Fastsetting av brytningspunkt og metoder for resistensbestemmelse

Fastsetting av brytningspunkt ved
resistensbestemmelse
Villtypepopulasjon, Mikrobiologiske,
Farmakologiske og kliniske kriterier
Martin Steinbakk
Avdeling for bakteriologi og infeksjonsimmunologi
Divisjon for smittevern
FHI, AFA
Forelesning AFA-kurs 2015
Antibiotikaresistens og resistensbestemmelse.
Noen begreper
•
•
MIC
MBC
•
Agardiffusjon (hemningssone i mm)
Minimum inhibitory concentration
Minimum bactericidal concentration
Resultatet tolkes som S, I eller R
– Sensitiv
• Midlet er aktivt ved vanlig dosering (tolkning: det er stor sannsynlighet for at
mikroben vil svare på terapi med midlet)
– Resistent
• Midlet er ikke aktivt mot mikroben (tolkning: det er liten sannsynlighet for at
mikroben vil svare på terapi med midlet)
– Intermediært følsom (el. usikkert resultat)
• Midlet er aktivt dersom det kan gis høye doser eller midlet konsentreres i
infeksjonsfokus
• Usikkert resultat (teknisk ”buffersone”)
Resistensbestemmelse
•
MIC-bestemmelse
– Buljong-fortyning med MH (micro broth dilution)
• Referansemetode for resistensbestemmelse (ISO 20776-1 Part 1: Reference method
for testing the in vitro activity of antimicrobial agents against rapidly growing
aerobic bacteria involved in infectious diseases), 2006
– Agar-fortynning
– Agar-gradientdiffusjon (Etest®, MIC Test Strip, MICE®)
– Beregnet ”IC” (fra brytningspunkt-metoder og automatiserte systemer)
•
Agar-diffusjon
– Standard betingelser og gode tolkningskriterier (ie. EUCAST disk diffusion)
– Ficks diffusjonslover
• Beregnet ”IC” (fra regresjonsligning)
•
Resultatet tolkes som S, I eller R
Sammenhengen mellom
mm hemningssone og MIC
•
Fick’s diffusjonslov
– Diffusjonskonstanten for et middel bestemmes av molekylstørrelse og mediets
viskositet
– Temperatur
•
Dannelse av hemningssone
– IC (inhibitory concentration)
– Kritisk tid (avhengig av inokulat og veksthastighet)
•
•
Antibiotikakonsentrasjonen i agaren er omvendt proporsjonal med kvadratet
av avstand fra diffusjonsentrum.
For de fleste mikrober og antibiotika finnes det en IC som akkurat hemmer
veksten og her vil hemningssonen dannes.
– Litteratur: Bakteriologiske undersøkelsesmetoder Kapittel 38, s 355-395. FADL,s
Forlag 1979
EUCAST suggested updated definitions 2015
Hvordan bestemmer vi bakteriers følsomhet for
antibiotika?
– Villtype-populasjoner
– Resistensmekanismer
– Definere følsomme og resistente populasjoner
– Farmakokinetikk og farmakodynamikk (PK/PD)
– Mikrobiologisk respons
– Klinisk respons
• Tolkning baseres på brytningspunkt (BP)
– S, I eller R
• som indikerer sannsynlighet for et gitt utfall
Wild type MIC distributions of target organisms
and epidemiological cut-off values
Wild type (WT) - EUCAST definition
A micro-organism is defined as wild type (WT) for a
species by the absence of acquired and mutational resistance
mechanisms to the drug in question.
A micro-organism is categorized as wild type (WT) for a
species by applying the appropriate cut-off value in a defined
phenotypic test system.
The cut-off value will not be altered by changing
circumstances
Wild type micro-organisms may or may not respond
clinically to antimicrobial treatment.
E.coli and ciprofloxacin in ECO•SENS
The tentative epidemiological breakpoint
25
Canada
20
25
15
15
10
10
5
Sweden
20
5
0
0
5
10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70
25
Spain
20
0
0
25
15
10
10
5
5
0
0
5
10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70
Slide by Gunnar Kahlmeter
10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70
E.coli ATCC 25933 vs Ciprofloxacin 10 µg
20
15
0
5
0
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
70
S
.a
u
r
e
u
s-c
lin
ic
a
l is
o
la
te
sv
sS
.a
u
r
e
u
sA
T
C
C
2
9
2
1
3
1
2
5c
lin
ic
a
lis
o
la
te
sv
s
.1
2
5d
e
te
rm
in
a
tio
n
so
fo
n
ety
p
es
tra
in
3
6
3
3
3
0
2
7
S
.a
u
r
e
u
s-c
lin
ic
a
lis
o
la
te
s
S
.a
u
r
e
u
sA
T
C
C2
9
2
1
3
2
4
Noofobs
2
1
Linezolid
1
8
1
5
1
2
9
6
3
0
0
5
1
0
1
5
2
0
Z
o
n
ed
ia
m
e
te
r(m
m
)
Slide by Gunnar Kahlmeter
2
5
3
0
3
5
4
0
Hvordan karakterisere mikrobers antibiotikafølsomhet?
