Kemi arbejdsark 0.0 Oversigt Der er i alt 17 arbejdsark til Isis A. De er udarbejdet i Word 2003. Formler og figurer i øvrigt er lavet i ISIS Draw 2.5 eller ChemSketch 10.0. 1.1 1.2 1.3 2.1 2.2 2.3 2.4 2.5 2.6 3.1 3.2 4.1 4.2 4.3 5.1 5.2 5.3 Isis A ΔHmo-beregning i regneark Gibbs-energi van’t Hoffs ligning Enheden elektronvolt (eV) Bølgetallet Boltzmann-fordelingen Bohrs atommodel Spektre fra NIST Chemistry WebBook NMR-spektre fra Spectral Database for Organic Compounds Beregning af hvilespænding Beregning af ligevægtskonstant Reaktion af første orden Reaktion af anden orden Aktiveringsenergi Proteiners sidegrupper Kondensation DNA og WeblabViewer Lite © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 1.1 ΔHmo-beregning i regneark På opslag 6 i Isis A er der redegjort for, hvordan en reaktions molare entalpitilvækst kan beregnes: ΔHmo = ΣHmo(produkter) – ΣHmo(reaktanter) Beregningerne er forholdsvis enkle, men alligevel kan det være en god ide at udføre dem i et regneark. Her opbygges et regneark, der kan anvendes for en vilkårlig reaktion, dog med maksimalt 3 reaktanter og 3 produkter. I et regneark laves følgende skema: Generelt reaktionsskema: reak 1 + reak 2 + reak 3 → prod 1 + prod 2 Indgående stoffer: CH4(g) + → CO2(g) + H2O(g) + Koefficienter: Standardentalpier: ΔHmo = 1 -74,25 -802,9 O2(g) 2 0 + 1 -393,51 + prod 3 2 -241,82 kJ/mol I eksemplet er der indtastet oplysninger for en kemisk reaktion. Disse felter skal naturligvis udfyldes på ny, når der er tale om en ny reaktion. Det drejer sig om oplysningerne om Indgående stoffer, Koefficienter og Standardentalpier. I resultatfeltet er der indtastet en formel til beregning af reaktionens molare entalpitilvækst. Det vil være en god ide at indtaste standardentalpier for relevante stoffer i en tabel i regnearket, så de kan kopieres ind i beregningsskemaet herfra. Indtast fx stofferne fra tabellen bagerst i Isis A. Er der behov for flere end 3 reaktanter og/eller produkter kan skemaet naturligvis umiddelbart udvides efter behov. Tilsvarende regneark kan naturligvis laves til beregning af entropitilvækst og tilvækst i Gibbs-energi. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 1.2 Gibbs-energi På opslag 10 i Isis A regnes der på ligevægten: 2 NO2(g) → N2O4(g). Betingelserne for ligevægt er G = Gmin eller ΔG = 0. De to betingelser fører naturligvis til samme resultat. På opslaget regnes der på ΔG. Her regnes på G. Fra starten er der 1,0 mol NO2(g). Beregning af partialtryk for NO2 og N2O4 2 NO2(g) 1,0 mol - x Stofmængde: Eftervis formlerne: 1,0 mol - x p NO = ⋅p 2 1,0 mol - ½ x G-funktionen → N2O4(g) 0 mol ≤ x ≤ 1,0 mol ½x p N 2O 4 = ½x ⋅p 1,0 mol − ½ x Argumenter for formlerne: θ Gm ( NO 2 ) = Gm ( NO 2 ) + R ⋅ T ⋅ ln( p NO2 ) θ Gm ( N 2 O 4 ) = Gm ( N 2 O 4 ) + R ⋅ T ⋅ ln( p N 2O4 ) G ( x) = (1,0 mol - x)G m ( NO 2 ) + ½ x ⋅ Gm ( N 2 O 4 ) Regneark Til brug for graftegning skal der laves et regneark med følgende kolonner (anbring p i et felt for sig selv; start med p lig 1,0 bar): x p NO 2 pN 2 O4 G(NO2) G(N2O4) G(x) 0,001 0,05 0,10 0,15 0,20 : 0,999 Hvorfor kan x lig 0 og 1 ikke anvendes i nogle af formlerne? Graf for G(x) Isis A Tegn i regnearket grafer for G(x) for forskellige værdier af p. Hvad sker der med ligevægtsstillingen, når p varieres? © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 1.3 van’t Hoffs ligning Når man anvender van’t Hoffs ligning, forudsætter