מעבדה לכימיה אורגנית לתלמידי מדעי החיים מעבדה לכימיה אורגנית לתלמידי מדעי החיים -ביוטכנולוגיה מבוא במעבדה שלפנינו נבצע מספר קטן של ראקציות בסיסיות על מנת לרכוש מיומנויות בסיסיות בהכנה ,ניקוי וזיהוי של תרכובות אורגניות .המעבדה מבוססת על מספר מצומצם של פרפרטים שכל אחד מהם מייצג משפחה חשובה ורחבה של ראקציות אורגניות .במעבדה נילמד שיטות הכנה ,ניקוי וזיהוי של חומרים אורגנים. ניקוי והפרדה וקביעת זהותה של תרכובת אורגנית ,בין שהוכנה באופן סינתטי ובין שהופקה מן הטבע ,הם חלק בלתי נפרד מעבודתו של כימאי .לתכלית זאת נוקטים בפעולות הבאות: שלב ראשון – בידוד וניקוי הנעשים בשיטות שונות :מיצוי ,זיקוק ,גיבוש או כרומטוגרפיה מסוגים שונים. שלב שני – קביעת נתונים פיזיקאלים כגון נקודת התכה ,נקודת רתיחה ,מסיסות ,צפיפות וביצוע מדידות ספקטרליות שהנפוצות ביניהן הן האולטרא-סגול ) ,(UVהאינפרא-אדום ) (IRותהודה מגנטית גרעינית ) .(NMRאם החומר הוא גבישי ניתן לבצע מדידות קריסטלוגרפיות ) X-ray .(crystallography שלב שלישי – אנליזה כמותית של היסודות המרכיבים את התרכובת וקביעת היחסים שביניהם, כולל מדידת ספקטרום המסות המאפשר בין היתר קביעה מדוייקת של המסה המולקולרית של התרכובת. השוואת הנתונים הללו עם אלה שבספרות תאפשר זיהוי וקביעת המבנה של החומר שסונתז או בודד. אנו נכלול במעבדה הנוכחית ,בשל מגבלות הקורס ,רק את השיטות הבסיסיות ביותר. 1 מדידת קבועים פיסיקליים .1נקודת התכה Melting point נקודת התכה של תרכובת מוגדרת כטמפרטורה שבה הפאזה הנוזלית והפאזה המוצקת נמצאות בשיווי משקל והיא מוגדרת כטמפרטורה שבה מתחיל מוצק גבישי להינתך בלחץ אטמוספרי. כשהחומר נקי ויבש ,יש לחומר נקודת התכה חדה והתחום שבו הופכת כמות קטנה של החומר ממוצק לנוזל אינו עולה על .0.5ºCמאחר ולרוב התרכובות המוצקות יש נקודת התכה מוגדרת, זהו נתון חשוב לצורך זיהוי ואיפיון. להלן תמונה של מכשיר המצוי במעבדה המשמש לקביעת נקודת התכה: ציור מס' :1מכשיר לקביעת נקודות התכה קביעת נקודת התכה מאפשרת בדיקת מידת ניקיונה של התרכובת .נוכחות חומר זר )אף בכמות קטנה( מורידה את נקודת ההתכה של התרכובת אף אם נקודת התכתו של החומר הזר עצמו גבוהה מנקודת ההתכה של התרכובת .נוכחות חומר זר ,לא רק שהיא מורידה את נקודת ההתכה של תרכובת נתונה ,אלא גם מרחיבה בדרך כלל את תחום טמפרטורת ההתכה ומכאן שנקודת ההתכה אינה יכולה להיות חדה. אם בידינו שני חומרים שנקודת התכתם זהה ,ניתן לקבוע אם הם שונים או זהים על ידי קביעת "נקודת התכה מעורבת" .לצורך זה כותשים ומערבבים היטב מספר גבישים מכל אחד משני החומרים וקובעים נקודת התכה של התערובת .אם נקודת ההתכה המעורבת נמצאת זהה לזו של כל אחד מהחומרים הנקיים המרכיבים את התערובת ,ניתן לקבוע ששני החומרים אמנם זהים .אם אין הדבר כך ,אפשר לקבוע כי שני החומרים אינם זהים .נקודת ההתכה של התערובת תהיה 2 נמוכה מנקודת ההתכה של כל אחד ממרכיביה )כל חומר משמש אי ניקיון לשני( והיא יכולה להגיע אף לכדי 20-30 ºCמתחת לנקודת ההתכה של המרכיבים. קביעת נקודות ההתכה צריכה להתבצע בחומרים יבשים לחלוטין ויש צורך להשתמש בגבישים דקים וכתושים. מדידת נקודת התכה במעבדה: מכניסים מעט חומר לתוך קפילרה עם קצה אחד סגור )ציור 2א'( ואותה מכניסים למכשיר דרך אחד משלושת החריצים )ציור 2ב'( .החריצים האלה מאפשרים מדידה של מספר קפילרות בו זמנית .מבעד לחלון )חץ בציור 2ג'( מסתכלים ורואים באיזה טמפ' מתחיל החומר להתנזל ובאיזה טמפ' החומר לגמרי נוזל וזה התחום שמדווחים עליו )תמיד מדווחים על תחום טמפרטורות(. המכשיר נועד למדידת נקודות התכה בין 70ºCל 350ºCהוא מחמם עד 400 ºCומבוסס על סלילים חשמליים .יש לכוון את טמפ' החימום לשתי מעלות פחות מטמפ' ההתכה של החומר. הכיוון נעשה על ידי החיצים חץ למעלה מעלה את הטמפ' ב 100והחץ למטה מוריד את הטמפ' במעלה אחת )ציור 2ד'( .לוחצים על אנטר )ציור 2ה'( והחימום מתחיל .הנורות נדלקות לפי הקרבה של הטמפ' לטמפ' היעד וקצב עליית הטמפ' נעשה איטי יותר ככל שמתקרבים לטמפ' היעד )ציור 2ו'( .כאשר טמפ' הסלילים מגיעה לטמפ' היעד יש צפצוף .לחיצה נוספת על אנטר מעלה את הטמפ' בקצב של מעלה לדקה .לחיצה על clearמראה את טמפ' היעד .בסיום המדידה יש ללחוץ 4פעמים על clearולראות שהטמפ' מתחילה לרדת )חשוב מאד אחרת המכשיר ימשיך לחמם – מסוכן למכשיר(. ג' א' ב' ו' ד' ה' ציור מס' :2שלבים לקביעת נקודות התכה 3 .2נקודת רתיחה Boiling point נקודת רתיחה של נוזל היא טמפרטורה שבה לחץ האדים של הנוזל שווה ללחץ החיצוני שבמערכת )הלחץ שמעל פני הנוזל( ציור מס' :3תאור גרפי של תלות לחץ אדים בטמפרטורה של כלורופורם לכל תרכובת יש נקודת רתיחה קבועה לכל לחץ חיצוני .נקודות הרתיחה המתוארות בספרות מתייחסות ללחץ של אטמוספירה אחת ) 760מ"מ כספית( ,אלא אם צויין אחרת במפורש. ניתן למדוד נקודת רתיחה של חומר בעזרת שיטת מיקרו :מכניסים לתוך מבחנה יבשה 0.3-0.5 סמ"ק מהנוזל שאת נקודת רתיחתו רוצים לקבוע .מכניסים למבחנה קפילרה סגורה בקצה אחד באופן שהקצה הפתוח יטבול בנוזל .מחברים את המבחנה לתרמומטר על ידי גומיה ואת התרמומטר למהדק וטובלים אותו בכוס עם שמן פרפין ומחממים .עם חימום השמן מתחמם גם הגז בקפילרה )המכיל אוויר ואדי החומר( ,כתוצאה מכך הוא מתפשט ויוצא תוך בעבוע מהקפילרה .כשהטמפרטורה עולה – גדלה גם זרימת הבועות .כשמגיעים לנקודת הרתיחה )או מעבר לה( יוצאות הבועות מהקפילרה בזרם חזק ורציף ואז מפסיקים את החימום. כשהטמפרטורה מתחילה שוב לרדת נפסקת זרימת הגז .ברגע שזרימת הגז נפסקת וטיפה מן הנוזל מתחילה להיכנס לקפילרה ,רושמים את הטמפרטורה .זוהי טמפרטורת הרתיחה של הנוזל .יש לחזור על התהליך כמה פעמים .בשיטה זו מקבלים דיוק קביעה של .1-2ºC .3מדידת סיבוב אופטי ספציפי )(Specific Optical Rotation למולקולות בלתי סימטריות יש "פעילות אופטית" :הן מסובבות את מישור הפולריזציה של אור מקוטב העובר דרכן .שיעור הסיבוב הוא גודל מצטבר ותלוי במספר המולקולות הפעילות המתנגשות בקרן האור המקוטב העובר דרכן והוא תלוי גם באורך הגל ובטמפרטורה שבה נערך הניסוי. 