– Påvise resistensmekanisme
– Populasjonsstudier (histogram) kan skille følsom
og resistent bakteriepopulasjon
– Helbredelse versus MIC
• Mikrobiologisk effekt (mikroben blir borte)
• Klinisk effekt (pasienten blir bra)
Clinical
classification
Susceptible
Intermediate
Resistent
No. of isolates
MIC
Low
High
Susceptible
Microbiological
classification
Resistant
Low-level
Intermediate
High-level
Hypotethical distribution of MICs among strains of bacteria from infected patients classified as
Clinically suscpetible, Intermediate or Resistant and Microbiologically Susceptible or Low-level,
Moderately or Hig-level Resistant
Påvisning av resistensfaktor
påvisning av resistens-gen eller resistens-protein
• Enkelt faktor som gir resistens
– Penicillinase hos S. auerus og andre mikrober (penicillinaseømfindtlige penicilliner)
– mecA-protein hos S. aureus (penicilliner, cefalosporiner og
karbapenemer)
– rpoB-gen hos M. tuberculosis (rifampicin)
• Samspill mellom flere faktorer (i samme gen eller mellom ulike gener)
gir samlet høy MIC-verdi
– Kinolonresistens (ofte flere mutasjoner i gyrA, parC eller andre gener
(qnr) )
– Efflux (gir ofte lavgradig resistens når eneste faktor)
– Porintap (kan gi både lavgradig og høygradig resistens)
BP – basert på MIC-fordeling (populasjonsbasert)
• Godt egnet ved bimodal fordeling med god separasjon av
følsom og resistent populasjon (eller unimodal fordeling
som for S. pyogenes og penicillin)
• Reduserer metodefeil ved resistensbestemmelse
• Skiller følsom vill-type populasjonen (WT) fra annen og
mer resistent populasjon
• Bør danne basis for følsomhetskategorisering ved
diffusjonsmetode
NORM Blood cultures E. coli 2002 (n=959)
BP- basert på farmakokinetikk og
farmakodynamikk
• Farmakokinetikk og dyreeksperimentelle studier viser
antibiotikas (og bakterienes) skjebne i vev (oftest hos
mus)
• Tar også i betraktning ulike vertsfaktorer for å bestemme
brytningspunkt (f. eks. må serumkonsentrasjonen av
beta-laktamantibiotika overstige MIC i 40-50% av
doseintervallet)
• Tar ikke hensyn til fordeling av bakteriepopulasjonen og
kan introdusere metodefeil (BP som deler villtypepopulasjonen)
Pharmakodynamic parameters for Ciprofloxacin
Enterobacteriaceae
fAUC/MIC
bacteriostasis
P. aeruginosa
30-40
fAUC/MIC
2 log drop
80-100
fAUC/MIC
clinical data
80-100
Cmax/MIC
12.2
S. pneumoniae
30-40
100
EUCAST Rational document Ciprofloxacin v 1.9
30-40
fAUC/MIC
Probabilities of Target Attainment (PTA) for 500 mg x 2 oral
200
180
160
140
120
100
80
60
40
20
0
0.25
Ciprofloxacin 500 mg x 2 oral
95% percentile
99% percentile
mean
2 teoretiske mål
(target attainment),
35 og 20
0.5
1
2
4
8
MIC mg/L
The following pharmacokinetic parameters were used to obtain the PTA: Volume of Distribution
(Vd): 180L, CV 17% Clearance (Cl): 31 L/h, CV 17%Fraction unbound (Fu): 70% Absorption
rate coefficient (Ka): 2h-1 Bioavailability (F): 0.8, CV 12 % Results of simulations for the 400
mg x 2 iv dose do not markedly influence conclusions.