man, at ΔHmo og ΔSmo er temperaturuafhængige, selv om både Hmo og Smo afhænger af temperaturen: ln( K ) = − Θ ΔH m 1 ΔS Θ ⋅ + m R T R Vi vil her afprøve, hvor godt dette er opfyldt for fremstillingen af ethanol ud fra ethen og vand: CH2=CH2(g) + H2O(g) → CH3CH2OH(g) Indtast nedenstående termodynamiske data i et regneark. CH2=CH2(g) T/K 300 400 500 600 700 800 900 1000 1100 1200 1300 1400 1500 Hmo/(kJ/mol) 52,341 49,254 46,533 44,211 42,278 40,655 39,310 38,205 37,310 36,596 36,041 35,623 35,327 Smo/(J/mol⋅K) 219,582 233,327 246,198 258,322 269,770 280,559 290,754 300,405 309,556 318,247 326,512 334,384 341,892 H2O(g) T/K 300 400 500 600 700 800 900 1000 1100 1200 1300 1400 1500 Hmo/(kJ/mol) -241,844 -242,845 -243,822 -244,751 -245,620 -246,424 -247,158 -247,820 -248,410 -248,933 -249,392 -249,792 -250,139 Smo/(J/mol⋅K) 188,833 190,158 192,685 195,552 198,469 201,329 204,094 206,752 209,303 211,753 214,108 216,374 218,559 CH3CH2OH(g) T/K 300 400 500 600 700 800 900 1000 1100 1200 1300 1400 1500 Hmo/(kJ/mol) -234,897 -239,826 -243,940 -247,260 -249,895 -251,951 -253,515 -254,662 -255,454 -255,947 -256,184 -256,206 -256,044 Smo/(J/mol⋅K) 282,029 303,076 322,750 341,257 358,659 375,038 390,482 405,075 418,892 431,997 444,448 456,298 467,591 Tegn grafer, der viser, hvordan Hmo, Smo, ΔHmo og ΔSmo varierer som funktion af temperaturen. Hvordan stemmer antagelsen, at ΔHmo og ΔSmo er nogenlunde uafhængige af temperaturen? Beregn ln(K) som funktion af 1/T, idet ΔHmo(300 K) og ΔSmo(300 K) anvendes i van’t Hoffs ligning. Tegn grafen for ln(K) som funktion af 1/T, idet ΔHmo(300 K) og ΔSmo(300 K) anvendes i van’t Hoffs ligning. Beregn ln(K) som funktion af 1/T, idet ΔHmo(T) og ΔSmo(T) anvendes i van’t Hoffs ligning. Tegn grafen for ln(K) som funktion af 1/T, idet ΔHmo(T) og ΔSmo(T) anvendes i van’t Hoffs ligning. Sammenlign de to grafer og kommenter resultatet. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 2.1 Enheden elektronvolt (eV) I Isis A anvendes aJ (10–18 J) som enhed for energi i atomare systemer, idet joule er en del af SI-enhedssystemet. Ofte ser man enheden eV (elektronvolt) anvendt i stedet. 1 eV er defineret som den tilvækst i kinetisk energi, som en elektron får, når den gennemløber en spændingsforskel på 1 V. Af definitionen på spændingsforskel følger: ΔEkin = q ⋅ U = e ⋅ 1 V = 1,6022⋅10–19 C ⋅1 V = 1,6022⋅10–19 J Der gælder altså: Omregning 1 eV = 1,6022⋅10–19 J Fremstil et regneark, der 1. kan omregne fra enheden elektronvolt til enheden joule, og som også beregner tilhørende værdier for frekvens og bølgelængde. 2. ud fra bølgelængde kan beregne frekvens og energi i både elektronvolt og joule. A 1 B C D E F E = 1,00 eV λ = 700 nm E = 0,1602 aJ f= 4,28E+14 Hz f = 2,41E+14 Hz E= 0,2837 aJ E= 1,77 eV 2 3 4 5 Ad punkt 1 λ = 1240 nm Energien i elektronvolt indsættes i B1 Anvendte formler: Celle B3 B4 B5 Formel C2*1,6022E-19*1E+18 C2*1,6022E-19/6,626076E-34 299792458/C5*E+9 Redegør for formlerne. Ad punkt 2 Lav selv formler for E3, E4 og E5. Udvidelse Som 2, men med udgangspunkt i frekvensen Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 2.2 Bølgetallet IR-spektre har normalt bølgetal på 1-aksen; som enhed anvendes cm–1. Bølgetallet er den reciprokke værdi af bælgelængden og betegnes λ–1. Omregning Fremstil et regneark, der 1. kan omregne bølgelængde til bølgetal, frekvens og energi. 