4 בתנאים קבועים )אורך גל ,טמפרטורה ,ריכוז( לכל תרכובת בלתי סימטרית זווית סיבוב ספציפית שמסמנים ב ,αהתלויה במבנה שלה .את זווית הסיבוב מודדים בעזרת פולרימטר. הפולרימטר )ציור מספר (4בנוי ממקור אור מונוכרומטי ,פריזמת ניקול )המקטבת את האור( שהיא הפולריזר ,שפופרת בעלת אורך קבוע שבתוכה התמיסה הנמדדת ופריזמת ניקול נוספת )פולריזר( המשמשת כאנליזר. כשקרן אור עוברת דרך הפולריזר – היא יוצאת מקוטבת .כשהתמיסה שבשפופרת איננה פעילה אופטית יוצאת הקרן מן התמיסה כשמישור הקיטוב שלה לא השתנה .כשהאנליזר "מקביל" לפולריזר ,עובר דרכו מלוא האור ומגיע לעין הצופה .כשמסובבים את האנליזר ,כמות קטנה יותר של אור עוברת דרכו .כשהאנליזר ניצב לפולריזר – שדה הראיה חשוך. ציור מס' :4תאור סכמטי של פולרימטר מכוונים את האנליזר באופן ששדה הראיה חשוך .כשמכניסים חומר בעל פעילות אופטית לשפופרת – הוא מסובב את מישור הקיטוב של האור .על מנת לקבל שוב שדה ראיה חשוך – יש צורך לסובב את האנליזר באותה מידה בו סובב החומר את מישור הקיטוב של האור אך בכיוון ההפוך. הסיבוב הספציפי αמוגדר במשוואה הבאה: - αזווית הקריאה – lאורך השפופרת בדצימטרים – cריכוז התמיסה בגרמים ב 100סמ"ק תמיסה – tטמפרטורה – Dאור נתרן באורך גל 5890Å קביעת "זווית סיבוב ספציפית" מספקת נתון פיסיקלי חשוב לזיהוי ואיפיון תרכובות אורגניות בלתי סימטריות .נציין רק שרוב התרכובות הביולוגיות הן פעילות אופטית. כמו כן ניתן בעזרת הפולרימטר לעקוב אחר מהלך ראקציות המלוות בשינוי הסיבוב האופטי תוך התקדמות הראקציה. 5 שיטות טיהור Purification .1זיקוק רגיל Distillation אחת הדרכים לניקוי חומר אורגני נוזלי היא על ידי זיקוק ,היינו ,הפיכת החומר לאדים על ידי חימום ,עיבוי האדים לנוזל ואיסופו מחדש. מערכת זיקוק )ציור מס' (5בנויה מגולה ) ,(flaskשלתוכה מכניסים את החומר לזיקוק ,ראש זיקוק ) (still headהמכונה גם תרנגול ,תרמומטר למדידת הטמפרטורה של האדים ,מעבה ) (condenserשדרכו עוברים אדי החומר ,שופר ) (adapterוכלי לאיסוף הנוזל ).(flask ציור מס' :5מערכת לזיקוק רגיל מחברים את הגולה על ידי מהדק לעמוד ברזל בגובה מתאים ולאחר מכן בונים את שאר חלקי המערכת לפי הסדר :ראש זיקוק )תרנגול( ,מעבה ,שופר וגולה מקבלת .המעבה בנוי מצינור פנימי שדרכו עוברים אדי החומר וממעטפת חיצונית שדרכה זורמים מים לקירור .את המים מזרימים על ידי חיבור לסירקולטור ששואב מים מתוך פיילה .המים נכנסים דרך צינור לתוך המעבה ויוצאים ממנו דרך צינור נוסף חזרה לתוך הפיילה .בצורה כזו המים נעים במחזוריות ויש לדאוג לקירור של המים בפיילה על ידי הוספת קרח .כאשר נקודת הרתיחה של חומר מזוקק היא מעל ,150ºC אין להזרים מים במעבה .במקרה זה האוויר מספיק לקרר ולעבות אדים .קירור יתר על ידי מים יכול לגרום לפיצוץ המעבה בגלל הבדל הטמפרטורה הגדול בין המים הקרים לבין אדי החומר. )פירוט לגבי הרכבת מערכת זיקוק בפרק" :בניית מערכות בסיסיות"(. 6 .2זיקוק בוואקום Vacuum Distillation במקרים מסויימים אי אפשר לזקק נוזל במערכת זיקוק רגילה ,אם בשל העובדה שנקודת הרתיחה של החומר גבוהה מאד והחומר עלול להתפרק לפני שהגיע לנקודת הרתיחה או בשל העובדה שהחומר הינו רגיש לטמפרטורה וחימום קל עלול לגרום בו לשינויים כימיים .במקרים כאלה יש אפשרות לזקק את החומר בטמפרטורה נמוכה יותר על ידי הורדה של הלחץ החיצוני שבמערכת, מאחר ונקודת הרתיחה של חומר תלויה בלחץ החיצוני. לשם כך משתמשים במערכת זיקוק בוואקום ,בה מורידים על ידי שאיבה את הלחץ שמעל הנוזל שבמערכת .אפשר להשתמש במערכת הזיקוק שהשתמשנו בה לזיקוק רגיל ,כפי שמתוארת בציור .5את הצינור הצדדי של השופר מחברים למשאבה .מערכת נוספת לזיקוק בוואקום מוצגת בציור מס' .6 ציור מס' :6מערכת לזיקוק בוואקום מערכת זו מורכבת יותר אך הברזים שבה מאפשרים הכנסת המערכת לוואקום בהדרגתיות. השימוש במערכת זו מקטין את הסיכוי לאיבוד חומר בגלל הקצפה מה שעלול להתרחש עקב הורדת הלחץ במערכת .בנוסף על ידי שימוש בברזים ניתן להחליף גולות מקבלות ולאסוף פרקציות שונות בזיקוק ביתר קלות. זיקוק בוואקום מאפשר לא רק זיקוק נוזלים אלא גם זיקוק חומרים שבלחץ אטמוספרי הם מוצקים ,אך בלחץ נמוך יותר אפשר על ידי חימום לזקקם ללא פירוק. 7 .3זיקוק למקוטעין Fractional Distillation זיקוק רגיל או זיקוק בוואקום ,מאפשרים הוצאת תרכובת נדיפה מתוך תערובת עם חומרים בלתי נדיפים .האדים המתעבים בכלי הקיבול הם אדי החומר הנדיף .בגולת הזיקוק נשארים כל שאר החומרים .כשמזקקים תערובת של נוזלים נדיפים ,לחץ האדים של התערובת שווה לסכום לחץ האדים החלקיים של המרכיבים .אדי התזקיק לא יכילו רק אחד ממרכיבי התערובת אלא כמות מסויימת מהאדים של כל החומרים הנדיפים .אם יש לפנינו תערובת של שני נוזלים ,יכילו האדים תערובת של שתי התרכובות באופן שהאדים יהיו עשירים יותר בתרכובת הנדיפה יותר מאשר הנוזל )ראה ציור מס' .(7 ציור מס' :7עקומת זיקוק של תערובת בנזן-טולואן בזיקוק חלק מהתערובת ,יתאסף מקטע העשיר יותר בנוזל הנדיף .אם נשוב ונזקק מקטע זה באופן חלקי ,נקבל מקטע חדש העשיר עוד יותר בחומר הנדיף .תיאורטית נחוץ מספר אינסופי של זיקוקים להפרדה מלאה בין תערובות כגון זו של בנזן וטולואן .למעשה – אנו בונים מערכת המאפשרת בזיקוק אחד "זיקוקים חוזרים" רבים ,זוהי מערכת של זיקוק למקוטעין תוך שימוש בקולונת הפרדה ,המכונה גם "קולונת ויגרה" ).(Vigre column בונים מערכת זיקוק למקוטעין )ציור מס' ,(8באופן שבין גולת הזיקוק לבין ראש הזיקוק )תרנגול( נתונה קולונה מתאימה .קולונת ויגרה מכילה פלטפורמות זכוכית ,האדים הפוגעים בהן מתעבים וחוזרים לגולה .הקולונה מחוממת מלמטה על ידי האדים כך שהחלק התחתון שלה הוא החם ביותר והחלק העליון הוא הקר ביותר .הנוזל רותח והאדים העולים בקולונה מכילים ריכוז גבוה יותר של החומר הנדיף מאשר הנוזל .חלקם מתקרר ,יורד ,נפגש באדים חדשים העולים 8 בקולונה ורותח שוב ,וחוזר חלילה .כל רתיחה מחודשת היא "זיקוק מחדש" .