v1-biokemija.pdf

BOKEMIJA, 1. Letnik, letni semester 2014/15
Izvedba predavanj in seminarjev ter študijskih obveznosti študentov
Predavanja se bodo izvajala po urniku vsak četrtek in petek, od 10.15 ure do 12. ure v
P19 na MF. Predavanja izvajata prof. dr. Uroš Potočnik (11 predavanj po 2 uri, skupaj 22
ur) in prof. dr. Maja Leitgeb (19 predavanj po 2 uri, skupaj 38 ur).
Seminarji se izvajajo v računalniški učilnici 1N24 (26.2., 5.3., 12.3. in 19.3), v vseh
ostalih terminih pa v predavalnici P19, v štirih skupinah po 2 uri.
Tabela: termini za seminarje
Izvajalec
prof. dr. Uroš Potočnik (1x 8 ur)
prof. dr. Maja Leitgeb ( 3x 8 ur)
doc. dr. Mateja Primožič (11 x 8 ur)
Termin
Četrtek 12:15 – 14:00
Četrtek 14:15 – 16:00
Četrtek 16:15 – 18:00
Četrtek 18:15 – 20:00
Skupina
III
II
I
IV
Laboratorijske vaje se izvajajo v Laboratorijskem centru (vajalnica v pritličju) na
Magdalenskem trg 5 v šestih skupinah.
Tabela: Izvajalci vaj, termini izvedbe vaj in skupine
Izvajalec
asist. dr. Katja Repnik
tehnični
sodelavec:
Jurgec
Termin (teden)
vaje 1-14 vse skupine
ur
180
Staša
Vsebina pri predavanjih in seminarjih se povezuje z eksperimentalnimi vajami.
V prvem tednu izvajanja predmeta se pri seminarju študentom razdeli teme za seminarske
naloge. Vsakokrat se pri seminarju obravnavata po 2 temi. Prisotnost študentov na seminarjih
je obvezna. Študenti, ki bodo predvideni za predstavitev seminarja, morajo svoj izdelek
poslati predavatelju in vsem sošolcem v skupini vsaj 1 teden pred predstavitvijo. Vsak
študent-predavatelj bo predstavil svoj seminar v 25-30 minutah, nato sledi še diskusija 15-20
min. Priprava na seminar za vse ostale študente poslušalce je obvezna, v diskusiji vsak
študent postavi vsaj eno vprašanje. Dobra predstavitev vprašanj in sodelovanje v razpravi
lahko prispevajo h končni izpitni oceni.
Prisotnost na laboratorijskih vajah je obvezna – študent mora opraviti vse vaje po tem
programu. Vsak izostanek je potrebno utemeljeno opravičiti. Priprava na laboratorijske vaje
je obvezna in se kontrolira na začetku vaj. Na koncu vaj se izvede kolokvij. Opravljen
kolokvij iz vaj je pogoj za pristop na izpit.
Izpit iz biokemije lahko opravite s tremi pisnimi kolokviji.
1
Na kolokvijih pride v poštev snov, ki je bila podana na predavanjih in seminarjih s strani
predavateljev. V poštev pa ne pride snov iz študentskih seminarjev. Ker želimo spodbuditi
opravljanje izpita iz biokemije s kolokviji, bodo pisni izpiti zajemali celotno snov treh
kolokvijev, vključno s temami študentskih seminarjev.
Izvedba laboratorijskih vaj po tednih
Ponedeljek, 2.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 3.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
Uvod. Navodila za praktikum.
Pisanje dnevnika. Pravila za varno
delo. Biokemijski laboratorij.
Pipetiranje. Centrifuga.
TEDEN 1
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 5.3.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 9.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
Pufri, pKa in HendersonHasselbachovo ravnotežje (glicinski
pufer, titracija šibke kisline z
močno bazo.
16:30 – 19:45 Skupina 2
Pomen pufrov).
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 10.3.2015
TEDEN 2
Četrtek, 12.3.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 16.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 17.3.2015
Reverzibilno in ireverzibilno
obarjanje proteinov (fizikalnokemijski pogoji obarjanja tripsina)
13:00 – 16:30 Skupina 1
TEDEN 3
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 19.3.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
TEDEN 4
Ponedeljek, 23.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
2
Kromatografija
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 24.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
(gelska kromatografija, analiza
frakcij)
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 26.3.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 30.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 31.3.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
TEDEN 5
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 2.4.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
Sprektofotometrično določanje
koncentracije proteinov
(umeritvena krivulja glede na
albumin, določanje koncentracije
proteinov v kromatografskih
frakcijah). Elektroforeza – SDSPAGE.
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 13.4.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 14.4.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
Kvalitativna analiza ogljikovih
hidratov (Mollish, Bradford,
Fehling, jodovica, Benedict,
disaharidi, polisaharidi).
TEDEN 6
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 16.4.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 20.4.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 21.4.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
TEDEN 7
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 23.4.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
3
Kvalitativne reakcije lipidov
(določanje posameznih lipidnih
komponent v jajčnem rumenjaku)
Ponedeljek, 4.5.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 5.5.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
TEDEN 8
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 7.5.2015
Encimi in encimska kinetika
(izvedba kinetike na primeru
encima tripsina, izdelava
standardne krivulje, obdelava
kinetičnih podatkov, določitev Km
in vmax).
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 18.5.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 19.5.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
TEDEN 9
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 21.5.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Ponedeljek, 25.5.2015
13:00 – 16:30 Skupina 5
Celična frakcionacija in izolacija
bioloških molekul
(celična frakcionacija z
ultracentrifugiranjem jetrtnega
tkiva, izolacija mononuklearnih
celic s centrifugiranjem na Ficollu,
analiza frakcij na prisotnost
organelnih markerjev).
Naprednejše biokemijske tehnike.
16:30 – 19:45 Skupina 6
Torek, 26.5.2015
13:00 – 16:30 Skupina 1
TEDEN 10
16:30 – 19:45 Skupina 2
Četrtek, 28.5.2015
12:00 – 15:30 Skupina 3
16:00 – 19:15 Skupina 4
Maribor, 22. 1. 2015.
4
Diskusija vseh vaj in vprašanj iz
skripte, priprava na kolokvij.