EUCAST Rational document Ciprofloxacin v 1.9
200
180
160
140
120
100
80
60
40
20
0
0.25
ciprofloxacin 500 mg q12h oral
fAUC/MIC
fAUC/MIC
4. Using available Pk/Pd data, Monte Carlo simulations are performed and a Pk/Pd
breakpoint calculated based on conventional dosing regimens
99% CI
Average
0.5
1
2
4
8
MIC mg/L
S < 0.25 mg/L
For S. pneumoniae
200
180
160
140
120
100
80
60
40
20
0
0.25
levofloxacin 500 mg q24h oral
99% CI
Average
0.5
1
2
MIC mg/L
Pk/Pd
S < 1 mg/L
4
8
4. Using available Pk/Pd data, Monte Carlo simulations are
performed and a Pk/Pd breakpoint calculated
based on conventional dosing regimens
S < 0,125
mg/l
R > 2 mg/l
BP– basert på bakteriologisk respons
• Proof of the pudding?
– Mikroben forsvinner
• hvordan har pasienten det?
– Oppfølgende prøve er ofte vanskelig el. uetisk å få
tatt
– Hvilken mikrobe er årsak til infeksjonen?
• Luftveisinfeksjoner
– Må baseres på gode kvantitative data (mm eller
MIC) – SIR-kategorier ikke godt nok
Sammenheng mellom mikrobiologisk respons og MIC ved nosokomial
pneumoni – et eksempel
BP – basert på klinisk respons
• Proof of the pudding?
– Pasienten blir bra av infeksjonen, men hva skjedde med
mikroben og hadde antibiotika noe med resultatet å gjøre
• F. eks LVI, H. influenzae og makrolider
• Det er jo bakterien vi måler (resistens-bestemmer) og ikke
egenskaper ved pasienten
– Vanskelig å skaffe gode data
– Krever gode kvantitative resistensdata
– Slike data er avgjørende for evaluering av behandlingseffekt (og
indirekte resultat av resistensbestemmelse)
Relationship Between Ciprofloxacin AUC:MIC and Efficacy in Treating
Bacterial Pneumonia
Forrest, AAC 37:1073.
Percent
Clinical Cure
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
0-62.5
Eradication
62.5-125 125-250 250-500
24 hr AUC:MIC
>500
NF-M 2001
Dicloxacillin dose vs. Time > MIC of free (non-proteinbound) concentration
Dose
1gx3
1gx4
2gx3
2gx4
Time > MIC
in h
in % of dosing interval
1.8 – 2.8
-2.4 – 3.6
--
23 - 35 %
30 - 47 %
30 - 45 %
40 - 60 %
T½ = 0.6-0.8 h; Vd= 0,13- 0,19 l/kg; Prot.bind.= 91-98 %; MIC-s.a.= 0,4
Treatment and outcome of S. aureus bacteremia:
A prospective study of 278 cases
Jensen AG et al. Arch Intern Med, 2002, 162: 25-32.
+ Risk
-Risk factor Univariate
factor
Died/total,%
Died/total,%
P
Focus not
eradicated
42/125
34%
4/61
7%
7.2
<0.001
Septic
shock
18/38
47%
28/148
19%
3.9
0.001
Diclox daily
dose < 4g
40/142
28%
6/44
14%
2.5
0.02
Age > 60 y
32/96
33%
14/90
16%
2.7
0.006
NF-M 2001
Momenter ved valg av metode for
resistensbestemmelse
• Biologisk variasjon
– innen en gruppe, slekt eller art
– mellom bakterieslekter
• Metodens egnethet
– Valgt metode må kunne skille mellom følsomme
og resistente stammer
– Enkelte midler er bedre egnet til å påvise
følsomhet enn andre innen samme
legemiddelgruppe
Måleunøyaktighet og biologisk variasjon
- MIC for WT viser genusspesifikk variasjon
8000
7000
6000
5000
4000
3000
2000
1000
0
E. coli
MIC (mg/l)
Gentamicin
128
64
32
16
8
4
2
1
0.5
0.25
0.125
P. aeruginosa
0.064
No of isolates
Distribution of MIC-values
Relationship between max. Peak/MIC ratio and the rate of clinical response for
aminoglycosides
Response
rate, %
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
Moore et.al. J Infect Dis, 1987, 155: 93
2
NF-M 2001
4
6
8
10
Maximum Peak/MIC ratio
12
Måleunøyaktighet og biologisk variasjon
- gjentatte analyser gir ulike svar, WT (Wild type)
Ampicillin 10 ug
15
Ampicillin 10 ug lapp
10
ant.