בדרך כלל משתמשים בזיקוק למקוטעין להפרדת תערובת של נוזלים שהפרש טמפרטורת הרתיחה שלהם קטן מ .25ºCככל שהפרש בטמפרטורות הרתיחה של שני הנוזלים קטן יותר ,יש צורך בקולונה יעילה יותר להפרדה טובה יותר ביניהם. ציור מס' :8מערכת לזיקוק למקוטעין 9 .4גיבוש מחדש Recrystallization אחת משיטות הניקוי החשובות של חומרים מוצקים היא שיטת הגיבוש מחדש .עיקרה בהמסת החומר המוצק המבוקש בממס מתאים ,שממנו נותנים לגבישי החומר לצמוח מחדש ללא "אי ניקיונות" הנשארים בתמיסה .לרוב נבחר ממס שבו החומרים הזרים נמסים טוב יותר מהחומר המנוקה ,בעיקר בקור. שיטת גיבוש מקובלת היא "גיבוש מתמיסה חמה" .בוחרים ממס שבו התרכובת נמסה היטב בחום, אך קשת-תמס בקור ומבצעים את השלבים הבאים: .1ממיסים את החומר הגולמי בכמות מינימלית של ממס רותח ,דהיינו מכינים תמיסה רוויה של החומר הגולמי. .2אם התמיסה אינה צלולה ומכילה אי-נקיונות שאינם נמסים כלל ,מסננים את התמיסה החמה במהירות דרך נייר סינון מקופל ומחומם לתוך ארלנמייר .סינון חם נועד למנוע התגבשות של החומר על נייר הסינון – איבוד חומר. .3משהים את התמיסה החמה שבארלנמייר לקירור איטי .מאחר ובממס שנבחר מסיסות החומר בקור קטנה ,יתגבש החומר מתוך התמיסה .ככל שהגיבוש איטי ,הגבישים גדלים ממספר קטן יותר של מרכזי התגבשות ,והם יפים יותר ובעיקר הומוגניים יותר. .4מסננים את המשקע שמתקבל דרך משפך ביכנר )ציור מס' .(9הסינון נעשה בעזרת משאבת אוויר .הסינון בדרך זו מהיר והגבישים מתייבשים במהירות. "תמיסת האם" – זו התמיסה הנשארת לאחר סינון הגבישים .היא מכילה את אי-הניקיונות הנמסים בממס וכן כמות מסויימת מהחומר שגובש. ציור מס' :9סינון דרך משפך ביכנר בשיטת הגיבוש מפסידים חומר על חשבון ניקיונו ,ולכן חשוב לבחור ממס אשר בו מסיסותה של התרכובת בקור נמוכה ככל האפשר .לכן גם משתמשים בכמות מינימלית של ממס כי בתמיסה 10 מהולה יותר הפסד החומר יהיה גדול יותר .לעיתים קרובות קשה למצוא ממס מתאים לגיבוש מתמיסה חמה. דרך גיבוש אחרת היא על ידי מציאת שני ממסים ,המתערבבים אחד בשני )כמו מים וכוהל או אתר ופתרול-אתר( שבאחד החומר נמס היטב ובשני אינו נמס כלל .ממיסים את החומר בממס הראשון ,מסננים את התמיסה מאי ניקיונות קשי-תמס ,ואחר כך מוסיפים תוך טפטוף את הממס השני .מסיסות החומר בתמיסה שבה הולך ועולה ריכוז הממס השני – הולכת וקטנה ,והחומר שוקע מתוך התמיסה .זהו גיבוש על ידי השקעה מתערובת ממסים. .5סובלימציה Sublimation סובלימציה מוגדרת כמעבר ישיר מפאזה מוצקת לפאזה הגזית מבלי לעבור דרך הפאזה הנוזלית. אפשר לבצע סובלימציה של מוצק שלחץ אדיו גבוה במיוחד בתנאי המעבדה והיא באה במקום שיטת הגיבוש .מכשיר הסובלימציה בנוי ממבחנה רחבה )ציור מס' (10עם צינור צדדי )שאפשר לחברו למשאבה( ,ומבחנה פנימית המאפשרת זרימת מים ,כפי שמתואר בציור ,או המאפשרת הכנסה של קרח כתוש לתוכה. ציור מס' :10מכשיר סובלימציה החומר הגולמי מוכנס למבחנה הרחבה .למבחנה הפנימית מכניסים קרח או מזרימים מים קרים. בחימום ,החומר הגולמי שבמבחנה החיצונית עובר סובלימציה ,וממריא על הדפנות החיצוניים הקרים של המבחנה הפנימית. 11 .6מיצוי Extraction אפשר להוציא תרכובת מתוך תערובת גולמית או מתמיסה ,על ידי העברתה לממס אחר בתנאי שהממסים אינם מתערבבים ביניהם .כך ,למשל ,ניתן להעביר תרכובת מתמיסה מימית לתמיסה אורגנית .תהליך זה נקרא מיצוי .כשתרכובת אורגנית נמסה גם במים וגם בממס אורגני, ומטלטלים אותה היטב במשפך מפריד עם תערובת שני הממסים ,שאינם מתערבבים בינם לבין עצמם ,מתחלקת התרכובת האורגנית בין שתי הפאזות. התחלקות תרכובת נתונה בין שתי פאזות נקבעת על פי "עיקרון החלוקה" )(partition low האומר שכאשר מוסיפים למערכת של שני נוזלים בילתי-מתערבבים כמות מסויימת של חומר שלישי הנמס בכל אחד מהנוזלים ,התחלקות החומר בין שני הנוזלים הינה לפי יחס קבוע בטמפרטורה נתונה: CA CB =K = Kקבוע ההתחלקות = CAריכוז החומר בממס A = CBריכוז החומר בממס B למיצוי תרכובת אורגנית מתוך תמיסות מימיות יש לבחור בממס אורגני מתאים .למשל, כשהתרכובת בלתי פולרית ,משתמשים בממסים לא פולריים ,כגון פטרול-אתר ,פחמן טטראכלורי ,בנזן ועוד .כאשר החומר הוא פולרי ,יש לבחור בממסים אורגנים פולריים כגון דיכלורומתאן ,כלורופורם ,אתר ועוד. למיצוי טוב יותר של חומר מתמיסה מימית ,מוסיפים לפעמים לתערובת הממסים מלח בישול. לתהליך של "הוצאת התרכובת" מתוך המים על ידי מלחים קוראים "מילוח" ).(salting out 12 זיהוי והפרדה -כרומטוגרפיה שתי הדרכים החשובות ביותר בהן ניתן להפריד תרכובת מבוקשת מאי-נקיונות ,או לבודדה מתוך תערובת מרכיבים הן) :א( מיצוי) ,ב( כרומטוגרפיה .שתי השיטות מבוססות על התחלקות בין שתי פאזות. חשיבות השיטות הכרומטוגרפיות נובעת מכך שהן מאפשרות הפרדה בין מספר מרכיבים שבתערובת על ידי ניצול תכונת ההתחלקות השונה של כל אחד מהמרכיבים בין שתי הפאזות. ההתחלקות השונה של תרכובת בין שתי פאזות יכולה לנבוע :א( מהבדלי מסיסות ,היינו עיקרון ההתחלקות ) ;(partitioningב( מהבדלים בכושר הספיחה של הפאזה לגבי כל אחד ממרכיבי התערובת ).(adsorption בכל שיטות הכרומטוגרפיה מתחלקת התרכובת בין פאזה ניידת ) (mobile phaseופאזה נייחת ) .(stationary phaseישנן מספר רב של שיטות כרומטוגרפיות המסווגות על פי אופי הפאזה הנייחת והפאזה הניידת .להלן כמה משיטות הכרומטוגרפיה העיקריות: .1כרומטוגרפיה בשכבה דקה )(thin layer chromatography – TLC .2כרומטוגרפיה בקולונה )(solid liquid chromatography .3כרומטוגרפיה בפאזה גזית )(gas chromatography – GC .4כרומטוגרפיה בפאזה נוזלית ).(liquid liquid chromatography .1כרומטוגרפיה בשכבה דקה )(thin layer chromatography – TLC כרומטוגרפיה בשכבה דקה מבוססת על התחלקות חומר בין פאזה נוזלית ניידת ופאזה מוצקה נייחת .בשיטה זו ההפרדה בין החומרים הנמצאים בפאזה הנוזלית הניידת מתבצעת על ידי השכבה המוצקה על ידי כך שהחומר המוצק סופח על שטח פניו באופן סלקטיבי את החומרים השונים העוברים דרכו .