2. kan omregne bølgetal til bølgelængde, frekvens og energi. A 1 B C λ = 10000 nm λ–1 = 1000 cm–1 D E –1 F –1 λ = 1000 cm λ= 10000 nm 2 3 4 5 Ad punkt 1 f = 2,998E+13 Hz E= 0,0199 aJ f = 2,998E+13 Hz E= aJ Bølgelængden i nm indsættes i B1 Anvendte formler: Celle B3 B4 B5 Formel 1/B1/1E-7 299792458/B1/1E-9 6,626076E-34*B4*1E+18 Redegør for formlerne. Ad punkt 2 Lav selv formler for E3, E4 og E5. Udvidelse Som 1, men med udgangspunkt i frekvensen Isis A 0,0199 © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 2.3 Boltzmann-fordelingen Den østrigske fysiker Ludwig Eduard Boltzmann (1844-1906) opstillede på baggrund af statistiske overvejelser en fordel, der kan anvendes til at bestemme, hvordan fx molekyler i en gas fordeler sig energimæssigt mellem to energitilstande Ehøj og Elav ⎛ E høj – E lav ⎞ ⎟⎟ = exp⎜⎜ – N lav k ⋅T ⎝ ⎠ Nhøj er antallet af molekyler med energien Ehøj, og Nlav er antallet af molekyler med energien Elav. k er boltzmann-konstanten, der har værdien 1,381⋅10–23 J/K, og T er den absolutte temperatur. N høj IR-spektroskopi Det fremgår af formlen, at befolkningen af energitilstande falder eksponentielt, idet den laveste tilstand har den største befolkning. Inden for IR-spektroskopi er den laveste tilstand og den anslåede tilstand normalt den først anslåede tilstand. Beregn, hvordan 100 CO2-molekyler vil være fordelt mellem vibrationsgrundtilstanden og første anslåede tilstand ved 298 K, når bølgetallet for overgangen mellem de to tilstande er 667 cm–1. NMR-spektroskopi Formlen kan også anvendes til at beregne, hvordan 1Hkernerne fordeler sig mellem at være parallelle med magnetens felt og modsat rettede. Beregn, hvordan 100 1H-kerner vil være fordelt mellem de to tilstande ved 298 K, når spektrometerfrekvensen er 100 MHz. Andre formler Isis A E høj – E lav = h ⋅ f = h ⋅ © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S c λ Kemi arbejdsark 2.4 Bohrs atommodel Ifølge Bohrs atommodel kan energien for de enkelte skaller i hydrogenatomet bestemmes efter formlen: 1 1 E n = – h ⋅ c ⋅ R ⋅ 2 = –2,179 aJ ⋅ 2 n n Her er h Planck-konstanten, c er lysets hastighed, og R er Rydberg-konstanten (altså her ikke den molare gaskonstant). Her tjekkes, at kun 4 overgange giver anledning til synligt lys. Regneark Fremstil et regneark, der 1. Beregner energien for de ti laveste stationære tilstande. 2. Beregner bølgelængden for to udvalgte overgange. A B C D E 1 n En/aJ 2 1 3 -2,179 nlav = 2 Elav = -0,54475 aJ 2 -0,54475 nhøj = 3 Ehøj = -0,06053 aJ 4 3 -0,06053 5 4 -0,00378 6 5 -0,00015 λ = F G 411 nm Beregning Vis, at h⋅c⋅R er lig med 2,179 aJ. Indtastning Skalnumrene indtastes i D2 og D3; det laveste nummer øverst. Formler Celle F2 F3 D5 Formel SUM.HVIS(A$2:A$11;D2;B$2:B$11) SUM.HVIS(A$2:A$11;D3;B$2:B$11) 6,63E-34*3E+8/((F3-F2)*1E-18)*1E+9 Redegør for formlerne og foretag beregningerne op til n lig 10. Synligt lys Isis A Brug regnearket til at finde ud af, hvilke overgange der giver bølgelængder i det synlige område fra 400 nm til 700 nm © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 2.5 Spektre fra NIST Chemistry WebBook Det er muligt via internettet at hente spektre og andre oplysninger for en lang række kemiske forbindelser fra Spektre fra NIST Chemistry WebBook. Blandt andet er der UV/VIS-spektre og IR-spektre for mange af de organiske forbindelser, der arbejdes med i kemiundervisningen. Stofferne kan fx findes ud fra deres (engelske) navn, molekylformel eller