5
0
6
7
8
9
10 11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
WT
-5
H. influenzae
BLNAR
ATCC
WT
-10
mm hemningssone
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
Cefuroxim 30 ug lapp
Cefuroxime
10
8
WT
6
4
CXM
CXM atcc
2
0
6
7
8
9
10
11 12 13 14
15 16
17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52
-2
-4
-6
H. influenzae
BLNAR
Blood cultures E. coli 2002 (n=959)
Beta-laktamase-positive
isolat
Blood cultures E. coli 2002 (n=959)
Blood cultures E. coli 2002 (n=959)
BP basert på Pk/PD
Blood cultures Klebsiella spp 2002 (n=352)
R
Alle Klebsiella spp har kromosomal kl A bla og er resistente for Ampicillin
EUCAST definitions of clinical breakpoints
Clinically Susceptible (S)
•
•
a microorganism is defined as susceptible if inhibited in-vitro by a concentration of an antimicrobial agent that is
associated with a high likelihood of therapeutic success
a microorganism is categorized as susceptible (S) by applying the appropriate breakpoint in a defined phenotypic
test system.
Clinically Intermediate (I)
•
•
a microorganism is defined as intermediate by a level of antimicrobial agent activity associated with uncertain
therapeutic effect.
- It implies that an infection due to the isolate may be appropriately treated in body sites where the drugs are
physically concentrated or when a high dosage of drug can be used; -it also indicates a buffer zone that should
prevent small, uncontrolled, technical factors from causing major discrepancies in interpretations.
a microorganism is categorized as intermediate (I) by applying the appropriate breakpoints in a defined
phenotypic test system
Clinically Resistant (R)
•
•
a microorganism is defined as resistant if inhibited in-vitro by a concentration of an antimicrobial agent that is
associated with a high likelihood of therapeutic failure
a microorganism is categorized as resistant (R) by applying the appropriate breakpoint in a defined phenotypic
test system.
Clinical breakpoints may be altered with legitimate changes in circumstances
Clinical breakpoints are presented as S<x mg/L; I>x, <y mg/L; R>y mg/L
EUCAST wild type MIC distributions and epidemiological cut-off values – the
concept
EUCAST developed the concept of antimicrobial wild type MIC distributions and epidemiological
cut-off values (JAC 52:145-148, 2003).
Software was created to receive and display large volumes of MIC data for bacteria and fungi over
the internet. It is freely available at http://www.eucast.org.
Distributions are displayed in an aggregated format. Tables and graphs show the part of the MIC
distribution which, when EUCAST has defined the ”epidemiological cut-off value”, is considered the
”wild type distribution”.
The epidemiological cut-off value separating microorganisms without (wild type) and with acquired
or mutational resistance (non-wild type) and clinical breakpoints are shown on the bottom line of
the graph.
The epidemiological cut-off value (left lower corner) is shown as WT≤ X mg/L.
The clinical breakpoints (right lower corner) are shown as S≤ Y mg/L and R> Z mg/L.
Error rate method –
fra MIC til mm ved regresjonsanalyse
MIC
8
R
R
MiE
MiE
I
Very Major
Errors, VME
4
2
I
1
Minor Errors,
MiE
0,5
0,25
S
0,12
Major
Errors
0,06
MiE
S
0,03
14
16
18
20
24
28
30
36
38
40
42
44
46
48
mm
Brytningspunkt ~ tolkningskriterier ved
resistensbestemmelse
• S - indikerer stor sannsynlighet for terapeutisk suksess
• R - indikerer stor sannsynlighet for manglende terapeutisk suksess
• Kunnskap om mikrobe og antibiotikum
– MIC-distribusjon (histogram) er nødvendig
• Kunnskap om antibiotikums farmakokinetikk og –dynamikk
– Monte Carlo simulering
• Kunskap om terapirespons
– Mikrobiologisk respons og klinisk respons
• Kunnskap om en metodes egnethet til å måle mikrobers
antibiotikafølsomhet eller påvise resistens
EUCAST NordicAST og AFA
The EUCAST websites are accessed via www.eucast.org
This is a section of the official ESCMID website giving details of all EUCAST
activities including
- constitution, organisation, committee members, meetings
- EUCAST documents
- clinical MIC breakpoint tables
- MIC distributions for wild type bacteria and fungi
- epidemiological MIC cut-off values
• NordicAST http://www.nordicast.org
• www.Antibiotikaresistens.no
• Direkte til AFA
– http://www.unn.no/afa/category10274.html
Antimicrobial concentration (mg/L)
0
32
16
8
4
2
1
0,5
0,25
Agar gradient-diffusjon