הספיחה היא סך כל כוחות המשיכה הבין מולקולריים :כוחות אלקטרוסטטים, קשרי מימן ,קשרי וון-דר-וולס וכדומה .בשיטה זו המוצק הסופח )סיליקה/אלומינה( מרוח בשכבה דקה על פלטה של זכוכית ,אלומיניום או חומר פלסטי קשיח .מניחים טיפה מתמיסת התערובת להפרדה על הפלטה ,קרוב לקצה אחד שלה )ציור מס' .(11מכניסים למיכל נוזל מריץ בכמות קטנה באופן שפני הנוזל יהיו נמוכים מהטיפה שעל הפלטה .לאחר מכן מכניסים את הפלטה למיכל הפיתוח .הנוזל המריץ עולה בפלטה )עליה בנימיות הסופח( וסוחף עימו את התערובת הנבדקת .קצב ההרצה של כל מרכיב בתערובת תלוי במס' גורמים חשובים: 13 .1נטייתו של החומר להקשר להתמוסס או להסתפח אל הפאזה העומדת. .2נטייתו של החומר להקשר או להתמוסס במריץ. לכל חומר/מרכיב בתערובת תכונות שונות של קישור ,המסה וכד' -לכן מהירות תנועתו במערכת הכרומטוגרפיה היא אופיינית לו ,ושונה מזו של חומרים אחרים .היחס בין מרחק הנדידה של החומר לבין מרחק נדידת הנוזל המריץ מנקודת המוצא נקרא קבוע הנדידה .(Rate of flow) Rf קבועי הנדידה Rfהינם גדלים קבועים ובתנאים נתונים הם מאפשרים איפיון החומרים .שרטוט סכמטי של תערובת ראקציה ,חומר מוצא והתוצר של ראקציה מסויימת שעברו הפרדה בTLC מובא בציור מס' :11 א' ב' ציור מס' :11א' :הכנת פלטת TLCלכרומטוגרפיה .ב' :הפרדה של תערובת ראקציה ב .1:TLCתוצר הראקציה .2 ,תערובת הראקציה .3 ,חומר המוצא. כשהמרכיבים צבועים ,אפשר לראותם במישרין על הפלטה .אם הם חסרי צבע ,יש צורך לבצע בהם ראקציה כלשהיא על הפלטה על מנת לקבל תוצרים צבעוניים נראים לעין .אחת השיטות היא הכנסת הפלטה למיכל המכיל אדי יוד .יוד יוצר תרכובות קומפלקסיות צבועות עם רוב התרכובות האורגניות .אולם השיטה המקובלת ביותר היא להסתכל על הפלטה באור אולטרא-סגול בעזרת מנורת ,UVשכן לרוב החומרים האורגניים בליעות בתחום. .2כרומטוגרפיה על קולונה כרומטוגרפיה על קולונה אף היא כרוכה בהתחלקות חומר בין פאזה נוזלית ניידת ופאזה מוצקה נייחת .הקולונה מפרידה בין החומרים השונים שבפאזה הניידת על ידי כך שהמוצק הממלא אותה סופח על פני שטחו באורח סלקטיבי את החומרים השונים העוברים דרכו .ההפרדה מתבססת על 14 ההבדלים בזיקה היחסית של החומרים בתערובת לשתי הפאזות .חומרים להם זיקה רבה יותר לפאזה הנייחת ישהו בה זמן רב יותר ועל כן ינועו )באופן ממוצע( לאט יותר בעוד חומרים להם זיקה רבה יותר לפאזה הניידת ינועו )באופן ממוצע( מהר יותר .בחירתם של הממס לשימוש בפאזה הניידת ושל הפאזה הנייחת נעשית בהתאם לתערובת אותה רוצים להפריד .בשלב ראשון מטעינים בראש העמודה המלאה בחומר סופח )כגון אלומינה ,Al2O3סיליקה ג'ל ועוד( את התערובת להפרדה .לאחר מכן מוסיפים במנות את הפאזה הניידת שעוברת דרך העמודה מלמעלה למטה בכוח הגרביטציה .התערובת מחלחלת לאיטה דרך העמודה ,כשמרכיביה נודדים במהירויות שונות ,לפי הזיקה שלהם לפאזה הנייחת/פאזה ניידת .אם החומרים המופרדים הם בעלי צבע אז בדומה ל TLCניתן מיד לזהותם .אם הם חסרי צבע ניתן לזהותם על ידי :א( .איסוף מקטעים של נוזל ביציאה מהעמודה .ב( .הפעלת ראגנטי זיהוי או שיטות זיהוי אחרות )כגון שיטות ספקטרליות( על כל מקטע .לעיתים רחוקות אף נהוג לפרק את העמודה לאחר הניסוי ולמצות מתוך הפאזה הנייחת את החומרים שהופרדו. ממס)פאזה ניידת( חול א' פאזה נייחת ב' כיוון זרימת הפאזה הניידת ציר הזמן חול כותנה ציור מס' :12א' :קולונה לכרומטוגרפית ספיחה .ב' :הפרדה של שלושה חומרים על קולונה. .3כרומטוגרפיה בפאזה גזית )(Gas chromatography בכרומטוגרפיה בפאזה גזית הפאזה הניידת היא גז אינרטי )הליום או חנקן( הנקרא גם גז נושא ) ,(carrier gasהזורם ממיכל מיוחד לתוך המערכת .הפאזה הנייחת מצופה בתוך קולונה ספירלית ארוכה )מספר מטרים( .הקולונה יושבת בתוך תנור המחומם לטמפרטורה מעל טמפרטורת האידוי של החומרים בדוגמא .הדוגמא להפרדה מוזרקת לתוך הקולונה ועוברת תהליך אידוי בחלק ההתחלתי של הקולונה .לאחר אידוי הדוגמא הגז הנושא דוחף את הדוגמא במצבה הגזי לאורך הקולונה ותהליך ההפרדה מתבצע .אילו הקולונה היתה ריקה היה החומר נסחף בזרם הגז ויוצא מן הקולונה במהירות בה יצא הגז .מאחר ובקולונה מצוי חומר בעל כושר ספיחה, 15 מתקיימת תחרות )על פני הקולונה( על מולקולות החומר בין הנוזל לבין הגז ,כשהמולקולות נספחות על פני הנוזל ומשתחררות וזורמות הלאה לאורך הקולונה .מהירות זרימת החומר תיקבע לפי מהירות זרימת הגז ,הטמפרטורה של הקולונה ואורכה ובעיקר אופי הפאזה הנוזלית. בפעולת הפאזה הנוזלית משתתף גורם הספיחה ,גורם ההתחלקות לפי מסיסות וכן לחץ האדים של החומרים השונים בתערובת .החומר הסופח בקולונה נבחר לפי אופי התרכובות שצריך להפריד. קולונה יעילה תהיה זו שבה חומר אחד יוצא בשלמות )ספיחה קטנה על הקולונה( לפני שהחומר השני יתחיל לצאת .הזמן הדרוש למעבר החומר בקולונה מרגע הזרקתו ועד לרגע יציאתו ממנה נקרא (retention time) Rtוהוא נתון המאפיין את החומר בתנאי המכשיר. בסוף הקולונה מוצב גלאי הרגיש לסוג החומרים שעוברים הפרדה .האות היוצא מהגלאי נרשם על גבי רשם או נאגר במחשב .בדרך כלל אינטגרציה של עוצמת האות מהגלאי )עבור כל חומר( פרופורציונית לכמות החומר בדוגמא המוזרקת .נתון זה משמש לאנליזה כמותית של כל חומר בדוגמה. .4כרומטוגרפית נוזל-נוזל )(liquid-liquid chromtography שיטת הכרומטוגרפיה נוזל-נוזל מבוססת על התחלקות בין שתי פאזות נוזליות כאשר אחת נייחת והשניה ניידת .שיטת כרומטוגרפיה נוזל-נוזל בלחץ גבוה High Performance Liquid ) HPLC (Chromatographyנחשבת לאחת משיטות ההפרדה היעילות ביותר ובעזרתה ניתן להפריד תערובות של חומרי טבע מורכבים כמו חומצות אמינו ,סוכרים ,סטרואידים ועוד .בשיטה זו הפאזה הנייחת מורכבת מחלקיקים קטנים מאוד בקוטרם )קטן מ 200מיקרון( של מוצק המצופים בחומר נוזלי .פאזה זו בדרך כלל פולרית והפאזה הניידת היא נוזל בלתי פולרי .את החלקיקים הנ"ל דוחסים לתוך קולונה ספירלית .בעקבות העובדה שהקולונה דחוסה מאוד הפאזה הניידת )נוזל( לא מסוגלת לעבור בה בכוח הגרביטציה בלבד ויש צורך להפעיל לחץ באמצעות משאבה. בדומה ל GCביציאה מהקולונה מוצב גלאי .