strukturformel. Her søges der efter oplysninger for benzen. Web-adresse NIST Chemistry WebBook er på http://webbook.nist.gov/chemistry Molekylformel På NIST Chemistry WebBook’s startside klikkes under punktet Search Options på Formula. Så kommer siden: Search for Species Data by Chemical Formula For at finde data for benzen, skal der under punkt 1 tastes: C6H6. Hvis der er IR-spektret, der ønskes, sættes der under punkt 4 et flueben i feltet IR spectra. Endelig klikkes der under punkt 5 på Search. Så kommer siden: Search Results Der er flere stoffer i databasen med molekylformlen C6H6. Klik på Benzene for at få benzens data. På siden med benzens data er mulighed for at se to forskellige IR-spektre; vælg spektret for en opløsning af benzen. Det er også muligt at se benzens UV/VIS-spektrum; det sker ved at klikke på UV/Visible Spectrum. Navn (engelsk) På NIST Chemistry WebBook’s startside klikkes under punktet Search Options på Name. Så kommer siden: Search for Species Data by Chemical Name Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S For at finde data for benzen, skal der under punkt 1 tastes: benzene. Det engelske navn fremkommer ofte, som her, ved at tilføje et e til det danske navn. Herefter fortsættes som ovenfor. Strukturformel På NIST Chemistry WebBook’s startside klikkes under punktet Search Options på Structure. Så kommer siden: Search for Species Data by Structure or Substructure Klik under punkt 1 på Use applet to draw a structure. Så kommer der en side, hvor (hvis pc’en kan køre en Java-applet) man har mulighed for at tegne en strukturformel. Hvordan det gøres er forklaret nederst på siden. For benzens vedkommende er det let. Klik på Template, klik på strukturformlen for benzen, klik et sted i tegnefeltet og klik til sidst på Done. Nu fremkommer et Java-applet-vindue, hvor der klikkes på OK. Nu kommer siden Search Results. Klik på Benzene for at få benzens data. Andre spektroskopiske oplysninger Ud over at se spektre er det også muligt at få hjælp til tilordningen. Det sker ved under punktet Information on this page at klikke på Vibrational and/or Electronic Energy Levels. Sammenlign oplysningerne i kolonnen Infrared med den tilordning af benzens IR-spektrum, der findes på side 47 i Isis A. Under Notes er der forklaringer på de symboler, der optræder. Andre oplysninger Se siden med oplysninger om benzen igennem for andre relevante oplysninger. Andre stoffer Udvælg selv andre stoffer, eventuelt nogle af dem, der er omtalt i Isis A. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 2.6 NMR-spektre fra Spectral Database for Organic Compounds Det er muligt via internettet at hente NMR-spektre og andre oplysninger for en lang række kemiske forbindelser fra Spectral Database for Organic Compounds. Blandt andet er der 1H-NMR-spektre og 13C-NMR-spektre for mange af de organiske forbindelser, der arbejdes med i kemiundervisningen. Stofferne kan fx findes ud fra deres (engelske) navn eller molekylformel. Her søges der efter oplysninger for 1,3,5-trimethylbenzen. Web-adresse Spectral Database for Organic Compounds har web-adressen: http://www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/ For at få adgang skal man love at anvende databasen på en hensynsfuld måde, fx bør man højst hente 50 spektre pr. dag. Klik på I agree the disclaimerand use SDBS. Molekylformel Der fremkommer nu en side, hvor man kan indtaste