Miniprojektet

Projekt 1: Ett konsultuppdrag
kurs: matematisk modellering med statistiska tillämpningar
18 mars 2015
Uppgift
Nedan finns en förfrågan från en högre chef på ett mindre biotech-företag om
hjälp med att förstå svaret från läkemedelsverket angående en studie som de
skickat in. Svaret antyder att någon på läkemedelsverket inte gör samma tolkning som företaget vad gäller vad studien har gett för resultat.
Uppgiften är att försöka identifiera både hur företaget resonerat och hur
myndigheten resonerat, och sedan lämna en förklaring av de statistiska resultaten i studien till företagsledningen, som antas helt okunnig om hur statistik
verkligen fungerar. I svaret måste du också tänka framåt och föreslå hur man
ska gå vidare i ljuset av myndigheternas svar.
Tänk på att svaret måste vara förklarande för en publik som inte är matematiskt eller statistiskt kunnig – men kanske tror sig behärska statistik.
Förfrågan
Bäste N.N.!
Vi på AllCare AB håller på att utveckla en allergimedicin som går under
arbetsnamnet Zamavica. Vi har nu kommit till stadiet att vi vill planera ett Fas
3-program i syfte att få Zamavica registrerad som en behandling för allergisk
astma. Vi har därför genomfört en Fas 2-studie i syfte att identifiera vilken dos
vi ska använda i Fas 3.
Studien var konstruerad som en parallellgruppsstudie i vilken doserna 20,
40, 80 och 160 mg av Zamavica studerades i patienter som har diagnosen allergisk rhinit (hösnuva) och som var dokumenterat allergiska mot gräs. Studien
var dubbelblind och tillgick så att efter randomisering gick patienterna på sin
behandling i fyra veckor innan de sattes i en EEC (Environmental Exposure
Chamber). I denna utsattes de för gräspollen i luften under 2 timmar och noterade efter en halvtimme, och sedan var halvtimme, vilken grad av symptom
från näsa och ögon de hade. Dessa symptomdata samlades sedan i en “totalscore” som kallas TSS (Total Symptom Score) som fungerar så att en högre
score innebär färre symptom.
Studien genomfördes på tre sjukhus i Belgien varunder data samlades in i
en databas som sedan togs om hand av kontraktsbolaget Metronomica i Berlin.
1
Dessa analyserade data och skrev en rapport i vilken de drog slutsatsen att rätt
dos att undersöka i Fas 3 var 40 mg. De ansåg att studien i detta avseende var
konklusiv.
När vi på AllCare sedan skickade in den av Metronomica skrivna rapporten
till läkemedelsverket fick vi till vår förvåning följande delsvar:
Läkemedelverkets experter anser inte att studien konklusivt visar
att 40 mg är en lämplig dosering av Zamavica, utan ifrågasätter om
inte påtagligt högre doser skulle vara mer lämpade. Studien ger dock
ingen vägledning kring vilken en sådan, högre, dos skulle vara, varför
vi rekommenderar AllCare att noga undersöka möjligheterna av att
skaffa kompletterande information för att möjliggöra ett sådant val.
Vi har kontaktat Metronomica för att höra deras kommentar till detta, men
vill även ha en oberoende bedömning av resultaten, varför vi vänder oss till Er
och ber om hjälp att förstå den uppkomna situationen. Varför drar Metronomica
och läkemedelverket så olika slutsatser från samma data?
Tyvärr har vi av säkerhetsskäl inte möjlighet att sända hela den kliniska
rapporten, men det urval av tabeller som bifogas tror vi utgör basen för de
tolkningar som både Metronomica och läkemedelsverket har gjort.
Vi hoppas verkligen ni kan åta er detta uppdrag, och vore tacksamma för
ett svar så fort möjligt är.
Tabeller
Summary Statistics for TSS means during EEC exposure
Center
1
2
3
All
Dose
20
40
80
160
All
20
40
80
160
All
20
40
80
160
All
All
n
9
8
8
8
33
8
9
8
8
33
8
8
9
8
33
99
Mean
54.1
47.9
43.3
101.7
61.5
18.3
96.1
49.7
67.6
59.1
34.9
40.6
57.8
80.9
53.7
58.1
SD
44.6
52.0
33.9
29.1
45.5
20.4
45.4
42.7
23.7
44.4
42.5
21.3
38.5
37.5
38.7
42.6
2
Min
-7
-18
-19
53
-19
-23
43
-26
39
-26
-25
6
-7
27
-25
-26
Q1
28
-8
24
87
33
9
69
24
52
37
2
23
36
59
27
27
Median
47.9
69.0
45.2
99.9
72.4
23.1
81.3
53.0
62.0
52.9
36.1
47.2
54.8
77.7
54.8
55.8
Q3
73
83
73
120
94
32
115
81
81
81
68
58
89
97
80
84
Max
144
114
80
146
146
41
173
108
111
173
92
64
105
154
154
173
Dose group comparisons
Parameter
40 mg vs 20 mg
80 mg vs 20 mg
160 mg vs 20 mg
160 mg vs 40 mg
Estimate
26.6
14.4
47.1
20.50
95% C.I.
(4.14, 49)
(-8.02, 36.8)
(24.4, 69.7)
(-2.15, 43.1)
P-value
0.021
0.21
<0.0001
0.076
The SD of the ANOVA was 39.6
Summary of Adverse Events (No. of events reported)
Center
1
2
3
All
Dose
20
40
80
160
All
20
40
80
160
All
20
40
80
160
All
All
n
9
8
8
8
33
8
9
8
8
33
8
8
9
8
33
99
Headache
0
1
1
0
2
0
0
0
1
1
1
0
0
1
2
5
Nausea
1
1
1
1
4
0
1
0
0
1
0
0
0
1
1
6
3
GI problems
0
1
2
1
4
0
0
1
0
1
0
1
0
1
2
7
Other
0
2
0
0
2
0
1
0
1
2
0
1
1
0
2
6
Total
1
5
4
2
12
0
2
1
2
5
1
2
1
3
7
24