הגלאים הנפוצים במערכות HPLCהן גלאי בליעת ,UVגלאי פלורסנציה ,גלאי מוליכות ועוד .בדומה ל GCאינטגרציה על עוצמת האות מהגלאי )עבור כל חומר( פרופורציונית לכמות החומר בדוגמא המוזרקת .נתון זה משמש לאנליזה כמותית של כל חומר בדוגמה. 16 שיטות ספקטרליות כיום משתמש הכימאי באופן שיגרתי במספר רב של שיטות ספקטרוסקופיות ,שמטרתן לזהות ולאפיין את המבנה של תרכובות חדשות שהוכנו או בודדו .השיטות הללו המחליפות את השיטות הכימיות הקלאסיות ,כוללות בין היתר אנליזת מסות ) (mass spectrometryושיטות ספקטרוסקופיות המבוססות על אינטראקציה בין קרינה אלקטרומגנטית לבין החומר הנבדק. השיטות הספקטרוסקופיות כוללות שיטות לקביעת מבנה במצב מוצק ,כמו קרני X-ray ) X (crystallographyושיטות אחרות המותאמות יותר לקביעת מבנה בתמיסה ,כגון ספקטרוסקופיה בתחום הנראה והאולטרא-סגול ) ,(UV visible spectroscopyספקטרוסקופיה בתחום האינפרא-אדום ) ,(infra-red spectroscopy-IRוספקטרוסקופיה של תהודה מגנטית גרעינית – תמ"ג ) .(nuclear magnetic resonance – NMRמכל השיטות שנזכרו לעיל, NMRהיא השיטה השימושית ביותר לקביעת מבנה בתמיסה .שיטה זו מכילה כמות רבה יותר של אינפורמציה וככל שמדובר במבנה כימי מסובך יותר ,הופך ספקטרום ה NMR-לבעל חשיבות רבה יותר .בשנים האחרונות הפכה שיטת התמ"ג לשיטה העיקרית לקביעת מבנה שלישוני מפורט בתמיסה של מולקולות ביולוגיות כמו חלבונים ומקטעים של .DNA השיטות הספקטרוסקופיות המבוססות על אינטראקציה בין גל אלקטרומגנטי וחומר מבוססות על כך שכל גל אלקטרומגנטי נושא עמו כמות אנרגיה בהתאם למשוואה ):(1 האנרגיות השונות של הגלים האלקטרומגנטיים השונים מובאות בטבלה .1 כשקרינה אלקטרומגנטית פוגעת בצורון כימי ב"מצב היסוד" )” ,(“ground stateעשוי צורון זה לבלוע כמות אנרגיה אם זו מתאימה לעירור הצורון הכימי ,היינו העברת הצורון למצב מעורר. תהליך זה בא לידי ביטוי בקבלת ספקטרום בליעה .לחליפין ניתן לעקוב אחרי החזרה של המערכת למצב היסוד .במקרה זה אנו מדברים על ספקטרום פליטה .מקור "מצב העירור" )” (“excited stateיכול להיות אלקטרוני ,היינו ,מעבר אלקטרון מאורביטלה-קושרת 17 ) (bonding-orbitalאחת לאורביטלה בעלת אנרגיה גבוהה יותר )בדרך כלל anti-bonding (orbitalאו עירור הקשור בעיוות הקשרים שבין האטומים במולקולה שהוא עירור של רמות ויברציוניות או עירור הכרוך בהיפוך הספין המגנטי ועוד .כל צורת עירור קולטת אנרגיה מסויימת בסדר גודל אחר .על כן ספקטרום הבליעה של המולקולה משתנה לפי תחום הקרינה האלקטרומגנטית שבו משתמשים. כעיקרון ,רגישות של שיטה ספקטרלית נקבעת על ידי הפרש האנרגיה שבין הרמות האנרגתיות שמעורבות בתהליך העירור .כך שברור כי שיטת ה UV-visibleיותר רגישה משיטת ה ,IR שהיא כשלעצמה רגישה יותר משיטות של תהודה מגנטית אלקטרונית ) (ESRאו גרעינית ) .(NMRואולם שיטת ה NMRהיא השיטה האינפורמטיבית ביותר לקביעת מבנה של מולקולות אורגניות וביוכימיות שונות. כפי שנאמר 3 ,השיטות המקובלות ביותר במעבדה האורגנית הן שיטות ה ,UV-visibleה,IR - וה .NMR -אולם בשל החשיבות הרבה של שיטת ה – NMRבזיהוי ואיפיון של מולקולות אורגניות ,רק נזכיר את המאפיינים של שיטות ה UV-וה IR-ונדון מעט יותר בהרחבה בשיטת ה.NMR- 18 א .ספקטרוסקופיה בתחום הנראה והאולטרא סגול )(UV-visible אורכי הגל המשמשים בספקטרוסקופיה מסוג זה הם :בתחום הנראה 400-750nmובתחום האולטרא-סגול .200-400nmכאן מדובר על מעברים אלקטרונים .השיטה רגישה ומאפשרת מדידת נוכחות של כמויות קטנות של חומר .הספקטרום המתקבל הוא מספר בליעות רחבות ומסמנים את מקומה של הבליעה ב λmaxואת עוצמתה ב .εmax -המעברים יכולים להיות קשורים לאלקטרוני σהנמצאים בקשרים בודדים ,אלקטרוני πהנמצאים בקשרים כפולים ומשולשים ובאלקטרונים בלתי קושרים (non-bonding) nכדוגמת האלקטרונים על החמצן בקשר קרבונילי .המעברים הנצפים בסדר אנרגתי יורד הם מעברי: )* מסמלת אורביטלה לא-קושרת( אלקטרונים בקשרים בודדים בולעים בתחום האולטרא-סגול הרחוק ואפילו עירור * π---- πבולע באיזור של ,250nmואולם ככל שהמערכת האלקטרונית יותר מצומדת יש הסחה של הבליעה לכיוון הספקטרום הנראה .ספקטרום ה UVמאפשר רק קביעה של קיום קבוצות פונקציונליות ואולם חשיבות השיטה היא בקביעת הריכוז של תרכובות ידועות בהסתמך על חוק בר-למברט הקובע כי קיימת תלות לינארית בין עוצמת הבליעה והריכוז של החומר ).(2 ספקטרומטר ה UV-מצייר בדרך כלל את עוצמת הבליעה כפונקציה של אורך הגל ,כך שניתן כעיקרון לקבל גרף כיול עבור כל חומר שהוא על ידי הרצת הספקטרום עבור תמיסות בעלות ריכוז ידוע ואורך תא נתון .מכך ניתן לחשב את .εלאחר שיש לנו את εניתן לבצע אנליזה של תמיסת נעלם ולקבוע את ריכוזה .יתרונות השיטה הן פשטות הפעלת המכשיר ,מהירות הבדיקה והצורך בכמויות קטנות של חומר על מנת לבצע את הבדיקה והעובדה שהבדיקה אינה הרסנית. להלן בליעות אופייניות של כמה מערכות מצומדות: 19 כפי שניתן לראות מנתונים חלקיים אלה מיקום הבליעות הן אדטיביות בקירוב ראשון ,כלומר ניתן לקבלן על ידי חיבור התרומות של כל אחד מן הכרומופורמים הקיימים במולקולה. ב .ספקטרוסקופיה בתחום האינפרא-אדום )(infra red - IR תחום הספקטרום שמשתמשים בו במכשירי IRהוא תחום האינפרא-אדום הקרוב .היחידות המקובלות לתחום זה הן המיקרון μאו מספר הגל המוגדר כ .ν = 1/λ cm-1תחום הבליעה של המכשירים הסטנדרטיים הוא 2.5-15μ :או .667-4000cm-1 תחום ה IR-הוא תחום עירור של רמות ויברציוניות בתוך הרמות האלקטרוניות של האטומים בתוך המולקולות .המודל הפשוט ביותר להמחיש את העירורים הללו הוא להסתכל על מולקולה כאילו היא בנוייה מכדורים )אטומים( הקשורים בינהם בקפיצים )קשרים( .ככל שהקשר חזק יותר ,נאמר שזהו קפיץ חזק יותר – ההיינו קפיץ שקבוע הכוח שלו kגדול יותר. במכשירי ה IR-קרינה אלקטרומגנטית עוברת דרך החומר הנבדק שנמצא בדרך כלל בין לוחות .NaClאם החומר הוא נוזל שמים כמה טיפות של חומר בין לוחות ה NaClואם החומר הוא מוצק ,ניתן להכין ממנו תרחיף מכמה גבישים של החומר ונוג'ול )פראפין אליפאטי נוזלי( .