søgeoplysninger. For at finde data for 1,3,5-trimehylbenzen tastes C9H12 i feltet Molecular Formula. Dernæst klikkes på Search. Så kommer siden: SDBS Search Results Siden viser en række stoffer, der alle har molekylformlen C9H12. Klik på det nummer til venstre, der ud for mesitylene, der er det samme som 1,3,5-trimehylbenzen. Hvis der er 1H-NMR-spektret, der ønskes vist, vælges dette i spalten til venstre på siden med oplysninger om 1,3,5trimehylbenzen. I ruden til højre vises øverst 1H-NMR-spektret. Nedenunder vises strukturformelen for 1,3,5-trimehylbenzen. Endelig er tilordningen af linjerne i spektret angivet. Sammenlign med oplysningerne side 59 i Isis A. Yderligere oplysninger om spektret fås ved at klikke på peak data. Hvilken spektrometerfrekvens er der anvendt? Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Navn (engelsk) Klik på Return to Search. Skriv i 1,3,5-trimehylbenzene feltet Compound Name. Det engelske navn fremkommer ofte, som her, ved at tilføje et e til det danske navn. Når man som her skriver et entydigt navn på det stof, der søges oplysninger om, er der kun et hit. Klik på nummeret til venstre eller på Y under HNMR. Herefter fortsættes som ovenfor. 13C-NMR-spektret Prøv også at få vist 13C-NMR-spektret af 1,3,5-trimehylbenzen. Sammenlign med oplysningerne side 71 i Isis A. IR-spektret Prøv også at få vist IR-spektret af 1,3,5-trimehylbenzen. Andre stoffer Udvælg selv andre stoffer, eventuelt nogle af dem, der er omtalt i Isis A. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 3.1 Beregning af hvilespænding Hvilespændingen for en elektrokemisk celle beregnes ud fra Nernst-ligningen: R ⋅T Θ ln(Y ) = e h – e v U0 = U0 − z⋅F Her fremstilles et regneark, der beregner hvilespændingen ud fra en tabel med standardelektrodepotentialer. Fremstil et regneark, der kan beregne hvilespændingen for en elektrokemisk celle ud fra tabellen i kolonnerne A til C. Kelvintemperatur, antal overførte elektroner, koncentrationerne i hver af halvcellerne skal indtastes. Desuden skal angives nummeret på hver af de to redoxpar, hvorefter regnearket selv finder standardelektrodepotentialet i tabellen. Regnearket 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 A nr. 1 2 3 4 5 6 7 9 10 B redoxpar Au+/Au Ag+/Ag Cu2+/Cu Fe3+/Fe2+ Fe2+/Fe Zn2+/Zn Al3+/Al Na+/Na Li+/Li Indtastninger C e°/V 1,692 0,800 0,340 0,770 -0,440 -0,762 -1,676 -2,710 -3,040 D E F T= z= nr. 3 6 Uo = G H [Mz+] 0,25 0,25 e/V 0,322 -0,780 298 K 2 Uo°/V 0,34 -0,762 1,102 V Kelvintemperaturen indtastes i F1, antal overførte elektroner i F2, mens koncentrationerne i hver af halvcellerne skal indtastes i G5 og G6. Numrene på redoxparrene i de to halvceller, der er angivet i tabellen, indtastes i E5 og E6; det laveste nummer øverst. Formler Isis A Celle Formel F5 SUM.HVIS(A$2:A$10;E5;C$2:C$10) F6 SUM.HVIS(A$2:A$10;E6;C$2:C$10) H5 F5-(8,314*$F$1/$F$2/96485)*LN(1/G5) H6 F6-(8,314*$F$1/$F$2/96485)*LN(1/G6) F8 H5-H6 Redegør for formlerne. © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 3.2 Beregning af ligevægtskonstant Ligevægtskonstanten for en redoxreaktion kan beregnes ud fra elektrokemiske data: ⎛ z⋅F Θ⎞ K = exp⎜ U0 ⎟ ⎝ R ⋅T ⎠ Her fremstilles et regneark, der beregner ligevægtskonstanten ud fra en tabel med standardelektrodepotentialer. Fremstil et regneark, der kan beregne ligevægtskonstanten for en elektrokemisk celle ud fra tabellen i kolonnerne A til