category

Metadatastödd manuell klassificering av medicinska
publikationer: en titt på människa vs maskin
Daniel Wadskog Karolinska Institutet
2015-11-05
Certain data included herein are derived from the Web of Science ® prepared by THOMSON REUTERS ®, Inc. (Thomson®), Philadelphia, Pennsylvania, USA: © Copyright
THOMSON REUTERS ® 2015 All rights reserved.
Disposition
 Hur klassade vi publikationer på Karolinska Institutet?
 Hur väl stämmer den manuella klassningen med de alternativa
klassningar vi har att tillgå?
2
Förutsättningar för Karolinska Institutet
 Enbart medicinska publikationer
 Enligt FOKUS bör medicin klassas på 5-siffernivå
 Vi har tillgång till MeSH (kontrollerad medicinsk vokabulär)
 Vi har professionella indexerare på biblioteket
 Vi har ett egenbyggt bibliometrisystem baserat på WoS och
Medline (ingen publikationsdatabas)
 Ca 4000 pek per år
 För FOKUS innebär det 2012- 2015 dvs över 16000 publikationer
3
Olika metadata finns som kandidater till
klassificeringsstöd (och eventuell automatisering)
 Forskarens egen ämnestillhörighet enligt SCB/UKÄ
 Mesh-termer
 ISI-klassningar
 Institution (både per forskare och per publikation)
 Abstract/titel
4
• Klassningar per halvtidsvecka:
• Klassningar på en arbetsdag:
• Klassningar på en arbetad timme:
350 publikationer (all time high =479)
150 publikationer (all time high =233)
30 publikationer (all time high =68)
Dvs, det tar ca 7 veckors heltidsarbete
för att indexera ett års publikationer.
Eller ett halvår med två man på halvtid
för att indexera 4 års FOKUS-förberedelse.
Vi klassade totalt 2200 publikationer
från 2013
http://cliparts.co
5
Författarmappning
 KI-författare har valt eget forskningsämne utifrån SCB/UKÄ:s system på 5-siffernivå
6
Ena sidan av myntet
Neurolog
Onkolog
Manuellt
SCB/UKÄklassade till
Onkologi
7
Cancer and Oncology
8
Andra sidan av myntet
Neurolog
Onkolog
Manuellt
SCB/UKÄklassade till
Onkologi
9
Cancer and Oncology
70%
10
Neurologi
Cancer
11
Neurology
52%
23%
12
MeSH-mappning
 Våra indexerare har mappat meshen mot SCB/UKÄ i de fall där det är möjligt
13
Ena sidan av myntet
Onkologi
Neurologi
Manuellt
SCB/UKÄklassade till
Onkologi
14
Cancer and Oncology
15
Andra sidan av myntet
Radiologi
Onkologi
Manuellt
SCB/UKÄklassade till
Onkologi
16
Cancer and Oncology
93%
17
Neurology
18
Neurology
94%
19
Hur fungerar Thomson Reuters tidskriftsklasser?
20
Ena sidan av myntet
Neurologi
Onkolog
Manuellt
SCB/UKÄklassade till
Onkologi
21
Oncology
22
Andra sidan av myntet
Neurologi
Onkologi
Manuellt
SCB/UKÄklassade till
Onkologi
23
Cancer and Oncology
46%
24
Neurosciences
25
Neurology
30%
22%
26
Institutionstillhörighet som proxy?
 En del institutioner har relativt specifika forskningsinriktningar
27
Dentistry
Våra institutioners randighet
28
Mappningstoppen
 Då vet vi allt om Cancer och Neurologi, hur är det med resten då?
29
Andel Mesh-mappade publikationer som klassats till
samma
SCB/UKÄ-klassning
Cancer och onkologi
Kardiologi
Psykiatri
Neurologi
Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi
Neurovetenskaper
Endokrinologi och diabetes
Infektionsmedicin
Hälso- och sjukvårdsorganisation, hälsopolitik och hälsoekonomi
Gastroenterologi
Medicinsk bioteknologi
Immunologi inom det medicinska området
Reumatologi och inflammation
Cell- och molekylärbiologi
Lungmedicin och allergi
Reproduktionsmedicin och gynekologi
Radiologi och bildbehandling
Medicinsk genetik
Urologi och njurmedicin
Farmakologi och toxikologi
Mikrobiologi inom det medicinska området
Pediatrik
Arbetsmedicin och miljömedicin
Näringslära
Oto-rino-laryngologi
Fysiologi
Beroendelära
Publications
246
152
121
114
100
77
75
74
72
70
70
67
60
55
52
51
50
46
42
42
38
36
32
24
23
21
20
Share MeSH
0,93
0,89
0,78
0,95
0,57
0,01
0,53
0,22
0,69
0,81
0,01
0,85
0,00
0,75
0,24
0,66
0,02
0,81
0,17
0,03
0,08
0,00
0,00
0,70
0,75
30
Andel författar-mappade publikationer som klassats till
samma
SCB/UKÄ-klassning
Cancer och onkologi
Kardiologi
Psykiatri
Neurologi
Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi
Neurovetenskaper
Endokrinologi och diabetes
Infektionsmedicin
Hälso- och sjukvårdsorganisation, hälsopolitik och hälsoekonomi
Gastroenterologi
Medicinsk bioteknologi
Immunologi inom det medicinska området
Reumatologi och inflammation
Cell- och molekylärbiologi
Lungmedicin och allergi
Reproduktionsmedicin och gynekologi
Radiologi och bildbehandling
Medicinsk genetik
Urologi och njurmedicin
Farmakologi och toxikologi
Mikrobiologi inom det medicinska området
Pediatrik
Arbetsmedicin och miljömedicin
Näringslära
Oto-rino-laryngologi
Fysiologi
Beroendelära
Publications
246
152
121
114
100
77
75
74
72
70
70
67
60
55
52
51
50
46
42
42
38
36
32
24
23
21
20
share author
0,70
0,66
0,64
0,23
0,78
0,97
0,63
0,57
0,38
0,61
0,29
0,78
0,65
0,76
0,50
0,69
0,40
0,74
0,81
0,60
0,76
0,72
0,84
0,75
0,52
0,38
0,30
31
32
33
34
Två sidor av myntet
Biblioteksklassad till
ämne B
Proxyklassad till
ämne B
35
36