כאשר החומר מומס בתמיסה יש לשים בתא הרפרנס את הממס כך שהספקטרום שירשם יהיה ההבדל 20 בין הבליעה של התמיסה ושל הממס .סיבוב הפריזמה במכשיר מאפשר רישום של הבליעה בכל אורך גל שבתחום האינפרא-אדום הקרוב. כפי שכבר הוזכר ,מתברר כי קבוצות אטומים מסויימות כמו –NH2 ,C=O ,OHבולעות בתחום צר ואופייני גם אם הן מוקפות בקבוצות אטומים נוספות ושונות .מסת האטומים שבקבוצה וחוזק הקשרים שביניהם קובעים בקירוב טוב את מיקום הבליעה וניתן לצפותה על פי משוואה ):(3 כאשר MAו MB -הן המסות של Aו ,B-בהתאמה. להלן כמה בליעות אופייניות של קבוצות פונקציונאליות חשובות )טבלה .(2 21 ציור מס' :13ספקטרום IRאופייני של חומצה הקסאנואית. ג .תהודה מגנטית גרעינית )תמ"ג( )(NMR – Nuclear Magnetic Resonance תהודה מגנטית גרעינית הינה ללא ספק השיטה החשובה ביותר לזיהוי ולקביעת המבנה של תרכובות אורגניות וביוכימיות בתמיסה .השיטה ,שהחיסרון העיקרי שלה הוא רגישות יחסית נמוכה ,מאפשרת קבלת כמות עצומה של אינפורמציה על המולקולה האורגנית וזו מאפשרת בדרך כלל זיהוי ואף קביעת המבנה המרחבי של המולקולה ,אם יש צורך בכך. לגרעינים של אטומים מסויימים יש ספין גרעיני וניתן לומר שגרעינים בעלי ספין גרעיני מתנהגים כמגנטים קטנים כאשר מופעל עליהם שדה מגנטי חיצוני .ניתן לקבוע את מספר הספין Iשל גרעין אטום לפי הכללים הבאים: * כאשר מספר הפרוטונים ומספר הניוטרונים בגרעין האטום הוא זוגי אז מספר הספין הוא אפס )כמו 16O, 12Cוכו'(. * כאשר מספר הפרוטונים ומספר הניוטרונים בגרעין האטום הוא איזוגי אז Iהוא שלם ),2 ,1 (.....3כמו 14N, 2Dוכו'. * כאשר מספר הפרוטונים הוא איזוגי ומספר הניוטרונים הוא זוגי או להיפך I ,הוא חצי שלם ) 3/2 ,1/2וכו'( כמו 19F, 31P ,17O, 15N ,13C, 1Hוכו'. רוב הגרעינים החשובים לכימאים האורגניים ולביוכימאים הם בעלי ספין ½ וניתן לכנותם כ- .NMR active nuclei לכל גרעין אטום בעל ספין Iיש 2I+1רמות אנרגיה ספיניות .רמות האנרגיה האלה מנוונות בהעדר שדה מגנטי חיצוני .כאשר גרעינים אלה מוכנסים לשדה מגנטי חיצוני ) (B0מוסר הניוון ברמות האנרגיה הספיניות )ציור .(14יש מספר סופי של כיוונים המותרים בשדה מגנטי חיצוני 22 ולכל כיוון )למשל מקביל ,אנטי מקביל או ניצב( מתאימה אנרגיה שונה .עבור ספין 1/2למשל יש סה"כ שני מצבים אנרגטיים :עבור ספין ½ (α) +ועבור ½.(β) - B0 ציור מס' :14רמות אנרגיה של גרעינים בעלי ספין ½ וספין .1 עתה משהוסר הניוון בין רמות האנרגיה הספיניות ניתן להקרין את הדוגמא בקרינה אלקטרומגנטית ולגרום למעברים בין רמות האנרגיה הספיניות השונות של גרעין האטום .כאשר הקרינה האלקטרומגנטית נושאת אנרגיה המתאימה בדיוק להפרש האנרגתי בין הרמות יש בליעה של אנרגיה וזו נרשמת על ידי הגלאי .מצב זה נקרא הרזוננס של הגרעין וערכו ניתן על ידי משוואות 4ו.5- 23 תדירות הרזוננס של הגרעין תלויה בשדה המגנטי החיצוני .כך תדירות רזוננס של מימנים בשדה של 2.35Tתהיה 100MHzובשדה של 11.75Tהיא ) 500MHzתדר זה הוא בתחום של גלי רדיו( .ככל שנגדיל את השדה המגנטי החיצוני הפרש האנרגיה בין רמות הספין השונות יגדל וכך תגדל רגישות השיטה. איך בנוי מכשיר ה :NMR-בשדה מגנטי חזק נמצא סליל עם זרם .זרם משרה שדה אלקטרומגנטי בתדירות מתאימה לגרעין שאותו מודדים )במקרה שלנו זה פרוטונים( .כדי להתגבר על סטיות קטנטנות בשדה כתוצאה ממיקום הדוגמה ולהגיע להומוגניות ,מסובבים את הדוגמה .משנים את הזרם בסליל כדי לתת פולס לדוגמה .הספינים עוברים מרמה אנרגטית אחת לרמה אחרת .מכבים את המתח ומודדים .הפולס כולל את טווח תדירויות הרלוונטיות לאותו גרעין .דוגמא למכשיר NMRניתן לראות בציור מס' .15 ציור מס' :15מכשיר NMR המיקום של סיגנל המימן על הציר נקרא היסט כימי .טרנספומצית פורייה ) (Fourierמעבירה את הדעיכה ממימד הזמן למימד התדירויות .ניתן לקבל את ערכי ההיסט הכימי ביחידות של תדירות .Hzמכיוון שבמכשירים בעלי שדות מגנטים שונים ההיסט הכימי יהיה שונה ,מקובל יותר להשתמש בערך של היסט כימי שלוקח בחשבון את תדירות הרזוננס של אותו גרעין באותו שדה מגנטי .נוח למדוד את השינויים בתדירויות מסטנדרד פנימי מסוים .שתי התדירויות נמדדות ב Hz ואת ההפרש הזה מחלקים בתדירות המכשיר כדי לקבל ערכים מספריים חסרי מימד שאינם תלויים בשדה ויהיו בתחום נוח לשימוש. הסטנדרד הפנימי הוא כמעט תמיד טטרה מתיל סילאן ) (TMSוההיסט הכימי δמוגדר ע"י )δ = [νs(Hz) – νTMS(Hz)]/operating frequency (MHz 24 הפרמטר ,δאשר מודד את מיקומו של הסיגנל יהיה זהה בכל מכשיר NMRואיננו תלוי בסוג המכשיר אין לו יחידות והוא מבוטא כ .part per million – ppmטטרה מתיל סילאן נבחר כסטנדרדט פנימי מכיוון שהוא אינרטי ,נדיף ,בלתי רעיל ,זול יחסית ויש לו רק סיגנל אחד ,אשר נכנס לרזוננס בצד אחד קיצוני של התדירויות )מוגדר .(0ppm ההיסט הכימי וגורמים המשפיעים עליו :עד עכשיו ראינו שליסודות שונים יש תדירות בליעה שונה וכביכול כל המימנים היו צריכים לבלוע במקום אחד ,אך למזלנו זה לא כך .תנועת האלקטרונים משרה שדה מגנטי B1 .B1יכול לתרום לערך של השדה החיצוני ואז אומרים שהגרעין לא ממוסך ) (deshildedאו להפך להחסיר ממנו ואז אומרים שהגרעין ממוסך ) .(shieldedמיסוך תלוי בסביבה הכימית של גרעין המימן .לכן גם תדירויות של אותו גרעין בסביבה שונה ידעכו בזמן שונה .קרבת האטומים בעלי אלקטרושליליות קטנה מזו של פחמן גורמת לאלקטרונים להתקרב יותר למימן וכך נוצר מסוך .המימנים הממוסכים יופיעו ב ppm נמוך יותר )שדה גבוה יותר( .קרבת האטומים שיותר אלקטרושליליים מפחמן גורמת לאלקטרונים להתרחק מהמימן ולהתקרב לאותם אטומים אלקטרושליליים וכך נוצר דה-מיסוך. הגרעינים המימניים הלא ממוסכים יופיעו בשדה נמוך יותר כלומר ppmגבוה יותר. עוד גורמים שמשפיעים על ההיסט כימי הם קרבה לקשרים הלא רווים )כפולים ,משולשים(. טבעת בנזנית משרה זרם ע"י תנועה חופשית של אלקטרוני πויוצרת שדה מגנטי משלה שגורם למימנים להיות מאוד לא ממוסכים ויופיעו ב .7-8 ppm פיצולים :מימנים שנמצאים בסביבה כימית זהה לחלוטין יתנו סיגנל אחד בספקטרום .