C. Kelvintemperatur og antal overførte elektroner skal indtastes. Desuden skal angives nummeret på hver af de to redoxpar, hvorefter regnearket selv finder standardelektrodepotentialet i tabellen. Regnearket 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 A nr. 1 2 3 4 5 6 7 9 10 B redoxpar Au+/Au Ag+/Ag Cu2+/Cu Fe3+/Fe2+ Fe2+/Fe Zn2+/Zn Al3+/Al Na+/Na Li+/Li Indtastninger C e°/V 1,692 0,800 0,340 0,770 -0,440 -0,762 -1,676 -2,710 -3,040 D E F T= z= nr. 3 6 G H 298 K 2 Uo°/V 0,34 -0,762 Uo° = K= 1,102 V 1,97E+37 Kelvintemperaturen indtastes i F1, antal overførte elektroner i F2. Numrene på redoxparrene i de to halvceller, der er angivet i tabellen, indtastes i E5 og E6; det laveste nummer øverst. Formler Celle E5 E6 F8 F10 Formel SUM.HVIS(A$2:A$10;E5;C$2:C$10) SUM.HVIS(A$2:A$10;E6;C$2:C$10) F5-F6 EKSP((F2*96485)*F8/(8,31*F1)) Redegør for formlerne. Udvidelse Isis A Lav også en formel til beregning af tilvæksten i Gibbs-energi. © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 4.1 Reaktion af første orden Betragt en reaktion af første orden af typen: A → produkter Der gælder følgende hastighedsudtryk: v = k⋅[A] Det integrerede hastighedsudtryk er: [A] = [A]0 ⋅ e – k⋅t Der er følgende sammenhæng mellem halveringstid og hastighedskonstant: T½ = ln(2) k Her fremstilles et regneark, der bl.a. viser (t,[A])-grafen for en reaktion af første orden. Regneark Til brug for graftegning skal der laves et regneark med følgende indhold: A 1 B k = 0,069315 s C D E [A]/M %A tilbage F –1 2 [A] = 1,00 M 3 T½ = 10 s 4 5 t/s 6 0×T½ 0,00 2 100 7 1×T½ 10,00 1 50 8 2×T½ 20,00 0,5 25 9 3×T½ 30,00 0,25 12,5 10 4×T½ 40,00 0,125 6,25 11 5×T½ 50,00 0,0625 3,125 12 6×T½ 60,00 0,03125 1,5625 13 7×T½ 70,00 0,015625 0,78125 14 Formler Alle beregninger foretages ud fra indholdet i cellerne B1 og B2. Desuden skal starttidspunktet angives i B6. De anvendte formler er: Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Celle C6 D6… B7… C7… Formel B2 C6/$B$2*100 B6+$B$3 $C$6*EKSP(-$B$1*B7) (t,[A])-graf Anvend de beregnede værdier til fremstilling af en (t,[A])-graf. Hvilken betydning har værdien af [A]0 for grafens udseende? Hvilken betydning har værdien af k for grafens udseende? Lav formlerne i regnearket om, så det er halveringstiden, der kan indtastes, i stedet for hastighedskonstanten. (t,ln([A]))-graf Føj en kolonne til regnearket, hvor ln([A]) beregnes. Anvend de beregnede værdier til fremstilling af en (t,ln([A]))graf. Kommentér grafens udseende. Alternativt kan man i stedet for at beregne ln([A]) ændre formateringen af 2-aksen for den første (t,[A])-grafen til en logaritmisk skala. Prøv det. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 4.2 Reaktion af anden orden Betragt en reaktion af anden orden af typen: A → produkter Der gælder følgende hastighedsudtryk: v = k⋅[A]2 1 1 = + k ⋅t [A] [A]0 Der er følgende sammenhæng mellem halveringstid og hastighedskonstant: 1 T½ = k ⋅ [A]0 Det integrerede hastighedsudtryk er: Her fremstilles et regneark, der bl.a. viser (t,[A])-grafen for en reaktion af anden orden. Regneark Til brug for graftegning skal der laves et regneark med følgende indhold: A B C D –1 –1 1 k= 1,00 M s 2 [A]0 = 1,00 M 3 4 t/s [A]/M %A tilbage 5 0×T½ 0 1,000 100,00 6 1×T½ 1 0,500 50,00 7 2×T½ 2 0,333 33,33 8 3×T½ 3 0,250 25,00 9 4×T½ 4 0,200 20,00 10 5×T½ 5 0,167 16,67 11 6×T½ 6 0,143 14,29 12 7×T½ 7 0,125 12,50 13 8×T½ 8 0,111 11,11 14 9×T½ 9 0,100 10,00 15 10×T½ 10 0,091 9,09 18 t/s [A]/M %A tilbage 19 20 0,048 4,76 16 17 Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S E F Formler Alle beregninger foretages ud fra indholdet i cellerne B1 og B2. Desuden skal starttidspunktet angives i B5. De anvendte formler er: Celle A6 A7… B5… C5… Formel 1/(D1*D2) A6+$A$6 (1/$D$2+$D$1*A5)^-1 B5/$D$2 Nederst i tabellen kan beregningerne foretages for et vilkårligt tidspunkt, i eksemplet 20 s. De anvendte formler er: (t,[A])-graf Celle B19 C19 Formel (1/$D$2+$D$1*A19)^-1 B19/$D$2 Anvend de beregnede værdier til fremstilling af en (t,[A])-graf. Hvilken betydning har værdien af [A]0 for grafens udseende? Hvilken betydning har værdien af k for grafens udseende? (t,[A]–1)-graf Føj en kolonne til regnearket, hvor [A]–1 beregnes. Anvend de beregnede værdier til fremstilling af en (t,[A]–1)-graf. Kommentér grafens udseende. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 4.3 Aktiveringsenergi Den tyske kemiker Max Bodenstein offentliggjorde i 1920 resultater af sine undersøgelser af reaktionen: NO(g) + ½ O2(g) → NO2(g) Bodenstein fandt, at reaktionen følger hastighedsudtryk: v = – d[NO] = k ⋅ [O 2 ] ⋅ [NO]2 dt Bodenstein bestemte hastighedskonstanten ved en række temperaturer: t/°C – 50 – 45 – 25 0 20 50 k 0,130 0,122 0,0795 0,0612 0,0494 0,0358 75 0,0265 Ud fra disse data kan aktiveringsenergien, Ea, bestemmes. k har i dette tilfælde en lidt speciel enhed, men den er uden betydning for beregningen af aktiveringsenergien. Regneark Til brug for beregningen af aktiveringsenergien fremstilles følgende regneark: A B C D E F t/°C T/K T–1/K–1 k ln(k) -50 0,1300 -45 0,1220 -25 0,0795 0 0,0612 20 0,0494 50 0,0358 75 0,0265 Lav formler og beregn værdierne for T, T–1 og ln(k) (T–1,ln(k))-graf Anvend disse værdier til fremstilling af en (T–1,ln(k))-graf. Omskriv Arrhenius-ligningen, så den kan forklare (T–1,ln(k))grafens udseende. Bestem ligningen for tendenslinjen og dernæst aktiveringsenergien. Hvordan kan den negative aktiveringsenergi forklares? Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Max Bodenstein undersøgte også reaktionen: 2 HI(g) → T/K k/Ms–1 (T–1,ln(k))-graf 550 3,13⋅10–6 H2(g) + I2(g) 625 7,90⋅10–5 700 3,20⋅10–3 830 0,10 Anvend disse værdier til fremstilling af en (T–1,ln(k))-graf. Omskriv Arrhenius-ligningen, så den kan forklare (T–1,ln(k))grafens udseende. Bestem ligningen for tendenslinjen og dernæst aktiveringsenergien. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 5.1 Proteiners sidegrupper Alle proteiner er opbygget af aminosyre, således også proteinmolekylerne i cellemembranen. Næsten alle aminosyrerne, der indgår i proteiner, indeholder en aminogruppe og en syregruppe og kan angives med strukturformlen: H R O C C O NH2 H Sidegruppen R kan være polær, upolær, basisk eller sur. Polær eller upolær Afgør hvilke af følgende aminosyrer, der har en polær sidegruppe og hvilke der har en upolær. Afgørelsen skal begrundes. O O OH OH HO OH NH2 NH2 serin (ser) threonin (thr) * O O OH OH NH2 NH2 glycin (gly) alanin (ala) O O OH OH NH2 NH2 isoleucin (ile) * phenylanalin (phe) * O O OH NH2 HO tyrosin (tyr) Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S O OH NH2 NH2 asparagin (asn) Sur eller basisk Afgør hvilke af følgende aminosyrer, der har en sur sidegruppe og hvilke der har en basisk. Afgørelsen skal begrundes. O O O OH OH O HO OH NH2 NH2 asparaginsyre (asp) H2N