לדוגמא במתמיר CH3כל המימנים יהיו זהים ולא יפצלו אחד את השני .לכן הם לא נקראים שכנים אחד לשני .לעומת זאת במתמיר CH3-CH2מימנים Hאינם זהים מבחינת הסביבה הכימית למימנים Hולכן הם יהיו "שכנים" אחד של השני ויפצלו אחד את האחר .מקורו של פיצול זה באינטראקציות ספין-ספין ) .(spin-spin interactionsמספר הסיגנלים ועוצמתם מתחלקים לפי משולש פסקל )ציור מס' .(16 ציור מס' :16מבנה הקווים עבור בליעת NMRלגרעינים בעלי ספין ½ 25 – Jהוא קבוע הפיצול של מימן אחד ע"י השני .ערכו של Jשמימן Hיפצל את מימן Hיהיה אותו Jשמימן Hיפצל את Hוקבוע פיצול זה נקרא 3Jמכוון שיש 3קשרים בין שני המימנים. מימנים על אותו פחמן )ג'מינליים( מפצלים אחד את השני כאשר הם נמצאים בסביבה כימית שונה .הדבר אפשרי כאשר אין סיבוב חופשי סביב קשר פחמן-פחמן ,למשל ,מימנים טרמינאליים של קשר כפול. בעזרת שיטת העץ המוצגת בציור 17ניתן לנבא את מבנה הפיצולים של הבליעה בספקטרום ה .NMR ציור מס' :17שיטת העץ לניבוי מבנה הפיצולים של בליעת NMRלגרעינים בעלי ספין ½ נתון נוסף שמתקבל מספקטרום פרוטונים הוא יחס השטחים מתחת לפיק )או העוצמות( של הסיגנלים בספקטרום והוא כיחס בין המימנים שנותנים אותם סיגנלים .כך שבעיקרון נוכל לקבוע מספקטרום פשוט כמה סוגי מימנים יש בתרכובת ,כמה שכנים רואה כל סוג וסוג ומה הכמות היחסית של פרוטונים בכל קבוצה וקבוצה .דוגמא לספקטרום NMRשל אתאנול מוצגת בציור מס' .18 ציור מס' :18ספקטרום NMRשל אתאנול 26 בעשורים האחרונים חלה התפתחות מדהימה בתחום ה NMRעם פיתוח ה NMR-הדו-מימדי. כתוצאה מפריסת הספקטרום על כמה מימדים ניתן לאפיין גם מולקולות מורכבות יותר שספקטרום הפרוטונים החד-מימדי שלהן הוא צפוף וקשה לאיפיון .ניתן למשל לקבל בניסיון אחד קורלציות בין מימנים שקרובים במרחב או קורלציות בין מימנים שכנים .בעזרת טכניקות אלה ניתן לקבל מבנה תלת-מרחבי מדוייק של מולקולות ביולוגיות כמו חלבונים ,אנזימים ומקטעים של .DNA ציור מס' :19ספקטרום דו-מימדי של מקטע של {[d(GGTATACC)2]} DNAבמים בשנים האחרונות התפתח מאד התחום של NMRשל מערכות חיות ) (in vivo NMRהמאפשר קבלת ספקטרום של מטאבוליטים באזורים שונים של גוף החיה או האדם בצורה שהיא לגמרי לא חודרנית .ציור 20מראה ספקטרום פרוטונים וספקטרום זרחן )ציור 20א' ו-ב' ,בהתאמה( של מוח של חולדה בלווית שיוך של כמה מן הפיקים הבולטים ביותר .מספקטרום הזרחן ניתן אף לחלץ את ה pHהתוך-תאי של תאי מוח אלו. 27 א. ב. )(1 )(2 ציור מס' :20א .ספקטרום פרוטונים in vivoשל מוח של חולדה ב .ספקטרום זרחן ) in vivo (31Pשל מוח של חולדה כאשר ה pHהתוך-תאי שונה: ).pH = 7.1 (2) pH = 6.2 (1 28 בניית מערכות בסיסיות המערכות הבסיסיות במעבדה הם מערכת למיצוי ,ריפלקס ומערכת לזיקוק פשוט .בפרק הזה נסביר את שלבי בניית המערכות. המערכת הראשונה היא מערכת למיצוי והיא מתוארת באופן סכימטי בציור מספר .21המערכת מורכבת ממשפך מפריד המונח על טבעת ברזל ומתחת למשפך נמצא כלי קיבול בנפח המתאים לנפח המשפך המפריד. משפך זכוכית משפך מפריד טבעת ברזל ארלנמייר ציור מס' :21מערכת למיצוי השלבים לבנייה ועבודה עם מערכת המיצוי מתוארים בציור :22 .1מחברים לעמודה )סטטיב( מלחציים )מופה() .ציור 22א'( .2בעזרת המלחציים לחבר טבעת ברזל) .ציור 22ב'( .3בתוך הטבעת מניחים משפך מפריד לאחר שמוודאים כי הברז בקצה המשפך סגור .4מתחת למשפך המפריד מציבים ארלנמייר בגודל מתאים) .ציור 22ג'( .5לאחר הכנסת התמיסות ,פוקקים את המשפך עם פקק פלסטיק )ולא זכוכית( ואוחזים במשפך באופן המתואר בציור 22ד'. .6מנערים את המשפך המפריד כשהפתח שלו פונה אל תוך המנדף ומשחררים לחץ על ידי פתיחת הברז ,חוזרים על פעולה זו מספר פעמים. .7מוודאים שהברז סגור ,מניחים את המשפך חזרה לתוך טבעת הברזל ומסירים את הפקק. 29 .8לאחר שרואים הפרדה ברורה בין הפאזות ניתן לפתוח בזהירות את הברז ולשפוך כל פאזה לכלי נפרד. ד' ג' ב' ציור מס' :22השלבים בבנייה והפעלה של מערכת מיצוי מערכת נוספת היא מערכת לריפלקס .במערכת זו מחממים את תערובת המגיבים עם הממס עד לנקודת הרתיחה של הממס .לגולת הראקציה מחובר מעבה אליו עולים אדי הממס ,מתעבים וחוזרים חזרה לגולת הראקציה .המערכת משמשת לתגובות כימיות המתרחשות בטמפרטורות גבוהות )טמפרטורת הרתיחה של הממס הנבחר לתגובה הכימית( .מערכת הריפלקס מתוארת באופן סכימטי בציור .23 30 א' מעבה גולות פתח יציאת מים פתח כניסת מים גולה מהדק יחיד סיר שמן פלטת חימום ג'ק ציור מס' :23מערכת ריפלקס השלבים לבניית מערכת הריפלקס מתוארים בציור :24 .1על עמודה )סטטיב( מניחים ג'ק ,עליו מניחים פלטת חימום ועליה סיר שמן. .2מחברים לסטטיב מהדק יחיד ומחזיקים בעזרתו את גולת הראקציה שמכילה מגנט ביצה. את גובה הגולה במערכת קובעים לפי גובה מינימלי שעדיין מאפשר הוצאה של הסיר מבלי להזיז את הגולה) .ציור 24א'(. בנוסף צריך לבדוק שכמות השמן בסיר לא תהיה גדולה מדי )שמן עלול לגלוש( או קטנה מדי )לא מחמם את החומרים בגולה( .כאשר טובלים את הגולה בשמן גובה השמן צריך להיות כ 2-3ס"מ פחות מגובה הסיר )כי שמן מתפשט בחימום ועלול לגלוש( ועדיין לכסות לפחות מחצית מנפח הגולה) .ציור 24ב'( .3מעלים את הג'ק עד שהגולה טבולה בתוך השמן) .ציור 24ג'( .4למעבה גולות מחברים שני צינורות מים .את הצינור התחתון מחברים לסירקולטור ,את הצינור העליון מניחים באמבט מלא במים .מפעילים את הסירקולטור לפני חיבור המעבה לגולה 31 על מנת לבדוק שאין דליפה של מים )מעבה לא תקין( ושחיבורי הצינורות נעשו באופן הנכון. )ציור 24ד'( .5מחברים את מעבה הגולות לגולה )ציור 24ה'( .אפשר לתמוך המעבה בעזרת תלת-אצבע. .6קושרים יריעות בד סביב החיבור של המעבה לצינור )ציור 24ו'( .בהזרמת מי קרח דרך המעבה אדי מים מתעבים באיזור הזה ויריעת הבד מונעת מטיפות מים ליפול לתוך השמן החם. .7בעזרת מהדק יחיד מחברים מד-חום למדידת טמפרטורת השמן. ב' ג' ה' ו' ציור מס' :24השלבים בבניית מערכת ריפלקס 32 א' ד' המערכת השלישית היא מערכת לזיקוק פשוט ,המתוארת באופן סכימטי בציור .25 תרנגול פתח יציאת מים תלת אצבע גולה מעבה שופר סיר שמן גולה פלטת חימום פתח כניסת מים קערת קרח ג'ק ג'ק ציור מס' :25מערכת זיקוק פשוט 33 אופן בניית המערכת מתואר בציור :26השלבים הראשונים בבניית המערכת דומים מאד לאלו שבמערכת הריפלקס. .1על עמודה )סטטיב( מניחים ג'ק ,עליו מניחים פלטת חימום ועליה סיר שמן )עם כמות מתאימה של שמן )ראה מערכת ריפלקס(. .2מחברים לסטטיב מהדק יחיד ומחזיקים בעזרתו את גולת הראקציה שמכילה מגנט ביצה. את גובה הגולה במערכת קובעים לפי גובה מינימלי שעדיין מאפשר הוצאה של הסיר מבלי להזיז את הגולה) .ציור 24א'(. .3לגולת הזיקוק מחברים ראש זיקוק )תרנגול( )ציור 26א'( .4מחברים למעבה ליבינג שני צינורות מים .את הצינור התחתון )פתח המעבה המרוחק יותר מגולת הזיקוק( מחברים לסירקולטור ואת הצינור העליון )פתח המעבה הקרוב יותר לגולת הזיקוק( מניחים באמבט המים .יש לבדוק את תקינות המעבה וחיבורי הצינורות על ידי הפעלת הסירקולטור לפני חיבור המעבה למערכת. .5על סטטיב שני מחברים תלת אצבע. .6מחברים את המעבה לתרנגול ומהדקים בעזרת תופסן )קליפס כחול( ,המעבה נתמך ע"י תלת האצבע) .ציור 26ב'( .7למעבה מחברים שופר ומהדקים בעזרת קליפס כחול )ציור 26ג'( .8לשופר מחברים גולה שקולה ומהדקים בעזרת קליפס כחול )ציור 26ד'( .את הגולה המקבלת מקררים על ידי קערת מי קרח המונחת על ג'ק .קערת הקרח גם תומכת בגולה המקבלת. .9מכניסים מד-חום דרך לטש עם הברגה ומכניסים למערכת דרך התרנגול .מד-החום צריך להגיע לגובה המינימלי של הפתח בתרנגול דרכו נכנסים אדי החומר אל תוך המעבה )ציור 26ה'(. .10בעזרת מהדק יחיד מחברים מד-חום למדידת טמפרטורת השמן. המערכת הסופית מוצגת בציור 26ו'. 34 ב' א' ג' ד' ה' ו' ציור מס' :26השלבים בבניית מערכת זיקוק פשוט 35 נסיונות .1הפרדת תערובת – מיצוי ,זיקוק ,גיבוש וקביעת נקודת התכה נושאים :עקרון הזיקוק ,הגיבוש והמיצוי .הגדרה של גדלים פיזיקאלים כדוגמת נקודת התכה, נקודת רתיחה וגורמים המשפיעים על הגדלים האלה. דוגמא לבדיקה 3.2 :גר' חומצה בנזואית ו 2.1 -גר' טרנס-סטילבן מומסים ב 75מ”ל של כלורופורם. מיצוי :מצה את הדוגמה פעמיים ,כל פעם על ידי 15מ”ל של תמיסת 10% NaOHועוד פעם על ידי 15מ”ל של מים .אחד את כל הפאזות המימיות .יבש את פאזת הכלורופורם על ידי הוספת ,MgSO4וסנן כדי לסלק את ה.MgSO4- הפאזה הכלורופורמית :זקק את התמיסה מעל אמבט שמן ואסוף את הכלורופורם הנקי )לפי נקודת רתיחה( .בכלי הזיקוק נשאר הטרנס-סטילבן .גבש אותו מחדש מ 26-מ”ל של אתאנול וקבע את נקודת היתוכו. הפאזה המימית :הוסף לאט ותוך ערבוב מנות של 4מ”ל HClמרוכזת עד שתגיע ל pH-חומצי. קרר את התמיסה וסנן את המשקע של חומצה בנזואית במשפף ביכנר .המס את המשקע מחדש ב- 75מ"ל של מים על ידי הרתחה .הוסף כפית שטוחה של פחם פעיל )לאט כדי למנוע קפיצה של חומר מהכלי( והמשך את ההרתחה עוד 5דקות .סנן את התמיסה השחורה בעודה חמה לתוך ארלנמייר שעומד על פלטה ושמכיל מעט מים רותחים .עם קרור התסנין שוקעת חומצה בנזואית לבנה וטהורה .סנן את המשקע בביכנר ,יבש אותו וקבע את נקודת היתוכו. 36 .2נגזרות של חומצות קרבוקסיליות נושאים :ראקציות שיווי משקל ,השפעה על ראקציות שיווי משקל ,נגזרות של חומצות קרבוקסיליות ,פעילותן היחסית בראקציות אסטריפיקציה ,אסטריפיקציה במנגנון חומצי ובסיסי, הידרוליזה של אסטרים. אסטריפיקציה :הכנת n-butyl acetate הערות לגבי הפרוצדורה: כמויות – 50%מהפרוצדורה הוספת חומצה גופריתנית עם פיפטה חד-פעמית מכויילת ריפלקס של 2-3שעות ייבוש פאזה אורגנית עם מגנזיום סולפאט הזיקוק נעשה מעל אמבט שמן תוך בחישה עם מגנט ולא עם אבני רתיחה ).(porous porcelain 37 .3אלקיל הלידים נושאים :יציבות של יוני קרבוניום ,ראקציות SN1ו ,SN2 -מאפיינים ופעילות של אלקיל הלידים שונים לגבי כל אחד מהמנגנונים האלה .ראקציות מתחרות כמו אלמינציה. שיטות להכנת אלקיל הלידים: 38 הכנת ) Tert-butyl chlorideבשיטת (HCl הערות לגבי הפרוצדורה: את הראקציה מבצעים בתוך גולה ולא בתוך משפך מפריד. מערבבים את כל החומרים מספר דקות בתוך הגולה ורק אחר כך מעבירים למשפך מפריד. ייבוש הפאזה האורגנית נעשה עם .anhydrous calcium chloride הזיקוק נעשה תוך בחישה עם מגנט ולא עם אבני רתיחה ).(porous porcelain 39 .4פרידל קרפטס נושאים :חומצות לואיס ,מנגנון ראקצית פרידל קרפטס ,אלקילצית ואצילציית פרידל קרפטס, התקפה ארומטית אלקטרופילית ,קבוצות מאקטבות ודה-מאקטבות .הכוונה לעמדות שונות בטבעת הארומטית. הכנת (2-hydroxylepidine) 2-hydroxy-4-methyl-quinoline הערות לגבי הפרוצדורה: כמויות – 10%מהפרוצדורה הבחישה נעשית עם מגנט ולא עם בוחש מכני 40 .5תרכובות אורגנו-מתכתיות Organometallic Reagents נושאים :תרכובות אלקיל-ליתיום – הכנה ,יציבות .תרכובות גריניארד – יציבות ,הכנה ,פעילות. מנגנוני ראקציות עם חומרים שונים. הכנת חומצה בנזואית )על ידי קרבונילציה של ראגנט גריניארד( 41 הערות לגבי הפרוצדורה: ייבוש כלים עם אקדח חום יחד עם המדריך לא מוסיפים יוד למערכת )לפחות לא בשלב ראשון( את תערובת הברומובנזן והאתר מכינים בארלנמייר ומוסיפים למשפך המטפטף לפני התחלת התגובה לגולה מוסיפים 8מ"ל של אתר יבש )ולא 5מ"ל כפי שכתוב בפרוצדורה( ריפלקס נעשה עם אמבט שמן במשך 30דקות 42 .6שיחלופים מולקולאריים )(Rearrangements נושאים :יציבות של יוני קרבוניום ,מנגנוני שיחלוף שונים )בעיקר אלו המבוססים על קרבוקטיון( והכוח המניע לשיחלופים שכאלה. הכנת Pinacolone הערות לגבי הפרוצדורה: כמויות – 30.8%מהפרוצדורה הראגנט שמקבלים הוא pinacolוממנו צריך להכין .pinacol hydrate 6N sulphuric acidיש להכין מ 97%חומצה שיש במעבדה) .מיהול של חומצה גופריתנית נעשה עם קרח!!!( הזיקוק נעשה לתוך מסורה מקובעת. חוזרים על הזיקוק רק עוד פעם אחת )סה"כ פעמיים( ולא עוד שלוש פעמים )סה"כ ארבע פעמים( כמו שכתוב בפרוצדורה. 43
© Copyright 2024