glutaminsyre (glu) O O N OH NH2 OH N H lysin (lys)* NH2 histidin (his) Molekylformel og strukturformel Tegn den type strukturformel for lysin, der viser alle carbonatomer og alle hydrogenatomer. Bestem herudfra molekylformlen for lysin. Dipeptid Tegn strukturformlen for et dipeptid sammensat af to molekyler cystein (cys). Disulfidbinding I proteiner kan der dannes en disulfidbinding mellem sidegrupperne på to cysteinenheder: –CH3–S–S–CH3– Lav en strukturformel, der viser denne disulfidbinding mellem sidegrupperne på to cysteinenheder. Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 5.2 Kondensation Formelt dannes et disaccharid ved en kondensationsreaktion mellem to monosaccharider, fx 6 6 CH2OH 5 O H H 4 H 3 OH 2 H + H 4 OH 3 H α -D-glucopyranose O H 1 OH OH 5 H 4 OH 2 OH α -D-glucopyranose OH H H OH H 3 H ' CH2OH CH2OH O H 1 OH OH 5 H 6 6 CH2OH H ' 4 1 H O 2 ' 5 O H OH ' 3 H OH H H α ' 1 ' OH OH + 2 α-maltose α (4-O- -D-glucopyranosyl-α -D-glucopyranose) H2O Formelt dannes et dipeptid ved en kondensationsreaktion mellem to aminosyrer, fx R R H C C OH + N O H2 Byg modeller H N C C OH H H O R R H C C N C C OH + H2O N O H H O H2 1 Byg 2 molekylmodeller af α-D-glucopyranose, som er ringformen af D-glucose. Byg de to modeller sammen i en kondensationsreaktion. Byg alle klassens modeller sammen til amylose. (Opslag 54 i Isis B) Byg alle klassens modeller sammen til cellulose. (Opslag 54 i Isis B) 2 Byg molekylmodeller af aminosyrerne met, gly, pro og his. Byg modellerne sammen med peptidbindinger i en kondensationsreaktion, som det foregår i det udsnit af proteinsyntesen vist på figuren side 167 i Isis A. Spørgsmål Hvilken rolle spiller ATP i de to kondensationsreaktioner? Hvorfor står der ”Formelt dannes…” i teksten ovenfor? Hvilken reaktionstype er den modsatte af en kondensation? Isis A © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S Kemi arbejdsark 5.3 DNA og WeblabViewer Lite Med programmet WeblabViewer Lite, der er et freeware-program, er det muligt at undersøge molekylers rumlige struktur. Med programmet følger en række molekylfiler; andre kan findes på internettet. Web-adresse WeblabViewer Lite kan fx downloades fra: http://www.scalacs.org/TeacherResources/ Installation Når programmet er downloaded skal det installeres. C60-fulleren Start med at åbne filen BuckyBall, som viser C60-fulleren. Prøv ved hjælp af musen (eller andet) at dreje molekylmodellen. Vælg dernæst Window/New Hierachy Window. Det bevirker, at der dannes et nyt vindue (hierarkivinduet), der viser alle molekylets bestanddele, når man klikker på plusset ud for BuckyBall. I dette tilfælde er dette overskueligt, da der er tale om 60 carbonatomer. Klik fx på C40 og dette carbonatom fremhæves i vinduet til højre. DNA Åbn filen DNA. Vælg igen Window/New Hierachy Window. I hierarkivinduet angives nu de to nucleinsyrekæder. For hver nukleinsyrekæde er rækkefølgen af nucleotider angivet. For hver nucleotid kan man se de enkelte atomer, der indgår. Prøv at højreklikke i vinduet, der viser DNA-molekylet. Afprøv de forskellige visninger. Sammenlign med opslag 65 i Isis A og find de fire baser, der optræder i nucleotiderne i DNA. Filer fra IsisDraw eller ChemSketch Isis A Det er muligt i WeblabViewer Lite at vise molekyler der er tegnet i de meget anvendte kemiske tegneprogrammer IsisDraw og ChemSketch. © Hans Birger Jensen og Forlaget Systime A/S
© Copyright 2024